MC所致许多感染均可口服抗生素治疗。MC对以下药物通常是敏感的：阿莫西林-克拉维酸、磺胺甲噁唑/甲氧苄啶（复方磺胺甲噁唑）、四环素、第二代口服头孢菌素、大环内酯类、氟喹诺酮类等。MC也对替卡西林、哌拉西林、注射用头孢菌素、氨基糖苷类抗生素敏感。对青霉素、氨苄西林、万古霉素、克林霉素和林可霉素耐药。
因此对MC菌感染者，建议首选阿莫西林-克拉维酸和（或）氨基糖苷类抗生素。此外，对于原发病的治疗，增强抵抗力加强营养支持疗法等亦十分重要。
