Antpedia LOGO WIKI资讯

基因表达系列分析实验(SAGE)(四)

83. 用作测序的 2 ul PCR 产物(所需的确切用量取决于测序的方案,并应当优化)用下述方法处理:0.1 ul 外切核酸酶 I0.1 ul 虾碱性磷酸酶1.8 ul 50 mmol/L Tris·Cl,pH 8. 0加 2 ul 消化混合液到 2 ul DNA 中。84. 在热循环仪上进行反应,37°C 温育 15 min, 然后 80°C 加热 15 min。加水到 15 ul。直接取 2 ul 稀释的 PCR 产物测序。85. 从 SAGEnet 下载 SAGE 的分析软件(见因特网资源),按说明分析。收起 注意事项 其他 1. 材料:感兴趣的细胞或组织2. 试剂:含以下成分的 Dynbeads mRNA DIRECT 试剂盒(Dynal Biotech):Dynbeads oligo (dT)25裂解/结合缓冲液洗涤缓冲液 A洗涤缓冲液 B10 mmol/L Tris·Cl 再生缓冲液储存缓冲液oligo ......阅读全文

DNA microarray相关的基因表达数据处理攻略

基因表达谱 的发展有助于科研工作人员进一步的理论知识充实及应用到研发等领域中。基因芯片是最近几年发展起来的基因表达重要工具,本文主要对这种技术的数据分析和管理方法作具体介绍。一、引言DNA微阵列(DNA microarray),也叫基因芯片,是近几年发展起来的一种能快速、高效检测DNA片段序列、基因

比较分子生理基因组学 —cDNA阵列的异种杂交实验(二)

二、方法在开始任何微阵列实验之前,必须要选定合适的对照和时间点,这样获得的数据才有生物学意义。关于如何选择合适的对照,参见注释 1 和 2。1 总 R N A 的提取2 R N A 变性凝胶电泳(1)制备一块 1 % 的琼脂糖甲醛变性胶,浸没在 IXM OPS 缓冲液中,胶上的孔应被溶液完全没过。将

比较分子生理基因组学 —cDNA阵列的异种杂交实验

实验步骤 一、材料 这里用到的所有化学试剂都为分子生物学等级,或者用它们最高纯度的等效物。所有的塑料和玻璃制品,包括瓶子和移液器吸头都要高压灭菌,在核酸实验操作过程中必须始终戴手套。 cDNA A T L A S阵列从Clo

比较分子生理基因组学 —cDNA阵列的异种杂交实验

近几年来, DNA 微阵列已经被公认是分子生物学研究的一种标准方法。特别是在生物医学研究方面,常用物种的微阵列一面世就得到广泛应用。但是对于非模式生物来说 ,微阵列的应用尚未得到充分开展,而这些物种往往表现出一些很有趣的生理表型。对大多数比较生物学的研究者来说,制备一个新物种的 D N A 阵列或微

源资信息科技:数据挖掘和通路分析专家

  2010年全国质谱大会暨第三届世界华人质谱研讨会于2010年7月30日~8月1日期间在吉林长春顺利召开,源资信息科技(上海)有限公司在此次大会上主要向与会者介绍了高级化学分析软件(ACD/labs)及系统生物学中的GeneGo软件,引起了与会专家、参会代表及各大仪器厂商的极大兴趣。

高通量测序的应用及前景

一、高通量测序的应用 高通量测序可以帮助研究者跨过文库构建这一实验步骤,避免了亚克隆过程中引入的偏差。 依靠后期强大的生物信息学分析能力,对照一个参比基因组(reference genome)高通量测序技术可以非常轻松完成基因组重测序(re-sequence),2007年van Orsouw

高通量测序技术——第二代测序技术

高通量测序技术是对传统测序一次革命性的改变,一次对几十万到几百万条DNA分子进行序列测定,因此在有些文献中称其为下一代测序技术(next generation sequencing)足见其划时代的改变,同时高通量测序使得对一个物种的转录组和基因组进行细致全貌的分析成为可能,所以又被称为深度测序(de

基因突变导致他汀类药疗效不同

  Sage Bionetworks 机构的科研人员利用数据性状分析新方法,发现了一突变基因会导致患者服用他汀类药后出现肌肉疼痛和虚弱的症状,该基因的表达产物甘氨酸转脒基转移酶(glycine amidinotransferase,GATM)用于调控肌酸的合成速度。研究成果公布在《Natur

Nature新发现:导致疗效不同的基因突变

  研究人员采用一种新方法,发现了一种可能会导致一些患者服用他汀类药物,出现肌肉疼痛和虚弱的基因变异,这一研究成果公布在今日出版(8月29日)的 Nature杂志上。研究人员指出,利用他汀类药物进行治疗,一种称为甘氨酸转脒基转移酶(glycine amidinotransferase,GAT

SSH抑制性消减杂交文库构建方法介绍

SSH是一项可以快速获取两个不同生物材料中差异表达基因的分子生物学技术,是快速筛选差异表达基因的有效方法,也是寻找新基因的重要手段。该技术尤其适合以genome尚不完全清晰的物种或者以特殊材料为研究对象的科研工作者。是基因芯片技术的有效补充。基本流程:通过差减文库构建,文库验证和筛选(逆向斑点杂交)

蛋白质(十五)主要研究

主要研究历史在18世纪,安东尼奥·弗朗索瓦(Antoine Fourcroy)和其他一些研究者发现蛋白质是一类独特的生物分子,他们发现用酸处理一些分子能够使其凝结或絮凝。当时他们注意到的例子有来自蛋清、血液、血清白蛋白、纤维素和小麦面筋里的蛋白质。荷兰化学家格利特·马尔德(Gerhardus Joh

癌症为什么发生在特定细胞里?单一细胞测序可以解答!

   我们都知道癌症的起源离不开细胞突变,我们体内很多细胞的突变都可能会引起癌症,但相应的是,也有很多突变并不会导致癌症的发生,而如何辨别这些突变会不会引起癌症便是一个癌症早期防治的关键问题,在最新发表的一篇研究报告中,研究人员们探究了视网膜母细胞瘤与特定细胞突变的关系。Frolov 与 Ariss

高通量测序技术技术的应用及前景

高通量测序技术是对传统测序一次革命性的改变, 一次对几十万到几百万条DNA分子进行序列测定, 因此在有些文献中称其为下一代测序技术(next generation sequencing)足见其划时代的改变, 同时高通量测序使得对一个物种的转录组和基因组进行细致全貌的分析成为可能, 所以又被称

高通量测序技术技术的应用及前景

  高通量测序技术技术的应用及前景   (作者:生物芯片上海国家工程研究中心 滕晓坤, 肖华胜)   高通量测序技术是对传统测序一次革命性的改变, 一次对几十万到几百万条DNA分子进行序列测定, 因此在有些文献中称其为下一代测序技术(next generation sequencing)足见其划

一种无酚/无氯仿组织研磨从热带木本植物中提...(一)

一种无酚/无氯仿组织研磨从热带木本植物中提取核酸的方法概述:木本热带植物中含有大量复杂的有机化合物,这些有机化合物会抑制提取RNA或DNA所需的化学程序,从而不利于后续研究及应用,如RNA测序和基因表达分析。为了克服这个问题,研究人员必须使用CTAB / PVP缓冲液的提取方案,而不能使用市售的

Nature :一款新软件有望成为科学数据分享新利器

  Titus Brown一边飞行在太平洋上空,一边深潜到学生的研究代码中。从美国东兰辛市密歇根州立大学到澳大利亚墨尔本参加会议的这次长途旅行,给这位生物信息学家详细检查实验室的新运算法则以及去除RNA序列中的错误提供了一次良机。   3年前,Brown必须要等回到办公室后才能这样做,因为如果不经

【重要风向标】JP.Morgan:2017全球生物技术框架

  第35届JP摩根医疗健康年会将会如约在旧金山举行,作为世界顶级的医疗健康投资者年会,JP摩根健康年会从创立之初便吸引着千万来自全球各主要地区和国家的生物技术创业者和资本与金融界的行业达人。JP摩根是怎么看2017年全球生物科技领域未来的发展呢?  一、核心行业的基本面继续走强  生物科技领域仍处

【重要风向标】JP.Morgan:2017全球生物技术框架

  第35届JP摩根医疗健康年会将会如约在旧金山举行,作为世界顶级的医疗健康投资者年会,JP摩根健康年会从创立之初便吸引着千万来自全球各主要地区和国家的生物技术创业者和资本与金融界的行业达人。JP摩根是怎么看2017年全球生物科技领域未来的发展呢?  一、核心行业的基本面继续走强  生物科技领域仍处

【重要风向标】JP.Morgan:2017全球生物技术框架

  第35届JP摩根医疗健康年会将会如约在旧金山举行,作为世界顶级的医疗健康投资者年会,JP摩根健康年会从创立之初便吸引着千万来自全球各主要地区和国家的生物技术创业者和资本与金融界的行业达人。JP摩根是怎么看2017年全球生物科技领域未来的发展呢?  一、核心行业的基本面继续走强  生物科技领域仍处