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2018年新技术:追踪细胞血统

秀丽隐杆线虫(Caenorhabditis elegans)是著名的模式动物,以其细胞家族树而闻名,通过一系列的细胞分裂产生各种成体细胞类型。在二十世纪七十年代中期,科学家们付出了巨大的努力,在无数个小时的基本显微镜探索中记录了这棵细胞树,这是一个传奇。 近几十年来,体内标记和追踪细胞的方法已经得到长足的发展,但近期的一系列新方法延伸了谱系研究的范围——新工具能获得非常多样的细胞标记,并以高分辨率解析它们。 谱系信息对于理解诸如器官发生,细胞命运选择,细胞迁移和肿瘤演化等现象非常重要。目前已经有许多方法可以用于追踪细胞,染料或在细胞,细胞群中引入遗传标记,然后在其后代鉴定谱系关系。其次,还有一组方法追踪更多的祖细胞,例如,稀疏重组(sparse recombination)可以通过荧光报告分子的不同组合来标记独特颜色,从而标记细胞。还有利用编码高多样性DNA条形码的病毒文库转染细胞,再对后代进行测序分析。 新一代的工具......阅读全文

Cell:CRISPR解答细胞代谢谜题

  众所周知,线粒体是我们细胞中的发电厂,它利用呼吸作用来释放我们食物中的能量,捕获三磷酸腺苷(ATP)分子中的能量。  在发表于7月30日《细胞》(Cell)杂志上的两篇研究论文中,来自麻省理工学院的研究人员揭示出了增殖细胞,包括肿瘤细胞需要线粒体呼吸作用的原因。尽管有许多其他的途经可以生成ATP

CRISPR让肿瘤细胞自我抑制

  近日,一项新研究发现,CRISPR-Cas9基因组编辑系统能将一个促进小鼠肿瘤生长的细胞信号转变为缩小肿瘤的信号。相关论文9月5日在线发表于《自然—方法》期刊。  真核细胞(包括植物和动物细胞)的存活和凋亡由它们收到的调控其基因表达的信号决定。在这一实验中,深圳大学第一附属医院刘宇辰及同事使用了

NatureMethods发布CRISPR新技术:CRISPR-X

斯坦福大学遗传学系,药理学系的几位学者合作,开发出了一种为原位蛋白质工程重利用体细胞超突变的新技术――  CRISPR-X ,这将能帮助科学家们创建复杂的原始遗传突变文库,分析完善蛋白质工程。这一研究成果在线公布在10月31日的Nature Methods杂志上,文章的通讯作者是斯坦福大学Micha

CRISPR的前世今生:酸奶中的CRISPR

  两年前,一个缩写为CRISPR(clustered regularly interspaced short palindromic repeats,规律间隔成簇短回文重复序列)的基因编辑工具横空出世,席卷了许多实验室。而在这一系统被开发的数亿年前,细菌和古细菌就利用其非常精确的对几乎每个基因组中

CRISPR女王:她的生命被CRISPR照亮

  一位多年来埋头于实验室枯燥生活的微生物学家,突然有一天由于基因编辑技术站在了聚光灯下   现年48岁的Emmanuelle Charpentier在过去二十年学术生涯中辗转去过了5个国家九所不同的研究院,“我总是不得不从零开始,亲自构建新的实验室,”她说。45岁之前Charpentier还无法雇

CRISPR专家发表CRISPR/Cas9综述

  CRISPR技术的确在科学界掀起了基因组编辑的狂潮。在Pubmed中快速检索“CRISPR”,目前已有1400多项结果。也相继有专家为该技术撰写了综述论文,例如:Science综述:CRISPR-Cas9系统的历史和未来;北大魏文胜最新发表CRISPR综述。  最近,来自美国加州大学伯克利分校和

CRISPR的前世今生:酸奶中的CRISPR

  两年前,一个缩写为CRISPR(clustered regularly interspaced short palindromic repeats,规律间隔成簇短回文重复序列)的基因编辑工具横空出世,席卷了许多实验室。而在这一系统被开发的数亿年前,细菌和古细菌就利用其非常精确的对几乎每个基因组中

PNAS:CRISPR协助细胞对抗HIV

  宿主细胞在面对病毒感染的时候,会表达一系列对抗病毒的蛋白,这些蛋白被称为宿主限制因子。哺乳动物细胞编码的限制因子,可以限制HIV-1和其他病毒的复制。不过,被病毒感染的细胞往往不表达这样的限制因子。人们普遍认为,诱导宿主限制因子的表达是抑制病毒复制的一个潜在途径。   杜克大学的Bryan

PNAS:CRISPR协助细胞对抗HIV

  宿主细胞在面对病毒感染的时候,会表达一系列对抗病毒的蛋白,这些蛋白被称为宿主限制因子。哺乳动物细胞编码的限制因子,可以限制HIV-1和其他病毒的复制。不过,被病毒感染的细胞往往不表达这样的限制因子。人们普遍认为,诱导宿主限制因子的表达是抑制病毒复制的一个潜在途径。  杜克大学的Bryan R.

Nature Methods发布CRISPR新技术:CRISPR-X

  斯坦福大学遗传学系,药理学系的几位学者合作,开发出了一种为原位蛋白质工程重利用体细胞超突变的新技术—— CRISPR-X ,这将能帮助科学家们创建复杂的原始遗传突变文库,分析完善蛋白质工程。  这一研究成果在线公布在10月31日的Nature Methods杂志上,文章的通讯作者是斯坦福大学Mi