在电泳的时候加上DNA的分子量marker，一般16S的大小都是1.5 kb吧（很久不做了，记不太清楚）。如果有明显的目的条带而且大小也合适的话那就一般不会错，如果想要确定，可以将条带从胶中切下来，回收之后送去测序，就可以知道序列的详细信息了。
另外你的目的如果只是判断DNA的提取是否成功的话，那么在提取DNA之后直接跑电泳就可以了，没有必要做PCR扩增16S。一般细菌基因组都在15～16k大小左右。
PCR扩增后一般进行琼脂糖凝胶电泳分析，电泳后一般有以下几种条带：1、引物带。引物浓度过高或是扩增效率不是特别高时都会有，一般不呈现为细带，为发散状；如果目的扩增产物带和引物带都很亮，可以考虑适当降低......
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