谭敏佳：色谱质谱双翼护航助力蛋白质组学新突破

　　分析测试百科网讯 2021年9月23日，赛默飞双重新品线上直播发布会召开，重磅推出了Thermo Scientific™ TSQ™ Plus 三重四极杆质谱仪和Vanquish Neo UHPLC 系统，为蛋白质组学、精准医学、制药和生物制药、临床研究、转化研究等领域提供了从色谱到质谱的高效、高通量、高分析性能的产品。在新品发布会上，中国科学院上海药物研究所研究员、博士生导师、课题组长谭敏佳接受了现场采访，分享了在蛋白质组学和翻译后修饰方面的研究进展。

中国科学院上海药物研究所研究员、博士生导师、课题组长谭敏佳

质谱技术助力蛋白质组学和翻译后修饰研究

　　谭敏佳研究员目前担任中国科学院上海药物研究所的课题组长，其实验室主要以肿瘤和代谢性疾病为研究对象，利用最新生物质谱技术，围绕细胞内蛋白翻译后修饰及动态变化开展研究工作，旨在发现其在疾病中的调控机制，阐明相关药物的靶标和分子机理，鉴定“精准”指征药效的个性化生物标志物和探索治疗新策略。

　　谭敏佳介绍道：“目前，我们实验室主要从事基于质谱技术的蛋白质组学和蛋白质翻译后修饰的研究。具体来说，我们实验室主要围绕着细胞、动物以及临床样本进行大规模地蛋白质组学和蛋白质翻译后修饰组学的分析，进行系统地分子分型、研究病理的生发展机制以及鉴定相应个性化治疗的新策略。”

复杂微量样本的组学研究：纳升液相之关键作用

　　在蛋白质组学的研究中，色谱和质谱仪器发挥了重要作用，其中纳升液相色谱极其关键。谭敏佳强调：“对于蛋白质组学的样本来说，因为样本极其复杂和微量，色谱技术本身和质谱技术一样都占据了核心和不可替代的主导作用。仅采用质谱技术还不足以分离解析如此复杂的微量样本，必须要结合串联的色谱技术、串联的液质联用技术才能够最有效地进行复杂的蛋白质样本的分离、分析、定性和定量研究。我相信这也是我们蛋白质组学领域将来发展方向，是重要技术突破的领域。”

《Cell》 ：构建基于多维蛋白质组学的肺腺癌分子全景图谱

　　 2020 年 7 月 9 日，国际顶尖学术期刊 Cell 在线发表了由中国科学家完成的大规模临床肺腺癌蛋白质组草图的绘制工作。中国科学院上海药物研究所谭敏佳研究员团队，军事科学院军事医学研究院、国家蛋白质科学中心（北京）贺福初院士团队、汪宜研究员团队，国家癌症中心/中国医学科学院肿瘤医院程书钧院士、肖汀研究员团队，上海交通大学李婧教授等团队联合研究并发表，构建了基于多维蛋白质组学的肺腺癌分子全景图谱，发现早期肺腺癌的蛋白生物学特征及相关信号通路，绘制了肺腺癌疾病的分子亚型及各亚型的分子特征与临床表征。这项研究还揭示了不同亚型间的蛋白质表达、激酶活性、磷酸化蛋白修饰以及临床信息等方面的特征，筛选到若干肺腺癌潜在预后标志物及潜在药物靶标，为肺腺癌的精准医疗提供了重要资源和线索。这也是国际上首次对肺腺癌开展了大规模、高通量、系统性的全景蛋白质组学研究。

　　对于这项重大研究成果，谭敏佳表示：“使用质谱技术分析大规模临床样本的蛋白质组以及翻译后修饰组的特征，越来越成为肿瘤精准治疗领域的研究热点。从学科发展的方向来说，我相信未来将陆续有更多更有影响力、更重磅的研究工作发表。而相较于大规模基因组技术在临床样本中的应用，蛋白质组学技术尚有很多继续改进的空间，需要我们持续探索。”

蛋白质组大队列研究的三大突破方向

　　对于蛋白质组学在大数据、大队列研究的未来发展方向，谭敏佳提出了在微量分析、技术提升和信息整合三大方面的期许。

　　第一，如何更好地进行微量的临床样本的蛋白质组分析，是亟需技术突破的方向。

　　第二，进行大规模、大队列分析对整个蛋白质组学系统提出更高要求，需要更高灵敏度、更高通量、更高重现性的分析测试体系。从技术角度来说，这也是重要的临床蛋白质组学发展的方向。

　　第三点也是非常关键的是，如何进行大规模大数据整合的分析，包括蛋白质组和修饰、蛋白质组和基因组之间的整合分析等。这些生物信息学手段还需要更有效的方法学发展。

　　谭敏佳表示：“在我自己更关注的蛋白翻译后修饰研究方向中，实际上对临床样本的蛋白翻译后修饰的定性定量也是非常具有挑战性的。近几年来磷酸化组学分析方面已经取得显著进展，但其它的翻译后修饰如乙酰化、泛素化等，在临床样本的分析方面目前还有很多技术难度。希望今后若干年里出现更好的技术进展。”