新型基因编辑技术或能制造出完美的“双胞胎”多能干细胞
日前,一项刊登在国际杂志Nature Communications上的研究报告中,来自日本京都大学等处的研究人员通过研究开发了一种新型的基因编辑方法,其能够以较高的准确度修饰人类基因组中单个DNA碱基,这种新方法的特殊之处在于其能够指导细胞自身的修复机制,从而就能为研究疾病相关的突变提供一对基因匹配的细胞。图片来源: Kyoto University / Knut Woltjen DNA的单突变俗称为单核苷酸多态性(SNPs),其是人类基因组中最常见的突变,如今研究人员已经知道有超过1000万个SNPs,很多SNPs都与多种人类疾病直接相关,比如阿尔兹海默病、心脏病和糖尿病等,为了理解SNPs在遗传性疾病中的关键角色,本文中,研究人员从捐赠者机体中开发出了诱导多能干细胞(ips)。 iPS细胞能够维持供体的遗传组成,同时其还能转化成为机体中的任何细胞类型,以这种方式,研究人员就能在实验室中开发出大脑、心脏或胰腺等组织的细......阅读全文
动物细胞基因组DNA SNP的生物芯片检测-1
实验原理:1、SNP的概念及意义单核苷酸多态性(single nucleotide polymorphism,SNP),主要是指在基因组水平上由单个核苷酸的变异所引起的DNA序列多态性。它是人类可遗传的变异中最常见的一种。占所有已知多态性的90%以上。SNP在群体中的发生频率不小于1%。SNP在
动物细胞基因组DNA SNP的生物芯片检测-3
3.3、寡核苷酸DNA微阵列芯片检测SNP技术:寡核苷酸芯片检测基因突变技术是基因芯片技术的一种。该技术用于检测基因突变的基本原理是在玻璃、硅等载体上,根据检测需要,设计、固定多个特异的寡核苷酸探针。而后将大量经扩增、体外转录等技术掺入荧光标记分子的待测DNA样品与之杂交,若两者存在至少一个碱基的差
动物细胞基因组DNA SNP的生物芯片检测-2
DNA (500 ng) is digested with Nsp I and Sty I restriction enzymes and ligated to adaptors that recognize the cohesive 4 bp overhangs. All fragment
SNP检测技术(测序、taqman探针和snp芯片)
snp现有检测技术有主要的3大类别1、测序 主要发现新的snp位点和比较集中的snp位点,如hla区域,但成本较高,工作量大,不适合大样本做疾病关联分析。 2、taqman探针 结果比较可靠,国外文章也大量应用,不过对于国内成本偏高,同类还有snpshot技术,abi和贝克曼
SNP命名规则
一般写法是这样: dbSNP后面跟featureID. featureID一般是rs/ss后跟7-8位数字, 比如:rs12345678或者dbSNP|rs12345678以下是老鼠(Mus muculas)的1号染色体上SNP列表格式(部分):---------------------------
qPCR Protocol for SNP Genotyping
实验概要Platinum® qPCR SuperMix for SNP Genotyping is a ready-to-use reaction mix for the amplification and identification of single-nucleotide polymorp
SNP检测技术对比
1. SNP检测方法分类1.1. 根据检测原理分类根据检测原理进行分类,目前来说,基于杂交原理的检测方法应用更为广泛。1.2. 根据检测通量分类根据检测通量进行分类,可以分为高通量、中通量和低通量方法。目前中通量方法和高通量总的基因芯片法(包括beadschip)应用更为广泛。除此之外,基于Ta
SNP 的检测方法
SNP 的分型技术可分为两个时代,一为凝胶时代,二为高通量时代。凝胶时代的主要技术和方法包括限制性酶切片段长度多态性分析(RFLP)、寡核苷酸连接分析(OLA)、等位基因特异聚合酶链反应分析(AS2PCR)、单链构象多态性分析(SSCP)、变性梯度凝胶电泳分析(DGGE),虽然这些技术与高通量时代的
SNP基因分型(SNP genotyping)的几个常用数据库
做SNP genotyping应该常看的几个database:1. NCBI dbSNP从这里出发可以连到下面几个网站。http://www.ncbi.nlm.nih.gov/entrez/query.fcgi?db=snp2. International HapMap ProjectThe Int
SNP检测——HRM技术应用
HRM技术服务之SNP检测(snp检测的最佳方案) 单核苷酸多态性(Single Nucleotide Polymorphisms,SNPs),指单个核苷酸碱基的改变,包括置换、颠换、缺失和插入,导致的核酸序列的多态性。在不同个体的同一条染色体或同一位点的核苷酸序列中,绝大多数核苷酸序列一
SNP的检测知识
SNP的检测知识:人类基因组中存在着广泛的多态性,最简单的多态形式是发生在基因组中的单个核苷酸的替代,即单核苷酸多态性(single nucleotide polymorphisms, SNPs)。SNP通常是一种二等位基因的(biallelic),即二态的遗传变异,SNP的数量大、分布广,在组成人
SNP检测——HRM技术应用
单核苷酸多态性(Single Nucleotide Polymorphisms,SNPs),指单个核苷酸碱基的改变,包括置换、颠换、缺失和插入,导致的核酸序列的多态性。在不同个体的同一条染色体或同一位点的核苷酸序列中,绝大多数核苷酸序列一致而只有一个碱基不同的现象,这就是SNP。SNP在人类
SNP检测方法、前景和问题
SNP 是指基因组水平上由单个核苷酸的变异所引起的DNA 序列多态性,在群体中的发生频率不小于1 %。包括单个碱基的转换、颠换、插入和缺失等。所谓转换是指同型碱基之间的转换,如嘌呤与嘌呤( G2A) 、嘧啶与嘧啶( T2C) 间的替换;所谓颠换是指发生在嘌呤与嘧啶(A2T、A2C、C2G、G
SNP位点的选择原则
1,如果是检测基因的所有已知的SNP,那么首先要去了解并查询到这些SNP位点,SNP位点可以通过查询dbSNP数据库(http://www.ncbi.nlm.nih.gov/SNP/)和TSC(The SNP Consortium)数据库(http://snp.cshl.org/),可以获知基因及上
基因芯片与SNP分析
基因芯片技术作为一种新兴的生物技术,近年来得到迅速发展,其应用具有巨大的潜力。单核苷酸多态性(SNP)作为新的遗传标记对基因定位及相关疾病研究的意义亦非常重大。本文主要介绍了DNA 芯片技术的原理和分类、单核苷酸多态性检测方法及DNA 芯片技术在单核苷酸多态性检测方面的应用。生物芯片技术是90
查找SNP信息的方法介绍
SNP命名方法有以下几种:1、GenBank官方的refSNP ID单核苷酸多态性命名法 GenBank官方的refSNP ID单核苷酸多态性命名法是相对比较完善的命名体系,命名方法是rs+7位阿拉伯数字。如果已知一个SNP的refSNP ID,那么就可以在GenBank的SNP数据库中搜索
查找SNP信息的方法介绍
1、GenBank官方的refSNP ID单核苷酸多态性命名法 GenBank官方的refSNP ID单核苷酸多态性命名法是相对比较完善的命名体系,命名方法是rs+7位阿拉伯数字。如果已知一个SNP的refSNP ID,那么就可以在GenBank的SNP数据库中搜索到相关的信息和在基因
我国学者揭示SNP参与调控B细胞命运决定的新机制
在国家自然科学基金项目(项目编号:81730043、81621002、31530020)等资助下,清华大学生命学院和免疫学研究所刘万里课题组同北京大学人民医院风湿免疫科栗占国教授合作研究,首次报道人类膜联免疫球蛋白IgG1重链胞内区存在增加系统性红斑狼疮(SLE)易感性的单核苷酸多态性位点(SN
Authentication of Medicinal Plants by SNP-Based Multiplex PCR
Highly variable intergenic spacer and intron regions from nuclear and cytoplasmic DNA have been used for species identification. Noncoding internal
PYRO测序用于SNP基因分型原理
其实是一种段片段焦磷酸测序技术,在测序引物的引导下,完成段片段(含snp)的测序,从而实现基因分型。缺点:不能检测长片段,对于重复序列没有办法。原理简介1.测序引物与单链,PCR扩增的DNA模板相结合。然后将其与DNA聚合酶、ATP硫酸化酶、荧光素酶和三磷酸腺苷双磷酸酶,以及底物APS和荧光素一起孵
细胞化学词汇--折回DNA
中文名称:折回DNA英文名称:fold-back DNA定 义:(1)通过变性DNA的链内重联而复性的反向重复序列。(2)DNA分子的一种构象,指分子中的两个紧邻区域因含有反向重复序列以氢键相系形成的构象。应用学科:生物化学与分子生物学(一级学科),核酸与基因(二级学科)
细胞化学词汇--弯形DNA
中文名称:弯形DNA英文名称:curved DNA定 义:由于某些内在的或诱导的原因造成DNA分子局部变形,形成突环状而使在序列上相距较远部分在空间上彼此紧邻。通常发生在启动子区域,可以极大地增强DNA与蛋白质之间的相互作用,有利于增强转录起始复合体的亲和性,在许多基因的转录起始中发挥作用。应用学
细胞化学词汇--DNA重组
中文名称:DNA重组外文名称:DNA recombination类 型:同源重组、位点重组和转座重组作 用:是基因工程中的关键步骤本 质:两个不同姐妹染色体间遗传物质的交换应 用:疫苗开发等
细胞化学词汇--DNA杂交
中文名称:DNA杂交基 础:具有互补碱基序列的DNA分子意 义:定物种之间亲缘关系的远近相关理论:同位素被检出的灵敏度高
细胞化学词汇--DNA配对
中文名称:DNA配对英文名称:DNA pairing定 义:一种由寡脱氧核苷酸单链与靶DNA的互补链杂交形成异源双链DNA的过程。应用学科:生物化学与分子生物学(一级学科),核酸与基因(二级学科)
细胞化学词汇--DNA修复
中文名称:DNA修复外文名称:DNA repairing解 释:细胞对DNA受损伤后的一种反应作 用:使DNA结构恢复原样DNA修复(DNA repairing)是细胞对DNA受损伤后的一种反应,这种反应可能使DNA结构恢复原样,重新能执行它原来的功能;但有时并非能完全消除D
细胞化学词汇--DNA错配
DNA错配是指DNA双链核酸分子中存在的非互补性碱基配对的现象,即一条链上的碱基与另一条链上相应的碱基不是互补的。DNA双螺旋结构中碱基之间的配对不是随意的,总是 腺嘌呤(A)与胸腺嘧啶(T)配对,鸟嘌呤(G)与胞嘧啶(C)配对的原则。若出 现了 A与C或G配对,或T与G或C配对,也称为碱基错配。
细胞化学词汇--DNA环
中文名称:DNA环英文名称:DNA loop定 义:蛋白质因子和蛋白质或DNA间的相互作用而形成的DNA分子弯曲成环的结构。这种结构被广泛地用于解释蛋白质-蛋白质、DNA-蛋白质的相互作用。应用学科:生物化学与分子生物学(一级学科),核酸与基因(二级学科)
细胞化学词汇--过客DNA
中文名称:过客DNA英文名称:passenger DNA定 义:重组在克隆载体中的外源DNA序列。应用学科:遗传学(一级学科),分子遗传学(二级学科)
细胞化学词汇--卫星DNA
卫星DNA(satelliteDNA)是一类高度重复序列DNA。在介质氯化铯中作密度梯度离心(离心速度可以高达每分钟几万转)时,DNA分子将按其大小分布在离心管内不同密度的氯化铯介质中,小的分子处于上层,大的分子处于下层。从离心管外看,不同层面的DNA形成了不同的条带。根据荧光强度的分析,可以看到在