DNA(基因)检测-Southern Blot
DNA吸印转移
1.室温下将电泳后的琼脂糖凝胶浸入500ml溶液A中,摇动30分钟后换500ml新鲜溶液A再摇30分钟,使DNA双链碱变性。
溶液A:
5M NaCl 300.0ml
10M NaOH 50.0ml
H2O 650.0ml
2.为使凝胶重新回到中性,换入溶液B中重复上述1过程。
溶液B:
10M 乙酸铵 200.0ml
10M NaOH 4.0ml
H2O 1796.1ml
硝酸纤维素薄膜(NC膜)
3.料盒或盘中放一玻璃板支架,倒入10×SSC,将Whatman 3MM滤纸放在玻璃板上,两头浸在液体中,用玻棒赶除气泡。
4.心地将琼脂糖凝胶翻过(扣过来)滑到纸上,放平、赶除气泡。
5.将预先浸于溶液B中的NC膜,平铺在胶上,用玻棒赶除气泡。
6.在膜上放置两层预先以10×SSC浸湿的Whatman 3MM滤纸。
7.再放6张干燥吸水纸及4堆75px厚的折叠吸水纸。
8.在纸上覆盖玻璃平板,板上可置约250g重物,下部缓冲液根据虹吸原理能被吸上来,凝胶上的单链DNA即可被吸出并转移到NC膜上。转移速度取决于DNA片段的大小。<1kb的片段在0.7%的胶中2小时即可转出,而15kb的片段需15小时以上,一般维持12~24小时。
9.转移完成后,将胶与膜取出,通过样品槽、表明记号,并剪去膜的一角,以识别方向,此时膜与胶正面观察的方向是一致的。
10. 去掉胶,令膜稍加干燥,用圆珠笔标号。
11. 如为硝酸纤维素膜,则用3MM滤膜包好,80℃烘烤2小时。若为尼龙膜则用紫外等照10分钟,使DNA牢固地结合于膜上,即可用于分子杂交。
12. 将膜在6×SSC中浸泡几分钟,放入塑料袋,按0.2ml/cm2膜面积加入预杂交液,排净气泡封闭袋口,在68℃水浴中振动预杂交2~4小时。
13. 取出塑料袋,在一角切一缺口,倒出预杂交液,按50μl/cm2膜面积加入杂交液,排净气泡、封口,再于68℃水浴中振动杂交,一般来源于真核细胞的总DNA,需杂交12~16小时。
14. 杂交结束后取出塑料袋,剪开边缘,迅速将膜转到2×SSC和0.5%EDTA溶液中室温下洗涤(振荡)5分钟,再将膜转移人2×SSC和0.1%SDS溶液中洗涤15min,然后将膜浸入0.1倍SSC和0.5%SDS溶液中68℃振荡洗涤2小时,换同样溶液再洗涤30分钟。
15. 取出滤膜在Whatman滤纸上晾干,放入塑料袋或用塑料纸包好,在暗室中将X光片与滤膜接触,封于曝光夹中,进行放射自显影1~15天。
16. X光片被取出。常规显定影后显示杂交情况,如曝光时间不够可重新放入X光片再次曝光,直到带型显示清晰。
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