Nature:深度立体基因分析或可帮助理解机体肝脏的功能

如果你早晨醒来感觉精力充沛,头脑清楚, 那么你应该感谢机体肝脏在你吃早饭之前为你制造了一定的葡萄糖;在履行机体其它重要的功能中,肝脏还能够帮助清除体内的毒素并且在血液中产生大量的载体蛋白;近日一项刊登在国际著名杂志Nature上的研究报告中,来自魏兹曼科学研究院的研究人员通过研究发现,机体肝脏这种神奇的多任务处理技能至少部分是由于肝脏细胞中的精细劳动分工所造就的。 在每一个肝脏的微观世界中,一种六角小叶结构会组成洋葱样的同心层结构,通过绘制肝脏小叶结构所有细胞的基因活性图谱,研究者Shalev Itzkovitz博士及其同事就发现,每一层同心层结构都会发挥不同的功能,而且肝脏细胞能够被分为至少9种不同的类型,每一种类型都会专注于自己的任务。 研究者还发现,葡萄糖、凝血因子以及其它多种材料的合成都会发生于肝脏小叶的外层结构中,这些层状结构富含促进多种合成过程所需的氧气;肝脏小叶的内层结构则能够揭示毒素和其它物质被破碎的位点......阅读全文

连锁基因的遗传分析实验

实验方法原理连锁遗传规律阐明了位于一对同源染色体上的连锁遗传基因分离和组合的关系。由于连锁遗传基因在分离和组合过程中的相互影响,致使杂合体所产生的各类配子比例不等,其自交和测交子代表现型的分离比例也因重组率的不同而异,但总是重组型少,亲型多。由于基因在杂色体上的位置和距离不同,基因之间的连锁强度也不

基因表达快速分析新技术

实验概要介绍了一种新的基因表达快速分析技术-MPSS 技术的基本原理、技术路线及其优点和应用。实验原理MPSS技术是利用限制性内切酶和荧光检测知识,发展出的一种辨认和测定细胞每一个cDNA 克隆片段末端16~20bp序列的方法,从而查明细胞内所有基因的表达情况。MPSS 分析系统大体可划分为三大部分

基因芯片优缺点分析

基因芯片的最大优点在于其高通量。基因芯片出现之前,研究众多基因在特定研究体系中的表达变化的手段为原位杂交技术和NORTHERN技术。这两种技术有其各自优点。原位杂交技术可以精确定位待检测基因在组织中分布于哪些细胞类型,而NORTHERN技术可以显示待检测基因的分子量信息。但两个技术的致命缺点是极低的

基因表达数据分析主成分分析-PCA

DNA微阵列基因表达数据分析 主成分分析 ( Princ ipal Component Analysis , PCA ) 是一种掌握事物主要矛盾的统计分析方法,它可以从多元事物中解析出主要影响因素,揭示事物的本质,简化复杂的问题。计算主成分的目的是将高维数据投影到较低维空间。给定 n 个变量的 m

5万人基因组分析发现新致病基因

一些宾夕法尼亚人并没有意识到自己携带了一些提高心脏病和中风风险的基因突变。在一项迄今最大规模的研究中,科学家网罗了超过5万人的基因组数据,并连同他们的电子健康档案,最终识别出潜在的新的致病基因。这些数据进一步证明,每250人中便有1人携带了可能使其罹患心脏病和中风的基因变异,尽管他们并没

华大基因完成肠道微生物基因组关联分析

  从物种、功能及生态群落上展示肠道微生物与结直肠腺瘤及结直肠癌的关联特征,这是深圳华大基因研究院、奥地利因斯布鲁克医科大学、奥本多夫医院、丹麦哥本哈根大学、华南理工大学等多家单位最新的联合取得的科研进展。3月11日,国际学术期刊《自然通讯》杂志发表了这项研究成果。该研究对结直肠腺瘤、结直肠癌的早期

基因组分析揭示等位基因特异RNA编辑现象

  核糖核酸(RNA)编辑是RNA水平一种常见的修饰,是增加基因转录和功能多样性的重要形式。17日,来自中科院昆明动物研究所的消息,由张亚平院士领导的、多个研究机构加盟的团队,在等位基因特异的RNA编辑研究上取得了重要进展。  中科院昆明动物研究所周中银博士介绍,对二倍体生物来说,虽然两个等位基因的

全基因组分析发现多个疾病相关基因

  来自伦敦帝国理工学院的研究人员通过多次全基因组关联分析,发现了多个与疾病相关的基因,其中包括了糖尿病,冠心病等现代社会热点关注的疾病,这些成果陆续发表在《Nature Genetics》,《JAMA》等杂志上。   第一篇文章中,研究人员找到了控制电信号,也就是控制心律的基因,这种被称为SCN

基因组分析揭示等位基因特异RNA编辑现象

核糖核酸(RNA)编辑是RNA水平一种常见的修饰,是增加基因转录和功能多样性的重要形式。17日,来自中科院昆明动物研究所的消息,由张亚平院士领导的、多个研究机构加盟的团队,在等位基因特异的RNA编辑研究上取得了重要进展。 中科院昆明动物研究所周中银博士介绍,对二倍体生物来说,虽然两个等位基

全基因组分析发现多个疾病相关基因

来自伦敦帝国理工学院的研究人员通过多次全组关联,发现了多个与疾病相关的基因,其中包括了糖尿病,冠心病等现代社会热点关注的疾病,这些成果陆续发表在《Nature Genetics》,《JAMA》等杂志上。 第一篇文章中,研究人员找到了控制电信号,也就是控制心律的基因,这种被称为SCN10A的基因受

转基因植株的选择实验——转基因植物的分析

实验材料叶片试剂、试剂盒液氮DNA 纯化试剂盒bar 基因引物吐温PPT仪器、耗材PCR 分析塑料盆实验步骤一、PCR 分析1. 当植株长到合适大小时(即 3 ~4 张叶片),取约 2 cm 长的叶片,立即放于液氮中,抽提基因组 DNA。2. 在液氮中将叶片磨成粉末状,并使用 Wizard 基因组

分析基因扩增仪的技术特性

基因扩增仪是由上海旦鼎国际贸易有限公司代理销售的优质产品之一。上海旦鼎国际贸易有限公司是中国实验仪器权威的基因扩增仪商。下面旦鼎就为您介绍一下基因扩增仪技术特性。 基因扩增仪的技术特性: 1、加热模式:立体膜加热技术 2、制冷技术:新一代“peltier”效应“半导体热泵制冷”[1] 

基因组学分析揭示

  英国《自然》杂志18日在线公开的一篇基因组学论文显示,来自西伯利亚阿尔泰山脉东部尼安德特人的祖先,和现代人祖先的相遇与交融繁殖可能比原先认为的更早。已有证据显示,尼安德特人在47000年到65000年前在非洲之外就向现代人贡献了遗传物质。这项新研究还显示,大约在10万年前,现代人和尼安德特人之间

基因分析揭示古猫迁徙历史

   对古代猫的脱氧核糖核酸(DNA)进行的第一次大规模研究表明,在猫咪主宰互联网文化的几千年之前,这种动物便已经通过早期农民、古代水手乃至维京人遍布古代欧亚大陆和非洲。  这项研究对生活在距今15000年前至18世纪之间的200多只猫的基因组进行了测序。研究人员在9月15日召开的一次会议上公布了这

BCR/ABL融合基因及其产物分析

CML第9号染色体上c-ABL原癌基因易位于第22号染色体上BCR基因区域,形成1个新的5'BCR-ABL3'融合基因。后者可转录8.5kb的mRNA,含3.3kb BCR的编码序(5'端)和5.5kb ABL的编码顺序(3'端)8.5融合mRNA中BCR-ABL的阅

什么是基因表达的系列分析?

中文名称基因表达的系列分析英文名称serial analysis of gene expression;SAGE定  义通过构建较短的表达序列标签规模化地检测基因表达种类及其丰度的实验技术。应用学科遗传学(一级学科),基因组学(二级学科)

基因表达系列分析实验(SAGE)(四)

83. 用作测序的 2 ul PCR 产物(所需的确切用量取决于测序的方案,并应当优化)用下述方法处理:0.1 ul 外切核酸酶 I0.1 ul 虾碱性磷酸酶1.8 ul 50 mmol/L Tris·Cl,pH 8. 0加 2 ul 消化混合液到 2 ul DNA 中。84. 在热循环仪上进行反应

基因组分析的代表方法

基因组分析的代表方法 - end -上期回顾“二次元”基因第一回(1)“二次元”基因第一回(2)“二次元”基因第一回(3)“二次元”基因第二回(1)

基因表达系列分析实验(SAGE)(二)

31. 乙醇沉淀:11.5 ml 样品10 ul SeeDNA100 ul 糖原5.1 ml 7.5 mol/L 乙酸铵38.3 ml 100% 乙醇干冰/甲醇浴 15 min。然后室温溶化 2 min。32. 轻轻涡旋混匀,台式离心机的吊桶转子室温约 3000 g (4000 r/min) 离心

基因芯片数据的分析方法

研究背景:基因芯片可以通过探针和荧光标记对某个时间点生物体的全部基因表达量进行检测,探针代表的基因荧光强度通过仪器转换成基本数据。这些数据的背后隐藏着很多的生物学意义,这就需要我们通过生物信息学的方法去分析和挖掘。不同实验设计方案产生的海量芯片数据,其分析方法和思路都大同小异,这里分享一个多组实验设

基因表达系列分析的原理简介

  第一、一个9~10碱基的短核苷酸序列标签包含有足够的信息,能够唯一确认一种转录物。例如,一个9碱基顺序能够分辨262144个不同的转录物(49),而人类基因组估计仅能编码80000种转录物,所以理论上每一个9碱基标签能够代表一种转录物的特征序列。  第二、如果能将9碱基的标签集中于一个克隆中进行

关于汉坦病毒的宿主基因分析

  多采用细胞色素B基因分析方法。W.C.Black IV等采用微卫星DNA分析确定鹿鼠之间的基因关系,并研究了鼠类窝内汉坦病毒传播的方式。俄罗斯远东地区南部的7种宿主动物中存在4种汉坦病毒(HTN、PUU、SEO、KBR)。  L.Minskaya等的研究表明,从非主要宿主动物分离的病毒与标准株抗

缺失定位———基因精细结构分析

实验方法原理 如果某一待测缺失突变株能和一种已知缺失突变株进行重组,表明这一待测突变的位置一定不在已知缺失区域内。如果不能重组,待测定菌株突变位置便在已知缺失范围内。菌株A、B、C的缺失区域是已知的,另外有一系列点突变菌株1、2、3和4。分别将它们两两滴加在固体培养基表面的同一位置上,根据是否出现野

基因表达系列分析实验(SAGE)(三)

58. 用 1:10 000 的 SYBR Green I 染 15 min。在 UV 盒上观察,分出感兴趣的区带。59. 把每一块凝胶放入底部有约 0.5 mm 小洞的 0.5 ml 微量离心管中(用 21-G 针头刺的)。60. 把 0.5 离心管连同凝胶块放入 2.0 ml 的硅烷化的离心管里

TaqMan探针基因表达分析全面升级

TaqMan探针对于大家来说不是什么新名词了,然而你知道吗,对于部分降解的RNA,如福尔马林固定、石蜡包埋(FFPE)样品中的RNA,TaqMan引物探针的设计有更多的讲究,你知道这是为什么吗?FFPE样本在固定时导致核酸相互交联且片段化,RNA片段的大小在50-300 nt,大部分片段在100 n

关于myc基因的分析讨论介绍

  国内外用于检测N-myc、L-myc及C-myc的方法大多采用各种杂交技术。由于应用放射性同位素,需要各种防护措施,不安全又复杂,且一次只能检测Myc基因家族中的一个基因,临床上很难常规应用。PCR-琼脂糖凝胶电泳技术简单、易行、快速,但由于灵敏度低,不能分开只相差3个bpDNA的L-myc和N

BCR/ABL融合基因及其产物分析

  CML第9号染色体上c-ABL原癌基因易位于第22号染色体上BCR基因区域,形成1个新的5'BCR-ABL3'融合基因。后者可转录8.5kb的mRNA,含3.3kb BCR的编码序(5'端)和5.5kb ABL的编码顺序(3'端)8.5融合mRNA中BCR-ABL

缺失定位———基因精细结构分析

实验方法原理如果某一待测缺失突变株能和一种已知缺失突变株进行重组,表明这一待测突变的位置一定不在已知缺失区域内。如果不能重组,待测定菌株突变位置便在已知缺失范围内。菌株A、B、C的缺失区域是已知的,另外有一系列点突变菌株1、2、3和4。分别将它们两两滴加在固体培养基表面的同一位置上,根据是否出现野生

基因扩增产物分析方法介绍

PCR扩增DNA片段只是一个重要手段。扩增片段的检测和分析才是目的,根据研究对象和目的的不同而采用不同的分析法。琼脂糖凝胶电泳可帮助判断扩增产物的大小,有助于扩增产物的鉴定,点杂交除可鉴定扩增产物外,还有助于产物的分型;Southern杂交分析可从非特异扩增产物中鉴定出特异产物的大小,增加检测的特异

基因表达系列分析实验(SAGE)(一)

实验方法原理 实验材料 感兴趣的细胞或组织试剂、试剂盒 糖原EDTA缓冲液SDSBSATween 20连接子T4 DNA 连接酶BsmFIPC8SeeDNA乙酸钠乙醇DMSOPCR引物乙酸铵DNA ladder 聚丙烯酰胺 TBE凝胶DNA参照pZErO-1 质粒TE缓冲SOC培养液Tris · C