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PNAS:探查癌症基因组ncRNA“暗物质”

来自西奈山Icahn医学院的研究人员在癌细胞中发现了一组可以激发免疫反应的非编码RNA分子,它们具有与病原体相似的一些特征。由于这些分子在癌症中表达并扩增,它们造成的免疫反应有可能影响了癌症的生长。这项研究发布在《美国国家科学院院刊》(PNAS)上。 研究人员是通过探查基因组“暗物质”组成部分——称作为卫星DNA的区域来获得这一研究发现的。这一区域生成了大量有别于编码基因和mRNA的非编码RNA (ncRNA)。这些神秘的RNA分子大多不生成蛋白质,但具有重要的调控功能。 这项研究的高级研究员、Icahn医学院Tisch癌症研究所助理教授Benjamin Greenbaum博士说:“这些ncRNAs存在于人类和小鼠癌细胞中。过去这些区域被称作为‘垃圾DNA’,在过去的5年里研究人员开始认识到这是许多功能重要ncRNAs的居所。” 共同高级研究员、Icahn医学院Tisch癌症研究所免疫疗法主任、血液学与内科肿瘤学教授N......阅读全文

出人意料的新才能:非编码RNA

  在《来自基因组暗物质的lncRNA、ciRNA和miRNA》一文中我们提到:人类基因组中也存在大量被称为基因组“暗物质(dark matter)”的非编码序列,包括基因间非编码序列、内含子非编码序列等。所谓基因组“暗物质”,其实就是基因组中的非编码RNA——不包含用于制造蛋白质的版图,构成了超过

动物所piRNA的高精度预测算法研究获得突破

  第二代测序技术又称作深度测序技术,应用到RNA上统称作RNA-seq或RNA测序,它已成为基因表达和转录组分析的重要手段。第二代转录组测序数据中含有大量不编码蛋白质的ncRNA序列,因为它们像宇宙中的暗物质一样难以识别和有重要功能,也被称为“基因组暗物质”。由于数据量巨大,保守性差

利用CRISPR研究基因组“暗物质”

  超过98%的人类基因组由非编码基因组成。这些非编码基因被称为基因组的“暗物质”,它们能调控编码基因的表达,从而影响人类健康和疾病进程。自从人类基因组序列被公开发表以来,科学家们努力解析基因中的功能元件,包括非编码调节区——参与转录调节的顺式调节区和非编码RNA(ncRNA)。转录因子在整个基因组

Genome Research丨lncRNA在精子发生过程中的关键作用

  Genome Research丨lncRNA在精子发生过程中发挥重要作用   一直被很多科学家认为是真核生物基因组进化中“垃圾”信息的非编码RNA(ncRNA),既不编码蛋白质,又缺乏生物学功能的遗传学证据,近几年得到了“平反”,越来越多的研究表明ncRNA 在剂量补偿效应(Dosage co

ncRNA在精子发生过程中的关键作用研究

Genome Research丨lncRNA在精子发生过程中发挥重要作用一直被很多科学家认为是真核生物基因组进化中“垃圾”信息的非编码RNA(ncRNA),既不编码蛋白质,又缺乏生物学功能的遗传学证据,近几年得到了“平反”,越来越多的研究表明ncRNA 在剂量补偿效应(Dosage comp