发布时间:2012-07-10 00:00 原文链接: 细胞凋亡吞噬研究获进展

  6月15日,Genes & Development杂志发表了中科院生物物理研究所刘迎芳实验室和北京生命科学研究所(NIBS)王晓晨实验室的合作研究成果—— Structural Study of TTR-52 Reveals the Functional Mechanisms of a Bridging Molecule in Apoptotic Cell Engulfment。该工作通过结构和功能研究,揭示了在秀丽线虫凋亡细胞的清除过程中,桥联分子TTR-52介导吞噬细胞识别凋亡细胞的作用机制。

  细胞凋亡后需要被及时清除以维持机体平衡。在线虫中,TTR-52是一个介导凋亡细胞和吞噬细胞的桥联分子,通过识别凋亡细胞上外翻的磷脂酰丝氨酸( PS )来识别凋亡细胞,同时TTR-52也可以结合吞噬细胞上的受体CED-1,进而介导凋亡细胞的吞噬。从序列分析来看,TTR-52类似于 transthyretin,一种甲状腺激素结合蛋白。但是过去报道的transthyretin都不具有这种介导凋亡细胞吞噬的功能。为了研究TTR- 52的分子机制,研究人员希望得到TTR-52的晶体结构。在研究初期,重组表达的TTR-52蛋白非常容易聚集成不均一的高聚体,这给结晶工作带来很大的困扰。通过Alanine scanning方法筛选大量的突变体,研究人员最终发现一个突变体可以形成少量稳定的二聚体,经过晶体筛选,最终解析了这个突变体的晶体结构。并以此突变体为依据,构建了野生型蛋白的结构模型,并进行了功能分析和实验印证。

  晶体结构显示,TTR-52分子形成一个开放的β桶结构,与含有8个β折叠片的β桶和β三明治结构都不同,TTR-52由7个β折叠片组成。TTR-52的C端因为缺少一个β折叠片,造成部分疏水核心暴露,这种独特的结构特征暗示其具有生物学意义。随后的体内和体外实验都证明,TTR-52利用该疏水区域与吞噬受体CED-1结合。此外,TTR-52的第二、第三个 loop区域形成一个杯装的正电区,这和transthyretin很不同,却和其他PS结合蛋白如PKCα, TIM4具有类似之处。经过突变实验,研究发现TTR-52的这两个loop区域可以通过阳离子介导PS的结合,从而识别凋亡细胞;此外,晶体结构中还观察到TTR-52可以形成背靠背的二体,在该二体界面上进行突变可以将二体打开,但是该单体蛋白介导凋亡细胞吞噬的功能大大下降,该结果暗示由二体作为基本单元可能是TTR-52发挥功能的形式。

  该研究不仅揭示了线虫细胞凋亡中TTR-52介导吞噬细胞识别凋亡细胞的作用机制,而且对了解其他高等生物中桥连分子介导的凋亡细胞吞噬机制也有一定指导作用。

  中科院生物物理所康彦勇博士、梁欢欢博士和NIBS赵东风博士为本文的共同第一作者。王晓晨博士与刘迎芳研究员为共同通讯作者。此外,其他一些人员也在研究过程中提供了帮助和建议。该项工作得到科技部、基金委、中国科学院及北京市政府等方面的资助。(http://www.ebiotrade.com/)

  PALL鼓励中国科研工作者SCI文章发表活动 30000奖金等着您!

相关文章

重要化学数据库近千个晶体结构可能来自论文工厂

英国剑桥晶体学数据中心(CCDC)收录的近千个晶体结构的数据条目可能是论文工厂的产物,机构已将其标记为可疑条目,并对其进行审查。CCDC是化学家寻求晶体结构信息的一个必查资源库,存放了结晶学领域许多期......

曹雪涛团队的又一新进展,这次瞄向RNA结合蛋白

RNA结合蛋白(RBP)在癌症发展和治疗中发挥重要作用。然而,需要进一步确定可能作为癌症治疗靶点的促肿瘤RBP及其伴侣。2022年7月20日,海军军医大学曹雪涛团队在SignalTransductio......

这个研究团队发现2′3′cGAMP新的结合蛋白

近日,中国科学院上海有机化学研究所蒋洪课题组在CellChemicalBiology杂志上在线发表题为“APhotoaffinityLabelingStrategyIdentifiedEF1A1asa......

背靠背两篇Nature揭示SARSCoV2结合ACE2受体的晶体结构

一种新型高致病性冠状病毒(SARS-CoV-2)自2019年12月以来肆掠全球,应对这一疫情的关键是了解病毒的受体识别机制,调节其感染性、发病机制和宿主范围。而在分子和原子水平了解SARS-CoV-2......

我国学者首获植物漆酶ZmLac3晶体结构

3月2日,国际学术期刊《自然-植物》(NaturePlants)在线发表了题为“Structuralbasisformonolignoloxidationbyamaizelaccase”的研究论文,该......

肖锐教授揭示RNA结合蛋白与转录因子具有广泛的关联作用

越来越多的证据表明,转录控制和染色质活性在很大程度上涉及调节类的RNA,这可能会产生特定的RNA结合蛋白(RBPs)。尽管多个RBP与转录控制有关,但目前尚不清楚RBP如何直接作用于染色质。2019年......

科学家解析结核杆菌转录起始复合物的晶体结构

基因组的遗传信息得以表达,首先需要RNApolymerase(RNAP)以DNA为模板合成RNA。基因转录不仅是基因表达第一步,还是基因表达的主要调控步骤。对RNAP分子机器结构、运行机理以及调控机制......

我国学者成功合成并解析六巯基苯银晶体结构

具有特定的组成和拓扑结构的导电配位聚合物可以用于构建低维导体、二维材料、具有Kagome格子的材料等,从而研究相关的物理现象。同时,导电配位聚合物也可以作为热电材料、透明电极、电化学催化剂、超导材料等......

蛋白复合物Paf1:携带基因致病的奥秘

一个人生病的因素有多种多样,但不外乎于内因和外因两类。内在因素中最根本的就是基因,医学研究表明,所有的疾病或多或少都和基因有一些关联,主要是由于基因表达发生突变造成。基因的表达调控如何控制生物体的发育......

Nature子刊:SLFN蛋白家族被发现20年以来的第一个晶体结构

多家研究机构合作报道了Schlafen(SLFN)蛋白家族被发现20年以来的第一个晶体结构,证实SLFN是一个新型的核酸内切酶家族,通过破坏蛋白翻译机器调控真核生物的翻译进程,能够有效控制HIV病毒的......