海洋所科研人员绘制完成牡蛎全基因组序列图谱
近日，牡蛎基因组计划（Oyster Genome Project，OGP）项目组宣布，历时两年的牡蛎基因组序列图谱终于绘制完成。这是世界上第一张养殖贝类的全基因组序列图谱，标志着基于短序列的高杂合度基因组拼接和组装技术获得了重大突破。据悉，目前的基因组图谱已达到国际领先的基因组图谱标准。 近年来，我国的海水养殖业取得了长足发展。根据资料显示，2007年全国水产养殖总产量已达到3490万吨，占世界水产养殖产量的70%，其中海水养殖产量为1384万吨，占到我国水产养殖产量的41%。我国海水养殖产量75%以上是贝类，贝类养殖产业规模和产量均居世界首位。而牡蛎作为贝类的“模式种”，一直受到科学家们的广泛关注。 鉴于国家海洋经济发展战略和现代生物学科的发展需求、牡蛎优越的经济价值及其潜在的基础研究价值，2008年5月，中国科学院海洋研究所研究员张国范博士和美国新泽西州立大学教授郭希明博士联合发起了牡蛎基因组计划，并......阅读全文
海洋所科研人员绘制完成牡蛎全基因组序列图谱
近日，牡蛎基因组计划（Oyster Genome Project，OGP）项目组宣布，历时两年的牡蛎基因组序列图谱终于绘制完成。这是世界上第一张养殖贝类的全基因组序列图谱，标志着基于短序列的高杂合度基因组拼接和组装技术获得了重大突破。据悉，目前的基因组图谱已达到国际领先的基因组图
中科院、华大基因发表Nature新文章
由中国科学院海洋研究所和深圳华大基因研究院领导的一个国际研究小组完成了对太平洋牡蛎(Pacific oyster)的测序、组装与分析，这是第一个测序的软体动物基因组，将有助于填补我们对于种类丰富而较少研究的软体动物家族的了解空白。这一研究在线发布在9月19日的《自然》(Nature)杂志上，
海洋所等在海洋生物对逆境适应进化研究中取得重要进展
9月20日，由中国科学院海洋研究所联合华大基因、美国新泽西州立大学等多家单位完成的牡蛎对潮间带逆境适应机制的研究成果，由《自然》（Nature）杂志以长篇论文（Article）形式在线发表。 该研究利用新一代测序技术和全新的组装策略，构建了牡蛎全基因组序列图谱，证实了牡蛎基因组序列具有极
牡蛎基因组测序项目在中科院海洋所正式启动
牡蛎基因组测序项目(OGP)日前在中科院海洋所正式启动。 中国科学院海洋研究所介绍，开展牡蛎全基因组测序和组学研究，揭示牡蛎各种特异性状的基因组学基础，可以提升贝类和海洋基因组学研究水平，促进发展贝类养殖产业健康和可持续发展。 中国是牡蛎的故乡，分布有近20种牡蛎。牡蛎是一种重要的海洋生物资源，
中国完成海带等7种海洋生物全基因组测序
中国科学家10月30日在青岛首次披露了海带、栉孔扇贝和南美白对虾全基因组测序的部分成果，至此中国已完成7种大型海洋生物的全基因组测序，为改良这些海洋生物品质、提高产量奠定了科学基础。 中国的海洋生物基因组学研究虽然起步较晚，但现在一些研究成果已达到国际前沿水准。目前，人类完成全基因组测序的
中国学者9月参与发表多篇Nature文章
进入九月份，中国学者参与的多项研究在Nature杂志及其重要子刊上发表，其中主要包括的是太平洋牡蛎(Pacific oyster)基因组的测序、组装与分析，一种肠道细菌中的重要蛋白：Tir的作用，以及增强型绿色荧光蛋白的荧光会由于激光而被关闭等。 首先由中国科学院海洋研究所和深圳华大基
攻克基因组测序难题－探究茶树生物学奥秘
我国现存最早的中医医药典籍《本草经》记载：“神农尝百草，日遇七十二毒，得荼（茶）而解之。”这说明了茶的神奇功效。茶树起源于我国的云南、四川等地，在从中国向世界各地数千年漫长传播历程里，与全球多元文化邂逅交融，发展形成了今天地球上复杂而美妙的茶文化。茶之所以广受欢迎，除了有迷人的香气和令人愉悦的滋
《PLoS生物学》：老鼠全基因组测序图公布
最新一期的开放存取的《公共科学图书馆·生物学》(PLoS Biology)杂志上，美国、英国和瑞典的研究人员公布了老鼠的全基因组测序图。老鼠成为继人类之后第二个完成全基因组测序的哺乳动物。 在对人类和老鼠的基因测序图进行综合性比较后，研究人员发现两者之间的遗传差异要比人们预想的大得多。老鼠
牡蛎全基因组序列图谱绘制完成
牡蛎基因组部分序列及其分析牡蛎基因组计划（OGP）团队成员在深圳华大基因研究院讨论项目中国科学院海洋研究所和深圳华大基因研究院签约仪式牡蛎是产量最大的海水养殖动物 牡蛎养殖 近日，牡蛎基因组计划（Oyster Genome Project，OGP）项目组宣布，
活跃基因诠释牡蛎生存智慧
昨天凌晨，英国《自然》杂志网站在线发表了来自中国科学家的一项成果：他们完成了牡蛎的基因组测序，并从中窥视到了牡蛎应对极端生活环境的种种生存智慧。 牡蛎是动物界中的一大支系――冠轮动物（特点为身体柔软，体型多变）的代表，是一种具有重要经济、生态价值的贝类。论文通讯作者、中国科学院海洋研究所张国范研
《基因组生物学》：一种超级细菌的基因组测序完成
最近，英国桑格研究所（Wellcome Trust Sanger Institute）和布里斯托尔大学的研究者们共同完成了一种名为Steno的超级细菌的基因测序工作，研究结果显示，这是一种具有显著抗药性的生物体。对这种细菌基因组的了解将有助于研究者们发现如何应对这种具有独特抗药性的生物体。这一研究论
海洋所在牡蛎基因组编辑方面获进展
近日，中国科学院海洋研究所实验海洋生物学重点实验室张琳琳团队在牡蛎基因组编辑方面获新进展。相关研究成果发表在Frontiers in Marine Science（DOI：10.3389/fmars.2022.912409）上。 随着高品质动物蛋白需求的增长，水产养殖正成为人类食用海产品的主要
“千种动植物基因组计划”一期启动100多种测序
由深圳华大基因研究院发起的“千种动植物基因组计划”，一期已启动100多种动植物基因组测序分析项目，其中近一半的项目已经完成或接近尾声。 华大基因5月13日召开发布会称，该“千种计划”在重要物种基因组学研究领域和巨型基因组数据库构建上取得阶段性进展，该计划将加速全球基因组学研
揭示近江牡蛎种质资源格局的形成机制
近日，中国科学院海洋研究所贝类遗传与进化研发团队在《通讯-生物学》（Communications Biology）上在线刊发了关于牡蛎环境适应演化机制的研究论文Genome of the estuarine oyster provides insights into climate impact
基因组测序
如果楼主指的是人类基因组计划，那时用的方法叫做双脱氧终止法，也叫做sanger法。它的原理是在DNA合成过程中，DNA聚合酶能够使用ddNTP(双脱氧核苷酸）来作为原料，但它的反应会在加入ddNTP的时候终止。具体实验是通过PCR来完成的，但与普通PCR不同，它只需要一个引物而不是一对。在4个相同的
“千种动植物基因组计划”一期完成
记者近日从深圳华大基因研究院获悉，由该院发起的“千种动植物基因组计划”一期在重要物种基因组学研究领域和巨型基因组数据库构建上取得阶段性进展。 于2010年1月正式启动的“千种动植物基因组计划”（简称“千种”计划）预计在未来两年内将破译千种具有重要经济和科研价值的动植物物种基因
探秘海洋生物－赋能蓝色产业
谈到我国海洋生物学的发展，不能不提位于青岛黄海之畔的中国科学院海洋研究所（以下简称海洋所）。它是发源于70年前新中国第一个海洋生物研究机构。 今天，海洋所已为我国海洋生物研究练就一支生力军，培育了一个完整的链条。从探秘生命奥秘到建设“蓝色粮仓”，从发展海洋生物高技术到开发利用蓝色基因资源，从这
长牡蛎和栉孔扇贝全基因组框架图绘制完成
日前，长牡蛎和栉孔扇贝全基因组框架图绘制完成，并筛查得到与重要性状相关的基因或信号通路，在国际上填补了冠轮动物基因组学研究空白。 这是在国家863计划支持下，由中国海洋大学、中国科学院海洋研究所、中国水产科学研究院黄海水产研究所、中国科学院南海海洋研究所、威海长青海洋科技股份有限公司、大连獐子
著名海洋生物学家刘瑞玉院士逝世
中国共产党党员、九三学社社员、中国科学院资深院士，第六届全国人大代表，中国科协全国委员会委员、第四届山东省政协常委、九三学社山东省第二届副主委、山东省科协第二和第三届副主席、青岛市政协第八届副主席，九三学社青岛市第八届主委、中国海洋湖沼学会名誉理事长、国际黄海研究学会名誉主席、国际甲壳动物学会理
海洋生物学家海中遭大白鲨跟踪
北京时间1月10日消息，据英国《每日邮报》报道，独自乘坐一条小橡皮艇的海洋生物学家特雷·斯诺曾希望悄悄跟踪一只大白鲨。但是最近他却被这种世界上最可怕的杀手所跟踪。 大白鲨跟踪独木舟 最初，这只体型庞大的动物潜入海底，从下面观察特雷乘坐的皮船，然后以具有威胁性的方式浮出水面。然而对特雷来
PCR技术在－生态及海洋生物学的应用
对分析来说,传统分子技术所需的组织样品用量相对较多。尤其是许多无脊椎动 物,它们对于进行分子检测所用的一般操作方法来讲太小。因此,对于小生物、共生 生物或那些在培养基中不易生长的生物个体的直接分析是困难。聚合酶链反应有和来 扩大能进行分子检测的生物范围。现在可以直接研究象原生物和藻类等单细胞生物自
全基因组测序的竹亚科及生物学性状的比较基因组学研究
禾本科（禾草）是被子植物最大科之一，约有12000种，是水稻、小麦、玉米等人类粮食和牲畜饲料的主要来源，也为人类提供了加工淀粉、制糖、酿酒、造纸、编织和建筑等方面的重要原料。同时，禾本科又是植物遗传学和基因组学研究的模式类群。竹亚科（竹子）是禾本科的12个亚科之一，与早熟禾亚科、稻亚科组成BOP
解码“基因组学之父”桑格：测序，测序，测序
“桑格当之无愧地被称为‘基因组学之父’，他的工作为人类读取和理解基因代码奠定了基础，彻底变革了生物学并极大促进了当今的医学发展。”、 有一天，65岁的英国生物化学家弗雷德里克·桑格(Frederick Sanger)突然停下手中的试验，转身走出实验室，宣布自己正式退休。那一年是1983
基因组测序仪简介
基因组测序仪是一种用于生物学领域的分析仪器，于2012年12月19日启用。 技术指标 个体化基因组测序仪主机/ION TORRENT主机。 主要功能 样品处理、快速的运行时间以分析单个或多个样品 支持多重文库，从而实现最大的效率和经济性 可在必要时禁用个别测序通道，以节约试剂用量。
PNAS：甜瓜基因组测序
甜瓜在世界范围具有很高的经济价值，日前西班牙的九个研究中心通力合作，利用罗氏454平台完成了甜瓜基因组的测序。除了甜瓜的全基因组，科学家还得到了 7个特定甜瓜品种的基因组，文章发表在Proceedings of the National Academy杂志上。 联合国粮农组织2009年
认识泛基因组测序
什么是泛基因组？2005年，Tettelin等人提出了微生物泛基因组概念（pangenome，pan源自希腊语‘παν’，全部的意思），泛基因组即某一物种全部基因的总称。2009 年，Li等人首次采用新全基因组组装方法对多个人类个体基因组进行拼接，发现了个体独有的DNA序列和功能基因，并首次提出了“
海洋所合作在牡蛎适应进化研究中取得新进展
中国科学院海洋研究所研究员张国范团队与美国新泽西州立大学教授郭希明、佛罗里达大学教授Gary Litman合作，在长牡蛎免疫相关基因的进化和功能分化研究方面取得新进展。 该研究发现，牡蛎免疫基因除高度扩张外，更为有趣的是多个基因家族以及家族中的不同成员均在病原和非病原类胁迫防御中发挥着重要作用
454测序用于美洲奶牛种牛基因组测序项目
一只名为Pawnee Farm Arlinda Chief的种牛和它的儿子Walkway Chief Mark大约有60000个后代，其后代是牛奶生产的主力。最近一项研究中1，科学家通过454全基因组测序，掌握了他们的基因组中控制重要性状的基因，包括抗病能力、牛奶产量，这些性状已通过北美的当
我国完成小麦A基因组测序
本报讯（记者丁佳）5月10日，《自然》杂志刊发了中国科学院的一项最新成果，该项研究完成了小麦A基因组的测序和染色体精细图谱的绘制。 这项由中科院遗传与发育生物学研究所植物细胞与染色体工程国家重点实验室、中科院种子创新研究院和遗传发育所基因组分析平台等合作完成的研究，全面揭示了小麦A基因组的结构和
测序解读基因组，真的好吗？
测序解读基因组，真的好吗？ “对基因组了解过多也不全是好事。”贝勒医学院生物医学伦理学副教授、医学伦理和健康中心主任Amy McGuire，在今年旧金山举办的TEDMED机构年度大会上说，“尤其是对自己基因组信息的了解。” 虽然McGuire 从事人类基因组学研究已有多年，但