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质谱和蛋白质组学:击中目标

Nature Methods - 5, 741 - 747 (2008) 作者:Nathan Blow 分析测试百科 译 近年来,质谱仪大幅提高了动态范围和灵敏度,使研究者们在疾病生物标志物的发现和验证方面,更从容地面对挑战。 在2008年6月的美国质谱大会(ASMS)上,用于鉴定蛋白质生物标志物(指示了疾病或疾病状态的蛋白质)的质谱仪,成为了在质谱制造厂商中反复出现的一个主题。 Waters公司(美国,马萨诸塞州,Milford)推出了一款名为Xevo TQ MS的三重四极杆质谱仪,及其相应的软件包,两者都是为推动生物标志物从发现阶段到目标蛋白的验证阶段而设计的。安捷伦科技(美国,加州,Foster市)推出了新的6400系列的三重四极杆液质联用仪,并......阅读全文

蛋白质组最新研究进展

  蛋白质组(Proteome)的概念最先由Marc Wilkins提出,指由一个基因组,或一个细胞、组织表达的所有蛋白质。 蛋白质组的概念与基因组的概念有许多差别,它随着组织、甚至环境状态的不同而改变。 在转录时,一个基因可以多种mRNA形式剪接,一个蛋白质组不是一个基因组的直接产物,蛋白质组中蛋

第六届世界华人质谱会在美举办 共享质谱学术盛宴

  分析测试百科网讯 2016年6月4日,第六届世界华人质谱会在美国德克萨斯州圣安东尼奥举行,这是自第一届世界华人质谱会以来第一次在海外举办的华人质谱会,并恰逢距2006年在新疆举办的第一届世界华人质谱会10周年。会议由美国华人质谱协会(C

SWATH为全球科学界提供蛋白质组学研究的突破性技术

SWATH™采集模式为全世界科学界提供蛋白质组学研究的突破性技术  在TripleTOF™ 5600系统上运行非数据依赖的SWATH™采集模式,能够进行全面、完整的蛋白质定量,相关成果发表在《分子与细

近期《自然》期刊系列中发挥关键作用的赛默飞质谱仪

   【导语】在2011年10-11月期间,在一级科学刊物Nature和Nature Methods上有14篇科研论文使用赛默飞世尔LTQ-Orbitrap或TSQ质谱仪产生数据,聚焦的主题包括:目标物发现与定量研究,Top-down蛋白质组研究绘制蛋白质异构体,同位素标签方法的精度,提高糖蛋白质组

Aebersold研究组发布用于全蛋白质组的高通量定量方法

  瑞士苏黎世联邦理工学院的研究人员领导的一个研究小组,已制定了一个质谱工作流,用于对整个蛋白质组进行高通量的绝对定量。  据ETH的研究者、该研究的领头人Ruedi Aebersold说,对于多种形态,该技术实现了目标蛋白质组的重现性定量,提供用于

Orbitrap Exploris 480:丰富的定量流程介绍(二)

平行反应监控(Parallel Reaction Monitoring, PRM)是Orbitrap系列仪器上的高分辨靶向定量方法,类似于三重四极杆质谱上的选择反应监控(Selected Reaction Monitoring, SRM),其是进行潜在标志物验证的金标准方法之一。 但是PRM

Cell杂志最受关注十篇文章(10月)

  Cell创刊于1974年,现已成为世界自然科学研究领域最著名的期刊之一,并陆续发行了十几种姊妹刊,在各自专业领域里均占据着举足轻重的地位。Cell以发表具有重要意义的原创性科研报告为主,许多生命科学领域最重要的发现都发表在Cell上。本月《Cell》前十名下载论文为:  Hallmarks of

Cell杂志最受关注十篇文章

  Cell创刊于1974年,现已成为世界自然科学研究领域最著名的期刊之一,并陆续发行了十几种姊妹刊,在各自专业领域里均占据着举足轻重的地位。Cell以发表具有重要意义的原创性科研报告为主,许多生命科学领域最重要的发现都发表在Cell上。本月《Cell》前十名下载论文为:  Hallmarks of

Cell杂志最受关注十篇文章:稳居年榜首的是哪篇文章?

  Cell创刊于1974年,现已成为世界自然科学研究领域最著名的期刊之一,并陆续发行了十几种姊妹刊,在各自专业领域里均占据着举足轻重的地位。Cell以发表具有重要意义的原创性科研报告为主,许多生命科学领域最重要的发现都发表在Cell上。本月《Cell》前十名下载论文为:  Hallmarks of

一小时DDA鉴定DIA定量4000个Hela蛋白(二)

Skyline 中嵌入的 mProphet 软件会根据同一肽段的多个子离子峰的 feature 进行打分。 Feature 包括子离子共流出峰形、保留时间偏差、 dotp 值、信噪比等。为了区分假阳性的子离子峰, mProphet 可以建立 decoy 库,也可以将打分排名第二的肽段作为decoy,

一小时 DDA 鉴定 DIA 定量 4000 个 Hela 蛋白(二)

500 ng Hela 细胞裂解液用相同的色谱柱,相同的色谱梯度,将 QE HF 切换至 DIA 扫描模式进行 3 次 DIA 数据采集。在一次扫描循环中,目标母离子质核比范围 400–1000,四极杆的隔离窗口为 12 Da,包含 50 次 MS/MS 扫描。每一张 MS/MS 谱图中

HUPO见闻:SWATH对DDA将产生巨大冲击

      近一段时间,一直不断有Mann的新技术出现,THERMO的仪器基本上都是Mann首先发出的文章;而Aebersold自从回到瑞士以后在技术方面出的东西不多,今年ASMS质谱年会发

QTRAP代表文献回顾

 生物分子发表的代表性文献 QTRAP:同时具有三重四极杆和线性离子阱性能的独一无二的LC/MS/MS系统       QTRAP系统最早在ASMS 2002上,作为第一台商用的线性离子阱发布,是世界上唯一的线性离子阱和三重四极杆的复合

Cell杂志最受关注十篇文章:稳居一年榜首的是哪篇文章

  肿瘤异质性是指不同患者肿瘤之间和同一个肿瘤内不同细胞之间的差异。这种异质性的存在会影响对癌症患者的诊断、治疗和预后。为了解释肿瘤的异质性科学家已提出了不同的机制,如上皮间质转化(EMT),在该过程中上皮肿瘤细胞失去黏附力,并获得间充质细胞的迁移特性,该过程与肿瘤转移和耐药性相关。为何有些肿瘤会发

创新数据非依赖性采集用于复杂基质目标蛋白质...(三)

对10 条肽段的分析结果汇总(表1),结果表明,3 种DIA 方法在fg ~ pg 数量级肽段范围内均显示出良好的线性、重现性和灵敏度。3 种方法的最低定量限均达到amol 级,其中肽段GEEMEEMVQSAR在DIA 中最低定量限达14 amol,超越了常规SRM 和PRM 的定量水平。比