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研究揭示酿酒酵母组蛋白去甲基化酶Rph1底物特异性识别和催化机制 11月10日，Biochemical Journal在线发表了中科院上海生命科学研究院生化与细胞所丁建平组关于酿酒酵母组蛋白去甲基化酶Rph1底物特异性识别和催化机制的研究成果。 人和酵母等真核生物中存在一类含有JmjC结构域的蛋白家族，研究表明它们中的许多成员具有组蛋白去甲基化酶活性，并且都利用Fe2+和α-酮戊二酸为辅因子。人源JMJD2A可以特异性的去甲基化H3K36me3/2和H3K9me3/2。Rph1是人源JMJD2A在酿酒酵母中的同源物，可以特异性的去甲基化H3K36me3/2，这种活性在某些转录激活基因的转录延伸过程中发挥重要的促进作用。 丁建平组的博士生常媛媛等人解析了Rph1催化核心区域的结构，以及与Ni2+和α-酮戊二酸的复合物的结构。其中，Ni2+用来模拟Fe2+的结合形式。Rph1的催化核心区域具有与全长蛋白一......阅读全文
DNA 6mA（N6-甲基腺苷）作为DNA的第二种修饰形式，是哺乳动物基因组表观遗传调控的重要组成。基因组6mA的水平在生物体内具有调节组织发育、性别比例、基因表达、X染色体失活等多种作用，阐明其调控机制是解码这一新型修饰碱基生物学功能的关键。2016年，耶鲁大学Andrew Xiao首次报道A
表观遗传学指基因序列不变化的前提下，基因表达发生了可遗传的变化，包括DNA甲基化、染色质改型、基因沉默、RNA编辑、组蛋白修饰（甲基化、乙酰化、磷酸化等）等。其中，染色质改型调控基因表达的过程，涉及多种导致DNA和组蛋白组成变化、染色质构象变化的蛋白质。 众多研究已经证明，染色体畸变和染色质异
来自国家自然科学基金委员会的消息，国家自然科学基金委员会公布了2012年度面上项目、重点项目、重大国际(地区)合作研究项目、青年科学基金项目、地区科学基金项目、海外及港澳学者合作研究基金项目、科学仪器基础研究专款项目等方面的评审结果。有关评审结果将通知相关依托单位，其科研管理人员可登录
据世卫组织估计，到2035年全世界每年将有2400万新癌症病例和1450万癌症相关死亡案例。在与癌症相关的死亡中，如果可以早期诊断出癌症，约30%的人会有获救的希望。因此对癌症早期准确的诊断对于增加治愈癌症和提高癌症存活率的几率是非常重要的。癌症相关生物标志物的临床检测在癌症诊断和治疗方面具有重要意
分析测试百科网讯 2016年6月4日，第六届世界华人质谱会在美国德克萨斯州圣安东尼奥举行，这是自第一届世界华人质谱会以来第一次在海外举办的华人质谱会，并恰逢距2006年在新疆举办的第一届世界华人质谱会10周年。会议由美国华人质谱协会（C
分析测试百科网讯 2016年12月2日 为促进北京地区色谱技术的应用与交流，了解色谱技术的发展趋势，北京色谱学会于北京日坛宾馆举办了“2016年北京色谱年会”。本届色谱年会的主题是“色谱与健康”，年会邀请到张玉奎院士、江桂斌院士、庞国芳院士等色谱领域著名的专家、学者及色谱厂商作大会报告，报告在生
21世纪，表观遗传学的研究得到了快速发展，同时其产生了让研究人员感兴趣和憧憬的东西，当然了，这其中也存在一些大肆宣传的成分，本文中，我们回顾了表观遗传学在过去几十年里是如何演变的，同时分析了近年来改变科学家们对生物学理解的一些研究进展；我们讨论了表观遗传学和DNA序列改变之间的相互作用，以及表观
美国签署新处方药使用者费用法案 推动FDA改革 经过数月的广泛讨论以及随后的立法者之间的紧密磋商，美国众议院和参议院日前通过了《2012年美国食品和药物管理局安全及创新法案》(FDASIA)，即第V期《处方药使用者费用法案》(PDUFA V)。 在两党的广泛支持下，美国总统
DNA 6mA（N6-甲基腺苷）作为DNA的第二种修饰形式，是哺乳动物基因组表观遗传调控的重要组成。基因组6mA的水平在生物体内具有调节组织发育、性别比例、基因表达、X染色体失活等多种作用，阐明其调控机制是解码这一新型修饰碱基生物学功能的关键。2016年，耶鲁大学Andrew Xiao首次报道A
《Nature Methods》盘点2015年度技术，选出了最受关注的技术成果：单粒子低温电子显微镜（cryo-EM）技术。 除此之外，也整理出了2016年最值得关注的几项技术，分别为：细胞内蛋白标记（Protein labeling in cells）、细胞核结构（Unraveling nuc
组蛋白去乙酰化酶（HDAC, histone deacetylase）是癌症药物研发领域的热点。在人类中存在18种不同的HDAC，可以进一步细分为4类：I类HDAC（HDAC1、2、3和8）主要存在于细胞核中，主要功能是给组蛋白脱乙酰基。II类HDAC进一步分为：IIa类（HDAC4、5、7和9
实验步骤 一、杆状病毒表达载体 最简单的经典杆状病毒表达载体是一个重组的杆状病毒，其基因组含有一段外源核酸序列，通常为编码目标蛋白质的dDNA，在多角体蛋白启动子控制下进行转录。这个嵌合的基因由多角体蛋白启动子和外源蛋白编码序列组成
生物通报道：转座子通常是通过表观遗传学机制（包括DNA甲基化）保持沉默的。12月9日，在《Cell Research》杂志上发表的一项研究中，来自中科院上海生命科学研究院、美国普渡大学以及中科院遗传与发育生物学研究所的研究人员，在拟南芥中将一对Harbinger转座子衍生蛋白（HDPs）——HD
微阵列技术在单个实验中能同时分析数千个参数。捕获分子微点在固体支持物上固定成行列并暴露在含相应结合分子的样品中。基于荧光、化学发光、质谱、放射性或电化学的读出系统能检测每个微点形成的复合物。这些微小化和平行的结合分析高度灵敏，方法的分析能力又能被微阵列基因表达分析所放大。在这些系统中，检测固定的DN
本文中，小编盘点了多篇研究报告，共同解析科学家们在组蛋白研究上取得的新成就，与大家一起学习！图片来源：Daniel N. Weinberg et al，doi:10.1038/s41586-019-1534-3 【1】Nature：揭示组蛋白标记H3K36me2招募DNMT3A并影响基因间DN
实验步骤一、亲和介质的选择亲和纯化的成功取决于是否选择了合适的固相载体和配基。理想的亲和介质 (如吸附配基的固相载体)应该具备孔隙大、理化性质高度稳定的特征。亲和介质可以选择性的捕获相应耙标，既保证较弱的非特异性吸附，又可以在整个过程中维持良好的流动特征。优选介质应具备便宜、易获取和使用简便的特点。
实验步骤 一、亲和介质的选择 亲和纯化的成功取决于是否选择了合适的固相载体和配基。理想的亲和介质 (如吸附配基的固相载体)应该具备孔隙大、理化性质高度稳定的特征。亲和介质可以选择性的捕获相应耙标，既保证较弱的非特异性吸附，又可以在整个过
iNature 2019年9月4日，中国学者在Nature连续发表了6项成果，涉及生命科学，天文学，地球科学等不同的领域，iNature系统介绍这些成果： 【1】混合谱系白血病（MLL）家族的甲基转移酶 -包括MLL1，MLL2，MLL3，MLL4，SET1A和SET1B-在赖氨
分析其实也属于技术的一部分，且在蛋白质组学研究中显得尤为重要，因为蛋白质组学研究提供的数据是生物学上最庞大的，而且蛋白质组比基因组具有更大的复杂性，因此蛋白质组信息学更有挑战性。今天小编先抛砖引玉地介绍几个常用的分析方法和软件。蛋白质定性分析蛋白质定性分析通常是指利用质谱法进行蛋白质鉴定和序列分析。
1 植物群体遗传蛋白质组学 1.l 遗传多样性蛋白质研究基于基因组学的一些遗传标记，如RAPD(Random Amplified Polymorphic DNA)、RFLP(Restriction Fragment Length Polymorphism)、SSR(Simple Sequen
日前，复旦大学徐彦辉课题组在组蛋白甲基化修饰研究领域获得新进展，相关成果发布在《分子细胞》上，该项研究得到了国家自然科学基金面上项目的资助。 组蛋白甲基化修饰是一种非常重要的表观遗传修饰，参与调节异染色质形成、X染色体失活、基因印记及DNA的损伤修复等多种生命过程。关于组蛋白去甲基化酶的研究是
一、前沿生物技术主题 1.蛋白质测序新技术新装备及配套试剂国产化 (1)阵列毛细管柱蛋白质分离-阵列点样装置 研制二维阵列毛细管分离新装置，第一维分离柱可分离48个馏分,第二维维阵列毛细管分离柱可同时分离48个流份；开发阵列紫外检测器； 研制多柱点样头并行点样器和流份收集器；开发
来自国家自然科学基金委员会的消息，8月17日国家自然科学基金委员会公布了2016年国家自然科学基金申请项目评审结果，其中面上项目16934项、重点项目612项、创新研究群体项目38项、优秀青年科学基金项目400项、青年科学基金项目16112项、地区科学基金项目2872项、海外及港澳学者合作研究基
摘要对单核苷酸多态性（single nucleotide polymorphisms，SNPs）的研究分析近几年被广泛应用于生物及医学研究的诸多领域，筛查SNPs的方法很多，各具特色，并一直不断地发展.本文对筛查SNP的几种常用及最新方法做一简要介绍，其中包括PCR-RFLP，分子信标等.细胞外基质
活体动物体内光学成像(Optical in vivo Imaging)主要采用生物发光（bioluminescence）与荧光（fluorescence）两种技术。生物发光是用荧光素酶(Luciferase)基因标记细胞或DNA，而荧光技术则采用荧光报告基团（GFP、RFP, Cyt及dyes等）进
糖基化修饰是自然界最重要的蛋白质翻译后修饰之一。根据糖基修饰与蛋白质的连接方式和修饰位点的不同，以及糖基是单糖或寡糖的不同，主要可分为如下几类： 2013年来自中国和澳大利亚的两个研究小组，在Nature发表文章，报道来自细菌的三型分泌系统效应蛋白NleB可以对死亡受体复合物中的接头蛋白TRA
2014年1月22日，北京生命科学研究所何新建实验室在《PLOS Genetics》杂志在线发表题为“The SET domain proteins SUVH2 and SUVH9 are required for Pol V occupancy at RNA-directed DNA me
7月30日，《美国国家科学院院刊》（PNAS）杂志在线发表了中国科学院分子植物科学卓越创新中心上海植物逆境生物学研究中心朱健康研究组题为Histone Acetylation Recruits the SWR1 Complex to Regulate Active DNA Demethylati
近日，PNAS杂志在线发表了中国科学院分子植物科学卓越创新中心上海植物逆境生物学研究中心朱健康研究组题为“Histone Acetylation Recruits the SWR1 Complex to Regulate Active DNA Demethylation in Arabidops
近期《美国国家科学院院刊》（PNAS）杂志在线发表了中国科学院分子植物科学卓越创新中心上海植物逆境生物学研究中心朱健康研究组题为Histone Acetylation Recruits the SWR1 Complex to Regulate Active DNA Demethylation i