蛋白质序列分析和结构预测
【实验目的】 1、掌握蛋白质序列检索的操作方法; 2、熟悉蛋白质基本性质分析; 3、熟悉基于序列同源性分析的蛋白质功能预测,了解基于motif、结构位点、结构功能域数据库的蛋白质功能预测; 4、了解蛋白质结构预测。【实验内容】 1、使用Entrez或SRS信息查询系统检索人脂联素(adiponectin)蛋白质序列; 2、使用BioEdit软件对上述蛋白质序列进行分子质量、氨基酸组成、和疏水性等基本性质分析; 3、对人脂联素蛋白质序列进行基于NCBI/Blast软件的蛋白质同源性分析; 4、对人脂联素蛋白质序列进行motif结构分析; 5、对人脂联素蛋白质序列进行二级结构和三维结构预测。【实验方法】 1、人脂联素蛋白质序列的检索: (1)调用Internet浏览器并在其地址栏输入Entrez; (2)在Search后的选择栏中选择protein; (3)在输入栏输入homo sapiens adi......阅读全文
核酸和蛋白质序列分析-1
在获得一个基因序列后,需要对其进行生物信息学分析,从中尽量发掘信息,从而指导进一步的实验研究。通过染色体定位分析、内含子/外显子分析、ORF分析、表达谱分析等,能够阐明基因的基本信息。通过启动子预测、CpG岛分析和转录因子分析等,识别调控区的顺式作用元件,可以为基因的调控研究提供基础。通过蛋白质基本
蛋白质序列分析和结构预测
【实验目的】 1、掌握蛋白质序列检索的操作方法; 2、熟悉蛋白质基本性质分析; 3、熟悉基于序列同源性分析的蛋白质功能预测,了解基于motif、结构位点、结构功能域数据库的蛋白质功能预测; 4、了解蛋白质结构预测。【实验内容】 1、使用Entrez或SRS信息查询系统检索人脂联素(ad
蛋白质序列分析和结构预测
【实验目的】1、掌握蛋白质序列检索的操作方法;2、熟悉蛋白质基本性质分析;3、熟悉基于序列同源性分析的蛋白质功能预测,了解基于motif、 结构位点、结构功能域数据库的蛋白质功能预测;4、了解蛋白质结构预测。【实验内容】1、使用Entrez或SRS信息查询系统检索人脂联素 (adiponectin)
核酸和蛋白质序列分析-2
(2)输出:除了以文本形式外,还可以通过JalView显示和编辑结果。此外,还可以另外使用GeneDoc(常见于文献)及DNAStar软件等显示结果。多序列比对的结果还用于进一步绘制进化树。3、ORF(Open Reading Frame)分析从核酸序列翻译得到蛋白质序列,需要进行ORF分析,每个生
蛋白质序列分析和结构预测实验
实验步骤 1. 人脂联素蛋白质序列的检索(1)调用Internet浏览器并在其地址栏输入Entrez网址(http://www.ncbi.nlm.nih.gov/Entrez);(2)在Search后的选择栏中选择protein;(3)在输入栏输入homo sapiens adiponectin;
蛋白质序列分析和结构预测实验
实验步骤1. 人脂联素蛋白质序列的检索(1)调用Internet浏览器并在其地址栏输入Entrez网址(http://www.ncbi.nlm.nih.gov/Entrez);(2)在Search后的选择栏中选择protein;(3)在输入栏输入homo sapiens adiponectin;(
蛋白质序列分析和结构预测实验
蛋白质序列分析和结构预测实验 实验步骤 1. 人脂联素蛋白质序列的检索(1)调用Internet浏览器并在其
N 端封闭蛋白质内部序列测定实验
实验材料 蛋白质样品(约 200 mol) 试剂、试剂盒 1%乙酸溶液(含丽春红 S 染料)1% 乙酸0.2 mol/L NaOH0.1 mol/L 乙酸溶液(含PVP-40)消化缓冲液1 mg/ml 胰蛋白酶层析溶液 A层析溶液 B 仪器、耗材 0.22 μm
N 端封闭蛋白质内部序列测定实验
基本方案 实验方法原理 实验材料 蛋白质样品(约 200 mol)
N 端封闭蛋白质内部序列测定实验
实验方法原理 实验材料 蛋白质样品(约 200 mol)试剂、试剂盒 1%乙酸溶液(含丽春红 S 染料)1% 乙酸0.2 mol/L NaOH0.1 mol/L 乙酸溶液(含PVP-40) 消化缓冲液 1 mg/ml 胰蛋白酶层析溶液 A 层析溶液 B仪器、耗材 0.22 μm 硝酸纤维素膜酸洗过的