世界首个人类早期胚胎DNA甲基化全景观图谱
记者25日从北京大学第三医院获悉,该院生殖医学中心乔杰研究组与北京大学生命科学学院生物动态光学成像中心汤富酬研究组合作,绘就了世界首个人类早期胚胎DNA甲基化全景观图谱。这一成果日前已在线发表于《自然》,影响因子达38.597。 据介绍,哺乳动物的胚胎发育起始于单个受精卵细胞,父母的表观遗传记忆信息主要是DNA甲基化,需要在精子和卵细胞结合后被擦除,只保留特定的部分传递给下一代的个体。但由于技术上的困难以及所需研究材料的缺乏,研究人员一直无法在全基因组水平上,分析人类植入前胚胎的DNA甲基化动态模式。此次研究成果的贡献,主要表现在五个方面。 第一,受精前,精子和卵母细胞中的DNA甲基化程度均很高,而受精后,父母的表观遗传记忆均被大规模擦除,到植入前的囊胚阶段,胚胎的DNA甲基化水平降到最低点。但是在这一全基因组范围的DNA去甲基化过程中,标记着印记基因的DNA甲基化得以精确维持和保留。 第二,受精前,精子基因组DNA甲......阅读全文
Cell-Res重点论文:单细胞表观多组学测序技术最新突破
2017年6月16日,北京大学生命科学学院生物动态光学成像中心汤富酬课题组在《Cell Research》杂志在线发表了题为“Single-cell multi-omics sequencing of mouse early embryos and embryonic stem cells”的研
追溯囊胚培养液中游离DNA细胞来源
人类的妊娠效率很低,自然妊娠中只有不到50%的胚胎能够发育至足月。部分流产胚胎主要是源于胚胎的非整倍体染色体异常,在移植胚胎前鉴定并排除非整倍体胚胎是辅助生殖领域面临的巨大挑战。 当前临床上多采用对植入前胚胎的滋养外胚层进行样品活检和遗传学检测的方式来分析胚胎细胞的染色体倍性。该方法因涉及侵入
中科院Cell发表表观遗传突破性发现
来自中科院北京基因研究所的研究人员在斑马鱼实验中证实,早期胚胎过程中维持了精子而非卵母细胞的DNA甲基化组(Methylome)。这一突破性的研究发现以封面文章形式发表在5月9日的《细胞》(Cell)杂志上。 来自中科院北京基因研究所的刘江(Jiang Liu)博士和慈维敏(Weimin
两篇Nature文章发表表观遗传重要研究成果
表观遗传修饰是指在不改变DNA序列的情况下,发生的一种可影响基因表达的基因组变化。像DNA一样,当细胞分裂时某些表观遗传修饰可以被忠实地复制,使得子细胞中能够保留来自亲代的这一信息。这确保了沿着细胞谱系向下以一种稳定的方式维持基因表达。 近日发表在《自然》(Nature)杂志上的两篇新研究论文
DNA甲基化的作用特点
DNA甲基化(DNA methylation)为DNA化学修饰的一种形式,能够在不改变DNA序列的前提下,改变遗传表现。所谓DNA甲基化是指在DNA甲基化转移酶的作用下,在基因组CpG二核苷酸的胞嘧啶5号碳位共价键结合一个甲基基团。大量研究表明,DNA甲基化能引起染色质结构、DNA构象、DNA稳定性
DNA甲基化的过程介绍
由于Dnmtl和Dnmt3基因家族没有针对CpG二核苷酸序列的特异性,人们因此提出了DNA甲基化转移酶发现靶位点的机制。首先,甲基化转移酶并不是同等地接近所有染色体区域。具有染色体重构和DNA螺旋酶活性的蛋白质能调节哺乳动物细胞内DNA甲基化,如SNF2家族2个成员ATRX和Lsh;其次,附件因子(
DNA甲基化的类型介绍
DNA甲基化反应分为2种类型。一种是2条链均未甲基化的DNA被甲基化,称为从头甲基化(denovo methylation);另一种是双链DNA的其中一条链已存在甲基化,另一条未甲基化的链被甲基化,这种类型称为保留甲基化(maintenance methylation)。
吸烟可以改变-DNA-甲基化
近日,英国 Nature 出版社子刊《Scientific Reports》在线发表了浙江大学医学院附属第一医院李明定教授和他的学生马云龙博士最新研究成果——首次利用系统生物学的方法探讨吸烟如何导致癌症发生的表观遗传学机制,证明了吸烟可以通过改变 DNA 甲基化而导致癌症的发生,为预防和治疗由吸
DNA的去甲基化过程
DNA的去甲基化由基因内部的片段及与其结合的因子所调控。有两种假说可以解释DNA去甲基化的分子机制。一种假说与DNA半保留复制联系在一起,为被动去甲基化。如果甲基化的DNA经半保留复制后不被甲基化,其DNA则处于半甲基化状态,半甲基化的DNA如再次发生DNA半保留复制,而DNA甲基化活性仍被抑制,则
DNA甲基化反应类型
DNA甲基化反应分为2种类型。一种是2条链均未甲基化的DNA被甲基化,称为从头甲基化(denovo methylation);另一种是双链DNA的其中一条链已存在甲基化,另一条未甲基化的链被甲基化,这种类型称为保留甲基化(maintenance methylation)。
概述DNA甲基化的机制
由于Dnmtl和Dnmt3基因家族没有针对CpG二核苷酸序列的特异性,人们因此提出了DNA甲基化转移酶发现靶位点的机制。首先,甲基化转移酶并不是同等地接近所有染色体区域。具有染色体重构和DNA螺旋酶活性的蛋白质能调节哺乳动物细胞内DNA甲基化,如SNF2家族2个成员ATRX和Lsh;其次,附件因
DNA-甲基化测序常用方法
随着高通量测序技术(NGS)技术的发展,使我们能够从全基因组水平来分析 5’甲基胞嘧啶及组蛋白修饰等事件,由此能够发现很多传统的基因组学研究所不能发现的东西,这就是所谓的“DNA 甲基化测序”!DNA 甲基化测序方法按原理可以分成三大类: 1、重亚硫酸盐测序; 2、基于限制性内切酶的测序; 3、靶向
DNA甲基化的作用原理
DNA甲基化是最早被发现、也是研究最深入的表观遗传调控机制之一。广义上的DNA甲基化是指DNA序列上特定的碱基在DNA甲基转移酶(DNA methyltransferase,DNMT)的催化作用下,以S—腺苷甲硫氨酸(S—adenosyl methionine,SAM)作为甲基供体,通过共价键结合的
细胞化学词汇DNA甲基化
中文名称:DNA甲基化外文名称:DNA methylation影 响:控制基因表达甲基酶分类:DNM T1、DNM T3a、DNM T3b作 用:修饰DNA序列
简述DNA甲基化的原理
DNA甲基化是最早被发现、也是研究最深入的表观遗传调控机制之一。广义上的DNA甲基化是指DNA序列上特定的碱基在DNA甲基转移酶(DNA methyltransferase,DNMT)的催化作用下,以S—腺苷甲硫氨酸(S—adenosyl methionine,SAM)作为甲基供体,通过共价键结
DNA的诱变和甲基化
· In Vitro Mutagenesis Using Altered Sites (Bowtell Lab) In vitro Mutagenesis with dut ung single stranded DNA (Hahn Lab)· Site-direct
DNA甲基化的原理机制
DNA甲基化是最早被发现、也是研究最深入的表观遗传调控机制之一。广义上的DNA甲基化是指DNA序列上特定的碱基在DNA甲基转移酶(DNA methyltransferase,DNMT)的催化作用下,以S—腺苷甲硫氨酸(S—adenosyl methionine,SAM)作为甲基供体,通过共价键结合的
DNA甲基化有什么作用
DNA甲基化作用主要是DNA甲基转移酶以S-腺苷甲硫氨酸(SAM)为甲基供体,将甲基转移至碱基特定结构上的过程。哺乳动物中90%的DNA甲基化修饰是由DNA甲基转移酶识别DNA的5'CG-3'序列(CpG),并将SAM的甲基转移至胞嘧啶C-5位上。DNA 甲基化可引起基因组中相应区域
关于DNA甲基化的简介
DNA甲基化(DNA methylation)为DNA化学修饰的一种形式,能够在不改变DNA序列的前提下,改变遗传表现。所谓DNA甲基化是指在DNA甲基化转移酶的作用下,在基因组CpG二核苷酸的胞嘧啶5号碳位共价键结合一个甲基基团。大量研究表明,DNA甲基化能引起染色质结构、DNA构象、DNA稳
研究揭示合子DNA去甲基化机制
中国科学院生物物理研究所朱冰研究组揭示小鼠母源蛋白Pramel15促进合子DNA去甲基化机制。相关论文8月25日发表于《自然-通讯》。哺乳动物卵细胞受精后形成的受精卵会经历DNA甲基化的重编程,将继承自亲本的基因组甲基化状态重置,为后续的组织分化、胚胎发育做准备。其中,DNA甲基化维持的重要DNA甲
研究首次揭示DNA主动去甲基化可靶向病毒基因
βC1在体外和体内增强DME活性。中国农科院植保所供图 近日,中国农业科学院植物保护研究所作物病原生物功能基因组研究创新团队联合清华大学生命科学学院,首次发现植物病毒可以利用植物的DNA主动去甲基化机制来逃逸植物的防御反应,相关研究结果在线发表于《自然—通讯》(Nature Communicati
北京大学Nature发布重要甲基化景观图
来自北京大学、教育部辅助生殖重点实验室、哈佛大学等机构的研究人员,绘制出了人类早期胚胎全基因组水平的DNA甲基化景观图谱,提出了有别于以往小鼠研究结果的一些新见解。这些研究结果发表在7月23日的《自然》(Nature)杂志上。 北京大学第三医院的乔杰(Jie Qiao)教授以及汤富酬(Fuch
揭示全基因组DNA甲基化、半甲基化与遗传突变的新方法
5月31日,中国科学院北京生命科学研究院研究员孙中生团队与北京大学肿瘤医院合作,在Briefings in Bioinformatics上,发表了题为A new approach to decode DNA methylome and genomic variants simultaneousl
基因组所最新成果揭示精子对遗传使命的新贡献
20世纪生命科学的快速发展证实了遗传的物质载体是DNA,DNA序列可以稳定地从父母遗传到子代中去,从而使物种得以延续。但如果仅仅只是DNA序列的遗传,难以解释为什么一个受精卵细胞可以发育成一个包含多种不同细胞、组织和器官的复杂生命个体。 最近20年的研究发现,表观遗传信息通过有序地开启和关
单细胞测序这样的高通量技术的优势具体体现在哪里
单细胞全基因组测序主要应用于肿瘤发生机制及胚胎发育研究。单细胞转录组分析可以在全基因组范围内挖掘基因调节网络,尤其适用于存在高度异质性的干细胞及胚胎发育早期的细胞群体。2017年6月16日,北京大学生命科学学院生物动态光学成像中心汤富酬课题组在《Cell Research》杂志在线发表了题为“Sin
单细胞测序这样的高通量技术的优势具体体现在哪里
单细胞全基因组测序主要应用于肿瘤发生机制及胚胎发育研究。单细胞转录组分析可以在全基因组范围内挖掘基因调节网络,尤其适用于存在高度异质性的干细胞及胚胎发育早期的细胞群体。2017年6月16日,北京大学生命科学学院生物动态光学成像中心汤富酬课题组在《Cell Research》杂志在线发表了题为“Sin
单细胞测序这样的高通量技术的优势具体体现在哪里
单细胞全基因组测序主要应用于肿瘤发生机制及胚胎发育研究。单细胞转录组分析可以在全基因组范围内挖掘基因调节网络,尤其适用于存在高度异质性的干细胞及胚胎发育早期的细胞群体。2017年6月16日,北京大学生命科学学院生物动态光学成像中心汤富酬课题组在《Cell Research》杂志在线发表了题为“Sin
单细胞测序这样的高通量技术的优势
单细胞全基因组测序主要应用于肿瘤发生机制及胚胎发育研究。单细胞转录组分析可以在全基因组范围内挖掘基因调节网络,尤其适用于存在高度异质性的干细胞及胚胎发育早期的细胞群体。2017年6月16日,北京大学生命科学学院生物动态光学成像中心汤富酬课题组在《Cell Research》杂志在线发表了题为“Sin
《Nature》发文阐述人类围着床期胚胎发育分子调控规律
2019年8月22日,北京大学第三医院乔杰课题组和汤富酬课题组合作,在国际权威学术期刊《自然》(Nature,IF:43.07)在线发表研究成果“Reconstituting the transcriptome and DNA methylome landscapes of human impl
北大汤富酬课题组发表单细胞表观多组学测序技术新成果
2017年6月16日,北京大学生命科学学院生物动态光学成像中心汤富酬课题组在《Cell Research》杂志在线发表了题为“Single-cell multi-omics sequencing of mouse early embryos and embryonic stem cells”的研