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单核苷酸多态性(SNP)实验

SNP (Single Nucleotide Polymorphism)即单核苷酸多态性,可以用于检测由于单个核苷酸改变而导致的核酸序列多态性(Polymorphism)。实验方法原理由于单个核苷酸改变而导致的核酸序列多态性(Polymorphism)。据估计,在人类基因组中,大约每千个碱基中有一个SNP,无论是比较于限制性片段长度多态性(RFLP)分析还是微卫星标记(STR),都要广泛得多。SNP是我们考察遗传变异的最小单位,据估计,人类的所有群体中大约存在一千万个SNP位点。一般认为,相邻的SNPs倾向于一起遗传给后代。于是,我们把位于染色体上某一区域的一组相关联的SNP等位位点称作单体型(haplotype)。大多数染色体区域只有少数几个常见的单体型(每个具有至少5%的频率),它们代表了一个群体中人与人之间的大部分多态性。一个染色体区域可以有很多SNP位点,但是我们一旦掌握了这个区域的单体型,就可以只使用少数几个标签SNP......阅读全文

Proton和HiSeq外显子组平台比较

Proton和HiSeq外显子组平台比较:单核苷酸变异检测均表现良好美国国家癌症研究所的研究人员在近日发表的有关Proton和HiSeq 平台的对比研究显示,在进行外显子组测序时,Life Technologies的Ion Proton和Illumina的HiSeq 2000在单核苷酸变异检

Proton和HiSeq平台比较 单核苷酸变异检测表现良好

  美国国家癌症研究所的研究人员在近日发表的有关Proton和HiSeq 平台的对比研究显示,在进行外显子组测序时,Life Technologies的Ion Proton和Illumina的HiSeq 2000在单核苷酸变异检测方面均表现良好,但在准确检测插入缺失时存在某些问题。   该

Proton和HiSeq测序平台比较:SNPs检测均表现良好

  美国国家癌症研究所的研究人员在近日发表的有关Proton和HiSeq 平台的对比研究显示,在进行外显子组测序时,Life Technologies的Ion Proton和Illumina的HiSeq 2000在单核苷酸变异(SNPs)检测方面均表现良好,但在准确检测插入缺失时存在某些问题

离子交换柱层析(ion-exchange chromatography)分离核苷酸

一、目的:学习离子交换柱层析法分离核苷酸的原理及方法。二、原理:离子交换作用一般指在固相和液相之间发生的可逆的离子交换反应,它可用于分离各种可解离的物质。通常离子交换剂是在一种高分子的不溶性母体上引入若干活性基团。这样人工会成的离子交换剂具有各种各样的性能。作为不溶性母体的离分子有树脂、纤维素、葡聚

那些抽烟却长寿的人,是因为基因太强悍

  在我们的生活中,经常会听到XX抽烟,还活了XX高寿。吸烟不是有害健康吗?为什么某些人能活到100多岁?  吸烟却长寿的人体内存在多处单核苷酸多态性  为了解开这一谜底,近日美国加利福尼亚大学洛杉矶分校等机构的研究人员在新一期J Gerontol A Biol Sci Med Sci(《老年病学杂

基因检测技术成本大幅降低

  基因检测技术的突破   寻找与疾病有关基因的研究最先开始于上世纪80年代,当时科学家发明了基因剪接技术(gene-splicing),当时的研究速度很慢,工作量也很繁琐,并且需要从大量患病家族中收集DNA。比如1983年科学家发现了亨廷顿疾病基因的近似位置,但直到1993年,经过漫长的1

本周Science期刊发布 检测CRISPR脱靶效应新方法---DISCOVER-Seq

  本周又有一期新的Science期刊(2019年4月19日)发布,它有哪些精彩研究呢?让小编一一道来。图片来自Science期刊。  1.Science:开发出一种检测CRISPR脱靶效应的新方法---DISCOVER-Seq  doi:10.1126/science.aav9023; doi:1

基因芯片与SNP分析

基因芯片技术作为一种新兴的生物技术,近年来得到迅速发展,其应用具有巨大的潜力。单核苷酸多态性(SNP)作为新的遗传标记对基因定位及相关疾病研究的意义亦非常重大。本文主要介绍了DNA 芯片技术的原理和分类、单核苷酸多态性检测方法及DNA 芯片技术在单核苷酸多态性检测方面的应用。生物芯片技术是90

《自然》:日美研究人员探明过敏体质部分原因

  日本理化研究所近日发表新闻公报说,其研究人员与美国同行经动物实验发现,负责合成转录因子Mina的基因存在单核苷酸多态性,这一特点与过敏症发病相关。   有的人容易过敏,有的人则不易过敏,医学界普遍认为过敏体质与遗传有关,但迄今尚未完全了解导致过敏体质的基因和具体机制。   新闻公报说,理化研

与疟原虫耐受青蒿素有关的遗传位点

  一项研究发现了与青蒿素耐药性有关的4个恶性疟原虫的遗传位点。大多数疟疾流行的国家在联合疗法中使用青蒿素作为治疗恶性疟原虫的一线疗法。Christopher V. Plowe及其同事对从最近出现了对青蒿素耐药的恶性疟原虫的柬埔寨西部、孟加拉国和泰国进行的青蒿素疗法有效性临床试验中收集的恶性疟原

心理所关于疾病相关非编码区域的研究取得新进展

  遗传学因素在精神类疾患发生发展过程中的重要性已经得到公认。此外,影像遗传学证据显示,正常心理学现象中的行为/认知加工过程也表现出一定程度的遗传相关性。目前已有大量精神疾患及行为/认知加工相关易感基因鉴定工作发表在心理学主流杂志上,但是这些易感基因的功能分析,尤其是针对非蛋白质编码区域的功能研究有

成都生物所发明一种检测单核苷酸多态性的方法 简便实用

  中国科学院成都生物研究所“一种检测单核苷酸多态性的方法”获国家知识产权局发明专利(专利号:ZL 201310045649.0)。  单核苷酸多态性(single nucleotide polymorphism,SNP),主要是指在基因组水平上由单个核苷酸的变异所引起的DNA序列多态性,

离子交换柱层析分离核苷酸实验_离子交换层析法

本实验以酵母RNA 为材料, 将RNA 用碱水解成单核苷酸,再用离子交换柱层析进行分离, 最后采用紫外吸收法进行鉴定。旨在了解并掌握RNA 碱水解的原理和方法,掌握离子交换柱层析的分离原理和方法,熟练掌握紫外吸收分析方法。实验方法原理本实验以酵母RNA 为材料, 将RNA 用碱水解成单核苷酸,再用离

Nature子刊:DNA碱基编辑新方法

  10月,国际知名学术期刊《自然-方法(Nature Methods)》在线发表了中国科学院上海生命科学研究院/上海交通大学医学院健康科学研究所常兴研究组题为“Targeted AID -mediated mutagenesis (TAM) enablesefficient genomic div

SNP分子标记的原理及其分型方法的比较

美国学者Eric S. Lander于1996年正式提出单核苷酸多态性(SNP)为第三代分子标记以后,SNP已经广泛应用于经济性状关联分析、生物遗传连锁图谱构建、人类致病基因筛选、致病风险诊断及预测、个体化药物筛选等生物、医学研究领域。在经济作物育种领域,检测SNP可实现对所需性状的早期选择。这

NMN/β-烟酰胺单核苷酸真的可以抗衰老吗?

  首个经科学验证NAD+ 前体NMN衰老抑制剂Herbalmax瑞维拓问世   衰老和死亡是人类永恒的挑战,虽然长生不老在可预见的将来都难以实现,但减缓或者逆转衰老是否可能?   上图中的两只小鼠,左边的毛发乌黑浓密,双目明亮,动作轻盈;而右边的毛发斑白稀疏,眼神暗淡,步履蹒跚。若不提前告知,

Nature子刊:DNA碱基编辑新方法

10月,国际知名学术期刊《自然-方法(Nature Methods)》在线发表了中国科学院上海生命科学研究院/上海交通大学医学院健康科学研究所常兴研究组题为“Targeted AID -mediated mutagenesis (TAM) enablesefficient genomic diver

科学家用头发DNA绘制四千年前古人类肖像

  科学家们在研究中还发现,因努克人有秃头倾向,而且体格健壮,适合北极的严寒天气。研究中所使用的头发样本发现于20世纪80年代,发现地点是格陵兰岛北部地区。自发现以后,这团头发就一直保存于丹麦国家博物馆中。   与古人类皮肤和骨骼中所发现的DNA不同,这种存在于头发中的基因比较容易复原,而不会

欧盟出台限制基因测试新政策

   最近,欧盟出台限制基因测试新政策。这可能缩小了基因测试的应用场景。  医学研究者们并不支持这一限制。一些研究人员聚集在一起并表达了他们的意见。他们认为这个提案会限制基因测试的可用性,不利于社会发展。  基因测试是指通过实验方法来查看一个人的基因(带有遗传信息的DNA)。它可以用来诊断遗传性疾病

高通量、低成本 SNP、突变和甲基化检测方法 ——HRM技术应用

HRM介绍     HRM技术是 high-resolution melting analysis即高分辨熔解曲线分析技术,是近年国外兴起的一种全新的突变扫描和基因分型的遗传分析方法。基于高效稳健的 PCR技术,HRM不受突变碱基位点与类型局限,无需序列特异性探

特异性位点的DNA甲基化的检测方法

相关专题1 甲基化敏感性限制性内切酶 (methylation-sensitive restriction Endonuclease,MS-RE)-PCR/Southern法这种方法利用甲基化敏感性限制性内切酶 对甲基化区的不切割的特性,将DNA消化为不同大小的片段后再进行分析。常使用的甲基化敏感的

单碱基基因编辑研究进展速览

  本文中,小编整理了近年来科学家们在单碱基基因编辑研究领域取得的新进展,分享给大家!  【1】Nat Commun:科学家首次在猪身上实现多位点单碱基编辑  doi:10.1038/s41467-019-10421-8  近日,中国科学院广州生物医药与健康研究院赖良学课题组利用单碱基编辑器首次在猪

离子交换柱层析分离核苷酸实验

离子交换层析法             实验方法原理 本实验以酵母RNA 为材料, 将RNA 用碱水解成单核苷酸,再用离

日本研究人员发现川崎病相关基因

  日本理化研究所研究人员日前宣布,他们发现了与川崎病发病有关的基因,这一基因只要出现微小差异,川崎病的发病风险就会大幅提高。   理化研究所基因组医学研究中心发布公报说,该中心研究人员此前依靠全基因组扫描,发现有10个基因组区域与川崎病相关。在这次研究中,他们重点调查了其中的4号染色体上的区域,

上海生科院发现DNA碱基编辑的新方法

  10月10日,国际学术期刊《自然-方法》(Nature Methods)在线发表了中国科学院上海生命科学研究院/上海交通大学医学院健康科学研究所常兴研究组题为Targeted AID -mediated mutagenesis (TAM) enablesefficient genomic div

单核苷酸多态性(single nucleotide polymorphisms,SNPs)简介

摘要对单核苷酸多态性(single nucleotide polymorphisms,SNPs)的研究分析近几年被广泛应用于生物及医学研究的诸多领域,筛查SNPs的方法很多,各具特色,并一直不断地发展.本文对筛查SNP的几种常用及最新方法做一简要介绍,其中包括PCR-RFLP,分子信标等.细胞外基质

吸烟者是否患癌受遗传影响

  吸烟已被证明对寿命和疾病的发展有严重的影响。已有的很多研究都认为,吸烟通过加速人体老化过程,可能会增加死亡率和提高患上癌症的风险。然而事实上,不是所有的烟民都有早期死亡风险或者患上癌症,而且有很小比例的烟民活得非常久。使用寿命长的吸烟者作的基因组信息为研究对象,研究人员们发现有着特定类型单核苷酸

高通量、低成本 SNP、突变和甲基化检测方法 ——HRM技术应用

  HRM介绍    HRM技术是 high-resolution melting analysis即高分辨熔解曲线分析技术,是近年国外兴起的一种全新的突变扫描和基因分型的遗传分析方法。基于高效稳健的 PCR技术,HRM不受突变碱基位点与类型局限,无需序列特异性探针,在 PCR结束后直接运行高分

研究揭示红斑狼疮相关变异体功能丧失的全新分子机制

  7月25日,中国科学院生物物理研究所娄继忠课题组与浙江大学基础医学院/附属二院陈伟课题组、清华大学生命学院和免疫所刘万里课题组合作在红斑狼疮疾病发病机制研究领域取得新进展,在eLife 杂志上发表了题为FcγRIIB-I232T polymorphic change allosterically

RAPD分析的原理及操作技术

1 目的分子标记是一类建立在分子水平上的遗传标记,它同样具有遗传标记的两个特点,即可遗传性和可识别性。广义的分子标记包括同工酶和DNA分子标记两类,狭义的分子标记则仅指后者。DNA分子标记通常是一些小分子量的DNA片段(几十到2000bp左右),它们大量存在于真核生物的基因组内,能够通过特定的技术和