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改善蛋白组学研究图像分析的新软件

对双向电泳(2DGE)等蛋白分离实验的图像进行分析不仅耗时,而且经常丢失样本或得出假阳性结果。上周在伦敦举行的AngloNordic Biotech Conference IV会议上 ,瑞典Ludesi公司CEO Ola Forsstrom-Olsson宣布这种现状将有可能得到改善,其公司已经获得了解决这些问题的办法,以便其公司的pay-per-image服务能够节约研究时间,得出有复验性的结果。 尽管双向电泳早在上世纪70年代既已出现,但目前依旧是破译复杂物质生物分子组成的最常用工具之一。然而,自动成像分析存在缺陷,手动分析耗时且需要工作经验。 蛋白组学研究人员对电子图片分类整理,利用Ludesi软件将分析结果按需要剪裁,然后Ludesi公司按客户要求进行工作。工作结果可以从网上下载,利用Ludesi公司相关软件检查结果。Forsstrom-Olsson说这比研究人员自己做要快得多, Ludesi公司只需几天,研究人员则需......阅读全文

蛋白质技术——双向电泳

实验概要蛋白质组研究的发展以双向电泳技术作为核心.  双向电泳由O’Farrell’s于1975年首次建立并成功地分离约1000个E.coli蛋白,并表明蛋白质谱不是稳定的,而是随环境而变化.  双向电泳原理简明,第一向进行等电聚焦,蛋白质沿pH梯度分离,至各自的等电点;随后,再沿垂直的方向进行分子

植物蛋白质组学中的双向电泳技术实验

试剂、试剂盒尿素裂解溶液                                                                  IPG 干胶条水化液                                                              

植物蛋白质组学中的双向电泳技术实验

试剂、试剂盒尿素裂解溶液IPG 干胶条水化液IPG 胶条平衡液SDS 凝胶缓冲液电极缓冲液储液丙烯酰胺 甲叉双丙烯酰胺溶液过硫酸铵溶液琼脂糖溶液仪器、耗材等电聚焦仪IPGphor多重垂直 SDS 电泳仪实验步骤3.1 第一向:在 IPG 胶条中进行等电聚焦( IPG-IEF)采用 IPG ( IPG

植物蛋白质组学中的双向电泳技术实验(二)

2. 在平板仪器上进行 IPG-IEF ( Multiphor ll Unit)满足下列条件时,水化后的 IPG 胶条可以直接放在 IEF 仪器的冷却板上:① 如果运行时间不超过 12 h ( 经常发生在宽的或中等 pH 范 围 IPG,如 IPG 3~10 或 4~7 ) 。② 如果 pH 梯

植物蛋白质组学中的双向电泳技术实验(四)

3.3 第二向:多重垂直 SDS-PAGESDS-PAGE 可以在水平或垂直系统上进行 [29] 。水平设备适用于预制胶(ExcelGel SDS;Amersham Biosciences/ GE Healthcare) 。而垂直系统则应用于多块胶平行进行的电泳中,尤其是大规模的蛋白质组分析

植物蛋白质组学中的双向电泳技术实验(三)

使用 IPGphor 进行 IEF 的典型工作条件见表13-2和 表 13-3 。正如前文指出的那样 ,为了使高分子质量的蛋白质更好地进入聚丙烯酰胺胶内,水化时应在胶条两端加低电压(30~50 V ) ,否则将给水化上样造成困难[ 15,28] 。然后电压逐步升高至 8000 V。如果 IP

植物蛋白质组学中的双向电泳技术实验(一)

试剂、试剂盒 尿素裂解溶液IPG 干胶条水化液IPG 胶条平衡液SDS 凝胶缓冲液电极缓冲液储液丙烯酰胺 甲叉双丙烯酰胺溶液过硫酸铵溶液琼脂糖溶液仪器、耗材 等电聚焦仪 IPGphor多重垂直 SDS 电泳仪实验步骤 3.1 第一向:在 IPG 胶条中进行等电聚焦( IPG-IEF)采用 IPG (

蛋白质的双向电泳实验

实验方法原理 蛋白质的双向电泳的第一向为等电聚焦( Isoelect rofocusing ,IEF) , 根据蛋白质的等电点不同进行分离; 第二向为SDS-聚丙烯酰胺凝胶电泳( SDS-PAGE ) , 按亚基分子量大小进行分离。经过电荷和分子量两次分离后, 可以得到蛋白质分子的等电点

蛋白质的双向电泳实验

等电聚焦法             实验方法原理 蛋白质的双向电泳的第一向为等电聚焦( Isoelect rofocusing ,IEF) , 根据蛋白质的等电点不同进行分离;

蛋白质双向电泳过程与体会

    双向电泳IEF (sigma)IEF(not IPG)/SDS-PAGE最简单的装备推荐如下,适合于没多少money做IPG又想做“热”的所谓蛋白质组的.    IEF用Biorad的圆盘电泳槽(不行用国产的吧,不推荐),SDS-PAGE用六一厂的就可以了(ft,六一厂应该给我money吧,