发布时间:2021-06-04 16:41 原文链接: α微管蛋白:新的药物结合位点

  微管(Microtubule)是抗肿瘤药物研发的重要靶点。微管是“细胞的骨架”主要成分之一,在许多细胞重要事件中起着关键作用。微管是由α-和β-微管蛋白(Tubulin)异二聚体可逆地组装成而成的线性管装结构(图1)。

  图1:微管蛋白已知的六个结合位点及微管蛋白组装形成微管示意图

  目前,微管蛋白已有6个结合位点被报道,除结合在α微管蛋白pironetin外,其余5个均在β微管蛋白上,分别为长春花碱、秋水仙碱、紫杉醇、laulimalide 和美登素,它们都与 β-微管蛋白结合并干扰其正常动力学过程从而抑制微管蛋白的聚合或解聚。其中,靶向β-微管蛋白的紫杉醇、长春新碱代表了当今最成功一线抗肿瘤化疗药物,其中紫杉醇在全球销售额已经超过300亿美元。但由于β亚基具有 GTP 酶活性导致其构象不稳定,从而先天性决定了现有的结合于β亚基的抗微管药物均容易产生耐药性。与β亚基相反,α亚基没有 GTP 酶活性,不易发生构象变化,这类新型的靶向α-微管蛋白的药物很可能不受 β-微管蛋白的突变及 βIII-微管蛋白的高表达所影响,从而可以克服耐药。因此,开发靶向 α-微管蛋白的药物对克服化疗药物耐药具有巨大开发价值。

  近日,四川大学华西医院生物治疗国家重点实验室陈俐娟研究员团队在Science Advances的发表题为Cevipabulin-tubulin complex reveals a novel agent binding site on α-tubulin with tubulin degradation effect。研究解析Cevipabulin-微管蛋白复合物晶体结构,发现了一个促降解微管蛋白降解的药物结合位点。

  四川大学华西医院生物治疗国家重点实验室陈俐娟课题组一直从事靶向 α-tubulin 抑制剂的开发, 该课题组于2016年首次发现了位于α微管蛋白上的Pironetin位点,相关文章发表在Nature Communications杂志(Nature Communications 2016, 7 : 12103)。这次该课题组又在α微管蛋白上发现了一个全新的、且能导致微管蛋白降解的结合位点(图2)。该位点被首次命名为第七位点。

  图2:Cevipabulin-微管蛋白复合物晶体结构。(A) Cevipabulin的化学结构图。(B)Cevipabulin与微管蛋白复合物结合的整体视图。(C) Cevipabulin在β1-微管蛋白上的FO-FC密度图。(D) Cevipabulin在α2-微管蛋白上的FO-FC密度图. (E) Cevipabulin在β1-微管蛋白上的局部视图(H) Cevipabulin在α2-微管蛋白上的局部视图。

  如图2H所示,该第七位点位于αβ二聚体的内界面上, 由β2H10,α2T5, α2H6, α2H7和α2H1包裹形成。小分子Cevipabulin与第七位点结合后能够促进微管蛋白降解, 这是传统微管蛋白抑制剂所不具有功能。深入的机制发现Cevipabulin能够导致微管蛋白变性(图3A-3C)。从结构生物学上分析发现Cevipabulin结合到第七位点后能够导致αT5 loop环外移导致了原本此处的不可交换GTP变得可交换(图3D-3F), 从而破坏了微管蛋白的稳定性。

  图3:Cevipabulin结合第七位点导致微管蛋白稳定性下降而促进其降解. (A) TPE-MI蛋白变性指示剂原理图。(B) Cevipabulin促进微管蛋白变性。(C)泛素化抑制剂PYR-41抑制cevipabulin衍生物1导致的微管蛋白降解。(D)Cevipabulin的结合导致α-T5的外移(E)cevipabulin结合后破坏了不可交换GTP与α-T5的氢键相互作用。(F) Cevipabulin结合导致不可交换GTP变得可交换。

  相比较于该课题之前发现的pironetin位点,该位点结合的先导小分子Cevipabulin结构简单、且药代动力学数据好。具有更好的成药性。同时,第七位点具有微管蛋白降解的效果,为后续开发特异性的微管蛋白降解剂奠定了基础。

  华西医院陈俐娟研究员、李为民教授及杨建洪助理研究员为该文章共同通讯作者。杨建洪助理研究员、余亚梅副研究员,黎勇博士后及闫伟博士后为共同第一作者。


相关文章

α微管蛋白:新的药物结合位点

微管(Microtubule)是抗肿瘤药物研发的重要靶点。微管是“细胞的骨架”主要成分之一,在许多细胞重要事件中起着关键作用。微管是由α-和β-微管蛋白(Tubulin)异二聚体可逆地组装成而成的线性......

α微管蛋白:新的药物结合位点

微管(Microtubule)是抗肿瘤药物研发的重要靶点。微管是“细胞的骨架”主要成分之一,在许多细胞重要事件中起着关键作用。微管是由α-和β-微管蛋白(Tubulin)异二聚体可逆地组装成而成的线性......

水稻OsCTPS1在早期胚乳发育过程中发挥的重要作用

2021年5月31日,PlantBiotechnologyJournal在线发表了韩国庆熙大学GynheungAn(安镇兴)教授所带领团队完成的题为“CTPsynthaseisessentialfor......

我国学者应用液体核磁刻画CTCF多点识别DNA的动态特性

稳态强磁场实验装置(SHMFF)用户中科大生命科学学院施蕴渝院士/吴季辉教授团队的阮科副教授和张志勇教授利用液态核磁共振结合小角度X射线散射等技术,在对人源多功能转录因子CTCF的结构与功能研究中取得......

作用于微管系统的药物研究(四):tubulincode与药物靶点

有位同行曾经对我说:你在紫杉烷与微管作用及肿瘤耐药方面的研究虽然做得还不错,但无论是靶点还是药物分子都太老了。言下之意这样研究很难继续走下去。考虑到当今时代促使人们去弄潮(也可称之为追逐热点—其利与弊......

GenomeBiology发文介绍RNA印记法

生物学家们逐渐意识到,RNA不只是DNA和蛋白之间的过渡产物,它对调节基因的表达有重要作用。深入研究RNA调控,能够帮助科学家们进一步理解相关疾病。宾夕法尼亚大学的科学家们开发了分析RNA调控的新方法......

8月12日《自然》杂志精选

      “铁磁共振成像”技术纳米磁学研究的快速发展使得磁感应和磁记忆技术领域出现了一些有强大生命力的应用。然而,迄今为止还没有高分辨率磁......

微管解聚相关蛋白质Kinesin13、Stathmin和Katanin

摘要:微管是细胞骨架的主要成份,参与细胞内物质的运输与细胞形态的维持,还与有丝分裂和减数分裂等生命活动密切相关。大多数微管都表现出动力学的不稳定性,处于动态的聚合和解聚及之间的随机转换状态。Kines......