表观新修饰6mA甲基化助力IF飙升（二）
3、数据分析标准分析：（1）DNA甲基化富集峰的识别通过高通量测序和生物信息分析，识别甲基化富集的基因组区域，默认p <= 1e-5（具体参数以报告为准，云序生物会根据数据，适当调整参数）的峰为统计上显著的甲基化区。注：每个样品组做一个Input，以去除基因组背景，降低假阳性率。（2）DNA甲基化区域富集峰的注释富集峰识别后，得到的是一堆基因组位置信息，通过生物信息分析利用最邻近基因对富集峰进行注释，并根据峰中点相对于已知基因的位置，将富集峰为启动子峰、上游峰、内含子峰、外显子峰、基因间峰。（3）DNA甲基化富集峰区域的在基因中的分布 （4）差异DNA甲基化区域的鉴定（DMRs）与注释云序生物使用diffReps软件进行差异甲基化区（differentially methylated regions，DMRs）鉴定。默认p-value<0.0001，fold change >=2作为差异甲基化区的阈值......阅读全文
表观新修饰-6mA甲基化助力IF飙升（二）
3、数据分析标准分析：（1）DNA甲基化富集峰的识别通过高通量测序和生物信息分析，识别甲基化富集的基因组区域，默认p
表观新修饰-6mA甲基化助力IF飙升（一）
DNA甲基化修饰是表观遗传研究的热点之一，我们通常认为DNA甲基化就是胞嘧啶甲基化（5-methylcytosine, 5mC），却不知道随着测序技术的快速发展，科研者们已经在真核生物中（果蝇 、真菌、莱茵衣藻、秀丽隐杆线虫等）发现了一种新的DNA甲基化修饰—DNA-6mA甲基化，且DNA-
看表观新修饰-6mA甲基化如何助力IF飙升!
DNA甲基化修饰是表观遗传研究的热点之一，我们通常认为DNA甲基化就是胞嘧啶甲基化（5-methylcytosine, 5mC），却不知道随着测序技术的快速发展，科研者们已经在真核生物中（果蝇 、真菌、莱茵衣藻、秀丽隐杆线虫等）发现了一种新的DNA甲基化修饰—DNA-6mA甲基化，且DNA-6m
如何快速查找LncRNA序列
查找LncRNA序列的网站有很多，包括Genebank，Ensembl，RefSeq，UCSC数据库等。今天，小编就给大家讲讲如何通过LncRNA ID号查找LncRNA的序列。 一．根据LncRNA来源数据库，进入相应链接。 1. Genebank：https://www.ncb
动物所发表有关6mADNA修饰的综述文章
DNA甲基化修饰作为重要的表观遗传修饰之一，广泛存在于多种生物的DNA基因组中。DNA甲基化参与许多重要的生物学过程，如细胞命运决定、发育和组织、器官的形成和稳态维持；其调控的异常与人类疾病密切相关，如肿瘤。因此，DNA甲基化修饰的调控机理一直以来是人们关注的热点之一。 DNA甲基化以多种修饰
施扬、何川教授发表Nature综述：新表观遗传学标记
N6-甲基腺嘌呤（N6-methyladenine，6mA）是一种广泛存在于原核生物的甲基化修饰碱基，主要在宿主防御系统中起作用。最近科学家们发现，6mA在真核生物中也比较普遍，而且承担着重要的生物学功能。 哈佛大学的施扬（Yang Shi）教授和芝加哥大学的何川（Chuan He）教授日前在
科学家发现高等真核生物中DNA新修饰方式
DNA甲基化作为重要表观遗传机制调控基因的表达，从而影响一系列的生物学过程，如细胞命运决定、发育和组织、器官的稳态维持。医学上，DNA甲基化失调与人类疾病密切相关，如肿瘤。DNA甲基化以多种修饰方式[5-methylcytosine (5mC), N6-methyladenine (6mA) 和
中国科学家3篇Cell文章表观遗传学重大发现
一度被认为在线虫和果蝇中即便不是不存在但也不会多见的DNA甲基化表观遗传标记，实际上普遍存在于这些生物体和藻类的整个基因组，且其并非发生于在哺乳动物中已知被修饰的胞嘧啶而是在腺嘌呤上。来自中外的华人科学家将这一重大发现发布在4月30日《细胞》（Cell）杂志上的3篇研究论文中。 西班牙塞维利亚
中国科学家3篇Cell文章表观遗传学重大发现
一度被认为在线虫和果蝇中即便不是不存在但也不会多见的DNA甲基化表观遗传标记，实际上普遍存在于这些生物体和藻类的整个基因组，且其并非发生于在哺乳动物中已知被修饰的胞嘧啶而是在腺嘌呤上。来自中外的华人科学家将这一重大发现发布在4月30日《细胞》（Cell）杂志上的3篇研究论文中。 西班
Cell子刊：挑战传统理论的lncRNA
一度被认为在线虫和果蝇中即便不是不存在但也不会多见的DNA甲基化表观遗传标记，实际上普遍存在于这些生物体和藻类的整个基因组，且其并非发生于在哺乳动物中已知被修饰的胞嘧啶而是在腺嘌呤上。来自中外的华人科学家将这一重大发现发布在4月30日《细胞》（Cell）杂志上的3篇研究论文中。 西班牙塞维利亚