发布时间:2015-06-23 14:25 原文链接: Nature发布CRISPRCas9重大新成果

   来自麻省总医院的一个研究小组找到了一种新方法来扩大强大基因编辑工具——CRISPR-Cas9 RNA引导核酸酶的使用及提高其精确性。他们的研究论文在线发表在6月22日的《自然》(Nature)杂志上。

  在这篇Nature文章中,研究人员描述了一种演化版本的DNA切割酶Cas9。相比于迄今为止使用的自然形式的Cas9,演化版本的Cas9能够识别前者无法靶向的不同范围的核酸序列。

  论文的主要作者、麻省总医院分子病理学部研究人员Benjamin Kleinstiver博士说:“在我们的论文中我们证实了采用我们设计改进的新的Cas9变体,现在可以靶向过去用野生型Cas9无法改造的人类和斑马鱼基因。这将使得研究人员能够靶向各种基因组中扩大范围内的一些位点,这对于需要高度精确靶向DNA序列的一些应用将会有用。”

  CRISPR-Cas9核酸酶是由细菌Cas9酶和一段与DNA靶序列相匹配的、20个核苷酸的短RNA分子所构成。除了RNA/DNA匹配,Cas9酶还需要识别靶DNA附近、称作为前间区序列邻近基序(protospacer adjacent motif,PAM)的一段特异核苷酸序列。最常用的Cas9来自于酿脓链球菌,被称作为SpCas9。SpCas9可以识别任何核苷酸后面有两个鸟嘌呤DNA碱基的PAM序列。这将SpCas9靶向的PAM序列局限为必须包含两个连续鸟嘌呤的DNA序列。

  为了解决这一限制,麻省总医院研究小组建立了一个工程系统,使得他们能够快速地演化SpCas9识别不同PAM序列的能力。通过收集随机突变的SpCas9变体,他们鉴别出了使得SpCas9能够新PAM序列的突变组合。这些演化变体基本上让SpCas9可以进行靶向基因编辑的位点范围扩大了一倍。

  他们还意外地发现了一种更少可能诱导出脱靶基因突变的SpCas9变体。新论文的资深作者、麻省总医院病理科副主任J. Keith Joung曾在其领导的2013年的一项研究中描述了CRISPR-Cas9核酸酶有时会生成脱靶基因突变这一问题。“应将这一特异性增高的改良SpCas9变体立即提供给当前采用野生型SpCas9的研究人员,这应该会减少不必要脱靶突变的频率,”Joung说。

  Joung补充道:“或许更为重要的是,我们的研究发现第一次证实了可以通过定向的蛋白质演化来改变SpCas9的活性。事实上,我们在论文中证实了存在于另外两种细菌——金黄色葡萄球菌和嗜热链球菌中的Cas9形式也可以在我们的细菌演化系统中发挥功能,表明我们应该也能够改变它们的功能。对于Cas9可靶向的PAMs的范围,这项研究工作还只是了解了皮毛,我们相信通过相似的方法还可以改变Cas9酶其他的有用特性,使得有可能定制化许多重要的特性。”

相关文章

《自然·癌症》重磅综述:抗体靶向药物全攻略!

提问:对抗癌症的第一种精准靶向药物,属于哪一类药物呢?答案:1997年进入临床的利妥昔单抗。自此之后的二十多年里,凭借高特异性、高亲和力、长半衰期和强力杀伤等众多优势,基于单克隆抗体的靶向药物一个接一......

浙大科研团队发明无人机靶向急救给药系统

 急救信号的接受、急救目标的识别定位以及安全无碰轨迹的生成。(浙大供图)对于患有如心肌梗塞、严重低血糖、严重外伤等突发疾病的患者来说,如果不及时开展治疗,患者面临着极大的死亡风险,因此及时给......

细胞核定位的肿瘤靶向多肽进行功能成像和靶向药物递送

靶向多肽在肿瘤早期检测、术中微小病灶描绘以及控制显影剂全身毒性等方面具有较大临床意义。在许多临床前研究中,靶向多肽已经被成功验证用于肿瘤成像和手术导航的分子探针配体。比如,通过结合肿瘤细胞表面的αvβ......

单细胞拉曼结合靶向宏基因组揭示土壤活性抗生素耐药组

抗生素耐药性(AMR)在人类、环境和动植物间的传播,加剧全球“OneHealth”的负担。土壤是“OneHealth”的关键环节之一,所携带的抗生素耐药性可通过食物链等方式转移至人类而带来健康威胁。土......

孢粉证据揭示江南从荒漠到森林的演变过程

江南地区大致位于北纬30度附近,属于副热带高压的控制范围。纵观全世界同纬度地区,由于常年受副热带高压控制,降水稀少,大部分地区被沙漠覆盖。然而,奇妙的是,进入同纬度的我国江南地区,世界却仿佛变了一番模......

深度学习实现蛋白质序列高成功率从头设计

中国科学技术大学生命科学与医学部教授刘海燕、副教授陈泉团队与信息科学技术学院教授李厚强团队合作,开发了一种基于深度学习为给定主链结构从头设计氨基酸序列的算法ABACUS-R。经过实验验证,ABACUS......

猴痘基因组研究公布:14种序列皆来源这里

对来自正在进行的全球爆发的猴痘病毒(MPXV)基因组的分析发现,这些样本聚集在一起,表明它们的来源单一。根据世界卫生组织的数据,从今年年初到6月中旬,已有2100多例经实验室确诊的猴痘病例,其中大部分......

光免疫疗法可“点亮”并清除癌细胞

一些肿瘤非常接近身体的重要器官,为避免治疗时损害身体健康部位,开发新的癌症治疗方法至关重要。据英国《卫报》近日报道,一个国际科研团队成功开发出一种革命性的疗法,可以“点亮”并清除微小的癌细胞。这一突破......

斑鳖的全基因组序列解析:其与中华鳖亲缘关系密切

记者12日从中国科学院昆明动物研究所获悉,该所和长沙生态动物园合作,成功组装出了全球最濒危龟鳖类物种斑鳖的高质量参考基因组序列,并解析其适应性进化基础。研究人员发现,斑鳖与中华鳖亲缘关系密切,然而在5......

Nature:同时靶向CDC7和CDK1有望更有效治疗癌症

在一项新的研究中,来自美国威尔康乃尔医学院和丹娜法伯癌症研究院的研究人员发现一种长期以来被认为在细胞分裂过程的早期发挥着重要作用的蛋白---CDC7---实际上可以被另一种名为CDK1的蛋白取代。这一......