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华大基因参与破译虎尾海马全基因组

2016年12月15日,由中国科学院南海海洋研究所、德国康斯坦茨大学、华大基因和新加坡A*STAR研究院共同组成的研究小组,联合破译了虎尾海马(Hippocampus comes)的全基因组,有关研究成果以封面文章的形式发表在Nature杂志上。 海马隶属于海龙科。与其他硬骨鱼不同,海马呈现高度特殊的形态,例如头部前方具有管状长嘴,无腹鳍和尾鳍,尾端卷曲,全身覆盖硬骨骼,没有鳞片等。另一个特殊的点在于其雄性育儿及性别角色逆转,即雌性海马将卵子放入雄性海马的育儿袋中,雄性海马通过育儿袋孵化胚胎直到分娩。 为了探索海马特殊的形态及繁殖方式背后的遗传基础,研究小组针对虎尾海马进行全基因组测序并与其他辐鳍鱼进行比较分析。 研究发现,在已测定全基因组的硬骨鱼中,海马的进化速率是最快的。虽然有关机制还不太清楚,但是较高的进化速率会促进具有新功能及更高效蛋白的海马的出现,这些进化可能与其特殊的体型有关。另外,和斑马鱼等其他硬骨鱼相比......阅读全文

生命科学研究中常见模式生物简介(一)

模式生物由于其结构简单、生活周期短、培养简单、基因组小等特点,在生物医学等领域发挥重要作用。模式生物作为材料不仅能回答生命科学研究中最基本的生物学问题,对人类一些疾病的治疗也有借鉴意义。常见的模式生物有有真菌中的酵母,原核生物中的大肠杆菌,低等无脊椎动物中的线虫,昆虫纲的果蝇,鱼纲的斑马鱼,哺乳纲的

北京大学Cell Res基因编辑研究新成果

  来自北京大学的研究人员报告称,他们利用一种RNA导向的Cas9核酸酶在哺乳动物细胞和斑马鱼胚胎中有效实现了位点特异性基因编辑。相关论文“Genome editing with RNA-guided Cas9 nuclease in Zebrafish embryos”发表在3月26日的《细胞

《科学》杂志评出2007年十大科技突破

北京时间12月21日消息,美国《科学》杂志12月21日公布了2007年度科学突破,“科学家发现人类基因组差异”荣登榜首,成为2007年度最大的科学突破。以下是《科学》杂志年度十大科学突破名单: 1.揭开人类基因组个体差异之谜 揭开人类基因组个体差异之谜 在更为先进的DNA排序技术和基因组

胚胎发育之谜?刘江揭开面纱

  DNA甲基化是一种重要的表观遗传修饰。以高等动物为例,个体从受精卵发育成成体的过程中,DNA甲基化图谱都是动态变化的,会调控不同的细胞往不同的方向分化。因此,建立DNA甲基化图谱对理解生殖细胞形成和胚胎发育至关重要。刘江(中)团队合影  在基金委“细胞编程和重编程的表观遗传机制”重大研究计划中,

美研制出高效基因组改编方法

  中国科技网讯 据物理学家组织网、《自然》网站等媒体9月23日报道,一个由美国明尼苏达州罗彻斯特市梅奥诊所研究人员领导的国际研究小组,开发出一种高效的基因组改编方法,可对斑马鱼基因组进行精确定位的剪切替换,用于各种研究目的。该研究首次实现了对斑马鱼基因组分的自定义

2012国家自然科学基金评审结果名单之复旦大学(生物类)

  301 81201256 牛辰 复旦大学 丝/苏氨酸蛋白激酶Stk调控表皮葡萄球菌生物膜和毒力的分子机制研究 H1901 青年科学基金项目 23 2013-1-1 2015-12-31   302 81201277 毛日成 复旦大学 干扰素刺激基因MS4A4A抑制乙型肝炎病毒复制的机制

科学家在细胞层面深度跟踪人类发育

这种新技术将能让生物学家提出有关个体之间、器官之间以及随着其年龄增长的谱系树变化的问题。20世纪80年代初,约翰·萨尔斯顿连续18个月将时间花费在观察蠕虫生长上。他用光学显微镜观察一只秀丽隐杆线虫的胚胎,并且每隔5分钟勾勒观察图,例如一个受精卵分化为两个细胞,然后变为四个、八个,等等。他在英国剑桥医

科学家在细胞层面深度跟踪人类发育

  这种新技术将能让生物学家提出有关个体之间、器官之间以及随着其年龄增长的谱系树变化的问题。  20世纪80年代初,约翰·萨尔斯顿连续18个月将时间花费在观察蠕虫生长上。他用光学显微镜观察一只秀丽隐杆线虫的胚胎,并且每隔5分钟勾勒观察图,例如一个受精卵分化为两个细胞,然后变为四个、八个,等等。他在英

科学家在细胞层面深度跟踪人类发育

这种新技术将能让生物学家提出有关个体之间、器官之间以及随着其年龄增长的谱系树变化的问题。 20世纪80年代初,约翰萨尔斯顿连续18个月将时间花费在观察蠕虫生长上。他用光学显微镜观察一只秀丽隐杆线虫的胚胎,并且每隔5分钟勾勒观察图,例如一个受精卵分化为两个细胞,然后变为四个、八个,等等。他在

北大近年来首篇NatureMethods文章

  Nature Methods杂志是Nature出版社旗下的著名期刊之一,也是方法学领域的权威刊物,主要刊载具有创新性的技术进展,在去年之前,大陆学者在此刊物上发表的技术文章仅有3篇。近期来自北京大学生科院,加州大学洛杉矶分校的研究人员在这一著名期刊上发表了题为“TALEN-mediated

Nature头条:基因编辑技术开启新篇章

  斑马鱼是脊椎动物生物学和人类疾病研究的一个重要的参与者。其胚胎透明、体外受精、短繁殖周期和快速生长等特点意味着可对活体动物开展紧密地胚胎发育研究,斑马鱼可作为研究基因行为和功能的一种有用模型。   现在来自梅奥医学中心(Mayo Clinic)的分子生物学家Stephen Ekker领

Nature头条:基因编辑技术开启新篇章

  斑马鱼是脊椎动物生物学和人类疾病研究的一个重要的参与者。其胚胎透明、体外受精、短繁殖周期和快速生长等特点意味着可对活体动物开展紧密地胚胎发育研究,斑马鱼可作为研究基因行为和功能的一种有用模型。   现在来自梅奥医学中心(Mayo Clinic)的分子生物学家Stephen Ekker领导研

基因组编辑:改码生命,人定胜天

   谷峰1,高彩霞2  1温州医科大学附属眼视光医院 眼视光学与视觉科学国家重点实验室,浙江 温州 325000  2中国科学院遗传与发育生物学研究所 基因组编辑中心 植物细胞与染色体工程国家重点实验室,北京 100101  人类社会的发展是一个漫长的自然历史过程,期间人类与自然界的不断“摩擦与碰

Cancer Cell揭示肝癌的强力推手

  罹患晚期肝细胞癌(肝癌)的病人有很高的死亡率,现有的药物证实只有很小的显著生存优势。通过结合斑马鱼肝癌模型和来自人类肿瘤的数据,西奈山Icahn医学院的研究人员希望能够鉴别出一些能够被肝癌新疗法靶向的潜在目的基因。   利用转基因斑马鱼作为一种新兴的、强有力的、全新动物模型来发现癌症基因,结合

发育生物学领域最新研究进展

  本期为大家带来的是发育生物学领域的最新研究进展,希望读者朋友们能够喜欢。  1. Eur Respir J:新研究揭示肺脏发育高清图谱  DOI: 10.1183/13993003.00746-2019  过早出生的婴儿常常患有肺部发育不良,并可能面临危及生命的后果。为了给这些婴儿提供新颖的治疗

4月25日《自然》杂志内容精选

  验证量子性的经典方法   与量子系统所发生的实验相互作用是有限的,也是有必要如此的,那么是否有可能控制和命令这样的系统?Ben Reichardt等人参考量子计算和密码学(它们都涉及不完美模拟的或“不可信的”系统)来探讨关于量子力学的这一基础哲学问题。他们描述了一个能对大型量子系

基因编辑进展梳理 Part II 基于CRISPR-Cas9的技术应用篇(下)

  上一期为大家介绍了过去一年里CRISPR技术在动物造模及单碱基技术方面取得的重大突破。本期继续为大家从功能基因组筛选、细胞谱系示踪及疾病诊断方面谈谈CRISPR-Cas系统的技术运用。   一、大规模基因功能的筛选   尽管测序和基因组编辑技术取得了重大进展,但是解析复杂的基

基因编辑进展梳理 Part II 基于CRISPR-Cas9的技术应用篇(下)

  上一期为大家介绍了过去一年里CRISPR技术在动物造模及单碱基技术方面取得的重大突破。本期继续为大家从功能基因组筛选、细胞谱系示踪及疾病诊断方面谈谈CRISPR-Cas系统的技术运用。   一、大规模基因功能的筛选   尽管测序和基因组编辑技术取得了重大进展,但是解析复杂的基因型-表型关系仍

敲降斑马鱼基因的方法学比较

一、基因敲降的前期准备工作相同1.1 生物信息学分析目标基因在斑马鱼早期胚胎发送过程中是否有表达。1.2 收集斑马鱼早期发育胚胎(通常为48 hpf前的胚胎),提取总RNA,然后进行体外转录(RT)。1.3 设计检测目标基因表达的PCR引物,以1.2获得的cDNA为模板,进行PCR扩增,确认目标基因

敲降斑马鱼基因的方法学比较

  一、基因敲降的前期准备工作相同   1.1 生物信息学分析目标基因在斑马鱼早期胚胎发送过程中是否有表达。   1.2 收集斑马鱼早期发育胚胎(通常为48 hpf前的胚胎),提取总RNA,然后进行体外转录(RT)。   1.3 设计检测目标基因表达的PCR引物,以1.2获得的cDNA为模板,

敲降斑马鱼基因的方法学比较

  一、基因敲降的前期准备工作相同   1.1 生物信息学分析目标基因在斑马鱼早期胚胎发送过程中是否有表达。   1.2 收集斑马鱼早期发育胚胎(通常为48 hpf前的胚胎),提取总RNA,然后进行体外转录(RT)。   1.3 设计检测目标基因表达的PCR引物,以1.2获得的cDNA为模板,

基于PCR评估sgRNA特异性的方法

  CRISPR/Cas9已经成为一种通用的基因组工程工具,依赖于一个单导向RNA(sgRNA)和Cas9酶进行基因组编辑。研究人员可以用简单、快速和经济的方法来产生sgRNAs,因此能够在培养细胞、小鼠、斑马鱼和其他模型系统中进行靶向诱变。为了靶向效率,预先筛选sgRNAs,对于成功诱变和减少动物

8篇论文,Science最新研究成果概览

  1.Science:揭示哺乳动物卵母细胞中的非中心体纺锤体组装机制  doi:10.1126/science.aat9557  哺乳动物胚胎经常异常发育,从而导致流产和遗传性疾病,如唐氏综合症。胚胎发育异常的主要原因是卵子减数分裂过程中的染色体分离错误。与体细胞和雄性生殖细胞不同的是,卵子通过一

自闭症研究进展一览

  本期为大家带来的是自闭症的研究进展汇总,希望读者朋友们能够喜欢。  1. Cell Res:科学家利用猴子模型取得自闭症研究新进展  自闭症是一种常见的神经发育紊乱疾病,主要症状为社交行为首先以及出现重复性的行为。目前全球范围对自闭症研究兴趣越来越高,而且随着大规模外显子测序技术的发展,一些新型

强!中国学者用最短时间突破100篇CNS生命科学领域成果

  截止2020月7月27日,中国学者在Cell,Nature 及Science 发表了共计102项生命科学的研究成果,其中新冠肺炎领域占了近一半(共43篇)。iNature系统总结了这些研究成果:   按杂志来划分:Cell 发表了30篇,Nature 发表了45篇,

斑马鱼的基因敲除定制(Cas9-KO)法介绍

利用 CRISPR/Cas9 技术,针对靶基因序列设计 sgRNA, 指导 Cas9 蛋白在特定基因位点引起 DNA 双链断裂,在非同源性末端接合修复断裂 DNA 的过程中,靶基因碱基突变或缺失被引入到斑马鱼基因组中,最终导致靶基因无法正常转录翻译,达到基因敲除的目的。目前我们利用

水生所在污染物通研究中取得进展

  肠道微生物在维持宿主健康方面发挥重要作用,紧密调控着宿主生物一系列生理代谢活动,如能量代谢、免疫功能、神经行为等。然而,环境持久性有机污染物会显著干扰肠道微生物群落,进而影响宿主生理健康。然而,目前污染物如何影响肠道微生物和宿主健康缺乏机理研究。  近日,中国科学院水生生物研究所研究员陈联国团队

斑马鱼的基因敲除定制(Cas9-KO)法介绍

  利用 CRISPR/Cas9 技术,针对靶基因序列设计 sgRNA, 指导 Cas9 蛋白在特定基因位点引起 DNA 双链断裂,在非同源性末端接合修复断裂 DNA 的过程中,靶基因碱基突变或缺失被引入到斑马鱼基因组中,最终导致靶基因无法正常转录翻译,达到基因敲除的目的。目前我们利用 CRISPR

关于肝损伤修复及其分子调控机制

  利用 CRISPR/Cas9 技术,针对靶基因序列设计 sgRNA, 指导 Cas9 蛋白在特定基因位点引起 DNA 双链断裂,在非同源性末端接合修复断裂 DNA 的过程中,靶基因碱基突变或缺失被引入到斑马鱼基因组中,最终导致靶基因无法正常转录翻译,达到基因敲除的目的。目前我们利用 CRISPR

Science杂志最受关注的文章(5月)

  美国的《Science》杂志由爱迪生投资创办,是国际上著名的自然科学综合类学术期刊,与英国的《Nature》杂志被誉为世界上两大自然科学顶级杂志。Science杂志主要发表原始性科学成果、新闻和评论,许多世界上重要的科学报道都是首先出现在Science杂志上的,比如艾滋病与人类免疫缺陷病毒之间的