发布时间:2018-02-01 10:24 原文链接: 新工具可计算生物医学论文可重复性得分

  科学界正在寻找新工具衡量已发表研究成果的可再现性,因为人们担心许多研究无法独立再现。

图片来源:National Eye Institute, National Institutes of Health

  1月19日公布的一个新的在线工具可通过分析已发表论文的引文数量,衡量该论文可再现性。

  这个软件出现得可谓正当其时,很多证据已经给科学界和期刊行业敲响警钟,它们表明许多已发表文章的研究结果是不可重复的,为此科学界正在努力寻找可靠的方法来评估它们是否可以再现。

  新工具由美国康涅狄格州纽黑文市Verum分析公司开发,它生成了一个叫作r-因子的指标,该指标依据其他证明或驳斥其研究结果的研究数量,来说明一篇期刊文章的可再现性。但r-因子指标却引来了学者的大量批评,他们认为这种相对简单的方法可能不足以解决衡量可重复性的多方面问题。

  对新工具的初步反馈表明,Verum公司并没有完全消除这些担忧。该公司开发者承认新工具仍然存在局限性;他们表示开放该工具的目的是接受相关反馈,以获得关于其工作效果以及如何改进的建议。Verum公司自愿开发了该工具,其联合创始人Josh Nicholson说,他们希望公开该工具的初步版本能吸引潜在的投资人助力改善它。

  Verum去年8月在一篇预印文本中报告了该工具基于r-因子的方法,并在新工具中对其进行了改进。它仅依赖于受欢迎的生物医学搜索引擎PubMed网站上可免费获取的研究论文的数据。

  在开发之初,Nicholson和同事手动分析了4.8万个引用其他已发表文章的论文文本的片段。Verum和同事将每个片段分别归类为“证实、反驳或是提及”其他的文章。然后,Verum利用这些分类来训练一个算法自动识别样本群之外的每类片段。

  基于约1万个摘录的片段样本,Verum公司的开发人员称,新工具可以在93%的情况下对段落进行正确的分类。与证实或反驳性的引用片段相比,它能更准确地检测到“提及”其他文章的引用,因为证实或反驳类的样本更少。分析发现,绝大多数文章都提到了以前的研究,但却没有证实或反驳它们的主张;只有约8%的引用是证实性的,而反驳性的约有仅1%。

相关文章

上海发文!这些高端生物制造产业迎利好

上海市人民政府办公厅印发《上海市加快合成生物创新策源打造高端生物制造产业集群行动方案(2023-2025年)》,方案指出要持续强化长三角区域产业链供应链创新协同,促进产业链上下游企业多方联动,开展以产......

取消论文发表硬性规定,摒弃“快餐式”研究

近年来,已有多所“双一流”建设高校取消了博士研究生学位申请中对发表学术论文的硬性规定。为何要出台这样的政策,博士生们有何反应?对于博士生培养而言,发表论文究竟能起到怎样的作用?不再硬性要求发表论文,意......

故意的还是不小心?诺奖得主被曝14篇论文数据异常

ThomasC.Südhof于2013年与JamesRothman和RandySchekman共同获得诺贝尔生理学或医学奖,以表彰他们发现了调节细胞内主要运输系统——囊泡运输的机制的突出贡献。在202......

用科学挑战《科学》:百位师生四年磨一剑为中国诚信正名

“为了祖国的荣誉,可以来一场复制实验。”2019年6月,《科学》发表了一篇题为《全球公民诚信度》的研究,中国在40个国家中排名最末。而衡量诚信的标准,只有捡到钱包后是否用电子邮件联系失主这一条。这一结......

审稿一拖9个月,把人“等疯”!该放开“一稿多投”了?

一篇文章一审就是好几个月,甚至一两年的情况也时有发生。有些人因为论文发表太慢而错失职业生涯中重要的晋升机会,但就算投出去“石沉大海”也得等着,毕竟禁止“一稿多投”的规则还在,谁也不想被扣上“学术不端”......

爱“迟到”的诺贝尔奖让科学家获得认可的道路越来越长

近日,2023诺贝尔奖揭晓。能够获得这项一年一度的世界上最负盛名的科学奖项,是对获奖者努力的最大认可。但是有研究发现,这种“认可”到得越来越迟了——几乎一半的获奖者从做出有诺贝尔价值的发现到获得该奖项......

原核短Ago系统在病毒入侵后所发生变化获揭示

核糖核酸诱导的转录后基因调控在生命个体抵御外源入侵的过程中起到至关重要的作用。自然界中的生命体无时无刻都需要应对各种外部入侵,如细菌、病毒等。为了应对这些入侵,生命体的细胞会产生一种叫做核糖核酸的分子......

mRNA疫苗研发者获得诺贝尔奖,基础科学研究开创科技发展新空间

10月2日,2023年诺贝尔生理学或医学奖评选结果公布。美国匈牙利裔科学家卡塔琳·卡里科和德鲁·魏斯曼因为发明利用碱基修饰的方法来制备安全有效的mRNA疫苗而共同分享这个殊荣。mRNA疫苗技术获得诺贝......

刚刚!2023年诺贝尔生理学或医学奖揭晓mRNA疫苗再掀热潮

北京时间10月2日下午17点45分,2023年诺贝尔生理学或医学奖获奖者名单揭晓:KatalinKarikó和DrewWeissman,他们在核苷碱基修饰方面的发现,使新冠肺炎mRNA疫苗的研发成为可......

9月份生命科学领域掀起投融资狂潮,40余家企业完成数十亿融资!

在9月份,生命科学领域迎来了一场投融资的狂潮,众多企业纷纷参与其中。这一领域的创新和发展得到了全球范围内的广泛关注和认可,吸引了大量的资本和资源,40余家企业完成数十亿融资!生命科学涵盖了从生物大分子......