综述：代谢组学研究加快医学生物标志物的发现
生物标志物(Biomarker)是指 “一种可客观检测和评价的特性，可作为正常生物学过程、病理过程或治疗干预药理学反应的指示因子”，作为个体化医疗的“关键词”之一，寻找和发现有价值的生物标志物已经成为当前医学领域的研究热点。Biomarker的研究现状和发展趋势： 第一个肿瘤标志物可追溯到1846年由H Bence-Jones所证实的本周氏蛋白（Bence Jones Protein)，对多发性骨髓瘤有一定的诊断作用。170余年后的今天，随着基因组学、蛋白质组学、肽组学、代谢组学等在内的组学平台，以及包括纳米技术、生物信息学、抗体芯片等前沿在内的手段与方法，都为快速获得及筛选生物标志物带来了极大的可能。 基因组学及转录组学描述的是机体可能发生改变的生理指标， 而代谢物则是存在于信号通路的终端产物，反映的是机体当时的生理状态。与其他组学相比，代谢组学由于与表型更为接近，因此更适于疾病分型和标志物发现的研究。 2009年，......阅读全文
代谢组学、脂质组学在病毒研究中的应用（一）
在疫情逐步可控的情形下，一线的医务工作者和科研人员将有更多精力和时间对冠状病毒进行更深一步的研究和认识。我们此次调研了基于Orbitrap超高分辨的代谢组学，脂质组学，以及药物治疗在病毒学研究中的应用。致敬白衣天使和深耕医学研究的学者。 目前的研究显示，新型病毒进入细胞的路径与SARS冠状病毒一样，
代谢组学、脂质组学在病毒研究中的应用（二）
案例三基于代谢组学技术挖掘病毒感染宿主后代谢动态变化情况2019年发表在Viruses杂志上的另一篇文章，采用基于Orbitrap 的非靶标和靶标代谢组学方式研究了麻痹病毒（Cricket paralysis virus, CrPV）感染昆虫Bm5细胞后宿主代谢的动态变化情况。研究人员发现，CrPV
实质等同性（代谢组学）实验
实验材料：SIMCA - P 多变量统计软件 试剂、试剂盒：[ 1H ] - NMR 抽提剂 仪器、耗材：Eppendorf 聚丙稀管 NMR 管
实质等同性（代谢组学）实验
实验材料SIMCA - P 多变量统计软件试剂、试剂盒[ 1H ] - NMR 抽提剂仪器、耗材Eppendorf 聚丙稀管NMR 管NMR 波谱仪实验步骤本章描述的方法最适合于分析小麦精白面，但改进后也适用于全面粉、麦麸或其他组织，如叶和根。在开展实质等同性代谢组学实验前，如其他任何田间试验或温室
临床代谢组学研究常见问题
分享一些我们举办完第一期微信公开课——临床代谢组学研究策略后，所收集到的常见问题，供大家学习和参考。Q：如何设置验证集和测试集？A：按我理解你想问的问题是：training set训练集和test set测试集的设置问题。我们做分析化学、生物化学或者分子生物学的初学者通常会混淆这几个数据集概念，通常
实质等同性（代谢组学）实验
实验材料 SIMCA - P 多变量统计软件试剂、试剂盒 [ 1H ] - NMR 抽提剂仪器、耗材 Eppendorf 聚丙稀管NMR 管NMR 波谱仪实验步骤 本章描述的方法最适合于分析小麦精白面，但改进后也适用于全面粉、麦麸或其他组织，如叶和根。在开展实质等同性代谢组学实验前，如其他任何田间试
合作成果丨靶向代谢组学
本文内容非商业广告，仅供专业人士参考。关于岛津 岛津企业管理（中国）有限公司是（株）岛津制作所于1999年100%出资，在中国设立的现地法人公司，在中国全境拥有13个分公司，事业规模不断扩大。其下设有北京、上海、广州、沈阳、成都分析中心，并拥有覆盖全国30个省的销售代理
代谢组学全流程解决方案
赛默飞基于其超高分辨的静电场轨道阱（Orbitrap）质谱平台结合其功能强大的软件平台，提供代谢组学全流程解决方案。该方案不仅覆盖从极性代谢物到非极性代谢物的全面检测、峰提取与定量、统计学分析与可视化作图、代谢产物的全面鉴定、代谢通路分析等全流程的要求，而且还整合了从非靶标生物标记物发现到靶标生物标
质谱仪在代谢组学和代谢研究中有着杰出表现
质谱仪以离子源、质量分析器和离子检测器为核心。离子源是使试样分子在高真空条件下离子化的装置。电离后的分子因接受了过多的能量会进一步碎裂成较小质量的多种碎片离子和中性粒子。它们在加速电场作用下获取具有相同能量的平均动能而进入质量分析器。质量分析器是将同时进入其中的不同质量的离子，按质荷比m/e大小分
【JOAT刘虎威编者按】专题：代谢组学和脂质组学
刘虎威教授担任《Journal of Analysis and Testing》第三期特刊的客座主编。 近日，刘虎威教授担任《Journal of Analysis and Testing》第三期特刊的客座主编进行了约稿审稿工作，并撰写了题为“专题：代谢组学和脂质组学”的编者按。 代谢
武汉物数所代谢组学评价纳米金棒生物效应研究获进展
近日，依托于中科院武汉物理与数学研究所的中国科学院生物磁共振分析重点实验室的生物波谱及代谢组学研究组，在纳米金棒暴露的细胞代谢应答方面取得新进展，相关研究结果发表在Biomaterials上(Biomaterials 34; (2013) 7117-7126)。 十六甲基溴化铵(cet
代谢组学：一项艰巨的任务
学生化的孩子真是伤不起。糖代谢、脂代谢、核酸代谢，一系列代谢通路，一大堆代谢产物，简直让人头晕眼花。然而，这又不能跳过。毕竟，DNA编码蛋白质，而蛋白质在小分子上发挥其魔力。但很多时候，科学界对这些分子一无所知。 “如果你测定一滴血中的小分子，大约60% 所检测到的峰都无法与任何代谢物相匹配，
AFADESI空间代谢组学高级研修班
为做好AFADESI空间代谢组学技术服务工作，由中国科学院高能物理研究所测试中心和中国科学院-香港大学金属组学与健康和环境联合实验室共同承办的“AFADESI空间代谢组学高级研修班”将于2023年4月26日-4月27日在京召开。在这里，我们将竭诚为您提供丰富的前沿应用信息和与专家零距离交流的平台
临床代谢组学研究常见问题（一）
分享一些我们举办完第一期微信公开课——临床代谢组学研究策略后，所收集到的常见问题，供大家学习和参考。 Q：如何设置验证集和测试集？ A：按我理解你想问的问题是：training set训练集和test set测试集的设置问题。我们做分析化学、生物化学或者分子生物学的初学者通常会混淆这
综述：代谢组学在疾病中的应用
代谢组学经历了迅猛的技术演化在过去二十年。尤其是广泛靶向代谢组学技术的新起，实现一次性检测坚定上千种物质，同时能够定量。整合了非靶向和靶向代谢物检测技术的优点，创造性实现了高通量、高灵敏度靶向代谢物检测，为定性、定量检测大批量、低丰度代谢物提供了高效的方法。 应用代谢组学的定义事件的预测生
临床代谢组学研究常见问题（一）
分享一些我们举办完第一期微信公开课——临床代谢组学研究策略后，所收集到的常见问题，供大家学习和参考。 Q：如何设置验证集和测试集？ A：按我理解你想问的问题是：training set训练集和test set测试集的设置问题。我们做分析化学、生物化学或者分子生物学的初学者通常会混淆这
代谢组学常使用的数据库
代谢组主要是对小分子代谢物（一般50-1500 Da）进行高通量定性和定量分析，代谢组分析产生了大量的生物信息数据。代谢组数据库的开发对于归纳总结这些大数据，方便后续的代谢组学数据分析，揭示隐藏在大数据背后的生物学机理具有十分重要的作用。 目前常用的代谢组学数据库有HMDB、NIST、LMSD
利用精确血浆代谢组学方法揭示衰老相关代谢特征
过去二十年里，代谢（脂质）组学研究得到了迅速发展。液相色谱与高分辨质谱联用（LC-HRMS）技术是目前内源性代谢物最常用的手段，然而困扰LC-HRMS技术的分析精度和结构鉴定的瓶颈问题仍然存在。尤其是血浆样本，其组分化学性质各异，同时复杂的基质会显著减低代谢物定性与定量结果的准确性，导致生物学信
综述－|AD的蛋白质组学格局发病机制和生物标志物新见解
导 读 基于质谱的蛋白质组学使得对阿尔茨海默症(AD)的蛋白质组和蛋白质翻译后修饰(PTM)的深入剖析成为可能。在这里，我们回顾了AD蛋白质组学研究的历史和近期的进展以及局限。作为遗传图谱的补充，蛋白质组学研究不仅验证了典型的淀粉样蛋白和tau通路，而且还发现了蛋白质网络中的新组成部分，如RN
Cell提出一个新“组学”：蛋白质代谢小分子互动组学
科学家们提出了一个新的“组学”——一个处理蛋白质和小分子之间相互作用的互动组学（protein-metabolite interactomics）。此前系统生物学家专注于基因组学或蛋白质组学，现在他们日益发现了蛋白质-代谢小分子之间相互作用的重要性。 基因组学针对的是生物体基因的系统分析，而蛋
代谢组学研究的影响因素与降低生物化学和化学...（二）
组分提取软件的数据处理工作流程如图 4 所示。该软件能像分析人员一样解析数据，批量处理各个数据文件，而不是单独处理，并将每次运行得到的信息用于验证下一次运行获得的信息。按照这种方式，由于每种组分在数据集中的最大浓度点定义，从而大大减小了数据缺失值现象。同样的组分在低浓度样品中时，可以采用更靶标性
利用代谢组学发现中医黄疸病证候的关键生物标记物
国际蛋白质组学领域权威杂志《Molecular & Cellular Proteomics》(5-Year IF：9.392)2012年第8期发表了黑龙江中医药大学中药血清药物化学国家中医药管理局重点研究室王喜军课题组利用代谢组学全面解析中医黄疸证的研究论文《尿液代谢组学分析黄疸证的关键生物
近亿元！百趣生物完成A轮融资，加快代谢组学产品转化
近日，代谢组学专精特新企业——上海百趣生物宣布，完成近亿元 A 轮融资，本轮融资由启明创投独家领投。此次融资将主要用于百趣生物代谢组学科研服务仪器平台的扩建、检测试剂的研发及生产，促进代谢组学与蛋白质组学等多组学的技术融合，加快代谢组学产品的临床转化进程，推进质谱在生命科学领域的快速发展。百趣生物是
代谢组学研究的影响因素与降低生物化学和化学...（一）
代谢组学研究的影响因素与降低生物化学和化学噪音的策略目的为代谢组学生物标记物的发现开发一套全新的自动化工作流程和仪器分析方法。 前言在制药行业中，代谢组学用于研究潜在候选药物的药理学 响应所产生的生化变化，其识别毒性 / 药效标记物的能力可以显著加速药物研发的进程并帮助制定合适的临床计划。来自于
妇科肿瘤常用的生物学标志物
肿瘤标志物是指肿瘤细胞异常表达所产生的蛋白抗原或生物活性物质，可在肿瘤患者的组织、血液、体液或排出物中检测出来，可协助肿瘤的诊断、鉴别诊断及疗效监测。一、相关抗原与胚胎抗原 1、癌抗原125（cancer antigen 125，CA125）常用血清检测阈值为35 IU/ml。CA125是目前应
非靶向代谢组学中鉴定代谢产物适宜选用哪些分析方法
据相关科技要闻解读表明非靶向代谢组学已逐步成为研究生命活动的重要基础。它可高清呈现代谢产物的变化规律以及代谢种类，特别是那些评价高的非靶向代谢组学更是揭开了研究集体生命活动发生和发展的本质，现在就非靶向代谢组学中鉴定代谢产物更适宜选用哪些分析方法作简要阐述：1.主成分分析（PCA）非靶向代谢组学中鉴
Agilent与Stemina－宣布代谢组学领域的合作
Agilent与Stemina 生物标记物发现公司宣布共同促进 Stemina 的代谢组学研究 2010 年 5 月 24 日，北京——安捷伦科技公司(纽约证交所：A)与 Stemina 生物标记物发现公司(Stemina Biomarker Discovery, Inc.)今日宣布，两家公司
Agilent与Stemina－宣布代谢组学领域的合作
Agilent与Stemina 生物标记物发现公司宣布共同促进 Stemina 的代谢组学研究 2010 年 5 月 24 日，北京——安捷伦科技公司(纽约证交所：A)与 Stemina 生物标记物发现公司(Stemina Biomarker Discovery, Inc.)今日宣布，两家公司
Science：逆转传统认知，代谢组学揭示重要机制
来自Weill Cornell医学眼的研究人员在新研究证实氨基水杨酸(PAS)一种常用于治疗结核病(TB)的药物，通过在叶酸合成中的一种关键酶加工分解成不同的产物，干扰了随后在这条信号通路中起作用的酶。这一发表在11月1日《科学》(Science)杂志上的研究与从前认为其只与酶结合，而并未参
LCMS8060助力广泛靶向代谢组学研究
mGWAS (metabolome Genome-Wide Association Study)指基于代谢组学的全基因组关联分析，是将代谢组数据作为表型，与基因型数据进行关联分析的一种方法。由于代谢组数据对表型鉴定更为精细，因此关联分析的精度比传统GWAS分析更高。 海南大学和华中农业大学的罗杰