3000株水稻基因序列公开发表

近日,3000株水稻基因组测序文章在GigaScience正式发表,且整套水稻基因序列以可引用形式在该杂志的附属开放获取数据库GigaDB中公开。 该项目产生的数据是目前已公开水稻序列数据量的四倍。该成果标志着3000株水稻基因组项目第一阶段的完成,主要由中国农业科学院、国际水稻研究所以及华大基因合作开展。 由华大基因和生物医学中心共同创办的GigaScience是一个开放获取且数据公开的大数据期刊。“3000株水稻基因组项目”所产出和公开的大量遗传信息将最终被应用到智能育种实践中。不同植株间存在自然变异,而了解这些不同性状发生的遗传机制,将有助于成功培育出可高度适应不同环境的杂交品种。 据悉,上述三家单位的合作不仅公开了13.4TB的数据资源,而且还收集了每株水稻的种子(存放于国际水稻研究所的水稻基因资源库中)。储存这些种子对充分利用这些遗传信息已知的水稻品种来开发和验证最适合不同环境的杂交株是十分必要的。......阅读全文

我国已完成400多个水稻基因转基因克隆工作

  我国的水稻研究已进入了一个全新的领域,目前华大基因农能平台已经完成400多个水稻基因的转基因克隆工作,依托华大基因强大的高通量测序技术,今后将进一步加快水稻转基因育种研究工作。这是记者在6月29日结束的“水稻基因组学与农业应用研讨会”上获悉的消息。  作为世界上最早种植水稻的

新型转基因水稻使用杂草基因来对抗干旱影响

  联合国粮食及农业组织(FAO)曾表示,大米是仅次于玉米和小麦的第三大粮食作物,许多国家世界大部分地区的主食是大米。 随着需求的增加和气候变化影响的不断增加,水稻的干旱脆弱性日益受到关注。据外媒报道,现在日本理化研究所(RIKEN)可持续资源科学中心(CSRS)正在开发一种全新的新的转基因水稻,其

转基因水稻安全证书即将到期

  中国科学院院士、华中农业大学生命科学学院院长张启发近日披露,今年7月,国内61名两院院士联名上书国家领导人,请求尽快推进转基因水稻产业化,“不能再等,再迟缓就是误国”,这再次引发对转基因主粮商业化种植是否安全的大争论。   对于上书背景,环保部首席科学家薛达元告诉21世纪经济报道记者:这是因为

我国科学家发现水稻高产基因

记者22日了解到,中国农业科学院作物科学研究所周文彬研究员团队在水稻中研究发现了水稻高产基因OsDREB1C。  北京时间7月22日凌晨,相关研究成果在国际著名学术期刊《科学》(Science)杂志以研究长文的形式在线发表。该研究历时7年完成。  据介绍,基因OsDREB1C可提高光合作用效率和氮素

研究发现水稻应答镉胁迫关键基因

  6月17日,记者从中科院华南植物园获悉,由该园科研人员完成的“水稻金属耐受蛋白OsMPT1及其编码基因和其RNA干涉片段”获国家发明ZL授权。   过量的重金属在水稻体内累积,不仅影响水稻产量、品质及整个农田生态系统,而且可通过食物链危及动物和人类健康。研究水稻对重金属吸收转运的分子机制,可为

盐碱地水稻“逆”生长基因破译

  在耕地资源日趋紧张的背景下,如何将盐碱地变高产粮田,成为当下农业科学家研究的热点方向之一。1日,记者从湖南大学获悉,该校刘选明教授研究团队破译出一个能降低土地盐碱化对水稻产量影响的新基因STRK1,并揭示了其分子作用机制,为进一步解析植物耐盐的分子机制奠定了重要基础,并提供了耐盐特征性分子标记。

盐碱地水稻“逆”生长基因破译

  在耕地资源日趋紧张的背景下,如何将盐碱地变高产粮田,成为当下农业科学家研究的热点方向之一。1日,记者从湖南大学获悉,该校刘选明教授研究团队破译出一个能降低土地盐碱化对水稻产量影响的新基因STRK1,并揭示了其分子作用机制,为进一步解析植物耐盐的分子机制奠定了重要基础,并提供了耐盐特征性分子标记。

中国科学家发现增产水稻基因

  中国的研究人员发现了一种稻米基因可以同时提高主要农作物的品质和产量。 中国科学院遗传与发育生物学研究所(位于北京)的遗传学家傅向东与其同事在研究巴基斯坦的basmati香米时首次发现了一种重要基因,名为GW8基因。 basmati香米以其优良的谷物质量而闻名于世

湖北转基因水稻形成规模种植

  [导读]在湖北等地,转基因抗虫水稻早已形成规模种植。当地农民开始并不知道那就是转基因的水稻种子,以为是政府推广的另一种杂交稻的新品种。种了转基因大米的农民,对吃这种大米都抱有很谨慎的态度。   中国新闻周刊2010012期封面   大米也转基因了吗?   一场没有硝烟的变革正在13亿中

我国发现水稻耐淹水关键基因

  台湾中央研究院分子生物研究所特聘研究员余淑美实验室于10月6日发表国际重要论文Coordinated Responses to Oxygen and Sugar Deficiency Allow Rice Seedlings to Tolerate Flooding,发现水稻耐淹水的关键基因,揭

中国转基因水稻安全证书全部到期

  2014年5月16日,湖北省第十四届科技活动周开幕式在宜昌市夷陵广场举行,来自华中农业大学的科技人员展示的转基因水稻。   8月17日,中国转基因水稻仅有的2张安全证书、转基因玉米唯一的一张安全证书全部到期。如果续申请没有成功,则意味着中国将没有一种转基因主粮拥有安全证书,更不必说商业

胡萝卜基因组序列草图成功绘出

  来自美国的一个研究小组称,他们完成了对30余种胡萝卜样品的测序,绘制出了胡萝卜基因组序列草图。这很可能是迄今最完整的蔬菜基因组序列草图。研究人员称,这一研究阐明了胡萝卜的起源和演化过程,对改善胡萝卜和其他农作物的营养价值提供了可能。相关论文在线发表在《自然·遗传学》杂志网站上。   胡萝卜和生菜

科学家首次发现重度抑郁基因序列

  【新闻事件】:本周《自然》发表了一篇重要论文。在分析5303例汉族女性重度抑郁患者和5337名对照的DNA序列后发现两个和重度抑郁相关的基因序列。一个紧靠SIRT1,另一个是LHPP的内含子。这是科学家第一次把重度抑郁和某个基因序列可靠地联系在一起,为以后药物开发打下基础。  【药源解析】:抑郁

新软件按需组装无缝基因组序列

原文地址:http://news.sciencenet.cn/htmlnews/2023/2/494014.shtm 科技日报北京2月16日电 (记者张梦然)美国国立卫生研究院研究人员发布了一种创新的软件工具,用于组装来自各种物种的真正完整(即无缝)的基因组序列。这种名为Verkko的软件在芬兰

白菜甘蓝油菜全基因组序列测定

   由中国科学家领衔的白菜、甘蓝和油菜全基因组测序项目取得阶段性重大成果,获得了白菜全基因组的精细图,甘蓝和油菜全基因组的框架图。   研究表明,白菜、甘蓝和油菜的基因组大小分别约为5亿、6.5亿和11亿个碱基对,白菜和甘蓝含有的基因总数目分别约4.2万和4.5万个,油菜基因覆盖度85%以上。该

马铃薯基因组序列框架图全球发布

中国科学家的创新性思路助推测序工作提前完成   9月23日,由14国科学家组成的“国际马铃薯基因组测序协作组”分别在北京、阿姆斯特丹、伦敦、纽约、利马等地同时宣布了马铃薯基因组序列框架图的完成。此次公布的马铃薯基因“蓝图”绘制工作的中国参与单位主要来自中国农业科学院蔬菜花卉所和深圳华大基因研究院。

科学家首次完成蜈蚣基因序列测定

  日前,科学家完成了蜈蚣的基因组测序的测定。结果表明,它们的基因数量比人类大约少三分之一。科学家以生活在西北欧沿海的一种常见蜈蚣物种作为测序对象。参与该项研究的106名科学家来自10多个国家和地区。  研究表明,蜈蚣的基因组大小是人类基因组的十分之一,含有的基因数量是人类的三分之二,共1.5万个,

关于断裂基因的调控序列种类介绍

  ①在5′端转录起始点上游约20~30个核苷酸的地方,有TATA框(TATA box)。TATA框是一个短的核苷酸序列,其碱基顺序为TATAATAAT。TATA框是启动子中的一个顺序,它是RNA聚合酶的重要的接触点,它能够使酶准确地识别转录的起始点并开始转录。当TATA框中的碱基顺序有所改变时,m

-震惊!Genbank参考基因组序列多处错误!

 震惊!Genbank参考基因组序列多处错误!   随着基因组测序技术的飞速发展以及测序成本的快速降低,全基因组数据也在急速增加。尽管参考基因组数据是非常有价值的资源,但是由于测序过程中的外源污染或者研究者对数据组装方法的误用,使得基因组数据面临很多问题。  近日,约翰霍

怎么样通过引物序列找目的基因

你先看看你引物序列是什么吧,如果是巢氏PCR的引物,很有可能一部分序列是不在靶基因中的。即使是一般的PCR引物,也可以只有3'端的一部分序列与靶基因匹配即可。如果你想验证,直接合成后PCR,然后测序,验证下是不是得到EGFR序列即可。当然,你也可以根据EGFR基因自己设计引物,这个很容易。

香港中文大学破解水稻基因G蛋白-提升水稻抗病害能力

  据香港《大公报》报道,稻米也要提升抗逆力,香港中文大学的生命科学学院研究团队,与中国农业大学合作,首次破解水稻基因中“YchF类G蛋白”结构及功能,揭破水稻其中一项抗病害及对抗不良生长环境的能力。领导研究团队的教授林汉明表示,团队将会进一步研究G蛋白的运作机制,希望将有关发现实用化。   中大农

表达基因的克隆策略与分离表达基因序列的技术方法

人类基因组计划的主要任务之一就是要从大片段基因组区域或整条染色体DNA 上鉴定出基因表达序列(gene expressed sequences)或转录单位(transcription units)。在人类基因组30亿个碱基对中,发生转录的表达序列(即基因)仅占总序列的3~5%。基因组中绝大部

日本研究气象数据如何影响水稻基因

  将气温、降水量等气象数据输入电脑程序,就能推算出水稻稻叶中发挥机能的约1.72万个基因的表达状况,这是日本一个研究小组的最新研究成果。它将有助于人们更有针对性地改良水稻品种。   这是日本农业生物资源研究所等机构进行的一项研究,研究人员选择了日本两种较为常见的水稻品种“日本晴”和“农林8

日研究气象数据如何影响水稻基因

  将气温、降水量等气象数据输入电脑程序,就能推算出水稻稻叶中发挥机能的约1.72万个基因的表达状况,这是日本一个研究小组的最新研究成果。它将有助于人们更有针对性地改良水稻品种。   这是日本农业生物资源研究所等机构进行的一项研究,研究人员选择了日本两种较为常见的水稻品种“日本晴”和“农林8号”,

比“滥种”转基因水稻更严重的

  这几年每隔一段时间媒体就会炒作一番湖北“滥种”转基因水稻,这回因为央视号称对此做了调查,号称在武汉超市买到的大米5袋有3袋是抗虫转基因大米,却不告诉观众转基因大米其实是安全的,于是引起社会恐慌。湖北政府也罕见地雷厉风行,销毁了当地10多亩转基因水稻,于是引起更大的社会恐慌。连我一位久不联系的中学

基因新发现让水稻好吃又高产

  我国研究人员近来发现了一个可以同时影响水稻品质和产量的关键功能基因GW8,将它应用到新品种水稻的培育中,有望让水稻变得好吃又高产。相关成果6月24日由英国《自然—遗传学》杂志在线发表。   该成果由中科院遗传与发育生物学研究所研究员傅向东、华南农业大学教授张桂权和中国水稻研究所研究员钱前组成的

中国科学家成功克隆水稻增产基因

  中国科学家在新一期英国《自然·遗传学》杂志上报告说,他们成功克隆了一个可帮助水稻增产的关键基因,该基因能使水稻向秆壮穗大的理想株型发展,在高产育种中具有重要应用前景。   中国科学院遗传与发育生物学研究所李家洋院士和中国农业科学院中国水稻研究所钱前研究员等组成的科研团队取得了这一突破性进展。李家

烟草和水稻叶绿体cpDNA基因组成特点

1.基因组由两个反向重复序列(IR)和一个短单拷贝序列(short single copy sequence, SSC)及一个长单拷贝序列(long single copy sequence, LSC)组成;2.IRA和IRB长各10-24Kb,编码相同,方向相反。3.cpDNA启动子和原核生物的相

南方农村报:转基因水稻该不该种

  2009年8月,中国科学院院士、华中农业大学教授张启发牵头研发的“华恢1号”和“Bt汕优63”率先获得我国第一张转基因水稻生物安全证书,让中国转基因水稻商业化种植迈出了关键一步。但今年全国“两会”期间,100多名学者联名上书全国人大,“要求立即停止转基因水稻和玉米商业化生产问题”;随后

烟草和水稻cpDNA基因组成及特点

烟草和水稻(Oryza sativa)叶绿体全序列分析表明cpDNA基因组成有以下特点:1.基因组由两个反向重复序列(IR)和一个短单拷贝序列(short single copy sequence, SSC)及一个长单拷贝序列(long single copy sequence, LSC)组成;2.