发布时间:2018-02-09 14:19 原文链接: 华人研究组Nature解析“从头开始的DNA甲基化”

  加州大学河滨分校的一个研究小组解析了在DNA甲基化过程中起关键作用的一种酶的晶体结构,这对于了解“从头开始的DNA甲基化”具有重要的意义。

  这一研究成果公布在2月7日的Nature杂志上。由加州大学河滨分校的宋继奎(Jikui Song,音译),以及王钢(Gang Greg Wang,音译)领导完成。

  DNA甲基化会改变基因表达,这种基本的细胞作用机制对植物,动物和人类的演化具有重要意义。研究发现DNA甲基化能调节基因组稳定性和细胞分化。在人体中,甲基化发生错误与各种疾病,包括癌症有关。

  在哺乳动物中,DNA甲基化最初是由两种相关酶:DNMT3A和DNMT3B在生殖细胞发育和早期胚胎发育过程中建立。理解DNA甲基化如何“从头开始”的并不容易,其中一大挑战就是解析这些酶的结构。

  在这篇文章中,加州大学河滨分校的研究人员获得了结合了底物的DNMT3A晶体结构。这一突破揭示了这种酶如何识别和甲基化它的底物的重要信息。

  “这个结构揭示了DNMT3A分子如何靶向同一个DNA分子上相邻的两个底物位点的过程。我们的工作提出了从头DNA甲基化的第一个结构性观点,并且为了解DNMT3A突变如何影响癌症,如急性骨髓性白血病提供了模型,这些研究为剖析DNMT3B的功能提供重要的见解,”宋博士表示。

  了解DNMT3A的结构,能帮助科学家调控DNA甲基化含量,基因表达和细胞分化,所有这些都与疾病相关。

  “这对于癌症长期治疗意义尤为重大。”

  同时,这项研究也解释了为何哺乳动物的DNA甲基化主要发生在“CpG dinucleotides”上。

  “科学家们并不清楚为什么哺乳动物的DNA甲基化主要发生在CpG位点,而此前我们对新生DNA甲基化的理解纯粹是基于计算机模拟的,不能可靠地解释DNMT3A是如何工作的。DNMT3A如何成功地与其底物结合,这也是个谜。这项最新研究解析了DNMT3A-DNA复合物结构,解决了所有这些问题,对如何生成特定的DNA甲基化模式提供了新的见解。”

  由于难以产生稳定的酶-底物复合物,DNMT3A结构与底物的研究一直难以进行。

  为了克服这一挑战,这些研究人员成功地开发了一种方法可以捕获DNMT3A-底物复合物的反应中间体,并通过X射线晶体学解析了结构。

相关文章

最新发现DNA甲基化诱导的脂质代谢功能障碍可以加速衰老

表观遗传学改变和代谢功能障碍是衰老的两个标志。然而,它们之间在调节衰老过程中的相互作用机制仍不清楚。近期,来自我国科学院动物研究所、南方科技大学、澳门科技大学等单位的研究团队在《SignalTrans......

我国首次发现双生病毒逃逸DNA甲基化的新机制

近日,中国农业科学院植物保护研究所作物病原生物功能基因组研究创新团队联合国内其他科研单位,首次发现植物病毒可以激活植物的DNA主动去甲基化机制来逃逸植物DNA甲基化介导的防御反应,相关研究结果在线发表......

我国研究团队解析植物中独特的双链RNA合成机制

转座子(transposon)最早由美国遗传学家BarbaraMcClintock在玉米中发现,在细菌、病毒以及真核生物的基因组中广泛分布。转座子类似内源性病毒,能够在宿主基因组中“复制和粘贴”自己的......

MCTASeq检测DNA甲基化实现胃癌早期无创诊断

北京大学生物医学前沿创新中心(BIOPIC)、北京未来基因诊断高精尖创新中心(ICG)汤富酬教授/文路副研究员团队与北京大学第三医院普外科付卫教授团队合作,利用团队之前开发的甲基化CpG短串联扩增与测......

分子植物卓越中心揭示新的RdDM通路的分子机制

DNA甲基化是一种保守的表观遗传修饰,对基因表达和基因组稳定性具有重要意义。RNA介导的DNA甲基化(植物RdDM途径)是植物小RNA参与表观调控的重要方式,其需要两个植物特有的RNA聚合酶——Pol......

PNAS发文:多倍体农作物为何具有广泛适应能力

近日,南京农业大学在PNAS上发表了最新研究文章,从DNA甲基化和转录水平揭示了基因组多倍化如何增强水稻在盐胁迫环境中的适应能力。基因组多倍化(全基因组加倍)在植物的进化过程中普遍发生。许多植物包括重......

Nature:组蛋白标记H3K36me2招募DNMT3A并影响基因间DNA甲基化

催化DNA中CpG甲基化的酶,包括DNA甲基转移酶1(DNMT1)、DNA甲基转移酶3A(DNMT3A)和DNA甲基转移酶3B(DNMT3B)。这些DNA甲基转移酶对于哺乳动物组织发育和体内平衡是必不......

植物所解析RNA甲基化调控果实成熟的作用机制

DNA甲基化(5mC)和RNA甲基化(m6A)是两种重要的核酸修饰,在基因表达调控中发挥重要作用并参与诸多生物学过程。然而,这两种核酸修饰之间是否存在内在关联性却不清楚。近日,中国科学院植物研究所秦国......

卵子独特表观遗传状态机制获揭示

中科院生物物理研究所朱冰课题组发现了卵细胞基因组DNA甲基化水平正常建立的首个保障因子Stella。相关论文近日刊登于《自然》。雌性哺乳动物的一生中只能提供有限数目的卵子。卵子的DNA甲基化水平很低,......

华人学者发3篇《自然》揭示多项重要生物学发现

今日,顶尖学术期刊《自然》在线发表了最新一批论文,我们很高兴地看到,其中有3篇重要论文来自华人学者的科研团队。值得一提的是,这三篇论文的作者名单都为“全华班”。在今天,我们也将为各位读者介绍这3篇论文......