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蛋白质组学牛人利用新技术分析蛋白质图谱

蛋白质组(proteomics)分析是针对不同条件下细胞中蛋白的功能和特性进行研究的统称,这一领域的研究一直以来都落后于基因组研究,后者在技术创新方面取得了不少成果,一些令人眼花缭乱的快速基因组图谱绘制技术,还有无需借助核心实验室设备就能完成实验的技术,都令我们印象深刻。 但是与基因组研究的主要目的不同――基因组研究主要目的在于成列静态碱基对序列,而蛋白质组分析则需要考虑到不同的形状,大小和序列,这带给科研人员更多需要解决的问题。 “一些科学家指出,蛋白质组的复杂性是无限的”,来自美国巴克老年研究所(Buck Institute for Age Research )Bradford Gibson解释道,像是剪切变化,磷酸化修饰,蛋白表达时序变化,蛋白翻转,以及蛋白相互作用,都是造成蛋白质组复杂的原因。尽管蛋白质组存在许多变化,但现代的高尖端技术图谱也能帮助科学家们更好的了解细胞中的一举一动。The S......阅读全文

定量蛋白质组学质谱采集技术进展(二)

同步母离子选择(Synchronous precursor selection, SPS)技术的出现彻底解决了MS3 响应弱的问题。SPS 技术利用多频切迹的选择波形电压(MultiNotch) [27] ,在线性离子阱中实现一次选择同时获得多个离子,最多可同时选择15 个(图2A)。利用这一原理,

定量蛋白质组学质谱采集技术进展(一)

摘要 质谱是定量蛋白组学的主要工具。近年来随着定量蛋白质组学研究的深入,传统质谱定量技术面临着复杂基质干扰、分析通量限制等诸多问题。而最近一系列质谱新技术的发展,包括同步母离子选择(SPS)、质量亏损标记、平行反应监测(PRM)、多重累积(MSX)和多种全新数据非依赖性采集(DIA)等,为解决目前蛋

定量蛋白质组学质谱采集技术进展(三)

然而PRM 的分析通量不如SRM。PRM 能同时监测最多10 ~15 个母离子,而SRM 能同时监测上百个离子对,因为高分辨质谱的有效扫描速度通常只有10 ~15 Hz,远慢于SRM 的有效扫描速度。但是这一问题正逐步得到解决,多重累积(Multiplexing, MSX)技术的发展和使用有

定量蛋白质组学质谱采集技术进展(四)

无论是相对定量还是绝对定量方法,DIA很好地克服了DDA鸟枪法和SRM目标监测的种种不足, 在定量蛋白质组学中具有良好的应用前景。然而,目前DIA 方法的循环时间仍然较长,只能与纳流液相联用,并使用较长的梯度以获得足够的色谱峰宽,限制了DIA 的应用范围。这也是DIA 技术下一步需要解决

质谱技术在蛋白质组研究中的分析方法

2003年人类基因组精细图绘制完成,是人类科学史上一个里程碑式的事件。后基因组时代的研究重点自然落在了蛋白质头上。为啥?因为中心法则告诉我们,基因的产物——蛋白质,是生命活动的最终执行者。与基因组类比,研究生物体内全套蛋白质的科学,就是蛋白质组学。基因组计划完成的同年,人类蛋白质组计划启动,令人激动

质谱技术在蛋白质组研究中的分析方法介绍

  2003年人类基因组精细图绘制完成,是人类科学史上一个里程碑式的事件。后基因组时代的研究重点自然落在了蛋白质头上。为啥?因为中心法则告诉我们,基因的产物——蛋白质,是生命活动的最终执行者。与基因组类比,研究生物体内全套蛋白质的科学,就是蛋白质组学。基因组计划完成的同年,人类蛋白质组计划启动,令人

质谱和蛋白质组学:击中目标

Nature Methods - 5, 741 - 747 (2008)   作者:Nathan Blow   分析测试百科  译     近年来,质谱仪大幅提高了动态范围和灵敏度,使研究者们在疾病生物标志物的发现和验证方面,更从容地面对挑战。     在2008年6月的美国质谱大会(ASMS)

质谱技术帮助科学家发现蛋白质组学重要成果

最近,来自瑞士和荷兰的科学家,对在22种不同生长条件下大肠杆菌表达的蛋白质,进行了定量和定性分析。确定了超过2300个蛋白质,其中一些处于每个细胞一个副本的平均水平。由此产生的数据集描述了细胞中大多数(> 90%)的蛋白质量,对细胞生物学家来说这将是一个宝藏。相关研究结果发表在十二月出版的《Na

AB SCIEX推出创新的蛋白质组学质谱应用新技术

  将与苏黎世联邦理工学院通力合作,专注发展 TripleTOF 5600 系统上的 SWATH™ 采集方式,来研究全面的系统蛋白质组学  马萨诸塞州弗雷明汉市2011年6月7日电 /美通社亚洲/  --苏黎世联邦理工学院及 AB SCIEX(全球领

Orbitrap质谱蛋白质组沙龙在京举行

  【导语】使用质谱仪器进行蛋白质组研究中有三个关键环节,第一个是样品的处理阶段,这是最简单,也是最重要的一个步骤。第二个阶段是仪器的操作部分,使用液相、质谱等仪器把蛋白质进行分离、分析。主要涉及仪器参数的优化调整。第三步是生物信息学分析部分,这也是最难的部分。本期沙龙中中科院生物物理所的