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LightCycler应用:甲基化分析

主要应用:应用实时荧光PCR技术进行快速准确的DNA甲基化分析DNA甲基化是表观遗传学的重要研究内容之一,它可以在转录水平抑制基因的表达。具体的过程是在胞嘧啶-鸟嘧啶(CpG二核苷酸)的5位碳原子上添加了一个额外的甲基团,形成5-甲基胞嘧啶。CpG二核苷酸密度较高的区域在人体基因组中呈非随机分布于,优先分布于基因的启动子区,并被称为CpG岛[1]。对于癌症,其基因组的甲基化分布发生变化[2]。正常状态下应甲基化的区域未甲基化,而症状状态下非甲基化区域出现甲基化,例如CpG岛相关启动子呈超甲基化。这可导致受累基因座的染色质结构发生变化,致使基因沉默。启动子超甲基化可导致有关肿瘤演进的重要基因再次沉默,例如那些有关DNA修复、细胞周期调控和凋亡的基因。因此,可以认为DNA甲基化与肿瘤研究密切相关。肿瘤中某些基因的DNA甲基化状态的变化通过其生物学特征反映出来。因此,评估DNA甲基化的快速高通量方法对研究者和临床医生在诊断、治疗和预后......阅读全文

甲基化研究新思路

        组蛋白甲基化研究与表观调控是肿瘤机制研究中的重要方向,然而传统甲基化研究一般分四步走:寻找甲基化位点、分析甲基化位点与生物表型相关性、验证甲基化调控靶基因表达量变化、构建转录层面调控机制。为更深入探索表观

基因甲基化特异性PCR扩增(MSP)试剂盒使用说明

  基因甲基化特异性PCR扩增(MSP)试剂盒产品说明书(中文版)   主要用途   基因甲基化特异性PCR扩增(MSP)试剂盒是一种旨在通过设计符合胞嘧啶转化的特殊引物,对转化基因组的CpG岛区域进行PCR扩增,探测基因甲基化信息的权威而经典的技术方法。该技术经过精心研制、成功实验证明的。可以

基因甲基化特异性PCR扩增(MSP)试剂盒使用说明

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固相微萃取-气相色谱法测定水中的甲基膦酸

摘要: 报道了应用固相微萃取- 气相色谱法测定水中甲基磷酸的方法, 研究了不同固相微萃取纤维、萃取温度和时间、解吸时间、pH 值等萃取条件和衍生化温度和时间、衍生化程序等衍生条件对测定效果的影响;结果表明该法简便、快速、有效, 其检出限为0. 03mg/ L。   &n

化学所在共轭聚合物设计与生物医药应用领域获系列进展

  共轭聚合物具有较强的光捕获能力,可用来放大荧光传感信号,在疾病诊断以及生物检测等方面发挥了越来越重要的作用。近几年来共轭聚合物在细胞与动物水平的荧光成像以及生物医学领域的应用也获得了高度关注。在国家自然科学基金委以及科技部的资助下,中国科学院化学研究所有机固体重点实验室的科研人员在共轭聚合物设计

人类基因组DNA甲基化数据分析

  近期来自电子科技大学,清华大学等处的研究人员从CpG岛等基本定义出发,阐述了高通量DNA甲基化的检测技术以及针对芯片技术与下一代测序技术的低水平数据处理方法,并重点对比了基于机器学习理论对CpG位点及CpG岛甲基化水平的预测算法,以及所利用的特征对预测效果的影响与发展趋势。  DNA甲基化是表观

基因甲基化特异性PCR扩增(MSP)试剂盒使用说明

主要用途基因甲基化特异性PCR扩增(MSP)试剂盒是一种旨在通过设计符合胞嘧啶转化的特殊引物,对转化基因组的CpG岛区域进行PCR扩增,探测基因甲基化信息的权威而经典的技术方法。该技术经过精心研制、成功实验证明的。可以被用于父母印记、X染色体研究、肿瘤抑制基因等表观遗传学研究。产品即到即用,性能稳定

再创纪录!AI系统可诊断近100种脑癌

今日,《自然》杂志再出人工智能重磅成果。来自美国、德国、意大利等100多个实验室的近150位科学家通力合作,联合在顶级期刊《自然》发表了这篇文章,他们开发了一个超级AI系统,该系统基于肿瘤组织DNA的甲基化数据,可以准确区分近100种不同的中枢神经系统肿瘤。更厉害的是,这个AI系统还能自学成才,发现

Genome research:不同RNA m5C甲基化修饰存在巨大差异

  导读   近年来,RNA修饰的研究已成为当今生命科学领域最前沿最热门的研究方向之一,不断有CNS的文章问世,m5C RNA修饰的分子机理研究越来越清晰,也不断有学者探寻如何更全面的获得贴近真实的m5C修饰的原貌。近期,来自德国的Frank Lyko和Mark Helm团队在GENOME RES

Genome research:不同RNA m5C甲基化修饰存在巨大差异

  近年来,RNA修饰的研究已成为当今生命科学领域最前沿最热门的研究方向之一,不断有CNS的文章问世,m5C RNA修饰的分子机理研究越来越清晰,也不断有学者探寻如何更全面的获得贴近真实的m5C修饰的原貌。近期,来自德国的Frank Lyko和Mark Helm团队在GENOME RESEARCH(

m5C RNA修饰表达谱文章教您如何另辟蹊径快速发文

文章导读随着RNA修饰在生物领域的持续火热,关于m6A修饰的研究已经广 泛开展并发表,至今已觉不新鲜;5-甲基胞嘧啶RNA甲基化(m5C)是一类新的修饰方式,参与调控细胞应激、发育和基因表达等方面,目前m5C研究正处 方兴未艾之际,大量的科学研究工作也亟待开展,非常适合有探索性和新颖性需求的老师。这

哈医大张岩课题组《NAR》发表疾病甲基化新成果

  近日,哈尔滨医科大学生物信息科学与技术学院张岩教授带领的计算表观遗传学课题组在著名生命科学杂志《Nucleic Acids Research》在线发表新成果,发布了人类疾病甲基化数据库DiseaseMeth version 2.0。  DNA甲基化是一种发生在DNA序列上的表观遗传修饰,在基因的

哈医大张岩课题组《NAR》发表疾病甲基化新成果

近日,哈尔滨医科大学生物信息科学与技术学院张岩教授带领的计算表观遗传学课题组在著名生命科学杂志《Nucleic Acids Research》在线发表新成果,发布了人类疾病甲基化数据库DiseaseMeth version 2.0。DNA甲基化是一种发生在DNA序列上的表观遗传修饰,在基因的转录调控

不同RNA m5C甲基化修饰存在巨大差异

导读近年来,RNA修饰的研究已成为当今生命科学领域最前沿最热门的研究方向之一,不断有CNS的文章问世,m5C RNA修饰的分子机理研究越来越清晰,也不断有学者探寻如何更全面的获得贴近真实的m5C修饰的原貌。近期,来自德国的Frank Lyko和Mark Helm团队在GENOME RESEA

甲基化特异性 PCR 确定 DNA 甲基化的模式

用 PCR 来分析 DNA 甲基化的方法可以运用于:(1)对基因组中任何位置的 CpG 甲基化的分析;(2)检测肿瘤患者的基因改变以及介人被印的基因的固定遗传障碍的研究。实验方法原理DNA甲基化(DNA methylation)是最早发现的修饰途径之一,大量研究表明,DNA甲基化能引起染色质结构、D

专访张鹍教授:从“不被信任”到突破传统,改写癌症早筛

  本月,《Nature Genetics》杂志上一篇与高通量甲基化无创检测新技术相关的文章受到了国内外媒体的关注。 这项技术由加州大学圣地亚哥分校(UCSD)生物工程系张鹍教授及其团队开发,不仅可以检测癌症,还能确定肿瘤在体内的生长位置,为癌症早期诊断提供了新方向。这项技术的核心是肿瘤ctDNA液

云序RNA修饰技术余义勋课题组植物m1A修饰调控机制的运用

  导读   RNA甲基化修饰在调控生物生长发育的过程中起重要作用,m6A和m5C在植物体内的产生机制和生物学功能已有较多研究论文发表,然而RNA m1A(N1-甲基腺嘌呤)修饰在植物中的研究还非常少。   近日,Plant Physiology 在线发表了华南农业大学余义勋课题组题为“The

快速可靠的甲基化分析,无需亚硫酸氢盐转化

  在甲基化分析中,亚硫酸氢盐转化通常是必经之路。它将未甲基化的胞嘧啶转化成尿嘧啶,而甲基化的胞嘧啶保持不变,之后再结合PCR、测序等技术分析甲基化状态。听上去似乎很简单,但要想获得漂亮的结果,却并非那么容易。转化效率如何?回收率如何?这都是需要考量和优化的因素。   最近,QIAGEN

DNA甲基化与拟南芥的免疫力

  DNA甲基化有助于拟南芥的免疫力,它动态调控了某些基因的表达,让植物能够抵御细菌感染。近日,一篇在线发表于《PNAS》上的文章阐述了以上研究成果。   美国加州索尔克生物学研究所(Salk Institute for Biological Studies)的研究人员利用MethylC测序鉴

Cell Res重点论文:单细胞表观多组学测序技术最新突破

  2017年6月16日,北京大学生命科学学院生物动态光学成像中心汤富酬课题组在《Cell Research》杂志在线发表了题为“Single-cell multi-omics sequencing of mouse early embryos and embryonic stem cells”的研

Cell Res重点论文:单细胞表观多组学测序技术最新突破

  2017年6月16日,北京大学生命科学学院生物动态光学成像中心汤富酬课题组在《Cell Research》杂志在线发表了题为“Single-cell multi-omics sequencing of mouse early embryos and embryonic stem cells”的研

甲基化检测——MS-HRM技术

  HRM技术服务之甲基化检测(MS-HRM技术)    DNA甲基化是发生在DNA碱基序列上的一种共价修饰。在哺乳动物中,DNA甲基化主要发生在5'-CpG-3'双核苷酸序列的胞嘧啶上。在人类基因组中,大约有60%~70%的CpG胞嘧啶是甲基化的,其程度因不同的物种和细胞类型而异。DNA甲基化状

北京基因组所等揭示Y染色体表观信息遗传机制

  表观遗传学是与传统遗传学相对应的概念。遗传学以基于DNA序列的中心法则来传递遗传信息,在人群中,遗传信息在世代之间稳定遗传,那么表观遗传信息是否像遗传信息一样可被子代继承,尚缺少相关有力证据。DNA甲基化是非常重要的表观遗传信息,是表观遗传学研究的重要内容。目前,鲜少有DNA甲基化在人群中的继承

甲基化检测——MS-HRM技术

DNA甲基化是发生在DNA碱基序列上的一种共价修饰。在哺乳动物中,DNA甲基化主要发生在5'-CpG-3'双核苷酸序列的胞嘧啶上。在人类基因组中,大约有60%~70%的CpG胞嘧啶是甲基化的,其程度因不同的物种和细胞类型而异。DNA甲基化状态在基因组中呈现出一定的分布模式,90%的甲

Cell新文章聚焦罕见致命癌症

  由St. Jude儿童研究医院和德国癌症研究中心领导的一项新研究显示,分子分析有可能改善一种罕见脑瘤的分类与诊断,并推动精准施药。  该国际研究小组利用分子技术鉴别出了这种罕见脑瘤4种可能的新亚型,这为更准确地诊断这一难治性癌症及定身定制治疗方案奠定了基础。研究结果发布在2月25日的《细胞》(C

新一代测序技术(下)-SOLiD (ABI)

 【摘要】 2005年454公司首推划时代的新一代测序仪,从而引发了测序市场上454、Illumina、ABI等公司在新一代测序技术上的比拼高潮。也正是这种你追我赶,让绘制人类全基因组图谱由过去的耗费4.37亿美元和13年时间,骤然缩短到如今SOLiD 3运行一次即获得50GB可定位测序数据。新一代

高分辨率熔解曲线分析甲基化研究应用

高分辨率熔解曲线分析甲基化研究应用—表观遗传学中检测CpG位点的一种新技术甲基化敏感性高分辨率熔解曲线分析(MS-Hi-Res Melting®)是一种不需要PCR产物后续操作的,简单且灵敏的检测基因甲基化水平的方法。该方法主要通过比较曲线的熔解温度和峰形得以实现。该方法可以在一系列的CpG位点

多位专家指导:如何提取和研究血液DNA,RNA与蛋白

  血液是唯一与所有器官都有接触的组织,携带着有关机体的大量宝贵信息。在理论上,检测血液携带的 DNA、RNA、囊泡和细胞残骸可以帮助人们诊断和监控各种疾病。  产前基因筛查是血液检测的一个重要应用,通过分析孕妇血液中的胎儿DNA来鉴定染色体异常(比如唐氏综合症)。此外,越来越多的研究者开始关注血液

表观遗传学测序技术助力三阴性乳腺癌患者分层

  一组澳大利亚的研究员使用甲基化特异性测序技术发现了三阴性乳腺癌中某些甲基化的差异,这些差异可能具有预后价值。  如果患者缺乏雌激素、孕激素受体,并且HER2基因没有过表达或者扩增,则认为乳腺癌是“三阴性”的。具有三阴性乳腺癌(或TNBC)的患者,可以分成两部分,即癌症进展非常迅速或者进展非常缓慢

研究发现DNA甲基化参与调控柑橘成熟新机制

  1月12日,《美国国家科学院院刊》(PNAS)在线发表了中国科学院分子植物科学卓越创新中心/植物生理生态研究所上海植物逆境生物学研究中心郎曌博研究组题为Global increase in DNA methylation during orange fruit development and r