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我科学家PNAS:测序诊断癌症的强大工具

最近,来自香港中文大学的研究人员,通过分析血浆DNA中的甲基化序列,能够检测到癌症患 者的肝肿瘤和淋巴瘤,以及孕妇胎盘中的遗传异常。他们使用已知的组织甲基化图谱,能够识别循环DNA的组织起源,从而使其成为一种强大的工具,用于筛选、 癌症检测和治疗监测。这项研究是由几个机构的研究人员合作,由香港中文大学李嘉诚健康科学研究所所长卢煜明院士指导完成,发表在最近的《PNAS》杂志。延伸阅读:专访卢煜明:寻找科学宝藏,不可一叶障目。 表观遗传学表明,DNA往往有附着于胞嘧啶5碳的甲基原子团。某些组织和组织内某些类型的细胞,在其DNA中有一个明显的甲基化模式,从而使科学家们能够对身体的不同组织,创建一个甲基化模式的数据库。目前,科学家们已经能够从血浆中寻找来自一种单一组织类型的DNA,如胎盘或肝脏组织,该研究小组利用全基因组重亚硫酸盐测序,来研究血浆DNA的甲基化模式,并将其与甲基化数据库进行对比,以辨别血浆DNA的组成百分比或组织图......阅读全文

卢煜明教授:血浆游离DNA具有无限可能的临床应用

  “在我的科研工作中,我体会到科学宝藏有很多时候是放于最显眼、但却看似不可能的地方!其中一个例子就是孕妇血浆内有百分之十五是胎儿的DNA,”无创产前诊断奠基人,香港中文大学的卢煜明(Dennis Lo)教授说。  卢教授早在1987年就萌生了一种想法:胎儿细胞可能混杂在母亲的血液中,这在当时的主流

DNA甲基化:诊断癌症的强大工具

  最近,来自香港中文大学的研究人员,通过分析血浆DNA中的甲基化序列,能够检测到癌症患者的肝肿瘤和淋巴瘤,以及孕妇胎盘中的遗传异常。他们使用已知的组织甲基化图谱,能够识别循环DNA的组织起源,从而使其成为一种强大的工具,用于筛选、癌症检测和治疗监测。这项研究是由几个机构的研究人员合作,由香港中文大

新技术MCTA-Seq应用于探究外周血游离DNA的组织来源

  北京大学生物医学前沿创新中心(BIOPIC)、北京未来基因诊断高精尖创新中心文路副研究员与首都医科大学世纪坛医院肝胆外科彭吉润教授合作,利用团队之前开发的甲基化CpG短串联扩增与测序技术(MCTA-Seq),探究正常人、肝疾患者与急性胰腺炎患者外周血游离DNA的组织来源。研究成果以“Compre

云序高分文章利器:​ctDNA(羟)甲基化测序案例分享

  新型肿瘤标志物筛选利器-----ctDNA(羟)甲基化测序   cfDNA(Cell free DNA)是人体组织排放到血液、尿液或脑脊液等循环体系中降解的DNA小片段,是一种新型的分子标记物。ctDNA(Circulating tumor DNA)特指来源于肿瘤细胞的cfDNA,是液体活检主

云序高分文章利器:​ctDNA(羟)甲基化测序案例分享

  新型肿瘤标志物筛选利器-----ctDNA(羟)甲基化测序   cfDNA(Cell free DNA)是人体组织排放到血液、尿液或脑脊液等循环体系中降解的DNA小片段,是一种新型的分子标记物。ctDNA(Circulating tumor DNA)特指来源于肿瘤细胞的cfDNA,是液体活检主

ctDNA(羟)甲基化测序案例分享(二)

案例解析案例1:ctDNA甲基化可作为肝癌诊断和进程的分子标志物原文:Circulating tumour DNA methylation markers for diagnosis and prognosis of hepatocellular carcinoma期刊:Nature Materia

人类组织中m6A修饰的动态变化和进化

  文章导读   m6A是mRNA中普遍存在的一种内部修饰,通过多种机制,比如调控mRNA的剪接、表达、降解、翻译等对mRNA的命运产生不同影响。为了探究m6A修饰在不同组织之间、不同发育阶段的差异,m6A位点在转录本上的位置分布,以及这些分布差异可能对基因调控的进化产生怎样的影响,近期Nucle

利用DNA图谱诊断癌症

  作为无创产前诊断等相关领域技术的首创者,来自香港中文大学的卢煜明(DennisLo)教授最早就曾发现孕妇外周血中存在“漂流”的胎儿DNA,也就是说,假设每毫升母亲样品相当于1000个基因组,则总共含有1900条母亲的21号染色体,100条整倍体胎儿的21号染色体或150条21三体胎儿的21号染色

人类组织中m6A修饰的动态变化和进化

  文章导读   m6A是mRNA中普遍存在的一种内部修饰,通过多种机制,比如调控mRNA的剪接、表达、降解、翻译等对mRNA的命运产生不同影响。为了探究m6A修饰在不同组织之间、不同发育阶段的差异,m6A位点在转录本上的位置分布,以及这些分布差异可能对基因调控的进化产生怎样的影响,近期Nucle

北大、首都医科大联合开发癌症检测新技术

  来自北京大学、首都医科大学的研究人员报告称,他们开发出了一种称作为MCTA-Seq(methylatedCpGtandemsamplificationandsequencing)的新方法,可在全基因组范围检测肝癌循环游离DNA中的超甲基化CpG岛。这一重要的研究成果发布在10月30日的《细胞研究

北大、首都医科大联合开发癌症检测新技术

  来自北京大学、首都医科大学的研究人员报告称,他们开发出了一种称作为MCTA-Seq(methylated CpG tandems amplification and sequencing)的新方法,可在全基因组范围检测肝癌循环游离DNA中的超甲基化CpG岛。这一重要的研究成果发布在10月30日的

【大盘点】胰腺癌的基因和靶向治疗

  NCI 和 SEER 的数据显示胰腺癌 5 年生存只有 5-6%,大多数患者诊断时都已是进展期,区域性和远处转移分别为 27% 和 53%。胰腺癌治疗方面最近也没有突破性进展,含吉西他滨的治疗和手术是近 10 余年来的标准治疗,无论是用作新辅助还是辅助化疗,化疗选择很有限。美国 Frank 博士

2015年癌症诊断领域研究突破性进展

  一直以来,癌症的诊断研究领域都是科学家们关注的重点,近年来随着研究的深入,许多新型的癌症检测技术不断涌现,比如癌症液体活检技术,microRNA检测工具、成像追踪技术等,本文中小编就盘点了2015年癌症诊断领域的研究亮点。  【1】4篇权威期刊论文聚集癌症血液检测  虽然实体肿瘤的检测仍然是癌症

ctDNA与癌症早筛,这项新突破是否会带来颠覆?

  ctDNA已被证明与肿瘤实时变化密切相关,已被用于评估耐药性、监测治疗反应等。近年来,利用ctDNA液体活检来早期诊断癌症的研究热度不断攀升,成果也越来越显著。今天我们要分享的是近期刊登在《 Nature Genetics》杂志上的癌症早期筛查新突破。  ctDNA液体活检与甲基化检测全新组合 

北京大学团队发布肝癌无创早期诊断新技术

   DNA甲基化是指DNA的胞嘧啶(C)被加上一个甲基而形成甲基胞嘧啶的表观遗传修饰,主要发生于CpG二核苷酸。CpG二核苷酸高度聚集于被称为CpG岛的基因组区域,这些区域主要位于基因转录起始处,具有重要的转录调控功能。CpG岛在正常细胞中大多处于去甲基化状态,但在肿瘤细胞中,大量CpG岛会发生异

m5C RNA修饰表达谱文章教您如何另辟蹊径快速发文

文章导读随着RNA修饰在生物领域的持续火热,关于m6A修饰的研究已经广 泛开展并发表,至今已觉不新鲜;5-甲基胞嘧啶RNA甲基化(m5C)是一类新的修饰方式,参与调控细胞应激、发育和基因表达等方面,目前m5C研究正处 方兴未艾之际,大量的科学研究工作也亟待开展,非常适合有探索性和新颖性需求的老师。这

多位专家指导:如何提取和研究血液DNA,RNA与蛋白

  血液是唯一与所有器官都有接触的组织,携带着有关机体的大量宝贵信息。在理论上,检测血液携带的 DNA、RNA、囊泡和细胞残骸可以帮助人们诊断和监控各种疾病。  产前基因筛查是血液检测的一个重要应用,通过分析孕妇血液中的胎儿DNA来鉴定染色体异常(比如唐氏综合症)。此外,越来越多的研究者开始关注血液

利用DNA甲基化检测实现结直肠癌早期无创诊断

  北京大学生命科学学院生物医学前沿创新中心(BIOPIC)、北京未来基因诊断高精尖创新中心与北京大学第三医院普外科合作,利用团队之前开发的甲基化CpG短串联扩增与测序技术(MCTA-Seq),通过对患者血浆游离DNA中异常高甲基化CpG岛进行基因组规模的高灵敏度测序分析,实现结直肠癌早期无创诊断。

人类组织中m6A修饰的动态变化和进化(二)

5.进化角度分析人类m6A修饰位点作者通过比较人鼠之间保守m6A位点比例和保守对照A比例,来评估CDS区域m6A位点面临的自然选择压力,发现发生于第 一个密码子处的m6A的周围序列保守程度低,可能由于此处的m6A会带来不利的影响比如影响tRNA结合,而发生于第三个密码子处的m6A则受到进化选

METTL3调控m6A甲基化修饰对小鼠脂肪细胞发育的重要作用

  今 天我们为大家解读一篇今年4月3日发表在Nature communication(IF=11.878)的文章,作者研究了m6A修饰对小鼠脂肪组织发育的影响。   棕色脂肪组织(BAT)通过线粒体产生并耗散热量,对机体起到保暖和控制肥胖的重要作用,而BAT的出生后发育,正是它们获得这些功能的关

METTL3调控m6A甲基化修饰对小鼠脂肪细胞发育的重要作用

  今 天我们为大家解读一篇今年4月3日发表在Nature communication(IF=11.878)的文章,作者研究了m6A修饰对小鼠脂肪组织发育的影响。   棕色脂肪组织(BAT)通过线粒体产生并耗散热量,对机体起到保暖和控制肥胖的重要作用,而BAT的出生后发育,正是它们获得这些功能的关

解读《肿瘤个体化治疗检测技术指南》:9大检测技术

  肿瘤的个体化治疗基因检测已在临床广泛应用,实现肿瘤个体化用药基因检测标准化和规范化,是一项意义重大的紧迫任务。  为进一步提高肿瘤个体化用药基因检测技术的规范化水平,7月31日,国家卫生计生委个体化医学检测技术专家委员会,在广泛征求意见的基础上,制订了《肿瘤个体化治疗检测技术指南(试行)》。  

表观遗传之DNA甲基化(二)

二 DNA甲基化 DNA甲基化:DNA甲基化是通过DNA甲基转移酶在胞嘧啶环的第5个碳原子上共价加成甲基而产生的,从而产生5-甲基胞嘧啶(5-mC),在体细胞中,几乎仅在二核苷酸CpG的对称甲基化配对中发现了5-mC,而在胚胎干(ES)细胞中,在非CpG中也观察到了大量的5-mC。5-mC

Nature | m6A RNA甲基化识别蛋白YTHDF1参与记忆的形成

  目前来说,调控m6A修饰过程的阅读蛋白共有9种功能,今天不会大家一一来讲,而是主要讲参与蛋白编码过程的YTHDF1蛋白,它主要通过与mRNA的m6A位点结合,在脑神经发育[1],多巴胺分泌[2]和突触形成[3]等过程中起重要作用。   文章导读:   2018年10月31日,美国芝加哥大学何

科学家发现DNA甲基化物可用于肿瘤的敏感检测和分类鉴定

  近日,加拿大大学健康网络公司和多伦多大学等科学家在Nature杂志上发表了题为“Sensitive tumour detection and classification using plasma cell-free DNA methylomes”的文章,报道了一种基于免疫沉淀的可以敏感地检测低

癌症诊断技术新进展!

  【1】Nature:开发基于DNA包装的新型血检可检测多种癌症  doi:10.1038/s41586-019-1272-6  近日,来自约翰霍普金斯大学Kimmel癌症中心的研究人员开发了一种简单的新型血液检测方法,通过发现癌细胞脱落的DNA碎片在血液中循环的独特模式,可以检测七种不同类型癌症

JCI:血液样本中存在前列腺癌生物标志物

  在最近一项研究中,UCL的科学家发明了一种新的检测方法,可以识别血液中前列腺癌的最早遗传变化:该变化可以使医生便于查看癌症是否扩散,监测肿瘤行为并进行更好的治疗选择。  在这项发表在《Journal of Clinical Investigation》上的研究中,UCL癌症研究所的研究人员使用下

卢煜明创立的Cirina公司获A轮1200万美元融资

  创业公司Cirina在A轮融资中筹集了1200万美元,来开发无创筛查检测,用于癌症和其他疾病的早期发现。  Cirina公司由香港中文大学李嘉诚健康科学研究所所长卢煜明教授创立于2014年,Maneesh Jain担任该公司的首席执行官,在Life Technologies被赛默飞收购之前,Ja

何川教授亮点推荐中国学者成果:诊癌从血液入手

  芝加哥大学的何川(Chuan He)教授主要从事化学生物学、核酸化学和生物学、遗传学等方面的研究。近年来在甲基化修饰,尤其是5hmC和m6A等方面获得了许多重要的发现。迄今已在Nature,Science等国际权威学术期刊发表了150余篇论文。曾荣获美国癌症研究青年科学家奖,凯克基金会医学研究杰

何川教授亮点推荐中国学者成果:诊癌从血液入手

  芝加哥大学的何川(Chuan He)教授主要从事化学生物学、核酸化学和生物学、遗传学等方面的研究。近年来在甲基化修 饰,尤其是5hmC和m6A等方面获得了许多重要的发现。迄今已在Nature,Science等国际权威学术期刊发表了150余篇论文。曾荣获美国癌症 研究青年科学家奖,凯克基金会医学研