合并再生障碍性贫血的FA患者均需要支持治疗，有出血的患者，可用氨基己酸0.1g/kg，每6小时服用1次，有可能进行移植治疗的患者，应避免输注来自家族成员的血液制品，以减少移植时过敏的可能，过滤了白细胞的血液制品可减少输血反应和对白细胞过敏，避免接触可引起获得性再生障碍性贫血的药品和化学物质，血小板减少的患者避免应用影响血小板功能的药物，脾切除术只用于巨脾的患者，对长期预后没有明显的益处，大剂量的甲泼尼龙（甲基强的松龙），抗胸腺细胞球蛋白和环孢素曾用于FA患者的治疗，但缺乏疗效，FA继发AML的治疗困难，预后差，由于DNA修复缺陷，对化疗敏感性增加，因此化疗相关毒性增加，化疗剂量应减少，抗氧化剂治疗亦有报道，但在尝试中。
