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Cell:新工具可显示多重肠道细菌

肠道细菌对人体健康有广泛作用,但目前人们还缺乏探索微生物活性和宿主生理机能相互关系的工具。近日,两个独立研究组在《 细胞 》杂志发表论文称已经克服了这一障碍,开发出能同时显现多种肠道细菌的新工具。该方法有助于研究人员基于其发出的不同色彩,探明细菌在肠道中的位置。 “我们发现,合成生物学工具让我们能询问有关肠道细菌的新问题。”其中一篇论文的高级作者、美国耶鲁大学医学院 Andrew Goodman 说,该策略或许有助于新疗法的研发。 在其中一个研究中,斯坦福大学医学院的 Justin Sonnenburg 及其同事,开发出一种改造拟杆菌的方法,以便其同时追踪肠道中的多种菌株。这些工具包括一个合成激活子—DNA序列面板,其能开始抄写特定基因。 使用该面板,研究人员基因改良了不同的拟杆菌,制作出独特的红色荧光蛋白(mCherry)和绿色荧光蛋白(GFP)的组合。他们将该组合植入无菌鼠体内,两周后,使用荧光显微镜分析了小鼠结肠......阅读全文

高通量测序技术在肠道菌群多样性研究中的应用

在人体肠道中生活着数以万亿的共生菌群,它们的种类繁多,可达上千种,数量也很惊人,是人体细胞总量的10倍以上,迄今为止,仍有80%以上的微生物不为人知。这些肠道微生物和人体存在着互利共生的关系,对于维持人类的健康发挥着重要的作用。它们在肠道中保持着一种动态的平衡,能够合成维生素、帮助人体从食物中吸收

高通量测序技术在肠道菌群多样性研究中的应用(二)

二、肠道菌群与疾病发生之间的关联1.  Gut Microbiota in Human Adults with Type 2 Diabetes Differs from Non-Diabetic Adults——2010《PLoS One》以往文献报道肠道菌群与人类代谢疾病之间存在着某种关

Cell子刊推荐综述:人肠道细菌的命运

  肠道微生物是由一群构成不同的微生物群体组成,其中包括细菌,古细菌和真核生物,它们亲密无间的生活在一起。在过去二十年间,科学家们对于这些小生物的兴趣日趋浓厚,很大一部分原因是由于测序技术相关的分析飞速发展,今天大量的证据表明肠道微生物在宿主生理病理,以及肠道免疫平衡过程中扮演了重要的角色。  近期

2018年微生物领域都有哪些惊人发现?

  细胞是构成人体的基本单位。一个成年人的细胞数量大约是10的13次方,而与人体共生的细菌比人体细胞还要多10倍,其中肠道菌群就包含了500-1000种不同的细菌。早在1886年,就有学者发现了大肠杆菌对消化有辅助作用。由此而展开的,对大肠杆菌、双歧杆菌等常见肠道菌的发现和功能探索也开启了早期人类对

Nature新文章解析糖代谢

  我们都知道膳食纤维对健康有益。但膳食纤维到底是什么,我们又是如何代谢它的呢?   膳食纤维指的是非淀粉类的多糖,它们广泛存在于多种蔬菜水果的细胞壁中,人类需要摄取大量膳食纤维才能保证营养均衡。由于人类基因组中缺乏编码相应酶的基因,我们主要依赖肠道中的微生物群将这些复杂的糖类进行糖化发酵。  

世界上近一半人体内存在新型病毒

  科学家们急于查明感染肠道细菌的新型病毒是可以增进健康还是在某些条件下影响易感性。新型病毒crAssphage  根据一项新研究,一种存活于人类肠道内的病毒刚刚被发现,令科学家惊讶的是,竟然可以在全世界近一半人口身上找到这种病毒。  圣迭戈州立大学生物信息学教授罗伯特?爱德华兹(Robert Ed

微生物与健康之间关系

  物种身上的微生物与其健康之间有没有联系?这是美国科罗拉多大学微生物学家罗布·耐特想找破解的谜团。耐特在世界各地从野生动物身上提取细菌样本,然后带到实验室进行分析。耐特是微生物医学领域的权威,被誉为“基因序列机器”。他首先把各种微生物的基因序列破译出来,然后通过计算工作与物种身上的微生物

《Science》12月最受关注的文章

  美国的《Science》杂志由爱迪生投资创办,是国际上著名的自然科学综合类学术期刊,与英国的《Nature》杂志被誉为世界上两大自然科学顶级杂志。Science杂志主要发表原始性科学成果、新闻和评论,许多世界上重要的科学报道都是首先出现在Science杂志上的,比如艾滋病与人类免疫缺陷病毒之间的

Science杂志最受关注的文章(1月)

  美国的《Science》杂志由爱迪生投资创办,是国际上著名的自然科学综合类学术期刊,与英国的《Nature》杂志被誉为世界上两大自然科学顶级杂志。Science杂志主要发表原始性科学成果、新闻和评论,许多世界上重要的科学报道都是首先出现在Science杂志上的,比如艾滋病与人类免疫缺陷病毒之间的

中国学者《Microbiome》揭示肠道噬菌体组与II型糖尿病相关性

   中科院深圳先进技术研究院合成生物学研究所(筹)的研究人员发表了题为“A Human Gut Phage Catalog correlates the Gut Phageome with Type 2 Diabetes”的文章,通过人肠道噬菌体集揭示肠道噬菌体组和II型糖尿病的相关性,这首次证实

华人学者PNAS发表CRISPR新技术

  复杂的生物学现象受到不同基因的协调控制。在人类细胞中系统地鉴定这些基因组合是非常麻烦的,亟需一种可扩展的多重筛选技术。  美国麻省理工的研究人员最近在美国国家科学院院刊PNAS杂志上发布了多重条码的CRISPR-Cas9筛选平台。该平台结合了CRISPR-Cas9和CombiGEM技术,能够在人

深圳先进院首次揭示肠道噬菌体组与II型糖尿病的相关性

  近日,中国科学院深圳先进技术研究院合成生物学研究所(筹)研究团队,在人体微生物组研究领域取得进展,相关研究成果以A Human Gut Phage Catalog correlates the Gut Phageome with Type 2 Diabetes为题,发表在Microbiome(《

肠道微生物最新研究进展

  肠道是人体最大的消化和排毒器官,其回旋盘转的结构被形象地称为人体第二大脑。肠道中寄生着数以计亿的细菌,它们是人体内最重要的一种外环境,各种微生物按一定比例组合,相互制约,相互依存,在质和量上形成一种生态平衡。然而肠道菌群并不都是人类的朋友,按特性来讲,它们可分为3大类,即好菌、坏菌和中性菌。当人

当宏基因组遇上单细胞测序

  日前,科学家们通过宏基因组测序和单细胞测序鉴定了一类新细菌。  16S rRNA基因序列的保守性和普遍性,使其成为了微生物检测和分类鉴定的强有力工具。这种方法为科学家们揭示了微生物群体的高度复杂性,但它还是有所遗漏。美国能源部联合基因组研究所上周的一次会议上,研究者人员向人们展示了在四个温泉样本

细菌诱导癌症发生的细节 | Science、Cell子刊共同揭示

  “结肠中有两类细菌,会促进慢性炎症,增加结肠癌的发生风险”——这是2月初分别发表在《Science》、《Cell Host & Microbe》期刊上两篇文章的最新结论。科学家们深入解析了“特定细菌诱导肿瘤发生”背后的机制,并找到了关键分子。   image.png   细菌诱导结肠癌发生的

综合Cell和Science的文章分享:硫代葡萄糖苷的分类和代谢

  十字花科植物主产蔬菜和油料作物,蔬菜包括西兰花,萝卜,芥菜,花椰菜,甘蓝等,数量庞大,占据了蔬菜半壁江山;芸薹属是其中最主要的食用蔬菜,营养丰富,还含有许多有价值的抗癌成分,如维生素、黄酮花青素、胡萝卜素,硫代葡萄苷等。  《science》曾经报道西兰花中天然化合物吲哚-3甲醇的强效抗肿瘤功能

2018年5月Science期刊不得不看的亮点研究

  2018年5月份即将结束了,5月份Science期刊又有哪些亮点研究值得学习呢?小编对此进行了整理,与各位分享。  1.Science:肠道微生物组竟能控制肝脏中的抗肿瘤免疫反应  doi:10.1126/science.aan5931; doi:10.1126/science.aat8289 

微生物学检验基本技术(2)

第六节 自动化技术在微生物检验中的应用  微生物鉴定的自动化技术近十几年得到了快速发展。数码分类技术集数学、计算机、信息及自动化分析为一体,采用商品化和标准化的配套鉴定和抗菌药物敏感试验卡或条板,可快速准确地对临床数百种常见分离菌进行自动分析鉴定和药敏试验。目前自动化微生物鉴定和药敏分析系统已在世界

微生物学检验基本技术(2)

第六节 自动化技术在微生物检验中的应用   微生物鉴定的自动化技术近十几年得到了快速发展。数码分类技术集数学、计算机、信息及自动化分析为一体,采用商品化和标准化的配套鉴定和抗菌药物敏感试验卡或条板,可快速准确地对临床数百种常见分离菌进行自动分析鉴定和药敏试验。目前自动化微生物鉴定和药敏分析系统已

Nature聚焦微生物组的家

  人体内充满了微小的微生物,这些成百上千的细菌物种被统称为微生物组(microbiome),人们认为它们有助于人体的健康与生存。胃肠道,尤其是结肠是最高密度和最高多样性细菌物种的家园。然而由于食物和流体的通过,这一系统不断发生变化,这些生物体是如何能够存留于其中并旺盛生长的呢?   由加州理工大

Science新文章:有益菌群的保护伞

  哺乳动物宿主部分程度上是通过释放破坏细菌膜的抗菌肽(antimicrobial peptide)来对抗肠道感染。但直到现在人们都并不清楚,有益微生物是如何在所释放的这些抗菌肽中生存下来,并在肠道中维持稳定种群的。  根据发表在1月8日《科学》(Science)杂志上一篇新研究论文的结果,共生肠道

年终盘点:2018肠道微生物重要研究盘点

  在人体肠道内的微生物中,超过99%都是细菌。人体正常的肠道细菌种类有500~1000 种。人肠道中的细菌细胞数达100万亿个,占人体总微生物量的 78 %,然而人体细胞总数也不过10万亿个,这意味着胃肠道内的细菌总数比人体细胞总数还多10倍。  肠道细菌不仅数量庞大,种类也繁多。占主要地位的是厚

不自闭,抗焦虑,降压力——当肠道细菌改变了大脑功能

   肠道细菌能影响人类健康,如今已算不上新鲜事。许多人都知道这些微生物能够影响消化、过敏反应以及新陈代谢。上市的新书似乎都不约而同地详细列举出哪种饮食能让肠道细菌最为健康,大势已成,人们已司空见惯。  但这些微生物的影响可能更深入,深及人类大脑。肠道菌群的生态系统已为人所知,在世界各地,有越来越多

Science:益生菌无法让人人受益

  生活在我们肠道中的有益菌群(肠道微生物组)对免疫系统的发育和功能起重要作用。越来越多的证据表明,某些益生菌(将有益菌导入肠道中去的治疗方法)可以帮助缓解一些肠道疾病,如克罗恩病的某些症状。通过研究克罗恩病遗传风险因子与肠道细菌之间的相互作用,加州理工学院(Caltech)的研究人员发现了某些患者

MALDI-TOF-MS 在病原微生物鉴定中的研究进展

       基质辅助激光解吸电离飞行时间质谱(Matrixassisted laser desorption ionization-time of flight mass spectrometry,MALDI-TOF-MS)技术是近年来发展起来的一种软电离新

Science:寄生虫可调控细菌平衡,有望治疗炎症性肠炎

  近期,潜伏于动物肠道的寄生虫被证实有望治疗包括克罗恩病(CD)在内的炎症性肠病(IBD)。来自于纽约大学的Ken Cadwell团队以老鼠为模型,解析了寄生虫如何刺激有益肠道细菌战胜引发炎症的细菌,从而间接性治疗炎症性肠病的过程。最新研究有望通过模拟寄生虫功能,为肠道疾病的治疗提供新见解。  寄

Nature:利用食用海藻操纵肠道细菌!

  肠道细菌依赖于我们吃的食物茁壮成长。反过来,它们提供必要的营养物让我们保持健康、击退病原体,甚至有助于指导我们的免疫反应。  了解我们摄入的某些细菌菌株如何和为何能够成功地在大肠中站稳脚跟而其他的细菌菌株被快速地驱逐,可能有助于科学家们了解如何以增强我们的健康或协助抵抗疾病的方式操纵在那里存在的

炎症和肠道菌群如何影响自闭症?

  自闭症是一种以不同程度的言语发育障碍、人际交往障碍、兴趣狭窄和重复或刻板行为为特征的神经发育障碍。在世界范围内,平均每150名儿童中就有1人患有自闭症,且发病率不断攀升;在美国每68名儿童中就有1个患有自闭症。虽然自闭症的发病率很高,而且进行了大量的研究,但是自闭症背后的原因仍然没有完全弄清楚。

肠道微生物组进展一览

  本期为大家带来的是肠道微生物相关领域的研究进展,希望读者朋友们能够喜欢。  1. Nutrition Reviews:饮食对肠道菌群的影响  DOI: 10.1093/nutrit/nuz106  根据乔治华盛顿大学(GW)和美国国家标准研究院(National Institute of Sta

肠道菌群 | Science专刊:决定你健康状况的"第二基因组"

  肠道菌群与人体健康密切相关,二者之间的关系是目前研究的热点。随着研究者的不断深入,我们发现,对人体微生物的了解还远远不够,它们能帮助我们做什么,以及我们如何改变它们?  4月29日,美国《科学》杂志以“Microbiota at work”为主题发了一期专刊,从不同的方面介绍了人体微生物与健康的