蛋白质的分组重量编码及在结构型预测的应用
摘要: 从氨基酸的物化特性出发, 利用物理学中“粗粒化”思想, 提出了一种蛋白质序列的分组重量编码方法( Encoding Based onGrouped Weight, 简记为EBGW) , 并结合组分耦联算法进行结构型预测的研究。对标准集T359 中359 个蛋白质的Resubstitution检验和Jack- knife 检验预测准确性分别达到99.72%和91.09%, 其中Jack- knife 检验总体预测精度比相同条件下采用氨基酸组成编码的方法提高了约7%, 特别是!+" 类的预测精度提高了15%。实验结果表明蛋白质序列的EBGW编码方法能够有效地提取字母序列中蕴含的结构信息。 点击这里进入下载页面：进入下载页面......阅读全文
回文序列的特征与功能
特征有对称中心。例如，DNA序列ACCTAGGT之所以是回文序列，是因为它的互补序列是TGGATCCA，而反向互补序列是ACCTAGGT，和其原来序列一致。功能1）是限制性内切酶的识别位点；2）具有调节基因的表达作用，如色氨酸操纵子的前的弱化子；3）转录终止时的识别结构；4）基因工程的"手术刀"。
回文序列的特征与功能
特征有对称中心。例如，DNA序列ACCTAGGT之所以是回文序列，是因为它的互补序列是TGGATCCA，而反向互补序列是ACCTAGGT，和其原来序列一致。功能1）是限制性内切酶的识别位点；2）具有调节基因的表达作用，如色氨酸操纵子的前的弱化子；3）转录终止时的识别结构；4）基因工程的"手术刀"。
酿酒酵母的序列特征的简介
遗传信息分布在16个染色体中。其中有大约1/3的编码基因被认为是“孤儿”基因，也就是说，这些基因没有已知功能，这是因为这些基因的转录产物与酿酒酵母成其他生物所赋子功能的基因缺乏重要的同源性。这一数据仍在不断的体改中。 此染色体是由高、低G-C含量DNA结构域交替组成的，这和基因密度在染色体中的
核酸和蛋白质序列分析-1
在获得一个基因序列后，需要对其进行生物信息学分析，从中尽量发掘信息，从而指导进一步的实验研究。通过染色体定位分析、内含子／外显子分析、ORF分析、表达谱分析等，能够阐明基因的基本信息。通过启动子预测、CpG岛分析和转录因子分析等，识别调控区的顺式作用元件，可以为基因的调控研究提供基础。通过蛋白质基本
蛋白质序列分析和结构预测
【实验目的】 1、掌握蛋白质序列检索的操作方法； 2、熟悉蛋白质基本性质分析； 3、熟悉基于序列同源性分析的蛋白质功能预测，了解基于motif、结构位点、结构功能域数据库的蛋白质功能预测； 4、了解蛋白质结构预测。【实验内容】 1、使用Entrez或SRS信息查询系统检索人脂联素（ad
核酸和蛋白质序列分析-2
（2）输出：除了以文本形式外，还可以通过JalView显示和编辑结果。此外，还可以另外使用GeneDoc（常见于文献）及DNAStar软件等显示结果。多序列比对的结果还用于进一步绘制进化树。3、ORF(Open Reading Frame)分析从核酸序列翻译得到蛋白质序列，需要进行ORF分析，每个生
蛋白质序列分析和结构预测
【实验目的】1、掌握蛋白质序列检索的操作方法；2、熟悉蛋白质基本性质分析；3、熟悉基于序列同源性分析的蛋白质功能预测，了解基于motif、 结构位点、结构功能域数据库的蛋白质功能预测；4、了解蛋白质结构预测。【实验内容】1、使用Entrez或SRS信息查询系统检索人脂联素 (adiponectin)
关于回文序列的特征与功能的介绍
一、特征 有对称中心。例如，DNA序列ACCTAGGT之所以是回文序列，是因为它的互补序列是TGGATCCA，而反向互补序列是ACCTAGGT，和其原来序列一致。 二、功能 1）是限制性内切酶的识别位点； 2）具有调节基因的表达作用，如色氨酸操纵子的前的弱化子； 3）转录终止时的识别结
前导序列
中文名前导序列外文名leader sequence前导序列是结构基因中编码区之前的一段序列，这部分序列能被转录，但不被翻译，在mRNA是从5′端起至结构基因第一编码子开始点（通常 AUG）为止，在蛋白质合成过程中不被翻译。
蛋白质序列分析和结构预测实验
实验步骤 1. 人脂联素蛋白质序列的检索（1）调用Internet浏览器并在其地址栏输入Entrez网址（http://www.ncbi.nlm.nih.gov/Entrez）；（2）在Search后的选择栏中选择protein；（3）在输入栏输入homo sapiens adiponectin；