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lncRNA功能机制研究(二)

实验路线(1)LINC00346调控胃癌发展的上游机制结果:转录因子KLF5和MYC可与LINC00346启动子结合,并增强其表达a. 转录因子MYC、KLF5和 LINC00346的Oncoprint分析;b. 在含有或未含有胃癌KLF5/ MYC / LINC00346 SCNAs的转录因子KLF5、MYC、LINC00346基因表达;c. GSE51705数据库的分析显示,KATO-III GC细胞中KLF5与LINC00346基因启动子结合;d. UCSC基因组生物信息学网站显示, MYC高度富集在LINC00346的启动子上;e. GSE51575数据库显示LINC00346的表达与KLF5或MYC正相关;f. qPCR显示LINC00346的表达与KLF5或MYC 正相关;g. ChIP实验显示,内源性MYC和KLF5与LINC00346基因启动子区结合。h. WB显示干扰或过表达LINC00......阅读全文

lncRNA功能机制研究(二)

实验路线(1)LINC00346调控胃癌发展的上游机制结果:转录因子KLF5和MYC可与LINC00346启动子结合,并增强其表达a. 转录因子MYC、KLF5和 LINC00346的Oncoprint分析;b. 在含有或未含有胃癌KLF5/ MYC / LINC00346 SCNAs的转录因子

lncRNA功能机制研究(一)

文章导读LncRNA是长度大于200nt的长链非编码RNA,在调控不同的分子过程中发挥着重要作用。其主要功能不仅可以与功能蛋白结合,并在转录或转录后水平调控基因表达,而且lncRNA也可以作为诱饵,吸附miRNA,调节miRNA调控的靶基因表达。但是,目前关于lncRNA在胃癌中的表达谱和生物学功能

lncRNA促进胃癌进展的新机制研究思路分析(二)

2. GC细胞中FOXD2-AS1富集高的患者预后较差在芯片数据GSE51575基础上,以正常组织作为对照,来评估FOXD2-AS1的诊断效果。ROC曲线下面积为0.919(95%置信区间[CI] 0.809-0.976; P < 0.0001);特异性和敏感性分别为0.885和0.885。

lncRNA在农业领域的研究成果(二)

【思路及相应结果】内容与图片源:(王立方,2015)【结论】通过全转录组测序、lncRNA测序和实时荧光定量的方法发现和鉴定了与家蚕产丝相关的lncRNA和其在不同产丝阶段的表达量变化,挑出了与家蚕产丝调控紧密相关的非编码RNA和lncRNA。例如位于P25基因下游互补链的lncR2034,与P25

外泌体lncRNA介导的淋巴转移机制的揭秘(二)

(5)外泌体LNMAT2上调PROX1的表达有研究报道,PROX1通过调节内皮细胞的分化和转移,对淋巴管系统发育至关重要。因此作者通过qPCR和WB实验发现,HLECs中上调LNMAT2能够促进PROX1的表达;为了探究LNMAT2调控PROX1表达的分子机制,作者进行核质分离PCR,发现LNMAT

lncRNA促进胃癌进展的新机制研究思路分析

  近日,南京医科大学第一附属医院的束永前团队将最新的研究成果,以题为“Upregulation of the long noncoding RNA FOXD2-AS1 promotes carcinogenesis by epigenetically silencing EphB3 through

lncRNA促进胃癌进展的新机制研究思路分析

  Nature子刊|联合南京医科大发表重要研究成果:揭示lncRNA促进胃癌进展的新机制   近日,南京医科大学第一附属医院的束永前团队将最新的研究成果,以题为“Upregulation of the long noncoding RNA FOXD2-AS1 promotes carcinoge

Nature 子刊:研究lncRNA功能的新方法

  长非编码RNA(lncRNA)是长达两百个核苷酸以上的转录本。虽然lncRNA没有编码任何蛋白质,但它们在不同组织和发育阶段的表达依然具有特异性,这说明lncRNA具有重要的生物学意义。细胞中绝大多数lncRNA位于细胞核,它们对应的DNA区域有的与蛋白编码基因重叠,有的位于基因间或者内含子中。

云序客户8.0分成果揭秘还愁lncRNA功能机制如何研究吗?

  LncRNA是长度大于200nt的长链非编码RNA,在调控不同的分子过程中发挥着重要作用。其主要功能不仅可以与功能蛋白结合,并在转录或转录后水平调控基因表达,而且lncRNA也可以作为诱饵,吸附miRNA,调节miRNA调控的靶基因表达。但是,目前关于lncRNA在胃癌中的表达谱和生物学功能的

云序客户8.0分成果揭秘:还愁lncRNA功能机制如何研究吗?

  文章导读   LncRNA是长度大于200nt的长链非编码RNA,在调控不同的分子过程中发挥着重要作用。其主要功能不仅可以与功能蛋白结合,并在转录或转录后水平调控基因表达,而且lncRNA也可以作为诱饵,吸附miRNA,调节miRNA调控的靶基因表达。但是,目前关于lncRNA在胃癌中的表达谱