发布时间:2013-04-22 16:04 原文链接: 荧光RTPCR技术可快速检测H7N9禽流感病毒

  目前,在国内通用的确诊禽类中禽流感病毒H7N9亚型的检测技术中,除采用传统的鸡胚病毒分离方法外,通常采用核酸检测方法,如普通PCR方法和基于荧光RT-PCR的“二步法”,但还没有建立起采用荧光RT-PCR技术“一步法”检测禽流感病毒H7N9亚型的方法。

  据该项目组负责人、北京局检验检疫技术中心动物实验室博士高志强介绍,项目在实验过程中,共建立了3种检测方法。最终的禽流感病毒H7N9亚型双重荧光RT-PCR检测方法是在禽流感病毒H7亚型和N9亚型单重荧光RT-PCR检测方法的基础上通过优化建立,从而实现了对禽流感病毒H7N9亚型的一步快速定型。这种方法不仅能检测最近流行的H7N9毒株,还可以用于筛查其他H7亚型毒株。此方法不仅引物特异,而且探针特异,这一“双特异”性保证了结果的准确性,同时比普通PCR检测技术要灵敏100~1000倍。

  荧光RT-PCR检测禽流感病毒原理

  荧光RT-PCR就是在聚合酶链式反应(PCR)原有的一对特异性引物基础上增加了一条特异性荧光双标记探针。标准主要起草单位——北京出入境检验检疫局的科研人员根据A型流感病毒的核酸保守区共有序列,开发设计上百对引物和几十条探针序列,从中筛选出了敏感、特异的引物、探针,建立快速的通用型一步法检测活禽或禽产品中所有A型禽流感病毒及针对H5、H7、H9亚型的荧光RT-PCR检测技术。

  PCR反应进行一个循环,在合成了N条新链的同时,就水解了N条探针,并释放出了相应数量的荧光基团。仪器所接收到荧光信号的强度与PCR反应产物的量呈对应关系。随着PCR反应的循环往复,PCR产物呈指数形式增长,荧光信号也相应增长。如果以每一个PCR循环结束时所测得的荧光值为纵坐标,以PCR循环数为横坐标作图,即可得到一条连接每一个循环后荧光值的扩增曲线。当检测标本中含有所要检测病原体的核酸序列时,所得到的曲线呈“S”型;而当标本中不含病原体,则PCR过程不发生,探针不被水解,不产生荧光信号,其扩增曲线为一水平线。也就是说,扩增曲线为“S”型时,就检出了禽流感病毒;当扩增曲线为水平线时,就没有禽流感病毒检出。利用荧光RT-PCR检测方法的4项标准有3项分别是对H5、H7、H9亚型禽流感病毒检测提出的,还有一项是通用检测方法的标准。北京出入境检验检疫局动物检验检疫实验室主任张鹤晓介绍说,该方法可以检测H1~H15的各种禽流感病毒。

  禽流感病毒各亚型均属A型流感病毒,根据A型流感病毒共有基因特定的序列,合成一对特异性引物和一条特异性的荧光双标记探针。该探针与禽流感病毒特有的共同基因特异性结合,结合部位位于引物结合区域内。探针的5’端和3’端分别标记不同的荧光素,如5’端标记FAM荧光素,它发出的荧光能够被检测仪器接收,称为报告荧光基团(用R表示),3’端一般标记TAMRA荧光素,它在近距离内能吸收5’端报告荧光基团发出的荧光信号,称为淬灭荧光基团(用Q表示)。

  当PCR反应在退火阶段时,一对引物和一条探针同时与目的基因片段结合,此时探针上R基团发出的荧光信号被Q基团所吸收,仪器检测不到R所发出的荧光信号;当PCR反应进行到延伸阶段时,Taq酶在引物的引导下,以四种核苷酸为底物,根据碱基配对的原则,沿着模板链合成新链;当链的延伸进行到探针结合部位时,受到探针的阻碍而无法继续,此时的Taq酶发挥它的5’→3’外切核酸酶的功能,将探针水解成单核苷酸,消除阻碍,与此同时标记在探针上的R基团游离出来,R所发出的荧光再不为Q所吸收而被检测仪所接收;在Taq酶的作用下继续延伸过程合成完整的新链,R和Q基团均游离于溶液中,仪器可继续检测到R所发出的荧光信号。

  荧光RT-PCR检测法特点

  敏感性高、特异性强:荧光RT-PCR检测方法不仅能够用来检测禽流感病毒H5、H7、H9亚型,对其他禽流感病毒亚型也能检出,而且用通用型探针、引物检测常见的其他禽类病毒,未发现交叉反应,这就说明该方法敏感性高、特异性强。

  节约检测时间:在检验检疫实践中,如果用仅针对某一亚型禽流感病毒的探针、引物,一个亚型一个亚型的测试,势必会浪费人力、物力和时间。因此,先用通用型探针、引物验证是否是禽流感病毒,再用亚型的探针、引物分型,将大大节约检测时间。

  不易污染:荧光RT-PCR技术通过连接电脑分析PCR过程中产生的荧光信号,实现了实时、在线检测PCR扩增过程,而无需对PCR扩增产物进行后处理,克服了传统的PCR技术易污染的缺点,可实现在同一个标准的操作程序条件下进行稳定、可靠的检测。

相关文章

四川农大“医检灵”团队将科研成果带进社区

近日,四川农业大学动物医学院“医检灵——宠物病毒检测专家”实践团队通过宠物义诊、调研、科研实验等方式,深入社区、街道、实验室等开展宠物病毒检测相关的实践活动,促进人宠公共安全卫生保障。针对宠物最常发生......

华测检测广州中心材料实验室正式营业

近期,华测检测广州中心材料实验室正式营业,成为华测检测布局全国的第八个中心材料实验室。......

中国计量测试学会关于征集“2024年度团体标准项目”的通知

各有关单位:为贯彻落实国务院深化标准化工作改革方案要求,加快促进计量测试技术进步和科技成果转化,根据《中华人民共和国标准化法》《国家标准化管理委员会民政部关于印发<团体标准管理规定>的通知......

江苏部署开展校园食品安全排查整治专项行动

春季开学在即,为保障江苏省在校师生饮食安全,2月20日,江苏省食安办、省市场监管局联合省教育厅、省公安厅、省卫生健康委,召开江苏省校园食品安全排查整治专项行动月度调度会。会议传达了全国校园食品安全排查......

药典委:关于近红外光谱法标准草案的公示

关于近红外光谱法标准草案的公示编号:Fg2024-0064号我委拟制定《中国药典》近红外光谱法。为确保标准的科学性、合理性和适用性,现将拟制定的近红外光谱法公示征求社会各界意见(详见附件)。公示期自发......

哈工程主办“深海和极地关键技术与装备”重点专项深海潜水器项目启动会

近日,中国21世纪议程管理中心指导发起,哈尔滨工程大学、天津大学、中国船舶科学研究中心共同主办的国家重点研发计划“深海和极地关键技术与装备”重点专项深海潜水器项目启动会暨深海装备青年学者论坛在哈尔滨工......

群众过节我“站岗”护航游客放心过年

月牵古塔千年影,虹挂长街十里灯。位于福建省泉州市鲤城区西街的开元寺是游客打卡点,为确保每一名来泉州的游客能度过一个欢乐祥和的新春佳节,泉州市市场监管部门适时启动设在开元寺游客服务中心的节日期间消费投诉......

直接面向消费者的基因检测市场规模、趋势、2032年报告

2022年,全球直接面向消费者的基因检测市场规模为17.2亿美元,预计到2032年将达到76亿美元左右,2023年至2032年复合年增长率为16.10%。市场概况直接面向消费者的基因检测市场是一个快速......

【中央一号】加强耕地土壤重金属污染源排查整治,提升全过程食品安全监管

近日,中国共产党中央委员会和国务院联合发布了《中共中央国务院关于学习运用“千村示范、万村整治”工程经验有力有效推进乡村全面振兴的意见》,这是党的十八大以来第12个指导“三农”工作的中央一号文件。该文件......

此地13个区级疾控中心相继投用疾控检测项目增加至732项

随着武汉市区两级卫健系统挂牌设立疾控局,两级疾控中心陆续与卫生监督执法队整合,两级疾控中心相继完成单位级别升格,武汉疾控系统在服务能力方面有了明显提升。12月26日,武汉市人民政府新闻办公室举行新闻发......