发布时间:2020-04-29 17:28 原文链接: 植物表型研究文章TOP10(三)

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● 高通量表型和全基因组关联分析:研究揭示水稻的自然遗传变异

(Nat Commun,2014)

通过使用高通量测序技术对植物基因组学的研究迅速发展,传统的植物表型测试已远远落后。此文的作者开发了一个高通量水稻表型测定设施(HRPF),用于监测水稻生育期的13个传统农艺性状和2个新定义的性状。利用15个性状的全基因组关联研究(GWAS),他们确定了141个相关基因位点,其中25个包含已知基因,如‘绿色革命’半矮生基因SD1。 基于对HRPF和GWAS结果的性能评估,此文证明高通量表型分析具有取代传统表型分型技术的潜力,并且可以提供有价值的基因识别信息。多功能表型分型工具HRPF和GWAS的结合,实现对重要性状遗传结构的深入了解。

使用三种表型方法进行鲜重,地上部干重和绿叶面积的测量后,GWAS结果之间的比较

 

TOP 3

● 细胞到整株水平的表型分析时代

(Trends Plant Sci,2013)

成像和图像处理已成为植物表型研究的革命性技术,是表型性状测量的主要工具。 此文作者通过检查三个重要的特征来评估植物表型系统:通量,维数和分辨率。首先,整个植物表型分析系统与自动化技术的进步相结合,能够显着提高通量。然后讨论器官和细胞水平表型及其工具(通常以较低的通量操作),作为在升高的空间和时间分辨率下获得高维表型数据的手段。此文认为未来需要集中注意力在空间和时间分辨率的研究上,因为这些成像程序在植物表型系统应用中是关键方面。

表型分析的时空分辨率

 

多维度的表型分析示意图

 

模式植物拟南芥叶片组织、叶肉细胞表型分析