发布时间:2020-11-25 16:32 原文链接: 研究人员建立衰老生物学多组学数据库

  随着人口老龄化程度加剧,实现健康老龄化是亟待解决的社会问题和科学问题。近年来,随着衰老相关研究成果的不断增多和高通量测序技术的日益发展,衰老相关多组学数据层出叠见。然而,目前尚缺乏综合性的整合衰老生物学多组学数据的数据资源库。

  中国科学院动物研究所刘光慧研究组、曲静研究组,与北京基因组研究所(国家生物信息中心)鲍一明研究组、张维绮研究组合作建立了Aging Atlas数据库。该数据库从常规转录组、单细胞转录组、表观基因组、蛋白质组及药物基因组等不同层面整合了衰老相关数据集(如图),实现了不同条件下基因表达调控随衰老变化趋势的汇聚融合。在该数据库中,用户可实现对不同层次组学数据的交互查询和联合分析等功能,同时,数据库还将不断完善建立多层次组学间的整合分析和数据呈现,并形成升级版本。此外,数据库提供了归属不同通路的衰老相关基因集,使用户可以更深入全面地了解特定基因和通路在衰老生物学中的意义。作为面向全球持续更新的网站,Aging Atlas提供开放的数据共享平台,用户可在上传界面进行科学数据的上传操作,为实现全球数据共享提供便利。Aging Atlas的建立旨在为国际范围内衰老相关大数据的统一汇交、集中存储、安全管理、开放共享及前沿交叉研究和转化应用提供助力。近日,相关研究成果以Aging Atlas: a multi-omics database for aging biology为题,在线发表在Nucleic Acids Research上。

  Aging Atlas数据库实现了对与衰老相关的不同层次的多组学数据的收录和整合。该数据库对用户免费开放,相关运维团队将对该数据库进行定期维护,实时更新,推动衰老相关的基础研究和临床转化应用的发展。Aging Atlas希望在广大科学工作者的支持下,不断吸纳更多高质量的衰老研究数据,以更好地服务衰老生物学和老年医学的发展。

相关文章

微自噬机制对预防衰老至关重要

据最新发表在《EMBO报告》上的一项研究报道,日本大阪大学和奈良县立医科大学的研究人员首次证明,受损的溶酶体可通过微自噬机制修复,并确定了这一过程的两个关键调控因素,这对于预防衰老至关重要。为确定新的......

重磅!六项医工交叉团体标准获批发布实施

近期,中国科学院分子影像重点实验室牵头撰写的《胃部肿瘤智能辅助诊断软件测试和性能评价规范》(标准编号:T/SCGS313001-2023)、《医用内窥镜内窥镜荧光摄像系统影像质量评价规范》(标准编号:......

新人工智能模型“CELLO2”可预测脑胶质瘤治疗效果

近日,由香港科技大学领衔的国际科研团队研发出一套人工智能模型,可预测脑胶质瘤患者接受治疗后的进程和结果,将为改善病人管理策略和实施精准治疗提供新方向。相关成果于近日发表在《科学·转化医学》上。据悉,香......

研究揭示逆转心脏衰老的关键蛋白

中国科学院动物研究所刘光慧课题组、曲静课题组,联合北京基因组研究所张维绮课题组,在《自然-衰老》(NatureAging)上,在线发表了题为SIRT2counteractsprimatecardiac......

Nature子刊:研究揭示逆转心脏衰老的关键蛋白

衰老是心血管疾病的首要危险因素,可导致心脏结构异常和功能衰退,如室壁肥厚、舒张功能障碍、纤维性颤动等。这些与年龄相关的心脏变化会增加多种心脏疾病的患病率,进而影响人类健康和寿命。随着全球人口老龄化形势......

对衰老SayNo!

心脏是人体最重要的器官之一,其主要任务是将氧和养分通过血液泵送到全身,确保我们的生命活动正常运转。然而,随着年龄的增长,心脏也开始经历衰老的过程,其中一个显著的问题是心律失常。为什么衰老的心脏常常失去......

研究揭示早期预防骨骼肌衰老的新路径

近日,广东省科学院微生物研究所研究员谢黎炜团队与中国工程院院士、中国科学院亚热带农业生态研究所首席研究员印遇龙团队合作,首次报道了抗生素诱导的肠道菌群紊乱和衰老个体的肠道菌群及其代谢物会扰乱肌卫星细胞......

科学家揭开加速机体脂肪组织衰老的新型机制

脂肪组织在控制机体代谢稳态中发挥着核心作用,而机体中脂肪组织保存的失败与年龄相关的代谢性障碍直接相关,成熟脂肪组织在这种现象中所扮演的关键角色,目前研究人员并不清楚。近日,一篇发表在国际杂志Natur......

研究揭示蛋白质氧化折叠在干细胞衰老中的作用

长期以来,人们普遍认为线粒体是细胞活性氧的主要来源。然而,内质网中蛋白质二硫键形成过程会产生副产物H2O2。据估算,它约占蛋白质合成过程中产生总活性氧的25%。可见,内质网来源的活性氧不容忽视。8月3......

专家齐聚天津,共讨质谱未来

——天津首届生物及临床质谱主题分论坛及企业卫星会主题分论坛本次分论坛包括血药浓度、药物基因检测、临床与质谱、合成生物学、整合医学、临床多组学6大主题论坛。分论坛分别由生物医学、临床质谱等相关行业高尖端......