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缺乏数据使用指导原则,基因组数据共享遇阻

基因组数据共享将生物医学研究推向快车道,但向公共领域发布的现有数据指南一方面承认免费和无条件使用数据的重要性,另一方面还未能解决这种重要性与数据生产者首次发布数据的“权利”之间的关系。 在美国能源部联合基因组研究所负责人Nikos Kyrpides看来,这种自相矛盾导致了数据生产者和数据使用者对公共数据的使用有着不同的解释和持续的争论。 “根源在于缺乏数据使用的明确指导原则。”在接受《中国科学报》采访时,Kyrpides再次强调,公共数据应该被视为开放资源,不受限制地被用于分析、解释和发布。相关论文近日在线发表于《科学》。 时不时遇到“软障碍” 公共基因组数据使用自由是国际生命科学研究领域的传统与共识,自人类基因组计划实施以来,大量的开放共享基因组数据信息极大地促进了生物医学研究的进步。 1990年启动并有我国参与的人类基因组计划被看成科学史上的伟大工程,3年前,该计划负责人Eric Green、James Wa......阅读全文

缺乏数据使用指导原则,基因组数据共享遇阻

   基因组数据共享将生物医学研究推向快车道,但向公共领域发布的现有数据指南一方面承认免费和无条件使用数据的重要性,另一方面还未能解决这种重要性与数据生产者首次发布数据的“权利”之间的关系。  在美国能源部联合基因组研究所负责人Nikos Kyrpides看来,这种自相矛盾导致了数据生产者和数据使用

美国推进癌症基因数据共享

  美国麦利亚德基因公司(Myriad Genetics)拥有关于乳腺癌和卵巢癌的两个基因的专利,这让它们垄断乳腺癌检测的行业多年。虽然美国最高法院在去年六月已经对这两个基因的专利做了无效判决,但该公司仍然掌握这独有的130万份的检测数据。这些信息则使得麦利亚德公司在检测结果解释上有巨大优势。但是

太原监测观测数据共享

  山西省太原市环保局与市气象局近日就共同开展空气质量预报预警工作机制进行首次会商,确定从11月起,两部门联手对太原环境空气质量开展预报预警,以便有效控制空气污染。   太原市环保和气象部门在现有空气质量实时监测发布的基础上,建立了空气质量预报预警机制。每日由环保部门制作前日空气质量日报,双方同时

共享激光雷达数据集

3D 激光雷达数据可公开共享给众多用户和同事。共享激光雷达数据的两个主要方法是通过 Web 共享或通过文件系统共享。通过文件系统共享任何文件都可通过文件系统或 ArcCatalog 进行共享。只需记住,移动文件会使引用的数据源的链接断开。例如,复制、重命名或删除 LAS 数据集或汇总数据会导致 LA

我国超级稻基因组数据从“云端”向全球共享

  “我们的3000份绿色超级稻基因组原始测序数据,覆盖了全球25万份种质基因全部遗传变异的95%。这份核心数据,将正式通过阿里云平台,向全球免费开放。”9月15日,中国农业科学院、阿里云计算有限公司、华智水稻生物技术有限公司、北京聚道科技有限公司在长沙共同启动“云之稻项目”,中国农科院农作物基因资

农科院棉花所开放棉花资源和基因数据共享

  12月31日,由中国农业科学院棉花研究所生物信息与分子设计中心构建的棉花资源和网络数据库网站正式上线。用户可在该网站上进行数据挖掘和分析、可视化展示等,操作简单快捷,结果准确易懂。  该数据库网站(Gossypium Resource And Network Database,GRAND)目前主

英推迟大型医疗数据共享项目

  近日,一个获得很多科研团体大力支持的庞大计划被推延,该计划旨在创建一个覆盖全英国的医疗记录数据库。此举遭致很多争议,一些病人决定退出该计划。   “关怀·数据”项目原计划收集来自英国全科医生的病人数据(目前这些数据归当地机构管理)。之后,这些数据将向医学研究人员开放。研究慈善机构对该

呼吁数据共享!数据烂手里,何谈研究话语权?

  导 读  在大气、海洋、冰川等需要国际合作的研究领域,中国普遍缺乏拿得出手的高质量数据。问题出在了哪里?  “我们国家在数据方面基本没有话语权。”  在谈到IPCC报告里鲜有来自中国的数据时,A学者不无感慨地告诉《知识分子》。这位要求匿名的研究者举例说,在2013年第五次IPCC报告中,为决策者

解读美材料基因组计划:数据共享乃大势所趋

  美国的材料基因组计划(MGI)启动至今已有两年,5位专家日前在《自然》杂志撰文,指出材料科学家应该如何在该计划中实施工作。   Sally Tinkle: 借鉴其他项目   华盛顿科技政策研究所政策分析师   MGI由总统巴拉克·奥巴马于2011年6月启动,旨在将应用于能源、交通和安全等领

解读美材料基因组计划:数据共享乃大势所趋

  MGI于2011年6月启动,旨在将应用于能源、交通和安全等领域的先进材料的开发时间和资金成本减半。  美国的材料基因组计划(MGI)启动至今已有两年,5位专家日前在《自然》杂志撰文,指出材料科学家应该如何在该计划中实施工作。   Sally Tinkle:借鉴其他项目   华盛顿科技政策研究