1）容易导致女性不孕：一旦卵巢囊肿变大或者变性，就有可能使精子、卵子或者受精卵不能正常运行，从而影响生育，导致不孕的恶果。另外先天性无卵巢、幼稚型卵巢、卵巢功能早衰、多囊卵巢、卵巢肿瘤等卵巢的疾病会影响卵巢的排卵功能，从而导致不孕。卵巢功能早期衰竭，女性过早绝经，会导致女性卵巢过早停止活动，从而导致不孕。
2）女性容颜早衰：卵巢囊肿会引发内分泌失调、早衰、恶变，甚至会引发卵巢癌。
3）引发流产、难产：卵巢囊肿在早孕时可能引起流产，中期妊娠时则易发生卵巢囊肿蒂扭转，晚期妊娠时囊肿较大者可导致胎位异常，分娩时可能阻塞产道引起难产。
4）囊肿破裂、危及生命：当卵巢囊肿生长到一定大小，有可能出现并发症：感染、囊肿蒂扭转、出血或破裂，危及女性生命。
