发布时间:2012-07-24 09:24 原文链接: 质谱沙龙第三十六期活动报道

  2012年7月21日下午,第三十六期质谱沙龙活动在北京市朝阳医院职业病与中毒医学中心如期举行。来自北京朝阳医院、北京大学人民医院、AB SCIEX公司、中国科学研究院、北京安定医院等二十余名专家、学者、技术工程师参加了本次沙龙活动。本次沙龙涉及生物分析、代谢组学、小分子定性、小分子定量、大分子的应用等方面的内容。

第三十六期沙龙活动现场 分享与倾听

首都医科大学附属北京朝阳医院职业病与中毒医学中心 李惠玲

  李老师首先对北京朝阳医院毒物化学分析实验室做了简单的介绍,其次介绍了ICP-MS同时测定全血中多种元素的方法。

北京朝阳医院毒物化学分析实验室介绍

  北京朝阳医院毒物化学分析实验室从2005年开始建立并运行。希望通过沙龙扩展在毒物化学与分析方面质谱应用的新的思路。

  目前毒物化学分析实验室配备的仪器有GC-MS、ICP-MS、原子吸收分光光度计、原子荧光光度计、紫外-可见分光光度计、微波消解仪等先进的仪器、拥有比较完善的专业队伍。在国内的综合性医院中,朝阳医院的硬件和检测水平位居前列。朝阳医院毒物化学分析实验室可以满足北京地区各级医疗机构和患者毒物检测的需求,并同时承担国家和北京市突发化学品中毒临床救治任务。实验室日常的毒化检测项目包括六个方面:生活中毒、职业接触、意外接触、治疗用剂、代谢疾病的检测、微量元素的检测。检测的化合物包括33种农药类和4种鼠药类物质。

ICP-MS同时测定全血中多种元素

  李惠玲老师作了题为“血清中21种元素的直接进样动态反应池ICP-MS测定”的报告,主要从样品前处理方法、进样方式、内标物、基质、DRC条件的选择的几个方面介绍了ICP-MS同时测定全血中多种元素的具体方法。

  在现代医疗临床及研究中,人体中的微量元素越来越成为人们关心的焦点了,通过血液中元素的检测可以为相应疾病的诊断治疗提供依据。目前广泛用于人体血液中元素检测的仪器主要有原子吸收光谱、ICP-OES,前者由于有相关的行业标准,检测的应用比较多,但检测速度慢,并不适合做多元素同时检测。后者对于有些元素的检测灵敏度比较低,不适合做痕量元素的检测。

  样品前处理方法的选择

  采用简单的硝酸溶液稀释法,将样品稀释后进样检测。实验发现当硝酸浓度大于1%,会造成全血样品中蛋白质破坏产生沉淀,因此采用1%硝酸溶液作为稀释剂。

  进样方式的选择

  为了操作方便并考虑到在线内标加入具有一定的稀释比例(样品进样采用内径为0.38mm的泵管,内标采用内径为0.76mm的泵管,相当于3倍稀释),采用1.5mL的离心管作为容器,分别用微量移液器移取0.5mL待测血清和1.0mL1%硝酸溶液摇匀测定。

  内标物的选择

  对于质量数小于80的元素,李老师在初期设计了采用Sc的内标物,但在实际工作中发现即使是在纯水溶液中,45Sc的离子计数也达到了8000-10000cps,同时在实际血清样品的检测中,离子强度变化较大,样品中Ca、Si等元素含量的不同将导致内标强度的稳定性变差,最后确定了使用Rh作为内标元素,并根据强度的大小将浓度定为2ug/L。对于质量数大于100的元素,考虑的不仅需要内标元素,最好还能消除Hg的记忆效应,因此最后采用Au作为内标元素,浓度为2ug/L。

  基质的选择

  适当浓度的有机溶液对离子的检测具有增敏作用,从实际操作简便性及使用成本考虑,采用无水乙醇作为有机溶剂。样品中也含有大量的有机物,因此通过高浓度的有机溶剂加入可以将标准溶液和样品大致做一个基体匹配,通过实验最后确定乙醇的浓度为2%。

  干扰的消除及动态反应池(DRC)条件的选择

  对于一些元素或离子的检测存在大量的干扰,在实验过程中采用DRC技术消除干扰离子。在DRC中,通入选定的反应气体,气体与干扰离子进行化学反应滞后其质荷比将会发生改变,由此通过四级杆的质量过滤功能将其消除。


北京大学人民医院 赵立波

  北京大学人民医院药剂科的赵立波老师的报告的题目为“代谢组学研究简介及Qtrap用于代谢组学的初步探索”,主要介绍了代谢组学研究的简要情况和Qtrap用于糖尿病代谢组学研究的初探。

  代谢组学的基本概念

  代谢组学研究的对象是一些代谢产物,这些代谢产物以元素组成、院子排列、立体结构和分子结构来区分,检测代谢产物的方法就各不相同。代谢组学是“组学”研究的最终方向,对生物体的代谢情况提供一种由全局向细节的研究思路,是基因组学和蛋白组学的延伸乃至它们在代谢层面上的集合。

  代谢组学各分析流程技术包括样品的提取、样品预处理、化合物的分离、检测及鉴定、数据分析与可视化、建模与仿真。

  代谢组学的研究方法中对于单个细胞或细胞类型的小分子成分采用GC、LC、CE-MS的方法进行分离、检测与鉴定,而对于生物体液和组织进行系统测量和分析时需要采用NMR的方法。这两种分析技术各有优势,前者有较高的灵敏度和缴款的动态范围,但是检测较费时且样品前处理的过程较复杂。后者具有无损伤性、无偏向性的、良好的客观性和重现性、能够高通量检测的优点,但是灵敏度较低,动态范围有限。

  Qtrap用于糖尿病代谢组学研究的初探

  2型糖尿病(DM)是人类最主要的致残和致死因素之一,病因呈高度异质性,受遗传、环境、行为等因素的综合影响。作为一种代谢综合征,糖尿病很难用单一的评价指标和发病机制来反映其发生及变化,同时检测多成分的代谢组学,可以作为研究的手段之一。国外研究发现脂肪酸、色氨酸、尿酸、胆汁酸、溶血磷脂胆碱含量变化有着显著性变化,被认为是2型糖尿病的特征性变化,为如何鉴定漫长且无症状表现的2型糖尿病前期提供了一种有效的方法,对该病早起的诊断和预防有着重大的意义。国内也有大量研究表明甘油三酸酯、脂肪酸和乙酰乙酸这三种小分子代谢物的含量变化具有显著性差异,可能成为糖尿病诊断的潜在生物标记物。

  目前已有的糖尿病代谢组学质谱分析方法具有一定的局限性,研究对象只能是n<50的临床小样本,研究方法缺乏充分证据。

  赵老师讲到,人类已知的小分子代谢物大约有2500种,能被常规仪器检测的大约有1200种,但无法确定其所有的结构;目前国际一流的代谢组学实验室通常能一次性在一个生物样本中同时鉴别出400-600个内源性代谢物。

  仪器日内与日间精密度的考察

  赵老师选择可检出的15种标准物质与2种内标进行精密度的考察,配置混合溶液1/3MIX、1MIX、3MIX,40℃氮气流吹干,用健康人尿液复溶,漩涡振荡10min,转移至EP管13400rpm离心10min,取上清过0.22um水系滤膜,进行质谱分析。分别采用+EMS、-EMS方法检测。结果用MarkerView进行提取,采取外标法与内标法分别进行计算,得到的数据进行日内与日间精密度的计算。

  讨论

  代谢组学研究的对象是相对分子质量1000以下的内源性小分子化合物。人体中各类内源性小分子代谢物有上万种,各种代谢物的浓度范围和物理化学性质差异很大。目前没有一种分析技术对机体中所有的代谢物进行分析。

  人类已知的小分子代谢物约有2500种,能被常规分析仪器检测到的大致有一般,但尚无法确定其所有的结构。

  近年来NMR、MS与多种分离手段联用成为代谢组学中的重要分析工具,目前世界上较好的代谢组学实验室通常能一次性在一个生物样本中同时鉴别出400-600个内源性代谢物,可见代谢组学分析测定方法学还有很大的上升空间。

  关于Qtrap应用于代谢组学的方法学研究,近年来有少量报道。已有的研究均没有体积LS-MS方法的日间变异,也没有选用合适的内标对变异的进行校正,仅仅用于小数量生物标本的测定,难以满足大样本研究的需要。

  赵老师的研究建立了一种基于三重四极杆-线性离子阱杂交质谱技术的代谢组学分析方法,着重对该方法的变异性进行了论证。在选定的色谱质谱条件下,15种内源性代谢物的日内变异小于20%,而日间变异较大,内标的运用对变异的控制无明显改善。LC-QTRAP应用于代谢组学生物标志物的筛选还有很大的改进空间。

  代谢组学是一种半定量的研究方法,注重的是对所有代谢物的检测及其峰强度的比较。赵老师的研究是将低、中、高三种浓度的标准品与健康人尿样混合作为模拟生物样品,检测结果可为代谢组学生物样品的检测提供合理的评价。由于日间变异较大,进行代谢组大样本检测时,分析得到的生物标志物必须通过其他方式进行验证。

,

首都医科大学附属北京朝阳医院药事部 李鹏飞

  北京朝阳医院药事部李鹏飞老师分享了WHO生物分析方法学的相关内容。李鹏飞老师去年和今年参加了WHO有关生物分析的两次培训会。李老师将两次培训的内容总结与大家分享。

  分析方法学的全面确认

  包括五个方面的内容:选择性、残留效应、定量下限、标准曲线、准确性。

  选择性

  要求有六个来源的空白基质,并且空白基质中的响应小于定量下限(LLOQ)的20%,才能认为空白里是没有基质干扰的,否则空白是不合格的。比如做方法学验证时,三条曲线三个空白,可能第二个空白会有小峰,WHO的规定是小峰的面积不能超过定量下限峰面积的五分之一。还提到了代谢物、降解产物和联合给药可能产生的干扰。

  残留效应

  对于残留效应,国内做的比较少,首先保证它不会影响准确性和精密度,先注射高浓度的样本,再注射空白溶液,空白样本出峰要求<20% LLOQ、<5% IS。

  如果无法避免,则应采取具体的应对措施。样本分析中还要避免随机化。

  定量下限

  检测方法能够定量的最小药物浓度必须小于给药后达到的最大浓度的10%,即定量下限(LOQ)小于1/10Cmax。WHO对生物等效性要求较松。

  校准曲线

  与实际样本相同的基质,每个分析批一条标准曲线,确认三条标准曲线。在研究阶段,应在预期浓度范围内进行,建议至少应在浓度范围内选择五个(EMA的规定为六个)浓度进行试验(不包括空白和零点),大于75%的曲线上点合格。必须提交相关系数,回归y截距和斜率。对于校准品相对回归曲线的偏差,应进行分析,以便评估其线性。反向计算浓度的准确度小于15%(LLOQ除外:<20%)。建议在确认过程中使用最新的校准曲线。

  准确性

  应在掺加已知量分析物的样本中来评估准确性/精密度,使用至少3个浓度水平(低、中、高)的结果来评估准确性/精密度。准确性应报告为加样回收率。精密度为变异系数(标准差/平均值)。

  BE研究生物分析分析方法的验证

  局部验证

  如果已验过的分析方法有了轻微的变化,包括生物分析方法转移到另一个实验室,设备、校准浓度范围、储存条件等的变化。重新验证或部分验证的范围应该是合理的,在大多数情况下,就修改问题而言,应提供足够的附加精确度和精密度数据和相关稳定性的数据。

  交叉验证

  如果数据是从不同的研究基地取得的,则应当对所采用的分析方法进行检查验证。例如,样品制备的差异,或使用另一种分析方法。应该在分析研究样品前进行,同组QC样品应以两种分析方法进行分析,两次测量之间的差异不应超过15%。

  临床样本分析的要求

  临床样本分析应在开始采集临床样本之前,对分析方法进行确认。每个分析运行应包含充足的QC样本,此类样本应处于开始、中间和结果等至少3个水平(LQC、MQC和HQC)。在实际开始对临床样本进行分析之前,应预先确定批次的接受和拒绝标准。

AB Sciex公司 李春波

  最后来自AB SCIEX公司的李春波博士为大家带来了题为“SWATH技术与TripleTOF平台”的精彩报告。

       SWATH技术

  SWATH技术是AB SCIEX与Prof.Ruide Aebersold及其团队共同开发的,该技术为蛋白质组学研究带来了一种全新的工作流程。SWATH技术将扫描范围划分为25Dalton为间隔的一系列区间,通过超高速扫描来获得扫描范围内全部离子的所有碎片信息,是MS/MSALL技术的扩展。SWATH技术通过TripleTOF 5600平台实现,可同时提供完整的定量与定性结果,不需要进行方法优化,获得所有化合物的信息,可以对所有化合物进行查询,高分辨率的定量结果减少了潜在的干扰物,定量能力达到三重四极杆质谱的水平。

  李春波博士以地图全貌的方式,来形象地比较SWATH与MRMHR采集模式的不同。MRMHR采集虽然很精细,但却无法让我们看到整个全部的图;而用SWATH采集,首先可以看到全貌图,然后可以找出和MRMHR采集同样的详细图谱。SWATH的采集方法得益于AB SCIEX TripleTOFTM技术的超高采集速率和高分辨、高质量准确度;在一次分析中,可鉴定和定量样品中的几乎所有肽段和蛋白质。

MRM、MRMHR以及SWATH间对比图

       TripleTOFTM 5600/+系统应用于蛋白质组学

  (1)具有高灵敏度的特点,更多低丰度的蛋白质能被检测和鉴定出来;

  (2)SmartSpeedTM 100Hz谱图采集频率。定性时,单位时间内,相比任何质谱,IDA更多时间用在MS/MS上,保证质谱对复杂样品的挖掘深度,提高对复杂样品检测的实际灵敏度,从而鉴定到更多的蛋白质。定量时,不论MS或者MS/MS,都能获得更多的数据点,使得定量数据更可靠;

  (3)高分辨率(>40,000),无论是低分子量区和高分子量区,还是低扫描速度和高扫描速度下,都能达到高分辨率,满足蛋白质组学中对分辩率的绝大多数要求,对从头测序、iTRAQ提供最好的支持;

  (4)EasyMassTM质量准确度(<1ppm),MS和MS/MS都能达到,提供更可信的蛋白质鉴定系统;

  (5)定量线性动态范围>4个数量级,是所有高分辨率质谱中定量能力最强的。

       TripleTOFTM 4600

  TripleTOFTM 4600 在2012年全球首发于北京,是高性价比质谱平台,用于常规性/定量分析,以无与伦比的高采集速度,获得高灵敏度、高分辨率、高准确度的一级和二级质谱数据。

  (1)具有AB SCIEX公司优势的离子源和通路设计,其一级MS和二级MS/MS均具有超高灵敏度;

  (2)具有高分辨率:在TOF MS和MS/MS扫描模式下>25,000;

  (3)快速数据采集:高达100 Hz的采集速度,或在IDA(智能实时数据过滤)模式下每秒采集多达50张二级MS/MS 谱图;

  (4)具备高质量准确度,和简洁质量校正能力,在分析检测复杂蛋白质组时<1ppm RMS;

  (5)宽动态范围确保出色的定量性能,线性动态范围高达4个数量级。

  (6)TripleTOFTM 4600系统也具有三种工作模式,分别为定量分析模式、定性分析模式、全景分析模式,具备同时定性和定量的完美性能。该系统最大的亮点是它可以在一次运行中鉴定更多的蛋白,并将这些信息转化为靶蛋白质组学分析,重新分析样品而无需切换平台。使用4600系统,研究人员将大大简化他们的工作流程,因为对大量生物样本的定性和定量分析实验可以再同一系统上完成。

  更多产品信息链接

  TripleTOF™ 4600:高通量精确质量定性定量的主力机型

  AB SCIEX Triple TOF™ 5600新产品发布会在京隆重举行

相关文章

朱正江:软件平台自主创新破冰代谢组学研究难点

近期,中国科学院上海有机化学研究所生物与化学交叉研究中心朱正江研究员、刘南研究员课题组合作的最新学术成果发表在《自然·通讯》期刊(NatureCommunications),应用基于稳定同位素标记的非......

质谱技术实践与应用研讨会|一文看懂什么是代谢组学!

代谢组学是系统生物学的重要组成之一,与基因组、转录组、蛋白组共同解释了生命体从微观DNA分子到分泌小分子代谢物的整个变化过程。代谢组学侧重体现机体正在发生的事情,与表型关系更加紧密。代谢组学通过检测生......

布鲁克发布全新空间单细胞代谢组学研究策略

摘要*创新的无偏原位空间单细胞代谢组学(SSCM)能够以单细胞分辨率实现高通量代谢组织样本表征;*基于timsTOFfleXMALDI的全新5μmmicroGRID技术可在大视场内提供几乎无伪影的小分......

通过ZenoSWATHDIA,SCIEX宣布推出下一代数据独立采集技术

近日,丹纳赫公司(NYSE:DHR)旗下公司SCIEX推出ZenoSWATHDIA,这是生物标志物发现和翻译工作流程的重要一步。ZenoSWATHDIA是样本的最终数字记录,可以使研究人员发现更多的潜......

利用精确血浆代谢组学方法揭示衰老相关代谢特征

过去二十年里,代谢(脂质)组学研究得到了迅速发展。液相色谱与高分辨质谱联用(LC-HRMS)技术是目前内源性代谢物最常用的手段,然而困扰LC-HRMS技术的分析精度和结构鉴定的瓶颈问题仍然存在。尤其是......

一文读懂|西湖大学郭天南:多组学对新冠的研究与挑战

编译|陆恬,钱丽琴作者|陆恬,王瑛睿,郭天南COVID-19仍在全球肆虐,且似乎不会从地球消失。近日,西湖大学郭天南团队在CellReportsMedicine发表评述,在这篇评述中,郭天南等人讨论了......

2022代谢组学前沿论坛3月25日多位大咖聚焦前沿应用

代谢组学是生命科学和健康研究领域的重要方法和手段,质谱分析技术是代谢组学研究重要分析平台,在农业、环境、肿瘤、心血管疾病、代谢类疾病及肠道微生物相关的研究领域具有广泛的应用。2022年3月25日,由苏......

CASMS分论坛:质谱在调节生物分析中的应用

分析测试百科网讯美国东部时间2021年8月9日-13日,首届美国华人质谱学会(CASMS)学术研讨会暨展览会在Gather.Town隆重举行。在9日分论坛“MassSpectrometryinRegu......

CASMS分论坛:代谢组学方法与应用研究进展

分析测试百科网讯美国东部时间2021年8月9日-13日,首届美国华人质谱学会(CASMS)学术研讨会暨展览会在Gather.Town隆重举行。在11日“MetabolomicsMethodsandAp......

CASMS分论坛:质谱技术创新促生物发现

分析测试百科网讯美国东部时间2021年8月9日-13日,首届美国华人质谱学会(CASMS)学术研讨会暨展览会在Gather.Town隆重举行。在“TechnologicalInnovationEnab......