蛋白质组学发文章的四重境界（二）

译文：细胞+基因芯片+iTRAQ+WB+功能验证。遥想当初，很多老师意气风发砸钱做芯片，数据堆积如山，一脸懵逼。然而如今世风日下，基因芯片灌水发文章很难上5分，怎么将课题继续下去？其实芯片数据结合蛋白质组学可以玩出新花样，比如下面这篇：

Cheng DD, Yu T, et al. MiR-542-5p is a negative prognostic factor and promotes osteosarcoma tumorigenesis by targeting HUWE1. Oncotarget. 2016. (IF=5.0)

作者甚至没有临床样本，只在细胞水平通过miRNA芯片找到功能miRNA，随后干扰miRNA，做细胞水平的iTRAQ，找到了miRNA的作用靶点，并进行了WB验证，最终做了简单的功能验证，影响因子5.0分。

此外，在5分这一档上，还有个iTRAQ灌水小神器：SCIENTIFIC REPORTS杂志(IF=5.2)。其中的蛋白质组研究套路非常简明：临床样本+iTRAQ+数据分析+WB/IHC+功能验证。对于经费紧张的老师，这是目前发5分文章性价比最高的方案之一。

译文：临床样本+ iTRAQ + WB/IHC +功能验证+临床相关性。转化医学的轮回，就是从临床出发，再回到临床。若要将研究档次再上一层楼，从5分向10分攀登，必然要回到大量临床样本的验证中，将新发现的Biomarker的临床相关性予以证实。下面这篇文章，若能在分子机制上略加探索，分数再上一层楼绝不是问题：

Chiung HH, Chia WH, et al. Identification and characterization of potential biomarkers by quantitative tissue proteomics of primary lung adenocarcinoma. Mol Cell Proteomics. 2016.(IF=5.9)

此时，发文章已经不再是唯一的目标，找到更有临床价值的Biomarker，做成诊断试剂盒，申请专利，开公司，走上人生巅峰将不再是遥不可及的梦想。

译文：临床样本 + iTRAQ + 蛋白质组对基因组的深度注释。第四重功法变化多端，突破10分之后，每一项研究都饱含了深思熟虑，无法简单重复，只可意会不可言传，这里只能略举一例：

Mertins P, Mani DR, et al. Proteogenomics connects somatic mutations to signalling in breast cancer. Nature. 2016. (IF=38.1)