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棉花“甲基化基因图谱”首次绘成

30日出版的《基因组生物学》杂志刊登了中美科学家合作的一项重要研究成果:他们首次绘制出棉花表观遗传基因的“甲基化基因图谱”,即野生棉和种植棉之间500多种表观遗传基因的差异,为生物技术公司通过表观修饰育种培育出高产优质棉花提供了重要线索。 几十年来,科学家们发现,许多动植物的表观特征,既可用基于DNA序列改变的遗传学方法调控,也能用不改变DNA序列的表观遗传学方法进行可遗传性修饰。这些研究成果为动植物育种开启了全新路径,特别是利用表观遗传学技术,不需改变基因,就能创造出全新品种,可规避人们对转基因技术的质疑和争论。 在最新研究中,南京农业大学张天真教授课题组与德克萨斯大学杰夫瑞·陈的课题组合作,通过将美国陆地棉与野生棉对比,识别出500多种与DNA甲基化过程有关的基因开关列表,从而绘制出了这份棉花的“甲基化基因图谱”。DNA甲基化是一种重要的表观遗传修饰过程,新图谱信息可提供棉花在100多万年进化过程中的表观基因变化,帮......阅读全文

多囊卵巢综合征病人基因组的DNA甲基化免疫沉淀反应分析

  多囊卵巢综合征(Polycystic ovary syndrome, PCOS)是一种复杂的、病因不明的疾病,最新研究结果表明,胰岛素耐受(insulin resistance , IR)在PCOS的发生过程中起了重要的作用。本研究主要致力于探究IR在PCOS发生过程中的分子机制,运用基因组DN

多囊卵巢综合征病人基因组DNA甲基化免疫沉淀反应分析

  多囊卵巢综合征(Polycystic ovary syndrome, PCOS)是一种复杂的、病因不明的疾病,最新研究结果表明,胰岛素耐受(insulin resistance , IR)在PCOS的发生过程中起了重要的作用。本研究主要致力于探究IR在PCOS发生过程中的分子机制,运用基

多囊卵巢综合征病人基因组的DNA甲基化免疫沉淀反应分析

多囊卵巢综合征(Polycystic ovary syndrome, PCOS)是一种复杂的、病因不明的疾病,最新研究结果表明,胰岛素耐受(insulin resistance , IR)在PCOS的发生过程中起了重要的作用。本研究主要致力于探究IR在PCOS发生过程中的分子机制,运用基因组

DNA甲基化研究方法的回顾与评价(图)

摘要: DNA 甲基化是表观遗传学(Epigenetics)的重要组成部分,在维持正常细胞功能、遗传印记、胚胎发育以及人类肿瘤发生中起着重要作用,是目前新的研究热点之一。随着对甲基化研究的不断深入,各种各样甲基化检测方法被开发出来以满足不同类型研究的要求。这些方法概括起来可分为三类:整体水平的甲

Science解读甲基化组新观点

  在真核生物中,DNA甲基化通常发生在CG中的胞嘧啶上。由于甲基化不会改变DNA序列,它被视为一种表观遗传学标志。DNA甲基化可以在细胞分裂过程中延续到子代细胞,这一机制现在已经相当明确。而这种继承性使DNA甲基化成为储存表观遗传学记忆的潜在途径,这种记忆包括环境或发育过程中的基因调控。不过要证实

DNA甲基化研究方法的回顾与评价

摘要: DNA甲基化是表观遗传学(Epigenetics)的重要组成部分,在维持正常细胞功能、遗传印记、胚胎发育以及人类肿瘤发生中起着重要作用,是目前新的研究热点之一。随着对甲基化研究的不断深入,各种各样甲基化检测方法被开发出来以满足不同类型研究的要求。这些方法概括起来可分为三类:基因组整体水平的甲

基因组所最新成果揭示精子对遗传使命的新贡献

  20世纪生命科学的快速发展证实了遗传的物质载体是DNA,DNA序列可以稳定地从父母遗传到子代中去,从而使物种得以延续。但如果仅仅只是DNA序列的遗传,难以解释为什么一个受精卵细胞可以发育成一个包含多种不同细胞、组织和器官的复杂生命个体。   最近20年的研究发现,表观遗传信息通过有序地开启和关

5篇m6A甲基化文章教你如何使用纯测序数据得高分

2019年m6A修饰曾创下单月发表100+篇10分影响因子文章佳话。2020年1月17日何川教授团队最新Science揭示了m6A新功能---调控染色质状态和转录预示m6A等RNA修饰将仍然是目前最为热门的科研方向。 云序生物是国内最早提供m6A测序的科研平台,也是客户发表文章最多的RNA甲基化测

5篇m6A甲基化文章教你如何使用纯测序数据

文章导读2019年m6A修饰曾创下单月发表100+篇10分影响因子文章佳话。2020年1月17日何川教授团队最新Science揭示了m6A新功能---调控染色质状态和转录预示m6A等RNA修饰将仍然是目前最为热门的科研方向。m6A甲基化与mRNA关联分析案例一:非洲爪蟾睾丸组织中m6A甲基化图谱发表

5篇m6A甲基化文章教你如何使用纯测序数据得高分

  文章导读   2019年m6A修饰曾创下单月发表100+篇10分影响因子文章佳话。2020年1月17日何川教授团队最新Science揭示了m6A新功能---调控染色质状态和转录预示m6A等RNA修饰将仍然是目前最为热门的科研方向。   云序生物是国内最早提供m6A测序的科研平台,也是客户发表

同时检测各类癌症当中RNA甲基化相关酶&RNA甲基化水平(下)

  又到了一周云序生物课堂开讲时间!你,准备好了吗?   上一期文章当中,云序通过引用这样一张表格给大家传递了一个重要信息:表中的METLL3、METTL14、NSun2、FTO、ALKBH5、YTHDF2均是RNA甲基化重要的酶,而且这些酶在不同疾病当中意义有所不同,例如METTL3在AML、B

快速检测各类癌症当中RNA甲基化相关酶&RNA甲基化水平(下)

  又到了一周云序生物课堂开讲时间!你,准备好了吗?   上一期文章当中,云序通过引用这样一张表格给大家传递了一个重要信息:表中的METLL3、METTL14、NSun2、FTO、ALKBH5、YTHDF2均是RNA甲基化重要的酶,而且这些酶在不同疾病当中意义有所不同,例如METTL3在AML、B

遗传发育所在G蛋白提高水稻氮利用率的研究中取得进展

  哺乳动物受精后由一个受精卵发育成一个完整的个体,DNA甲基化则是指导受精卵发育成早期胚胎、进而发育成完整个体的最重要表观遗传调控方式之一。中国科学院北京基因组研究所刘江团队2013年揭示模式生物斑马鱼继承父代精子的甲基化图谱,但哺乳动物子代如何继承表观遗传信息仍知之甚少。刘江团队与南京大学黄行许

看表观新修饰-6mA甲基化如何助力IF飙升!

  DNA甲基化修饰是表观遗传研究的热点之一,我们通常认为DNA甲基化就是胞嘧啶甲基化(5-methylcytosine, 5mC),却不知道随着测序技术的快速发展,科研者们已经在真核生物中(果蝇 、真菌、莱茵衣藻、秀丽隐杆线虫等)发现了一种新的DNA甲基化修饰—DNA-6mA甲基化,且DNA-6m

检测各类癌症当中RNA甲基化相关酶&RNA甲基化水平(下)

  又到了一周云序生物课堂开讲时间!你,准备好了吗?   上一期文章当中,云序通过引用这样一张表格给大家传递了一个重要信息:表中的METLL3、METTL14、NSun2、FTO、ALKBH5、YTHDF2均是RNA甲基化重要的酶,而且这些酶在不同疾病当中意义有所不同,例如METTL3在AML、B

作物基因组学研究进展

  摘要:农作物基因组学研究的发展,对于有效利用现代分子生物学手段进行物种的遗传改良发挥了重要作用。随着测序技术的发展,已经实现对重要农作物,如水稻、小麦、玉米、大豆、油菜、棉花、蔬菜等作物基因组的测序或重测序,在此基础上完成对控制重要农艺性状基因的克隆和鉴定。本文综述了2017年度主要农作物基因组

胚胎发育之谜?刘江揭开面纱

  DNA甲基化是一种重要的表观遗传修饰。以高等动物为例,个体从受精卵发育成成体的过程中,DNA甲基化图谱都是动态变化的,会调控不同的细胞往不同的方向分化。因此,建立DNA甲基化图谱对理解生殖细胞形成和胚胎发育至关重要。刘江(中)团队合影  在基金委“细胞编程和重编程的表观遗传机制”重大研究计划中,

朱健康院士PLOS发表植物学新研究

  2015年1月8日,中科院上海生命科学研究院朱健康课题组,在国际著名学术期刊《PLOS Genetics》发表一项最新研究成果,题为“An AP Endonuclease Functions in Active DNA Dimethylation and Gene Imprinting in A

中国学者发表6篇Nature,在生命科学领域取得重大进展

  iNature  2019年9月4日,中国学者在Nature连续发表了6项成果,涉及生命科学,天文学,地球科学等不同的领域,iNature系统介绍这些成果:  【1】混合谱系白血病(MLL)家族的甲基转移酶  -包括MLL1,MLL2,MLL3,MLL4,SET1A和SET1B-在赖氨

中国科学家研究显示:父亲的基因更强大

  孕妇肚子里胚胎的早期发育主要由卵子决定的认识或要终结了。过去,人们发现卵子的体积很大、富含蛋白质和RNA,而精子的体积很小、几乎仅能携带一半的 DNA,因此推断,决定早期发育的信息几乎都在卵子中,而由中国科学院北京基因组研究所研究员刘江领导团队完成的研究称,DNA甲基化的图谱是来源于精子的,

DNA甲基化与拟南芥的免疫力

  DNA甲基化有助于拟南芥的免疫力,它动态调控了某些基因的表达,让植物能够抵御细菌感染。近日,一篇在线发表于《PNAS》上的文章阐述了以上研究成果。   美国加州索尔克生物学研究所(Salk Institute for Biological Studies)的研究人员利用MethylC测序鉴

组蛋白研究进展速览!

  本文中,小编盘点了多篇研究报告,共同解析科学家们在组蛋白研究上取得的新成就,与大家一起学习!图片来源:Daniel N. Weinberg et al,doi:10.1038/s41586-019-1534-3  【1】Nature:揭示组蛋白标记H3K36me2招募DNMT3A并影响基因间DN

续写十大科学突破 Science公布重要甲基化图谱

  来自耶路撒冷希伯来大学的科学家们在一项最新研究中,重构了尼安德特人与丹尼索瓦人的DNA甲基化图谱,并将其进行了比对,这对于深入探索表观遗传学调控机制,以及表观遗传差异造成的形态学差异具有重要意义。   2010年,2012年Science十大科学突破接连聚焦于古人类的DNA基因组序列测定结果,

作物基因组学研究进展(三)

⑸棉花基因组研究棉花是重要的天然纤维和油料作物,也是研究多倍体进化和作物驯化的重要模式植物。南京农业大学张天真等课题组通过将栽培棉与野生棉对比,绘制出了棉花表观遗传基因的“甲基化基因图谱”,对野生棉和栽培棉之间超过1200万个的差异甲基化胞嘧啶进行分析,鉴定出519个表观等位基因(epiallele

北京基因组所等首次精准解析结核分枝杆菌复合群甲基化

  结核病是全球最常见的传染病之一,据WTO“2015年全球结核病年报”报告,2014年全球新增感染人数960万,死亡150万,新增耐多药结核(MDR)病例48万(其中我国新增结核感染病例93万,居全球第三位),其目前仍是全球第二大传染病。结核分枝杆菌复合群(Mycobacterium tuberc

研究人员首次精准解析结核分枝杆菌复合群甲基化图谱

  结核病是全球最常见的传染病之一,据WTO“2015年全球结核病年报”报告,2014年全球新增感染人数960万,死亡150万,新增耐多药结核(MDR)病例48万(其中我国新增结核感染病例93万,居全球第三位),其目前仍是全球第二大传染病。结核分枝杆菌复合群(Mycobacterium tuberc

两篇Cell文章发现精子的作用远不止DNA遗传

  一般认为胚胎早期发育过程中,精子仅仅提供DNA遗传信息,其它方面主要由卵细胞决定,然而最新一期(5月10日)Cell杂志上接连公布了两项研究成果,指出精子的表观遗传学信息也会影响子代胚胎发育,这颠覆了传统上认为早期胚胎发育主要是由卵子决定的观念,也对于发育生物学和癌症生物学具有重要的意义。  

Nature重大成果:最全面的人类器官表观基因组图谱

  多年来,科学家们成功获得了人类基因组的工作图——编码人类生命的完整DNA序列图像。而现在他们仍然在往这一图集添加新页面——散布在DNA链上,影响了基因抑制的化学标记物——甲基的图谱。  来自Salk研究所的科学家们报告称,他们构建出了来自个体捐赠者(包括女人、男人和孩子)十多种不同人类器官最全面

表观新修饰-6mA甲基化助力IF飙升(一)

DNA甲基化修饰是表观遗传研究的热点之一,我们通常认为DNA甲基化就是胞嘧啶甲基化(5-methylcytosine, 5mC),却不知道随着测序技术的快速发展,科研者们已经在真核生物中(果蝇 、真菌、莱茵衣藻、秀丽隐杆线虫等)发现了一种新的DNA甲基化修饰—DNA-6mA甲基化,且DNA-

云序RNA修饰技术余义勋课题组植物m1A修饰调控机制的运用

  导读   RNA甲基化修饰在调控生物生长发育的过程中起重要作用,m6A和m5C在植物体内的产生机制和生物学功能已有较多研究论文发表,然而RNA m1A(N1-甲基腺嘌呤)修饰在植物中的研究还非常少。   近日,Plant Physiology 在线发表了华南农业大学余义勋课题组题为“The