Cell:利用新方法绘制蛋白与代谢物之间的相互作用组

在一项新的研究中,来自瑞士苏黎世联邦理工学院的研究人员利用一种新的方法来发现细菌细胞中的蛋白和小的代谢分子之间之前未知的相互作用。该技术也能够被用来测试药物的效果。相关研究结果发表在2018年1月11日的Cell期刊上,论文标题为“A Map of Protein-Metabolite Interactions Reveals Principles of Chemical Communication”。图片来自Ilaria Piazza / ETH Zurich / PDB database entry 4MQT 科学家们如今有一种新的“组学(omics)”---相互作用组学(interactomics),涉及处理蛋白与小分子之间的相互作用。之前专注于研究基因组学或蛋白质组学,如今系统生物学能够将蛋白-代谢物相互作用增加到其中。基因组学涉及系统性分析有机体中的所有基因,而蛋白质组学涉及处理一个生物学单元中的完整的一套蛋白。......阅读全文

与转录组学和蛋白组学比较,代谢组学有何优点

那年夏天Forever与转录组学和蛋白组学比较,代谢组学有以下优点:①代谢组学放大了基因和蛋白表达的微小变化,从而使检测更容易;②代谢组学的研究不需建立全基因组测序及大量表达序列 标签(EST)的数据库,且代谢产物的种类要远小于基因和蛋白的数目.③ 由于给定的代谢产物在每个组织中都是一样的,所以研究

代谢组学研究对象及定量代谢组学介绍

什么是代谢组学?代谢组学是用来解决什么问题的?       代谢组学(Metabonomics/Metabolomics)是20世纪90年代末期发展起来的一门新兴学科,是研究关于生物体被扰动后(如基因的改变或环境变化后)其代谢产物(内源性代谢物质)种类、数量及其变化规律的科学。代谢组学着重研究的是生

代谢组学研究对象及定量代谢组学介绍

  什么是代谢组学?代谢组学是用来解决什么问题的?   代谢组学(Metabonomics/Metabolomics)是20世纪90年代末期发展起来的一门新兴学科,是研究关于生物体被扰动后(如基因的改变或环境变化后)其代谢产物(内源性代谢物质)种类、数量及其变化规律的科学。代谢组学着重研究的是生

代谢组学研究对象及定量代谢组学介绍

  什么是代谢组学?代谢组学是用来解决什么问题的?   代谢组学(Metabonomics/Metabolomics)是20世纪90年代末期发展起来的一门新兴学科,是研究关于生物体被扰动后(如基因的改变或环境变化后)其代谢产物(内源性代谢物质)种类、数量及其变化规律的科学。代谢组学着重研究的是生

代谢组学研究对象及定量代谢组学介绍

  什么是代谢组学?代谢组学是用来解决什么问题的?   代谢组学(Metabonomics/Metabolomics)是20世纪90年代末期发展起来的一门新兴学科,是研究关于生物体被扰动后(如基因的改变或环境变化后)其代谢产物(内源性代谢物质)种类、数量及其变化规律的科学。代谢组学着重研究的是生

Cell提出一个新“组学”:蛋白质代谢小分子互动组学

  科学家们提出了一个新的“组学”——一个处理蛋白质和小分子之间相互作用的互动组学(protein-metabolite interactomics)。此前系统生物学家专注于基因组学或蛋白质组学,现在他们日益发现了蛋白质-代谢小分子之间相互作用的重要性。  基因组学针对的是生物体基因的系统分析,而蛋

代谢组学的研究方法

代谢组学的研究方法与蛋白质组学的方法类似,通常有两种方法。一种方法称作代谢物指纹分析 (metabolomic fingerprinting),采用液相色谱-质谱联用(LC-MS)的方法,比较不同血样中各自的代谢产物以确定其中所有的代谢产物。从本质上来说,代谢指纹分析涉及比较不同个体中代谢产物的质谱

代谢组学新工具:METLIN

  METLIN是由美国Scripps研究院Gary J Patti和Gary Siuzdak开发出的新型数据库,将能用于解决代谢组学等领域研究中关于数据处理这个大问题。   超过上万个代谢物   目前METLIN包括有超过10,000个代谢产物中带有详细,高分辨率串联质谱信息的六万化合物,

代谢组学的研究方法

代谢组学的研究方法与蛋白质组学的方法类似,通常有两种方法。一种方法称作代谢物指纹分析 (metabolomic fingerprinting),采用液相色谱-质谱联用(LC-MS)的方法,比较不同血样中各自的代谢产物以确定其中所有的代谢产物。从本质上来说,代谢指纹分析涉及比较不同个体中代谢产物的质谱

大熊猫乳汁蛋白质组学和代谢组学国际合作获进展

   国家国际科技合作专项项目“大熊猫乳蛋白的分析及人工乳的研制”承担单位成都大熊猫繁育研究基地联合英国格拉斯哥大学首次对大熊猫乳汁展开了蛋白质组学和代谢组学研究,取得了阶段性进展。双方研究人员通过非麻醉的方式采集驯化后的大熊猫母乳,连续采集至幼仔出生后180天,并对乳汁进行了蛋白组学和代谢组学的研

第一届全国代谢组学及蛋白质组学双星峰会

  继测序之后,基于质谱技术的代谢组学及蛋白组学于生命科学研究领域发展迅速。应用质谱技术从分子层面对生命体进行动态、精准的检测,可以了解生命体内代谢与蛋白整体水平的变化,为基础科学研究提供新方向。   为了贯彻 “两城一中心”的战略,江北新区继基因测序平台后,又重磅打造了质谱检测平台,旨在服务生命

GCMS-HRAM-代谢组学数据库-探索代谢组学的奥秘

  盐城4公分厚外墙岩棉板报价    岩棉制品是以精选的优质玄武岩为主要原料、经冲天炉熔化后,采用的四辊离心制棉工序,将玄武岩高温熔体甩扭成4-7μm的非连续性纤维,再在岩棉纤维中加入一定量的粘结剂、防尘油、憎水剂,经过沉降、固化、切割等工艺,根据不同用途制成棉毡、半硬板、保温带、管壳等系列产品。

非靶向代谢组学更适宜选用哪些代谢组学通路数据库?

据相关介绍表明非靶向代谢组学的研究成果为众多的药物靶学、疾病机理研究以及疾病诊断提供有力依据。它还推动了免疫组化以及免疫荧光等技术的发展,事实上长期供应非靶向代谢组学更是由此迅速推进了研究步伐,现在就非靶向代谢组学更适宜选用哪些代谢组学通路数据库作简要阐述:1.HMDB非靶向代谢组学的代谢通路必须借

非靶向代谢组学与靶向代谢组学的区别主要表现在哪些...

非靶向代谢组学与靶向代谢组学的区别主要表现在哪些方面?非靶向代谢组学已实现了对众多生物体系代谢物进行定性和相对定量分析,其结果的分析为各类医学研究以及药物开发提供重要参考数据。特别是那些比较好的非靶向代谢组学更是致力挖掘基因与细胞间更深层的关系,现在就非靶向代谢组学与靶向代谢组学的区别主要表现在哪些

安捷伦举办芯片液相色谱及蛋白质组学/代谢组学用户交流会

  疾病蛋白质组学重庆市市级重点实验室第二届学术委员会研讨会   暨安捷伦第一届芯片液相色谱及蛋白质组学/代谢组学用户交流会成功举办   2007年秋,为了开发建立一套全新理念的,与临床研究紧密联结的整体化蛋白质组学研究平台,以实现科研及早期临床诊断、新药开发及个体化医疗的需求,安捷伦科技和西南

长寿的代谢特征代谢组学研究的启示

  长生不老是人类自古以来的夙愿。  中国古代神话故事中,有菩提老祖的大品天仙诀,王母娘娘盛会上的蟠桃,太上老祖炼丹炉里的不老丹,还有妖怪们梦寐以求的唐僧肉都可以实现长生不老。在史学瀚海中,《史记》记载秦始皇东巡碣石,携童男童女入海求仙,寻求长生不老药;在现代科学中,衰老仍然是生物医学领域热门主题之

做好代谢组学研究的关键

首先明确代谢组学的核心任务。对小分子代谢物的定性、定量分析并发现差异代谢物:(1)对生物体系中的内源性代谢物及其变化规律进行表征;(2)以差异代谢物作为核心对生命奥秘进行解析。而基于色谱/质谱联用的分离分析技术具有灵敏度高、选择性好、动态范围宽、信息丰富等优点,已成为代谢组学研究的主流技术平台。其次

代谢组学:未来新方向

   加拿大阿伯特大学生命科学与计算科学教授David Wishart说,我们自身其实就是一大组生化反应,“因此,基因组和蛋白质组不断进化来支持代谢组,而不是相反的路径。” Wishart说,有别于其他组学方法,代谢组学提供了一种更加直接的生理状态检测方式。代谢组反应营养、胁迫或者疾病状态的速度比转

“代谢组学”技术与方法研究

【基于质谱的分析方法联用对”代谢组学”进行研究】 代谢组学”研究可分为:“发现代谢组学”和“靶标代谢组学”,两者共同组成了“代谢组学”研究的“生态系统”。本文将介绍基于质谱的分析方法联合统计学分析法对“代谢组学”进行研究。质谱能在一个广泛的动态范围内保持极高的检测灵敏度、高度的稳定性、重现

代谢组学——肿瘤研究的利器

  细胞内许多生命活动是发生在代谢物层面的,代谢物更多地反映了细胞所处的环境,比如细胞现在是不是健康?药物是否起效?环境污染物是不是正在伤害细胞?等等。由此,20世纪90年代,衍生出了一门新学科:代谢组学。它回答了基因组学和蛋白质组学不能回答的问题:细胞到底发生了什么?  1、肿瘤与代谢组学  肿瘤

如何看待代谢组学的前景

是不错的,但是代谢组本身还是一个发展中的新型学科,一些关键性技术还有待突破,如果你只想使用代谢组学而不去深入的研究它的话就应该没问题,如果想要进一步研究代谢组学方法就需要有相当的分析化学知识。现在世界前十的药厂都在使用代谢组学进行药学研究,所以它在里面的前景肯定是不会差的。随着技术的发展肯定会越来越

如何看待代谢组学的前景

是不错的,但是代谢组本身还是一个发展中的新型学科,一些关键性技术还有待突破,如果你只想使用代谢组学而不去深入的研究它的话就应该没问题,如果想要进一步研究代谢组学方法就需要有相当的分析化学知识。现在世界前十的药厂都在使用代谢组学进行药学研究,所以它在里面的前景肯定是不会差的。随着技术的发展肯定会越来越

“代谢组学”技术与方法研究

【基于质谱的分析方法联用对”代谢组学”进行研究】 代谢组学”研究可分为:“发现代谢组学”和“靶标代谢组学”,两者共同组成了“代谢组学”研究的“生态系统”。本文将介绍基于质谱的分析方法联合统计学分析法对“代谢组学”进行研究。质谱能在一个广泛的动态范围内保持极高的检测灵敏度、高度

进入前景光明的代谢组学

内容概要: 一、代谢组学在药物研发中的应用 二、SiDMAP技术在疾病诊断中的应用 三、仪器公司的研究开发:ThermoFisher Scientific公司和Advion Biosciences公司正在研发分析代谢物的更为灵敏的检测方法,而Bio-Rad公司正在发展用Holly Grail作

中药基础物质、代谢及代谢组学研究方案

  中药组成成分复杂、作用环节多样,中药药效物质基础以及临床疗效机理的阐明,已成为中医药现代化研究的重要内容。如何快速地从海量的质谱数据中获取有价值的信息,减轻繁重的数据处理工作量,成为广大中医药研究工作者的心声。  赛默飞的Compound Discoverer软件针对中药成分鉴定、体内代谢转化和

代谢组学-|-肿瘤治疗之靶向葡萄糖代谢

  能量代谢重编程是肿瘤的十大特征之一,其中葡萄糖代谢异常是肿瘤代谢最突出的特征。在氧气充足的情况下,肿瘤细胞依然倾向于进行糖酵解,将葡萄糖代谢为乳酸。肿瘤细胞有氧糖酵解能力是正常细胞的20 ~ 30倍,为肿瘤代谢提供 大量能量和中间产物。因此,靶向糖酵解等异常环节的代谢酶是抗肿瘤治疗的重点。一些研

代谢组学、脂质组学在病毒研究中的应用(一)

在疫情逐步可控的情形下,一线的医务工作者和科研人员将有更多精力和时间对冠状病毒进行更深一步的研究和认识。我们此次调研了基于Orbitrap超高分辨的代谢组学,脂质组学,以及药物治疗在病毒学研究中的应用。致敬白衣天使和深耕医学研究的学者。 目前的研究显示,新型病毒进入细胞的路径与SARS冠状病毒一样,

代谢组学、脂质组学在病毒研究中的应用(二)

案例三基于代谢组学技术挖掘病毒感染宿主后代谢动态变化情况2019年发表在Viruses杂志上的另一篇文章,采用基于Orbitrap 的非靶标和靶标代谢组学方式研究了麻痹病毒(Cricket paralysis virus, CrPV)感染昆虫Bm5细胞后宿主代谢的动态变化情况。研究人员发现,CrPV

实质等同性(代谢组学)实验

实验材料:SIMCA - P 多变量统计软件    试剂、试剂盒:[ 1H ] - NMR 抽提剂      仪器、耗材:Eppendorf 聚丙稀管                                                                  NMR 管