Science：生物信息学，神秘的新职业
今天的生物信息学家迎来了好时候。由于各个部门生成了几乎无穷无尽的生物数据，因此形成了对于生物、统计学和计算机科学交叉领域中有经验的专业人才的高度需求。科学家如果能够分析大量信息并将其清晰地展示给决策制定者，就会发现自己的工作和职业生涯前途无量，尤其是在大型制药和生物技术部门。 “在大数据时代，这是个有趣的地方，也是令人激动的时刻。”罗斯—豪曼理工学院计算机和软件工程教授Sriram Mohan评价道，他就利用自己的学术假期在一家数据管理公司Avalon咨询公司研发生物信息学软件。 而且数据量如此之大，部分是由于思维方式已经从数据的生成转变为数据的分析，美国休斯敦市德克萨斯大学健康科学中心生物医学信息学系副教授W. Jim Zheng表示。现在，更简单划算的工具促生了更多的数据，因此就更需要有专家能够以一种方式理清堆积成山的信息，让其对科学家和临床医生具有意义，并最终惠及客户和患者。 产业界和学术圈对于生物信息学的认知上......阅读全文
《Nature－Biotechnology》：新型生物信息学工具使转录组形象化
目前，日本RIKEN生命科学技术中心开发出一种免费可用的新型生物信息工具——ZENBU，可让研究人员快速轻松地对大规模下一代测序实验中产生的大量基因组信息，进行整合、形象化和比较分析。 下一代测序(Next-generation sequencing)技术已经彻底改变了功能基因组学，例
Nature－Genetics：细胞重编程迎来革命性生物信息学工具
Duke-NUS医学院、Bristol大学、Monash大学和RIKEN的研究团队开发了一个革命性的计算工具，能够准确预测将一种人类细胞转变为另一种类型所需的细胞因子。这项研究发表在一月十八日Nature Genetics杂志上，对细胞重编程和再生医学的进一步发展有重要意义。 我们知道，特定的
2021年度“中国生物信息学十大进展”公布
为推动我国生物信息学的学科发展和创新研究，充分展示和宣传我国生物信息学领域的重大研究成果，《基因组蛋白质组与生物信息学报》(Genomics, Proteomics & Bioinformatics, 简称GPB)组织评选了2018年度、2019年度和2020年度“中国生物信息学十大进展
安捷伦科技将生物信息学系统扩展为综合生物学套装
2010年 11 月 15 日，北京 — 安捷伦科技公司（纽约证交所：A）今日发布了，这是广泛使用的生物信息学软件的扩展版，能够对多种类型的生物学数据进行可视化和分析。目前 GeneSpring GX 11.5 是首款可同时对外显子芯片、蛋白组学和代谢组学实验进行解读的软件，该工具
陈润生院士等获颁中国生物信息学终身成就奖
9月27日，第九届全国生物信息学与系统生物学学术大会在上海开幕。在为期2天半的会议期间，来自全国各地的700余名专家学者代表，将围绕“新冠病毒研究与转化医学信息学”“单细胞组学分析方法与应用”“人工智能与生物信息学”和“脑科学与生物信息学”等生物信息学诸多传统与新兴领域进行研讨与交流。 中国科
数据无界：共创开放数据空间
8月28日，2024中国国际大数据产业博览会——数据空间国际交流活动在贵阳举办，活动以“数据无界：共创开放数据空间”为主题。海内外多位专家学者和企业代表分别做了主题发言和经验分享，涵盖能源、汽车、金融、跨境、城市治理等多个领域。会上，国家数据局局长刘烈宏表示，国家数据局正在研究推动数据空间试点，以数
院士专家共议：生物信息学的下一个十年
原文地址：http://news.sciencenet.cn/htmlnews/2023/6/503634.shtm“十年来，数学、计算机与生命科学交叉领域发生了显著的变化，如今伴随着大模型、人工智能等给我们提出了巨大挑战，也到了学科必须‘交叉’的时候，这无论对现代科学的发展，还是服务国家战略需求，
《基因组蛋白质组与生物信息学报》影响因子显著提高
在日前举行的第四届中国英文版科技期刊研讨会上，中国科学技术信息研究所发布了《2007年版中国英文版科技期刊引证报告》。根据这一报告提供的数据，中科院北京基因组研究所主办的《基因组蛋白质组与生物信息学报》（Genomics, Proteomics & Bioinformatics，简称GPB）的
“生物信息学基础信息整编”项目实施方案论证会在沪举行
“生物信息学基础信息整编”项目实施方案论证暨启动会在沪举行 6月2日，国家科技基础性工作专项重点项目“生物信息学基础信息整编”项目实施方案论证暨启动会在上海生科院举行。科技部基础研究司司长张先恩、综合与基础性工作处处长沈建磊，上海市科委施强华副巡视员，中科院计划财务局副局长
生物信息学在人类基因组计划中的应用
生物信息学是当前生物学领域的研究热点，预计在未来的若干年它将变得越来越重要、越来越引起人们的重视。近期任务由于未来几年蛋白质和核酸的测序数据将以指数方式增加，近期生物信息学将在以下几方面迅速发展：大规模基因组测序中的信息分析大规模测序是基因组研究的最基本任务，它的每一个环节都与信息分析紧密相关。目前
首届科学数据大会探讨“科研大数据与数据科学”
2月24日，首届科学数据大会在中国科学院大学国际会议中心举行。包括中科院院士郭华东、陈润生，中国工程院院士汪懋华在内的400多名专家、青年科研人员参会。 中科院副院长、国际科技数据委员会(CODATA)中国全国委员会主席丁仲礼向会议发来贺信。他在贺信中表示，科研大数据和数据科学的作用越来越
定性数据和定量数据的区别
1、定义不同定量分析是依据统计数据，建立数学模型，并用数学模型计算出分析对象的各项指标及其数值的一种方法。定性分析则是主要凭分析者的直觉、经验，凭分析对象过去和现在的延续状况及最新的信息资料，对分析对象的性质、特点、发展变化规律作出判断的一种方法。2、所依赖的哲学体系不同作为定性数据，其对象是客观的
定性数据和定量数据的区别
1、定义不同定量分析是依据统计数据，建立数学模型，并用数学模型计算出分析对象的各项指标及其数值的一种方法。定性分析则是主要凭分析者的直觉、经验，凭分析对象过去和现在的延续状况及最新的信息资料，对分析对象的性质、特点、发展变化规律作出判断的一种方法。2、所依赖的哲学体系不同作为定性数据，其对象是客观的
定性数据和定量数据的区别
1、定义不同定量分析是依据统计数据，建立数学模型，并用数学模型计算出分析对象的各项指标及其数值的一种方法。定性分析则是主要凭分析者的直觉、经验，凭分析对象过去和现在的延续状况及最新的信息资料，对分析对象的性质、特点、发展变化规律作出判断的一种方法。2、所依赖的哲学体系不同作为定性数据，其对象是客观的
组学期刊三巨头：《基因组、蛋白质组与生物信息学报》
近年来GPB的中国风封面 冯丽妃摄 从编委到现任执行副主编，美国费城儿童医院和宾夕法尼亚大学教授邢毅与《基因组蛋白质组与生物信息学报》（Genomics, Proteomics & Bioinformatics，以下简称GPB）期刊结缘已近10年。前些年，该刊编辑部不时找他约稿子，以解“缺米之炊”
大数据能否破解数据造假难题？
林宣雄，1962年9月生，江苏宜兴人，西安交通大学环保大数据研究中心主任。1998年获陕西省优秀青年科技工作者称号，1999年主持研发的“国家环境监理信息系统”被确定为国家级火炬计划项目，同年获省优秀软件人才称号；2003年获首届省优秀青年科技创新奖；2008年承担环境保护部节能减排核心重大软件
分析数据的处理——可疑数据的取舍
1. Q-检验法 （3~10次测定适用，且只有一个可疑数据） （1） 将各数据从小到大排列：x1, x2, x3……xn ; （2）计算 （x大-x小）, 即 （xn -x1）; （3）计算 ( x可-x邻), （4）计算舍弃商 Q 计 =ô x可-x邻ô/ xn -x1
直读光谱软件在查找数据时弹出数据
WinOE: Information! Maxmumdisplay limit has been reached.答：解决技巧：方法一：打开“我的电脑”C：/ARL-DATA/RESULTS将数据剪切到新建文件夹中退出即可；方法二：WinOEUtilitiesDatabases Res
《中国科学数据》：从根源唤醒沉睡的数据
近年来，因“原始数据丢失，工作无法重复”造成的撤稿事件屡见不鲜。 2020年1月，2018年诺贝尔化学奖得主Frances H. Arnold撤掉了2019年5月发表在《科学》上的一篇论文，原因是缺失了关键的原始数据，致使研究成果无法重复。 “只发表论文不公开研究数据，可能会导致科学研究
月桂酸的分子数据和计算数据
分子数据1、 摩尔折射率：59.202、 摩尔体积（m3/mol）：221.23、 等张比容（90.2K）：531.34、 表面张力（dyne/cm）：33.25、 极化率（10-24cm3）：23.47计算数据1、 疏水参数计算参考值（XlogP）：4.22、 氢键供体数量：13、 氢键受体数量：
《基因组蛋白质组与生物信息学报》：蛋白质组学技术面临
《基因组蛋白质组与生物信息学报》：蛋白质组学技术面临挑战 2003年4月人类基因组图谱基本绘制完成，但对基因的调节与功能问题仍未能解读。由于基因的功能主要是通过其编码的蛋白质来实现，蛋白质才是生命活动真正的执行者，所以越来越多的科学家致力于蛋白质的研究，试图找出人类疾病的致病机理，最终解决人类
中国本土期刊《基因组蛋白质组与生物信息学报》被SCIE收录
由中国科学院主管、中国科学院北京基因组研究所和中国遗传学会主办的英文期刊Genomics, Proteomics & Bioinformatics（简称GPB，中文名《基因组蛋白质组与生物信息学报》，ISSN 1672-0229，CN 11-4926/Q）于2017年8月被科睿唯安旗下的Scie
“计算生物学与生物信息学术研讨会”在基因组所召开
随着生命科学研究及基因测序等相关技术的飞速发展，计算生物学的重要性和复杂性在当前生物学数据量的不断增长中日益显现，并逐渐成为现代生物学研究的核心方法之一。为了推动国内相关研究单位间计算生物学和生物数据库等领域的交流与合作，10月27日至28日，中科院北京基因组研究所召集国内外众多
蛋白质组结果一般需要做哪些方面的生物信息学分析？
目前一般文献中的分析主要为维恩图分析、热图分析、火山图分析、层次聚类分析、蛋白质功能分析（GO分类为主）、蛋白质所属代谢通路富集分析（基于KEGG的pathway）、差异蛋白互作网络构建、转录因子预测等方面。其它一些比较特异的高级分析包括多组数据关联分析、多pathway延伸分析、磷酸蛋白激酶预测分
推荐一些评估－Immune－Cell－Atlas－基准数据集的数据偏差的资源
以下是一些可能有助于评估 Immune Cell Atlas 基准数据集的数据偏差的资源： 1. 相关的学术文献：在学术数据库（如 PubMed、Web of Science 等）中搜索关于 Immune Cell Atlas 数据集的研究论文，特别是那些专注于数据质量评估和偏差分析的研究。 2.
探头数据
技术数据 化学环境 光纤套管材料探头端部材料环氧树脂弱酸 石英/石英 +-ME -MS -PEEK -PVC ±+++316不锈钢PEEKPTFEHastelloyÒ C276镍合金-++++强酸 石英/石英 +-ME-MS-PEEK-PVC -±+±
能源常用数据
一）几种燃料所含的能量 1吨（t）煤:7560千瓦小时（kWh)=27.2吉焦耳（GJ） （1吉焦耳=109焦耳） 1立方米（m3）原油：10070千瓦小时（kWh）=36.3吉焦耳（GJ） 1立方米(m3木柴：1240千瓦小时(kwh)=4.5吉焦耳(GJ) 1吨(t)液化石油
福建上杭中止公布检测数据－污染数据算机密？
紫金矿业污水事故发生后，福建上杭县环境监测站中止公布可能致癌的六价铬检测数据。上杭县官员表示，这个数据是机密（央视7月22日报道）。 按照《环境信息公开办法》，企业排放数据要长期公开，企业污染环境数据，环保部门也应该公开。但上杭县官方却违反法律与自身职责，打着“机
闵应骅：大数据时代聊聊小数据
现在好像人人都爱说“大数据”，就像平时我去开会，不是用大数据分析这个，就是用大数据建构那个。可是我最近看《美国计算机学会通讯》（CACM）上面提到了几次小数据，我觉得大家也有必要了解一下这个有趣的概念。 什么是小数据？小数据就是个体化的数据，是我们每个个体的数字化信息。比如我天天都喝一两酒，突
中科信息取得基于元数据的数据存储专利
2024年9月4日，中科院成都信息技术股份有限公司取得一项名为“基于元数据的数据存储方法、装置、设备及存储介质“，授权公告号CN117312319B，申请日期为2023年10月。 专利摘要显示，本申请公开了一种基于元数据的数据存储方法、装置、设备及存储介质，所述数据存储方法包括以下步骤：获取统