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科学家呼吁关注全球基因组数据库污染

样品处理有可能是导致DNA数据库广泛污染的最主要原因 2月16日发表在《公共科学图书馆·综合》(PLoS ONE)期刊上的一份研究报告称康涅狄格大学的遗传学家Mark Longo及同事发现由顶级公共测序机构提供的测序结果构建的基因组数据库中的大约1/5的细菌、植物和非灵长类动物基因组数据受到了人类DNA的污染,样品处理有可能是导致DNA数据库广泛污染的最主要原因。这一研究报告引起了生物研究人员及各大权威媒体的高度关注,《科学家》(The Scientist)杂志以及《自然》(Nature)杂志均在其官方网络上第一时间对这一事件进行了报道。 Mark Longo等在报告中呼吁科学家们需更加努力以确保测序获得的基因组不受到污染,并应对来自公共基因组数据库的基因组进行潜在污染检测。 “基因组污染是一个大问题,但却不是一个新问题,”加州大学进化生物学家、美国能源部联合基因组研究所系统发育基因组学计划负责人Jonat......阅读全文

基因芯片技术及其研究现状和应用前景

  摘要:基因芯片技术是90年代中期以来快速发展起来的分子生物学高新技术,是各学科交叉综合的崭新科学。其原理是采用光导原位合成或显微印刷等方法,将大量DNA探针片段有序地固化予支持物的表面,然后与已标记的生物样品中DNA分子杂交,再对杂交信号进行检测分析,就可得出该样品的遗传信息。基因芯片技术目前国

基因芯片技术及其研究现状和应用前景

  生物芯片技术是随着"人类基因组计划"(human genome project, HGP)的进展而发展起来的,它是90年代中期以来影响最深远的重大科技进展之一,它融微电子学、生物学、物理学、化学、计算机科学为一体的高度交叉的新技术,具有重大的基础研究价值,又具有

生物芯片入门(五):应用

基因芯片技术及其研究现状和应用前景生物芯片技术是随着“人类基因组计划”(human genome project,HGP)的进展而发展起来的,它是90年代中期以来影响最深远的重大科技进展之一,它融微电子学、生物学、物理学、化学、计算机科学为一体的高度交叉的新技术,具有重大的基础研究价值,又具

基因芯片的制备、应用与前景

 摘要:基因芯片技术是90年代中期以来快速发展起来的分子生物学高新技术,是各学科交叉综合的崭新科学。其原理是采用光导原位合成或显微印刷等方法,将大量DNA探针片段有序地固化予支持物的表面,然后与已标记的生物样品中DNA分子杂交,再对杂交信号进行检测分析,就可得出该样品的遗传信息。基因芯片技术目前国内

凭基因测长相?

  一阵疾风骤雨般的批评落到了基因测序先驱Craig Venter的一篇论文上,该文章宣布可以通过DNA预测人们的生理特征。但评审人员,甚至是该文章的一名共同作者却称,它过于夸大利用一个人的基因辨别个人特征的能力,可能会引发对基因隐私的不必要担忧。   在这篇9月5日发表于美国《国家科学院院刊》(

ENCODE书写人类百科全书

    迄今最详细的人类基因组分析数据出炉。   一项大型国际计划显示,与青少年在学校掌握的知识相比,人类基因组—— 一个人的遗传信息总和——包含有更多的蛋白质编码基因。当研究人员决定在上世纪90年代晚期对人类基因组进行测序时,他们专注于寻找那些用来确定全部生命所需蛋白质的传统

迄今最详细人类基因组分析数据出炉

  迄今最详细的人类基因组分析数据出炉。图片提供:ENCODE计划    一项大型国际计划显示,与青少年在学校掌握的知识相比,人类基因组—— 一个人的遗传信息总和——包含有更多的蛋白质编码基因。当研究人员决定在上世纪90年代晚期对人类基因组进行测序时,他们专注于寻

法医新知(一):通过DNA是否能预测人脸?

  佛罗里达州的警察正在搜捕一名潜伏在暗处的男子。  两年多来,他至少吓坏了几十名女性。他从窗户偷窥,并溜进卧室,看她们睡觉。他触摸几名女性的脚或头发 - 有时,他甚至进行性侵犯。  媒体戏称他为“连环偷窥者”,而警察也在拼命找他。9月,他们发布了一张黑头发、黑眼睛的拉丁裔男子面部草图,他有着光滑的

哪些基因决定我们的面部特征?科学家已找到15个

  人的脸是由不同要素(眼睛、鼻子、下巴和嘴巴)组成的多部分特征,其大小、形状和构成明显是可遗传的。然而,科学家们对负责人类面部变化的遗传变异知识仍然匮乏。在最新一期《Nature Genetics》杂志上,来自比利时勒乌芬大学、匹兹堡大学、斯坦福大学和宾夕法尼亚州立大学的研究人员已经确定了15个与

Science关注自然界拿来主义“超人”

  如果自然界上演一场《幸存者》的真人秀,笑到最后的很可能是蛭形轮虫bdelloid rotifers而不是我们所说的“小强”蟑螂。这种小生物能够在高强度辐射和长年干旱中生存下来,并且能依靠无性繁殖延续千万年。蛭形轮虫的超能力受到了科学家们的广泛关注,近日Science杂志报道了该领域研究的新进

健康:让精准医学来治疗肿瘤吧

  此文作者为Mark A. Rubin,原刊登于nature comment。  新泽西州一位76岁售货员在尿路发现晚期肿瘤,因为多年常规治疗手段(手术,化疗和放疗)无效,她的医生决定尝试一种非常规的治疗。数个星期前,他们向我的团队寄送了她的肿瘤样本。基因测序结果显示,她的HER2基因(又称为ER

疫情下的疫苗丨Gregory Poland教授:就像边飞行边造飞机

  (转载自:药明康德公众号)  自18世纪末首次诞生以来,疫苗就成为了人们健康的“护身符”,它的出现使无数人能更好地预防疾病。在这次疫情中,用疫苗来预防新型冠状病毒导致的疾病,也是大众翘首以盼的方向之一。据不完全统计,全球范围内已经有超过20家创新生物技术和医药公司在进行新型冠状病毒疫苗的研发。 

第二代测序技术(NGS)推动个性化肿瘤学发展

  目前,肿瘤学已经上升到基因组分析的前沿,它可以被用于识别驱动突变和其他标记, 临床医生也可以借此设计疗法,监测病人的反应,而突变和标记可以通过NGS技术(第二代测序技术,一个生成gigabases数据的大规模平行测序技术)显现出来。  何为NGS?它面临着哪些问题?  NGS已经成为一个研究平台

新算法将更好组装DNA序列 检测特殊遗传突变

  刊登在国际杂志Bioinformatics上的一项研究论文中,来自杨百翰大学(Brigham Young University)的研究人员开发了一种新方法来进行人类基因组的装配,而且这或许可以帮助鉴别引发常见遗传障碍的新型突变。  这种新方法依赖于一种新算法,其可以非常敏感地检测DNA序列的特异

Nature医学:用大数据解开癌细胞的秘密

  最近,英国贝尔法斯特女王大学的一位著名癌症专家指出,将来自世界各地数以百万计的癌症患者的遗传信息进行共享,可能是彻底改变癌症预防和治疗的关键。相关研究结果发表在5月5日《Nature Medicine》杂志。  本文通讯作者是贝尔法斯特女王大学癌症研究和细胞生物学中心的Mark Lawler教授

【经典回顾】Cell子刊,癌症研究的八大问题!

  10月,Cell出版社推出旗下新子刊《Trends in Cancer》,作为创刊号的一部分,该杂志邀请世界领先的癌症研究学者,列出了目前癌症研究领域所面临的八大问题。  1.对于致癌突变的了解,如何才能指导治疗?  科学家们花了几十年时间,来了解可导致细胞分裂失控的精确基因突变。现在癌症患者可