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艺高人胆大!相当“嚣张”的测序技术——单细胞器测序

线粒体疾病如何诊断和治疗?(运用成熟的单线粒体分离技术在显微镜下挑取单个小鼠线粒体。) 宾夕法尼亚大学医学院James Eberwine领导的研究小组刚开发了一种适用于单个线粒体的分离和测序技术“单线粒体测序(single-mitochondrion sequencing)”利用这种新方法他们检测到了在此之前很难查探到的线粒体DNA(mtDNA)变异。 线粒体功能不正常会导致线粒体疾病,mtDNA突变是很多线粒体疾病的导火线,突变累积到一定程度,这些细胞“发电站”就会瘫痪,局部细胞也跟着“停电”而无法正常运转。 人类细胞包含成千上万个线粒体细胞器,单个线粒体内一般有几套基因组拷贝,每套线粒体基因组包含37个基因,主要编码呼吸链和能量代谢相关蛋白,常见的mtDNA突变或缺失疾病症状包括生长缓慢、发育迟缓、内分泌紊乱、肌无力、脑萎缩等。 患有线粒体疾病的孩子可能很难集中精力,经常感到疲惫或昏昏欲睡,这些到了某一阶段才愈演......阅读全文

发表论文的捷径?线粒体测序论文太多

  David Roy Smith是来自加拿大韦仕敦大学的一位生物学助理教授,近期他在The Scientist杂志上发文,指出目前涌现了太多线粒体基因组测序论文,2014年GenBank中新增的线粒体基因组序列信息多达上千条,这几乎比上一年激增了15%。  Smith指出,很少有人会质疑这些线粒体

昆明植物所利用第二代测序仪测定铁竹线粒体基因组

  同动物的线粒体基因组相比,植物的线粒体基因组有着十分独特的进化方式,如具有较大的基因组、极低的分子进化速率和相对较频繁的基因组结构上的变异等特性。目前,植物线粒体基因组大都通过传统的Sanger法进行测序,需要耗费大量的人力和物力,严重限制了植物线粒体基因组的测序,进而导致对其独特进化方式的研究

法医DNA检测仪器及其发展动向分析

摘    要:实践证明,法医DNA检测技术和相关仪器在犯罪嫌疑人认定、亲权鉴定和系列串并案侦破中发挥了显著作用,是我国公安一线侦察破案和打击犯罪的重要技术手段。以法医DNA检测技术为主线,对相关仪器的产生背景、发展历程、工作原理、各类技术优劣,以及国内外研究现

作物基因组学研究进展

  摘要:农作物基因组学研究的发展,对于有效利用现代分子生物学手段进行物种的遗传改良发挥了重要作用。随着测序技术的发展,已经实现对重要农作物,如水稻、小麦、玉米、大豆、油菜、棉花、蔬菜等作物基因组的测序或重测序,在此基础上完成对控制重要农艺性状基因的克隆和鉴定。本文综述了2017年度主要农作物基因组

一文了解血ngs检测的意义

  NGS 检测:高通量测序技术(High-throughput sequencing)又称“下一代”测bai序技术("Next-generation" sequencing technology),以能一次并行对几十万到几百万条DNA分子进行序列测定和一般读长较短等为标志。  

PacBio构建目前最高质量的植物基因组参考序列

  来自中科院遗传与发育生物学研究所,四川农业大学的研究人员发表了题为“Sequencing and de novo assembly of a near complete indica rice genome”的文章,对一个籼稻基因组蜀恢498(R498)进行PacBio单分子测序,结合遗传图谱和

多篇文章解读线粒体在机体健康中扮演的关键角色

  期以来,我们都知道,线粒体是细胞的能量工厂,近年来,随着科学家们研究的深入,他们渐渐发现,线粒体或许在机体健康的多个方面都扮演着关键角色,本文中,小编就对相关研究成果进行整理,分享给大家!图片来源:daily.jstor.org  【1】Nature:线粒体代谢在T细胞中发挥重要作用  doi:

昆明动物所建立人类线粒体DNA数据综合分析平台

  近年来,随着测序技术的快速发展和成本的降低,越来越多的人类线粒体DNA(mtDNA)基因组序列被测定,公共数据库中相关数据的存储量也显著增加。为了快速有效的分析、存储和利用这些已有数据以及处理新增mtDNA数据,中国科学院昆明动物研究所姚永刚研究员课题组的硕士研究生樊隆搭建了一个人

基因组学推动生命科学大步向前

  2010年下旬,河南安阳曹操墓真伪之辩正酣。而一则来自上海的重磅消息更是引发了多方关注。复旦大学现代人类学教育部重点实验室宣布,向全国征集曹姓男性DNA样本,拟用基因组科学的手段验证出土的头骨是否为曹操本人。   一下子,基因组科学成为热门,这一话题“落入寻常百姓家”。   事实上,伴随着2

Nature突破性研究—RNA甲基化新修饰 m1A

  说起近来的科研热点,RNA甲基化修饰的相关研究可以说是当前整个生命科学领域最热门的方向之一,亮点文章频出,着实让人有些目不暇接。日益增多的发表文章、特别是高分文章说明,这个领域现在正在迅速成为大家关注的焦点。RNA甲基化修饰类型很多,目前最热门的有三种,分别是:m6A RNA甲基化﹑m5C RN

两具4000年前埃及木乃伊亲缘关系获证

  曼彻斯特博物馆的两具4000年前埃及木乃伊。图片来源:EurekAlert!  据美国科学促进会(AAAS)科技新闻共享平台EurekAlert!17日报道,刊发在最新一期《考古学》杂志上的一项研究表明,陈列在曼彻斯特博物馆的两具4000年前埃及木乃伊,被DNA测序技术认定为“确系同母异父的兄弟

下一代测序技术将改变生物学现状

  新一代非基于“桑格技术”的基因测序法以空前的快速测序速度问世了,它为人类带来了重大的科学成果和先进的生物学应用软件。然而,要研发出新一代基因测序法,必须克服30年来以桑格技术为基础的惯性思维。    1977年,Fred Sanger 和Alan R. Coulson发表了两篇关于快速测序技

加拿大团队利用PacBio技术破译“筑坝高手”海狸的基因组

  在建筑学方面,海狸筑坝的高超能力给了人类不少启示。在生物学方面,人类又能从海狸基因组中获得哪些启示呢?近日,加拿大的团队测序并分析了加拿大海狸(Castor canadensis)的基因组。他们在《G3: Genes, Genomes, Genetics》杂志上报道了这项研究的成果。  多伦多大

加拿大团队利用PacBio技术破译“筑坝高手”海狸的基因组

  生物通报道 在建筑学方面,海狸筑坝的高超能力给了人类不少启示。在生物学方面,人类又能从海狸基因组中获得哪些启示呢?近日,加拿大的团队测序并分析了加拿大海狸(Castor canadensis)的基因组。他们在《G3: Genes, Genomes, Genetics》杂志上报道了这项研究的成果。

科学家构建出目前最高质量的植物基因组参考序列

  随着PacBio单分子实时(SMRT)测序技术的发展,利用它已能够独立完成高质量基因组草图的组装。然而,这些草图序列中仍然存在多种错误,比如序列中会包含有很多嵌合体(即不同位置的序列连接到了一起)或是组装质量比较差的区域等,特别是重复序列区域有的没有组装出来,有的组装出来多个序列,而且这些错误通

作物基因组学研究进展(一)

作物基因组学研究进展农作物基因组学研究的发展,对于有效利用现代分子生物学手段进行物种的遗传改良发挥了重要作用。随着测序技术的发展,已经实现对重要农作物,如水稻、小麦、玉米、大豆、油菜、棉花、蔬菜等作物基因组的测序或重测序,在此基础上完成对控制重要农艺性状基因的克隆和鉴定。本文综述了2018年度主要农

科学家在印加儿童木乃伊中检测到罕见基因

  这名男孩在500多年前死亡的时候年仅7岁,他因自己的美貌和健康而被选中,并成为capacocha这种印加仪式上的祭品。在这样的仪式中,孩子们会被例行公事地杀死用来纪念某个重要的场合、预防一场自然灾难、利用皇权并控制当时不断扩张的印加帝国(1438-1533)。1985年,一群登山者在阿根廷门多萨

DNA序列测定的技术和策略

目前应用的两种快速序列测定技术是Sanger等(1977)提出的酶法及Maxam和Gilbert(1977)提出的化学降解法。虽然其原理大相径庭,但这两种方法都是同样生成互相独立的若干组带放射性标记的寡核苷酸,每组寡核苷酸都有固定的起点,但却随机终止于特定的一种或者多种残基上。由于DNA上的每一个碱

盘点:全球十大顶尖基因测序公司

  新一代测序(NGS)的市场规模到底有多大?据BCC Research统计,到2022年NGS市场将达到105亿美元。MarketsandMarkets则更加乐观一些,估计届时将达到124.5亿美元。不过BIS Research的预测较为保守,认为市场增长速度将相对缓慢一些,预计2024年达到11

DNA序列测定技术(Sanger双脱氧链终止法与Maxam-Gilbert...-2

二、Maxam-Gilbert DNA 化学降解法与包括合成反应的链终止技术不同,Maxam-Gilbert法要对原DNA 进行化学降解。这一方法是在体外研究lac阻抑制与lac操纵基因相互作用时酝酿发展起来的。时至今日,可以探测DNA 构象的蛋白质-DNA 相到作用,仍然是Maxam- G

当23andMe弄混了96个样本之后……

  基因检测,从无创产前到肿瘤伴随诊断,从天赋基因到个人全基因组测序,暂且不说这里面各种科学和商业的是是非非,且问一句:你如何确定你拿到的检测报告是你自己的,而不是别人的?  父系祖源信息哪去了?  2010年6月1日,有用户在一家基因检测公司的论坛发帖子“父系祖源信息没了?”,内容是:  XXXX

Science回顾报道:贺建奎如何走上了这条“不归路”

   《Science》通过贺建奎的前公关助手Ryan Ferrell,追踪采访与贺建奎相关的人物,用碎片信息拼出了整个事件的大致轮廓——这位本来做测序公司的生物物理学家如何转向并让首例基因编辑婴儿横空出世?他如何起步、获得经费、与同行进行交流、同行当时的建议是什么、事后又如何评论此事?  2017

中国学者发表Nature Methods综述:表观转录组分析新技术

  12月29日的Nature Methods杂志公布了2016年度技术:Epitranscriptome analysis(表观转录组分析),来自北京大学生命科学学院的伊成器研究员受邀发表了题为“Epitranscriptome sequencing technologies: decoding

Nature突破性研究—RNA甲基化新修饰 m1A

说起近来的科研热点,RNA甲基化修饰的相关研究可以说是当前整个生命科学领域最热门的方向之一,亮点文章频出,着实让人有些目不暇接。日益增多的发表文章、特别是高分文章说明,这个领域现在正在迅速成为大家关注的焦点。RNA甲基化修饰类型很多,目前最热门的有三种,分别是:m6A RNA甲基化﹑m5C RN

检测木乃伊DNA发现 4000前一位埃及总督或被带绿帽

  据外媒Telegragh网站报道,日前英国曼彻斯特大学的研究团队对知名的“木乃伊兄弟”Khnum-nakht和Nakht-ankh进行了DNA测序研究,结果发现他们拥有不同的父亲,这让一个沉睡了4000年的古埃及“豪门”陷入一场家庭丑闻风波。  1907年,由英国考古学家弗林德斯⋅皮特里(Fli

法医DNA检测技术的现状及展望

法医DNA检测技术的现状及展望庞晓东 陈学亮 荣海博 俞丽娟 管桦 张涛公安部第一研究所DNA检测技术的应用,为法医学带来了一场技术革命。通过对遗传物质DNA的序列多态性及长度多态性的检验,即可实现个体识别及亲权鉴定,该技术正在成为当前法医物证鉴定最

癌细胞线粒体DNA漂移的分子机理

  通过对57例结肠癌患者的基因组进行基因分析,研究人员发现患者体细胞核内的平均线粒体DNA数量比健康人高4.42倍。“这表明,迁移到核基因组中的线粒体DNA可能对癌症的发展起重要作用,”本文的共同作者,来自UAB公共卫生学院的生物统计学教授Hemant K. Tiwari博士和UAB医学院遗传学教

PNAS论文提出葫芦起源新假说

  报道:葫芦(Lagenaria siceraria)是第一批驯化的植物之一,也是在前哥伦布时期唯一一种具有全球分布的植物。虽然葫芦原产于非洲,但早在11,000年前的东亚和 10,000年前的美洲,人们就已经常使用它。尽管葫芦对不同人群具有很大的重要性,但它为何具有如此广泛的分布,仍然悬

推翻教科书!线粒体DNA可通过父系遗传

  对于大多数哺乳动物来说,线粒体和线粒体DNA都是只通过母系遗传。尽管其他生物偶尔会经历父系遗传,但之前关于人类父系遗传线粒体的报道大多是因为污染或样本混淆。  然而,美国辛辛那提儿童医院的黄涛生博士和梅奥诊所的Paldeep Atwal博士本周在《美国科学院院刊》(PNAS)上发表论文,称他们在

Cell Res重点论文:单细胞表观多组学测序技术最新突破

  2017年6月16日,北京大学生命科学学院生物动态光学成像中心汤富酬课题组在《Cell Research》杂志在线发表了题为“Single-cell multi-omics sequencing of mouse early embryos and embryonic stem cells”的研