数学院等调控网络数学建模揭示干细胞分化关键转录因子

近期,国际学术期刊《细胞-干细胞》(Cell Stem Cell)在线发表了由中国科学院数学与系统科学研究院和美国斯坦福大学科研人员合作的干细胞分化的基因调控网络建模成果。这一成果提出了利用匹配的基因表达和染色质可及性数据刻画转录因子和调控元件结合调控下游基因表达的数学模型,构建了描绘细胞状态转化的染色质调控网络,通过网络分析鉴定出TFAP2C和p63分别为表面外胚层起始和角质形成细胞成熟的关键因子,并揭示了谱系定型过程中TFAP2C-p63对表观遗传转换的反馈调节机制。 干细胞为人类疾病治疗带来了希望,然而如美国国家卫生研究院国立普通医学科学研究所干细胞生物学基金监管人Marion Zatz说:“干细胞研究中面临的最大挑战之一就是如何调控干细胞转变为一种特异的细胞类型”。针对这一重要的科学问题,数学院研究员王勇与斯坦福大学统计系教授Wing Hung Wong、医学院皮肤系教授Anthony Oro、Howard Cha......阅读全文

胚胎干细胞转录因子NANOG的新发现

  在胚胎干细胞的自我更新中,转录因子Nanog 具有关键性的作用,这一因子也一直是近年来研究的热点。最近,西班牙国家癌症研究中心(CNIO)的科学家们发现,NANOG也调控成体生物分层上皮细胞的细胞分裂,分层上皮细胞是皮肤表皮的组成部分,或者覆盖在食管和阴道表面。相关研究结果发表在最近的《自然通讯

CCAAT转录因子

中文名称CCAAT转录因子英文名称CCAAT transcription factor定  义可与启动子中的CCAAT元件发生特异性相互作用的转录因子。应用学科细胞生物学(一级学科),细胞遗传(二级学科)

辅助转录因子

中文名称辅助转录因子英文名称ancillary transcription factor定  义协助RNA聚合酶同启动子结合,并促进已结合的RNA聚合酶启动转录速率的转录因子。应用学科细胞生物学(一级学科),细胞遗传(二级学科)

转录因子组成

真核生物在转录时往往需要多种蛋白质因子的协助。一种蛋白质是不是转录结构的一部分往往是通过体外系统看它是否是转录起始所需要的。一般这些促成转录起始所需的转录结构包括三个重要的组成部分:亚基RNA聚合酶的亚基,它们是转录必须的,但并不对某一启动子有特异性。复合物某些转录因子能与RNA聚合酶结合形成起始复

转录因子活性ELISA

转录因子活性ELISA是建立在ELISA基础上的高灵敏度的检测方法,比EMSA的灵敏度高l0倍,在5h内就能完成。不涉及放射性和凝胶电泳,安全简便,而且这种微孔板的形式能同时检测1—96个样品。ArrayStarTM转录因子活性ELISA试剂盒可以快速、灵敏地检测细胞核提取物中转录因子的DNA结合活

转录因子和转录因子之间可以有相互作用吗

可以转录因子真核生物转录起始十分复杂,往往需要多种蛋白因子的协助,转录因子与RNA聚合酶Ⅱ形成转录起始复合体,共同参与转录起始的过程。根据转录因子的作用特点可分为二类;第一类为普遍转录因子,它们与RNA聚合酶Ⅱ共同组成转录起始复合体时,转录才能在正确的位置开始。除TFⅡD以外,还发现TFⅡA,TFⅡ

转录因子的转录调控区的介绍

  同一家族的转录因子之间的区别主要在转录调控区。  转录调控区包括转录激活区(transcription activation domain)和转录抑制区(transcription repression domain)二种。近年来,转录的激活区被深入研究。它们一般包含DNA结合区之外的30-10

转录因子KLF5参与小鼠乳腺干细胞维持及乳腺发育

  乳腺癌是女性中发病率最高的癌症。近年来的研究表明,转录因子KLF5在乳腺癌的发生发展过程中发挥重要作用;前期的研究表明,KLF5在乳腺癌干细胞的自我更新和维持过程中发挥关键的促进作用(Theranostics, 2016; 6(4): 533-544);另外也有研究显示KLF5在胚胎干细胞的维持

数学院等调控网络数学建模揭示干细胞分化关键转录因子

  近期,国际学术期刊《细胞-干细胞》(Cell Stem Cell)在线发表了由中国科学院数学与系统科学研究院和美国斯坦福大学科研人员合作的干细胞分化的基因调控网络建模成果。这一成果提出了利用匹配的基因表达和染色质可及性数据刻画转录因子和调控元件结合调控下游基因表达的数学模型,构建了描绘细胞状态转

关于转录因子的转录抑制区的介绍

  也是转录因子调控表达的重要位点,但是对其作用机理研究尚不深入。可能的作用方式有三种:1)与启动子的调控位点结合,阻止其它转录因子的结合;2)作用于其它转录因子,抑制其它因子的作用;3)通过改变DNA的高级结构阻止转录的发生。  转录因子必须在核内作用,才能起到调控表达的目的。因此,转录因子上的核

简述转录因子的作用

  是通过和顺式因子的互作来实现的。这段序列可以和转录因子的DNA结合域实现共价结合,从而对基因的表达起抑制或增强的作用。  目前,人工转录因子(Artificial Transcription Factor,ATF)的构建已用于转录因子的生物学功能研究中起到重要作用。ATF是指将不同的DNA结合结

概述转录因子的组成

  真核生物在转录时往往需要多种蛋白质因子的协助。一种蛋白质是不是转录结构的一部分往往是通过体外系统看它是否是转录起始所需要的。一般这些促成转录起始所需的转录结构包括三个重要的组成部分:  1、亚基  RNA聚合酶的亚基,它们是转录必须的,但并不对某一启动子有特异性。  2、复合物  某些转录因子能

依赖ρ因子的转录终止

ρ因子是一种分子量为46kDa的蛋白质,以六聚体为活性形式。

通用转录因子的定义

通用转录因子(general transcription factors, GTFs) 。真核生物中有效的和启动子特异性的起始过程中需要几个起始因子,这些起始因子称为通用转录因子

转录终止因子的定义

中文名称转录终止因子英文名称transcription termination factor定  义辅助具有RNA聚合酶活性的转录复合体特异性地识别转录终止信号的蛋白质因子(如ρ因子等),其作用导致转录终止。应用学科生物化学与分子生物学(一级学科),基因表达与调控(二级学科)

通用转录因子的定义

通用转录因子(general transcription factors, GTFs)   。真核生物中有效的和启动子特异性的起始过程中需要几个起始因子,这些起始因子称为通用转录因子。

研究人员发现促进间充质干细胞骨形成的新型转录因子

  成骨分化是由细胞内信号和外部微环境信号共同调控的复杂生物学过程。在适当的刺激下,间充质干细胞(mesenchymal stem cells,MSCs)通过多个转录因子驱动的多步调控过程向成骨细胞分化,其特征是大量骨特征蛋白的表达。近日,来自意大利和西班牙的研究人员共同发现了小鼠体内一种新的转录因

人类干细胞模型中发现LINE1转录因子新功能2

 研究人员发现,TREX1功能不正常后所有细胞模型都出现了多余的染色体外DNA,它们主要来自LINE1 (L1)逆转录因子。L1是一类重复DNA序列,可在人类基因组中自发地“复制-粘贴”自己,在过去它们被称为“垃圾基因”,它们在细胞内的功能很大程度上仍然未知。在Muotri实验室创造的一些A

研究人员发现促进间充质干细胞骨形成的新型转录因子

  成骨分化是由细胞内信号和外部微环境信号共同调控的复杂生物学过程。在适当的刺激下,间充质干细胞(mesenchymal stem cells,MSCs)通过多个转录因子驱动的多步调控过程向成骨细胞分化,其特征是大量骨特征蛋白的表达。近日,来自意大利和西班牙的研究人员共同发现了小鼠体内一种新的转录因

人类干细胞模型中发现LINE1转录因子新功能1

干细胞是人体内一种尚未分化的细胞,具有极强的分化和再生能力。通过研究人类干细胞模型,可帮助研究疾病的治疗。Aicardi-Goutieres综合征(AGS)是一种罕见但致命的遗传性自身免疫性疾病,其临床特征包括炎症标志物和其他炎症反应增加,类似于婴儿在子宫内获得的出生前病毒感染。早期研究表明,

转录起始因子的定义

中文名称转录起始因子英文名称transcription initiation factor定  义参与转录起始作用的因子。应用学科遗传学(一级学科),分子遗传学(二级学科)

PNAS:“打了就跑”的转录因子

  细胞核中的调控蛋白,在活化基因时采取了一种“打了就跑”(hit-and-run)的策略。美国国家科学院院刊PNAS杂志上发表的一项最新研究,深入解析了这种高效的转录模式。  “就像马克吐温笔下闯了祸就跑的汤姆·索亚一样,转录因子结合启动子并激活转录之后就会立即离开,让小伙伴们去继续自己未完成的工

转录激活因子的定义

定义1:一个转录因子家族,通过识别和结合环腺苷酸应答元件而激活基因表达。环腺苷酸应答元件存在于很多病毒和细胞的基因启动子中。 所属学科:生物化学与分子生物学(一级学科);基因表达与调控(二级学科)定义2:与特定DNA序列结合以促进基因转录的因子。 所属学科:遗传学(一级学科);分子遗传学(二级学科)

转录终止因子的概念介绍

中文名称转录终止因子英文名称transcription termination factor定  义辅助具有RNA聚合酶活性的转录复合体特异性地识别转录终止信号的蛋白质因子(如ρ因子等),其作用导致转录终止。应用学科生物化学与分子生物学(一级学科),基因表达与调控(二级学科)

转录激活因子的定义

定义1:一个转录因子家族,通过识别和结合环腺苷酸应答元件而激活基因表达。环腺苷酸应答元件存在于很多病毒和细胞的基因启动子中。 所属学科:生物化学与分子生物学(一级学科);基因表达与调控(二级学科)定义2:与特定DNA序列结合以促进基因转录的因子。 所属学科:遗传学(一级学科);分子遗传学(二级学科)

通用转录因子的相关介绍

  在真核生物中有效的和启动子特异性的起始需要几个起始因子,这些起始因子称为通用转录因子。通用转录因子共同执行

基因转录因子的相关介绍

  转录因子(transcription factor)是起调控作用的反式作用因子。转录因子是转录起始过程中RNA聚合酶所需的辅助因子。真核生物基因在无转录因子时处于不表达状态,RNA聚合酶自身无法启动基因转录,只有当转录因子(蛋白质)结合在其识别的DNA序列上后,基因才开始表达。转录因子的结合位点

动物所发现转录因子Fev在造血干细胞发育中起到重要作用

  中科院动物研究所刘峰研究员领导的血液与心血管发育研究组以斑马鱼和人脐带血为研究模型,应用遗传学、细胞生物学和分子生物学等多种研究手段,发现 ETS家族转录因子Fev在造血干细胞发育中起到重要作用。在斑马鱼中敲低Fev导致造血干细胞及T细胞数量明显减少。应用TALEN技术得到的该基因遗传突变体

玉米转录因子和籽粒重要转录因子互作协同调控醇溶蛋白

玉米(Zea mays)原产于墨西哥和中美洲地区,是一种由古印第安人(Indians)在数千年前利用野生墨西哥类蜀黍(Euchlaenamexicana)(现存在于墨西哥和尼加拉瓜)杂交而来的品种。但是,作为一类重要的粮食作物,天然玉米籽粒在其营养价值上却有着重要的缺陷。根据已有的文献报道,玉米籽粒

玉米转录因子ZmMADS47和籽粒转录因子Opaque2-调控醇溶蛋白

  玉米(Zea mays)原产于墨西哥和中美洲地区,是一种由古印第安人(Indians)在数千年前利用野生墨西哥类蜀黍(Euchlaenamexicana)(现存在于墨西哥和尼加拉瓜)杂交而来的品种。但是,作为一类重要的粮食作物,天然玉米籽粒在其营养价值上却有着重要的缺陷。根据已有