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973计划支持蔬菜基因组学研究取得重要进展

在973计划的支持下,中国农业科学院蔬菜花卉研究所黄三文研究员的研究团队构建了包含360多万个位点的黄瓜全基因组遗传变异图谱,为全面了解黄瓜这一重要蔬菜作物的进化及多样性提供了新思路,并为全基因组设计育种打下了基础。该研究成果于10月21日由《自然 遗传学》杂志在线发表。 黄瓜是最重要的蔬菜之一,相比其他园艺作物有着较小的基因组,因此常被用来作为研究植物或者蔬菜重要经济性状形成的重要模式系统。在该研究中,科研团队对115个黄瓜品系进行了重测序,并对一个野生黄瓜进行了从头测序。他们共发现330多万个单核苷酸多态性位点(SNPs),33万多个小插入和删除,594个获得/缺失变异。基于这些数据,研究人员构建了一个单核苷酸分辨率的黄瓜遗传变异图谱。利用该遗传变异图谱,科学家证实了黄瓜发源于印度,同时将控制叶片、果实大小以及苦味等性状的关键基因定位在了染色体上,为下一步利用这些重要蔬菜驯化基因打下了基础。 973计划2......阅读全文

多吃水果蔬菜喔!不信?有数据哩

  我们一直念叨,或者被念叨,要多吃水果和蔬菜。可是具体要吃多少,才有助于身体健康呢?  近日,伦敦帝国理工学院的科学家们给出了一份答案:每天吃5份(400g)以上的水果、蔬菜能够有效降低心脏病、中风、癌症的概率,且可以预防过早死亡!  吃多少果蔬?5份可以,10份更佳!  每天我们需要摄取多少水果

缺乏数据使用指导原则,基因组数据共享遇阻

   基因组数据共享将生物医学研究推向快车道,但向公共领域发布的现有数据指南一方面承认免费和无条件使用数据的重要性,另一方面还未能解决这种重要性与数据生产者首次发布数据的“权利”之间的关系。  在美国能源部联合基因组研究所负责人Nikos Kyrpides看来,这种自相矛盾导致了数据生产者和数据使用

蔬菜中心:绘成世界首张西瓜基因组序列图谱

  我国是世界第一西瓜生产与消费大国,但是人们却始终未能从外到内了解它,直到2013年1月,国际学术顶级刊物《自然·遗传学》发表了世界首张西瓜基因组序列图谱(影响因子35.532),标志着人类成功破译了西瓜遗传“密码”。这项由蔬菜中心主任许勇的研究团队牵头进行的科研创新,为高效培育兼具优质、高产、抗

973计划支持蔬菜基因组学研究取得重要进展

  在973计划的支持下,中国农业科学院蔬菜花卉研究所黄三文研究员的研究团队构建了包含360多万个位点的黄瓜全基因组遗传变异图谱,为全面了解黄瓜这一重要蔬菜作物的进化及多样性提供了新思路,并为全基因组设计育种打下了基础。该研究成果于10月21日由《自然 遗传学》杂志在线发表。   黄瓜是最重要

基因组数据分析的“金标准”

  五月十八日,美国安大略癌症研究所、俄勒冈健康与科学大学、赛智生物网络(Sage Bionetworks)、分布式DREAM 团体(Dialog for Reverse Engineering Assessment and Methods)和加州大学圣克鲁兹分校的癌症研究人员,在《Nature M

北京基因组所发布表观基因组数据库MethBank 3.0

  中国科学院北京基因组研究所生命与健康大数据中心发布表观基因组数据库MethBank 3.0,并将其成果以MethBank 3.0: a database of DNA methylomes across a variety of species为题,在线发表在Nucleic Acids Rese

北京基因组所发布表观基因组数据库MethBank 3.0

  中国科学院北京基因组研究所生命与健康大数据中心发布表观基因组数据库MethBank 3.0,并将其成果以MethBank 3.0: a database of DNA methylomes across a variety of species为题,在线发表在Nucleic Acids Rese

国家基因组科学数据中心公布数据资源整合挖掘体系

  近日,国家基因组科学数据中心在国际学术期刊《核酸研究》(Nucleic Acids Research)在线发表题为Database Resources of the National Genomics Data Center in 2020 的文章,以整体形式介绍基因组数据资源整合与挖掘体系建

国际癌症基因组联盟公布逾1万个癌症基因组数据

  国际癌症基因组联盟(International Cancer Genome Consortium,简称"ICGC")近日向科研界公布了超过1万个癌症基因组的数据。这些数据能更好地帮助全世界的癌症研究者从基因方面了解癌症,加快对癌症的研究并帮助更多癌症靶向治疗的发展。   安大略癌症研究所所

北京基因组所数据资源建设取得进展

  近日,中国科学院北京基因组研究所生命与健康大数据中心团队研究论文在线发表于《核酸研究》期刊。该研究成果的发表是国内首次以数据中心为模式,整体发布我国生命组学数据资源建设情况,标志着生命与健康大数据中心建设取得实质性重要进展,也标志着我国建设综合性基因组数据资源获得国际同行认可。   生命与健