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北京基因组所发布表观基因组数据库MethBank3.0

中国科学院北京基因组研究所生命与健康大数据中心发布表观基因组数据库MethBank 3.0,并将其成果以MethBank 3.0: a database of DNA methylomes across a variety of species为题,在线发表在Nucleic Acids Research上。 Methbank 3.0整合了大量DNA甲基化数据。作为表观修饰的重要组成部分,DNA甲基化在人类疾病与衰老、动物胚胎发育以及植物生长发育过程都起重要作用。MethBank 3.0提供了4577个健康人外周血样本的450K芯片数据,并编审成34个不同年龄组的参比甲基化组(consensus reference methylomes,CRMs);提供不同年龄组健康人基因组胞嘧啶位点甲基化水平的分布范围,整合5个重要经济作物(水稻、大豆、木薯、菜豆和番茄)不同发育阶段多个组织的336个单碱基精度甲基化组(single-ba......阅读全文

北京基因组所发布表观基因组数据库MethBank 3.0

  中国科学院北京基因组研究所生命与健康大数据中心发布表观基因组数据库MethBank 3.0,并将其成果以MethBank 3.0: a database of DNA methylomes across a variety of species为题,在线发表在Nucleic Acids Rese

北京基因组所开发完成DNA甲基化重编程数据库

  DNA甲基化是一个重要的表观遗传标记,在胚胎早期发育过程中起到至关重要的作用,不同物种所采用的机制亦各不相同。因而,整合多个物种的海量甲基化数据并提供在线的数据浏览、获取及其功能分析,可帮助更多研究人员深入探析不同物种在早期发育时期的DNA甲基化差异,并揭示其DNA甲基化重编程过程与机制。   

北京基因组所生命与健康大数据研究获进展

  与健康大数据研究成果,包括生命组学数据资源建设成果(D14-20)、实时定量PCR内参基因知识库——ICG(Internal Control Genes;D121-126),甲基化数据库Methbank升级版(D288-295)以及基因组序列变异库——GVM(Genome Variation M

北京基因组所开发系列特色科学数据库

  近日,中国科学院北京基因组研究所生命与健康大数据中心(BIG Data Center,BIGD)有七篇数据库文章在国际学术期刊《核酸研究》(Nucleic Acids Research)杂志在线发表,并将于该刊2019年1月出版的数据库专刊中集中刊发。包括表观组关联分析知识库EWAS Atlas

北京基因组所开发系列特色科学数据库

  近日,中国科学院北京基因组研究所生命与健康大数据中心(BIG Data Center,BIGD)有七篇数据库文章在国际学术期刊《核酸研究》(Nucleic Acids Research)杂志在线发表,并将于该刊2019年1月出版的数据库专刊中集中刊发。包括表观组关联分析知识库EWAS Atlas

中国BIGD跻身国际生物组学数据库

  测序技术的发展将生命科学领域带入组学时代,海量的数据产出成为常态。组学是将基因、蛋白及代谢物等生物分子以整体为单位进行系统性的研究,基因组学、蛋白质组学和代谢物组学等相应产生。相较于此前以个体为单位的研究,组学最主要的特征就是大数据。随着组学数据的产出,搭建组学数据库,实现海量信息的存储、整合及

我国建成全球第四个综合基因组权威数据库

  近日,中国科学院北京基因组研究所生命与健康大数据中心团队题为“The BIG Data Center: from deposition to integration to translation”(北京基因组研究所生命与健康大数据中心:从存储到整合、再到转化)的研究论文被国际学术期刊《核酸研究》

北京基因组所生命组学数据资源建设获进展

  近日,中国科学院北京基因组研究所生命与健康大数据中心团队题为The BIG Data Center: from deposition to integration to translation 的研究论文被国际学术期刊《核酸研究》(Nucleic Acids Research)在线发表。该研究成