Nature:乳腺癌的第一次大规模蛋白组基因组研究成果

基于癌症基因组的Atlas (TCGA)计划的数据,美国的科学家联合小组已经完成乳腺癌的第一次大规模“蛋白基因组(proteogenomic)”研究,将DNA突变联系到蛋白信号并帮助确定癌症驱动基因。这项研究由美国国家癌症研究所的肿瘤临床蛋白质组学分析联盟成员进行,包括贝勒医学院、MIT和哈佛的Broad研究所,Fred Hutchinson癌症研究所,纽约大学Langone医学中心和华盛顿大学医学院。这项研究工作主要针对蛋白质,以及它们的修饰来更好地理解癌症。发表在6月2日的Nature上的相关文章表明了整合基因组和蛋白组数据获得更完整的癌症生物学图景,比任何单独的分析都要全面。 1联系起基因组和蛋白组及磷酸蛋白组 文章的一名资深作者,贝勒医学院的Matthew Ellis博士说啊:“我们对复杂的癌症基因组如何会导致复发和死亡率的驱动生物学并不完全了解。这些发现的结果表明,蛋白基因组整合有一天会被证明是一个强大的临床工......阅读全文

Nature:乳腺癌的第一次大规模蛋白组基因组研究成果

  基于癌症基因组的Atlas (TCGA)计划的数据,美国的科学家联合小组已经完成乳腺癌的第一次大规模“蛋白基因组(proteogenomic)”研究,将DNA突变联系到蛋白信号并帮助确定癌症驱动基因。这项研究由美国国家癌症研究所的肿瘤临床蛋白质组学分析联盟成员进行,包括贝勒医学院、MIT和哈佛的

胎牛血清中蛋白组分

胎牛血清 (Fetal Bovine Serum ,FBS) 是在屠宰怀孕母牛的时候, 通过心脏穿刺采取胎牛血获取的血清, 因其未与外界环境接触,所以血清内 IgG 等免疫因子相对含量较少,适合用于免疫类细胞的培养。1 胎牛血清与新生牛血清、小牛血清的区别简介1.1 分类与命名目前国内对牛血清的分类

穿越蛋白组学数据丛林

数据处理,验证,标准和蛋白质定量都是2007年10月在韩国举行的第六届人类蛋白质组组织(HUPO)世界年度会议的主题讨论内容。 HUPO成立于2001年2月,即人类基因组首张草图公布的同一周。现在,该组织的委员会有来自19个国家的48名成员,总部位于加拿大的麦吉尔大学以及蒙特利尔的基因组魁北克创新

蛋白组学的研究方法

蛋白组学的研究方法如下:蛋白质组学的发展既是技术所推动的也是受技术限制的。蛋白质组学研究成功与否,很大程度上取决于其技术方法水平的高低。蛋白质研究技术远比基因技术复杂和困难。不仅氨基酸残基种类远多于核苷酸残基(20/4), 而且蛋白质有着复杂的翻译后修饰,如磷酸化和糖基化等,给分离和分析蛋白质带来很

关于组蛋白组成部分的介绍

  组蛋白是存在于染色体内的与DNA结合的碱性蛋白质,染色体中组蛋白以外的蛋白质成分称非组蛋白。绝大部分非组蛋白呈酸性,因此也称酸性蛋白质或剩余蛋白质。组蛋白于1834年由德国科学家A.科塞尔发现。组蛋白对染色体的结构起重要的作用。染色体是由重复单位──核小体组成。每一核小体包括一个核心8聚体(由4

AB-SCIEX下一代蛋白组学平台为蛋白组学研究带来全新变革

  具备SWATH™ 采集技术 2.0 的全新TripleTOF® 6600系统在每一次运行中可捕获每一个可检测到的蛋白和肽段,从而深入洞察蛋白质组   ASMS 2014—巴尔的摩,马里兰州   2014年6月17日—全球生命科学分析技术的领导者AB SCIEX公司今天宣布推出用于定量蛋白

染色质蛋白组蛋白的相关介绍

  组蛋白是构成真核生物染色体的基本结构蛋白,富含带正电荷的Arg和Lys等碱性氨基酸,等电点一般在pH10.0以上,属碱性蛋白质,可以和酸性的DNA紧密结合,而且一般不要求特殊的核苷酸序列。  用聚丙烯酰胺凝胶电泳可以区分5种不同的组蛋白:H1、H2A、H2B、H3和H4。几乎所有真核细胞都含有这

蛋白组学分析软件一览

蛋白组学分析软件 StartFragmentProtParam 瑞士蛋白质专家分析系统中的子程序,适用于蛋白质序列的物理-化学参数(氨基酸、原子组成,等电点,消光系数等) MultiIdent 瑞士蛋白质专家分析系统中的子程序,适用于通过等电点、分子量、氨基酸组成、序列标签、肽指纹数据等识别蛋白 A

蛋白组学的研究意义是什么

  蛋白质组学,是以蛋白质组为研究对象,研究细胞、组织或生物体蛋白质组成及其变化规律的科学。这个概念最早是在1994年,由Marc Wikins首先提出的新名词。  随着人类基因组计划的实施和推进,生命科学研究已进入了后基因组时代。在这个时代,生命科学的主要研究对象是功能基因组学,包括结构基因组研究

Science:首次揭示蛋白组亚细胞结构定位地图

  对于人细胞中的蛋白是如何在细胞中定位的首次分析于5月11日在线发表在Science上,这项研究,揭示了在给定的一个细胞中,大部分的人类蛋白被发现存在一个以上的定位位置。  基于瑞典的Cell Atlas计划,研究人员检查了对应大部分蛋白编码基因的人类蛋白组的空间分布,空前地详细描述了蛋白在多个细

磷酸化蛋白组学需要多少蛋白

蛋白质磷酸化发挥作用的途径:(信号传导)2. 真核细胞蛋白质磷酸化位点一般位于(丝氨酸)、(苏氨酸)、(赖氨酸)3. 蛋白激酶在细胞信号转导途径主要作用:(调节细胞活性)、(放大传导信号)4. 目前常用的磷酸肽富集方式(TiO2)、(IMAC)5. 磷酸化蛋白组定性分析包括(单一磷酸化位点鉴定)、(

CCR:“癌症登月”想要成功不应忽视蛋白组学

  最近一篇发表在国际学术期刊Clinical Cancer Research上的文章指出,美国启动的癌症登月计划除了进行基因组学研究还应当靶向直接推动癌症发展的蛋白质。  巴拉克奥巴马总统在今年年初对国会发表的国情咨文中提出国家癌症登月计划。据估计明年将有10亿美元投入到该计划中,主要聚焦在免疫治

赛默飞推出蛋白组学研究云平台

  分析测试百科网讯 赛默飞在ASMS 2015 推出了一个云计算平台,其可支持蛋白质组学数据,以补充现有的数据模块 Sanger 测序和定量聚合酶链反应(定量PCR),使研究人员在蛋白质组学,基因组学和代谢组学等领域更接近于使用一个单一的平台,使数据的存储、分析实现共享和协作。   “现有的科学数

蜂王浆蛋白组分能维持干细胞多能性

  据英国《自然·通讯》杂志5日发表的一项研究,美国科学家团队发现,蜂王浆的蛋白组分——名为Royalactin的蛋白质能够维持小鼠胚胎干细胞的多能性。该研究同时指出,在哺乳动物体内发现了其结构类似物,对干细胞多能性具有类似的促进作用,揭示了干细胞自我更新的内在机制。  蜂王浆是蜜蜂的“蜂后制造者”

质谱技术在蛋白组研究中的应用(二)

6 质谱仪的最新进展 用质谱检测蛋白,首先考虑到用PMF与 MALDI-TOF联用,如果无法检测,下一步就用ESI-MS/MS创建序列标签。在PMF分析中,MALDI的平板中只需一小部分样本就足以检测,剩下的样本就可以用来创建序列标签。并且,在MALDI-TOF仪器上,用一种叫做“源后延迟”

改善蛋白组学研究图像分析的新软件

对双向电泳(2DGE)等蛋白分离实验的图像进行分析不仅耗时,而且经常丢失样本或得出假阳性结果。上周在伦敦举行的AngloNordic Biotech Conference IV会议上 ,瑞典Ludesi公司CEO Ola Forsstrom-Olsson宣布这种现状将有可能得到改善,其公司已经获得了

Cell重磅!揭秘肝癌多维蛋白组学最新成果

  2019年10月3日,国际顶尖期刊《cell》(SCI影响因子 36.216)在线发表了复旦大学附属中山医院樊嘉院士团队、中科院药物所周虎研究员团队、中科院生化与细胞所高大明研究员团队、美国“登月计划”临床蛋白质组肿瘤分析协作组(Clinical Proteomic Tumor Analysis

研究大豆蛋白组分对酸性豆浆凝胶的影响

  豆制品因其丰富的营养成分和低廉的价格而在世界范围内受到越来越多的关注。大豆酸奶是一种以豆浆为原料的乳酸发酵产品,是一种较新的产品,在国内外的研究和生产中都很受关注。然而,与传统牛奶酸奶相比,大豆酸奶的质地过于粗糙,严重抑制了其商业化。蛋白质是酸奶中主要的凝胶成分,重组蛋白成分是调节豆浆凝胶最直接

质谱技术在蛋白组研究中的应用(一)

[摘要] 质谱对于现代蛋白质化学研究是一项重要的技术。也可用于蛋白组分析,在同一时间监控上千种蛋白的表达情况。首先蛋白质混合物可以用双向凝胶电泳分开,再用质谱及随后的蛋白质数据库检索对单个蛋白进行鉴定和分析。最近几年,质谱领域取得了令人鼓舞的进展,使得全自动、高通量的蛋白检测成为可能。质谱也

世界宣传乳腺癌日|教你如何识别早期乳腺癌!

  在乳腺癌中,异常基因导致乳腺细胞生长不受控制,并且不会正常死亡。  如果这些细胞生长缓慢且不侵入其他组织,它们就会形成良性肿瘤。这些通常是被认为对健康危害不大的肿块。  当异常细胞以更快的速率生长并开始侵入周围组织时,它们形成癌性肿瘤。这些团块会造成严重的风险,可以在整个身体内进行散播,形成新的

乳腺癌复发率

  许多患者在积极配合治疗后,都会出现和这位患者相同的疑惑,本期乳腺肿瘤专家之声——胡震教授,就来和大家说一说,女性乳腺癌复发率到底高不高?  虽然随着科技的进步,早期(I~II期)乳腺癌患者的5年生存率达到了90%以上,但仍有相当多的患者会发生复发和转移。  乳腺癌的复发一般跟3个因素相关   相

孙学军:我国雄心勃勃进军人类蛋白组计划

  中国科技部将投入4千万美元进军人类蛋白组,范围包括10个重要器官和组织,以及疾病状态的心脏和肝脏组织。北京蛋白质组研究中心主任秦钧(Qin Jun)将负责该研究计划的监督实施。根据该中心官方网站介绍,北京蛋白质组研究中心Beijing Proteome Research Center,BPRC是

SCIEX开启微流SWATH全景蛋白组学交流之旅

  由武汉国家生物产业基地主办,武汉金开瑞生物工程有限公司承办的第一届表观遗传组与蛋白质组学技术研讨会将于2019年8月12日-14日在湖北武汉举行。  此次会议针对蛋白质组学、三维基因组、表观遗传学等热点议题展开深入研讨,邀请了来自中科院、上海交大、同济大学、华中科技大学、华中农业大学等全国知名高

蛋白组学实验中的常见问题及解答

1,关于使用三氯醋酸沉淀法后蛋白质难于重悬的问题Q:1,Hi !I have been trying to clean and concentrate proteins form eucariotic cell culture medium in order to analyse them in 2

MALDIMS:蛋白组学研究的推动力

有如此多的蛋白质需要研究,蛋白组学专家感觉到需要加快速度了。基质辅助激光解吸质谱,或称作MALDI- MS因此应运而生。范德比特大学(Vanderbilt University)医学院质谱研究中心主任Richard Caprioli博士表示:“只要样品制备顺利完成,就可以很轻松地在接下来的步

临床化学检查方法介绍糖化血红蛋白组分介绍

糖化血红蛋白组分(GHb,HbA1c)介绍:  糖化血红蛋白(GHb)是指血液中和葡萄糖结合了的那一部分血红蛋白。当血液中葡萄糖浓度较高时,人体所形成的糖化血红蛋白含量也会相对较高。人体内红细胞的寿命一般为120无,在细胞死亡前,血液中糖化血红蛋白含量也会保持相对不变。因些糖化因红蛋白水平反映的是在

蛋白组学获得差异蛋白怎么进行后续的研究

蛋白组学获得差异蛋白怎么进行后续的研究蛋白质组学和转录组学都是后基因组时代(Post genomics era)中重要的组成部分,其中转录组学和基因组结合更紧密,能够针对性的解决一些组织特异性相关的基因差异的问题,所以近几年随着越来越多的基因组获得测序,加上转录组测序成本的降低,获得了长足的进步,越

华人科学家用质谱和PDX模型寻找乳腺癌个体化治疗新策略

  癌症治疗的目的在于摧毁肿瘤,阻止肿瘤生长和扩散。为达到该目标,来自贝勒医学院和华盛顿大学医学院等研究机构的研究人员开发了一种寻找乳腺癌治疗策略的新方法。他们首先鉴定一些促进肿瘤生长的蛋白,然后再对实验药物进行筛选找到有望中和这些蛋白的潜在药物分子。相关研究结果发表在国际学术期刊Natue Com

乳腺癌三联疗法获FDA批准,用于早期乳腺癌

  近日,罗氏(Roche)集团成员基因泰克(Genentech)公司宣布,美国FDA已批准Perjeta(pertuzumab,帕妥珠单抗)加赫赛汀(trastuzumab,曲妥珠单抗)和化疗(简称基于Perjeta的治疗方案)的三联疗法,作为HER2阳性、有高复发风险的早期乳腺癌(EBC)患者的

化妆品易致乳腺癌?盘点乳腺癌7大诱因

  统计数据显示,多达1/8的女性在一生中的某个时间会患上乳腺癌。但是,乳腺癌风险存在很大的个体差异,美国“福克斯新闻网”11月3日载文,刊出“乳腺癌的风险因素”,并提醒所有女性每年查一次乳房X光片,以提早发现乳腺癌征兆。  1.体重超标。体重超标或肥胖会导致乳腺癌风险增加30%~60%。其原因是,