APT分享|蛋白质组学解锁木薯保鲜新技能

木薯是热带和亚热带地区的重要作物,与马铃薯和甘薯并称为世界三大薯类作物。当然,在中国大部分地区,我们最常见到的木薯,应该是这个样子出现的: 吃货们看过来~ 好,看完美食我们接着聊。木薯虽然不错,但是采后很容易变质,难以贮存。这在吃货界显然是不可以忍受的事!还好,大批科学家上线,希望找到让木薯更容易保存的方法。 最近,就有一个瑞士的研究团队利在相对定量蛋白组学技术的帮助下找到了缓解木薯变质的办法(VanderschurenH,et al., Plant Cell, 2014)。 文献来源:https://www.ncbi.nlm.nih.gov/pubmed/24876255 这个团队对于之前所有人都在研究变质相关基因的状况,提出了自己的看法:“整天基因基因哒,蛋白也很重要啊!修饰也很重要啊!能不能考虑考虑它们的感受?”于是乎,他们选择了Label Free对木薯根的蛋白组做了相对定量分析......阅读全文

中国蛋白质组学世界领先

  2003年12月15日,由中国科学院院士贺福初牵头的“人类肝脏蛋白质计划”(HLPP)启动,这是我国领导的第一项重大国际合作计划,也是第一个人类组织/器官的蛋白质组计划。  北京蛋白质组研究中心主任、蛋白质组学国家重点实验室副主任秦钧告诉《中国科学报》记者,十余年来,HLPP经历了三代更迭,从第

定量蛋白质组学的研究内容

  1.蛋白质鉴定:可以利用一维电泳和二维电泳并结合Western等技术,利用蛋白质芯片和抗体芯片及免疫共沉淀等技术对蛋白质进行鉴定研究。  2.翻译后修饰:很多mRNA表达产生的蛋白质要经历翻译后修饰如磷酸化,糖基化,酶原激活等。翻译后修饰是蛋白质调节功能的重要方式,因此对蛋白质翻译后修饰的研究对

定量蛋白质组学方法分类介绍

  【蛋白研究系列专题】-4丨定量蛋白质组学方法,您值得拥有   1 背景和意义    从生命活动的直接执行者——蛋白质的角度研究生命现象和规律(特别是疾病防治和病理研究)已成为研究生命科学的主要手段。而这些研究往往离不开对细胞、组织或器官中含有蛋白质种类和表达量的研究。对处不同时期、不同条件下

蛋白质组学相关问题与解答

  1.为什么通过elisa、WB能检测到的蛋白在itraq实验中没有检测到?    人血浆中的蛋白是有上万种的,而一般质谱只能检测到五六百种,也就是说只占了其中的百分之几,这是普遍现象,说明咱们的方法是不存在问题的;其次,ELISA/WB与质谱相对来说灵敏度不一样,前者具有放大效应,因为其间会用

Nature年度技术:定向蛋白质组学

  时近岁末,各大杂志接连进行了年终盘点,此前出版的《Nature》杂志也对2012年进行了回顾,评点了2012年的科技进展,科技政策以及重要人物,中国科学家王俊入选了人物篇。同时《Nature Methods》也盘点了今年与明年的技术热点,选出了2012年度技术成果:定向蛋白质组学(targe

蛋白质组学技术的功能介绍

“读”,在字典里的意思是识取、读取,放在蛋白研究中可以理解为对生物样本中未知单一蛋白或复杂蛋白的筛选、鉴定或者定量检测。自2003年4月14日人类基因组计划(HGP)宣告完成以来,基因组研究取得了举世瞩目的成就。基因组学虽然在基因活性和疾病的相关性方面为人类提供了有力证据,但实际上绝大多数疾病并不是

总裁专访-|-蛋白质组学新里程

  2020年是蛋白质组学发展关键的一年,全球新冠疫情突显了蛋白质组学在应对公共卫生危机中的临床应用。人类可以从这次新冠疫情中汲取许多经验,毫无疑问地,这些将在未来几年内影响蛋白质组学发展。近日,Technology Networks与布鲁克·道尔顿生命科学质谱执行副总裁Rohan Thakur博士

蛋白质组学研究-可投哪些期刊?

    蛋白质作为功能的直接行使者,已经被科研工作这广泛应用于不同领域中,目前蛋白组学有很多优秀的科研成果,在各个领域及期刊上发表,其中也不乏CNS在内的顶级期刊。那我们的蛋白组学文章可以投哪些期刊呢?了解已发表文章的情况可以帮助我们很好的解决这个问题。这里,我们以“Proteomics”为关键词,

鲁克在-timsTOF-4D蛋白质组学和表观蛋白质组学平台上扩展

  在蛋白质组论坛| EuPA 2022,布鲁克公司(纳斯达克股票代码:BRKR)宣布扩展了更深层次的蛋白质组学和表观蛋白质组学覆盖的能力,包括使用创新的 TIMScore 算法增强磷酸肽分析,该算法现在是基于 GPU 的新 PaSER 2022 平台的一部分。新的 TIMScore 算法利用机器学

Cell提出一个新“组学”:蛋白质代谢小分子互动组学

  科学家们提出了一个新的“组学”——一个处理蛋白质和小分子之间相互作用的互动组学(protein-metabolite interactomics)。此前系统生物学家专注于基因组学或蛋白质组学,现在他们日益发现了蛋白质-代谢小分子之间相互作用的重要性。  基因组学针对的是生物体基因的系统分析,而蛋

基因组学与蛋白质组学两大巨头建立合作

  AB Sciex和Illumina公司近日联手推出OneOmics™ 计划,其目的是在云计算环境中结合新一代蛋白质组学(NGP)和新一代测序(NGS)的工具。作为此计划的一部分,Illumina的应用商店BaseSpace将托管AB Sciex的SWATH™ 蛋白质组学云工具,这使得BaseSp

中国已获得较完整的木薯基因组草图

      记者1月16日从正在举行的首届中国农业科技创新论坛上获悉,中国热带农业科学院仅用1年的时间,已经完成3个木薯品种的基因组深度测序,同时采用几种超高通量测序技术,综合组装获得较完整的基因组草图。       据中国热带农业科学院生物技术研究

蛋白质组学之逆袭,深度注释基因组

  申请课题缺创新点?撰写论文没思路?急着毕业时间紧?别怕,对于吉凯,一切都是套路!更有甚者,对于宇宙终极难题:“屌丝如何逆袭白富美?”老司机黄博也有一套经典案例分享给大家。   从前,在生物学研究领域,有一个白富美叫基因组学(Genomics),她有一项强大的技能:DNA测序,凭借这项技能,她完

人类蛋白质组计划2.0和蛋白质组学驱动的精准医学

  “如果说抗生素的发明引发了第一代医学治疗技术革命,影像学和分子医学的发展引发了第二代医学诊断技术革命,那么,由蛋白质组学驱动的精准医学,势必带来精确诊断与精准治疗统一的第三代医学革命。人类蛋白质组计划2.0将在国际范围部署建立蛋白质组学驱动的精准医学技术体系和行业标准,进一步提升对重大、疑难疾病

安捷伦科技资助定量蛋白质组学研究

  安捷伦科技通过都柏林国立大学 Newman 奖学金计划   资助定量蛋白质组学研究  2010 年 5 月 12 日,加利福尼亚州圣克拉拉市和爱尔兰都柏林市 — 安捷伦科技公司(纽约证交所:A)和都柏林国立大学(University College Dublin, UCD)今日宣布 Ben

实质等同性(蛋白质组学)实验

实验材料ESI-MSMALDI - MS试剂、试剂盒提取缓冲液仪器、耗材SDS- 聚丙烯酰胺凝胶电泳实验步骤众所周知,在实验室内和实验室间难以保证双向聚丙烯酰胺凝胶电泳的重复性。在我们实验室,强制性地要求严格遵守标准操作程序(sop ) , 以确保不同的操作者可以获得可重复的分离结果。小麦白面粉样品

定量蛋白质组学的技术发展

  以质谱为基础的定向蛋白质组学研究领域的发展历程并不短,早在上个世纪70年,三重四极杆质谱仪就已经出现,并在80年代首次在发表的文章中,证明可以被用来检测肽段。  过去几年间,更广泛的范围内定向质谱技术的应用迅速攀升,而且新方法,新工具,新资源和新一代方法,也令更多研究领域的科学家们能利用到这项技

质谱和蛋白质组学:击中目标

Nature Methods - 5, 741 - 747 (2008)   作者:Nathan Blow   分析测试百科  译     近年来,质谱仪大幅提高了动态范围和灵敏度,使研究者们在疾病生物标志物的发现和验证方面,更从容地面对挑战。     在2008年6月的美国质谱大会(ASMS)

大连化物所蛋白质组学研究取得进展

  蛋白质甲基化是一种非常重要的翻译后修饰现象,其甲基供体为S-腺苷甲硫氨酸(SAM)。由于甲基化可发生在氨基酸残基的N-,O-和S-中心,并且N-中心甲基化还存在不同状态,同时甲基化对分离行为影响非常细微,限制了对蛋白质甲基化组的解析。常规基于抗体的研究策略仅捕获了部分N-中心甲基化的信息。中国科

蛋白质组学帮你找到衰老的秘密

  最近,研究人员发现,正常的和病理性的多肽组学变化,可能会增进我们对于衰老分子机制的理解。蛋白质组学分析与治疗相结合,可能会影响病理性衰老。  这是第一次有研究人员成功地在分子水平上展示了正常衰老和病理性衰老之间的差异。在一项最大的蛋白质组衰老研究中,德国Leibniz衰老研究所 ——Fritz

实质等同性(蛋白质组学)实验

实验材料ESI-MSMALDI - MS试剂、试剂盒提取缓冲液仪器、耗材SDS- 聚丙烯酰胺凝胶电泳实验步骤众所周知,在实验室内和实验室间难以保证双向聚丙烯酰胺凝胶电泳的重复性。在我们实验室,强制性地要求严格遵守标准操作程序(sop ) , 以确保不同的操作者可以获得可重复的分离结果。小麦白面粉样品

蛋白质组学研究的策略和范围

蛋白质组学一经出现,就有两种研究策略。一种可称为“竭泽法”,即采用高通量的蛋白质组研究技术分析生物体内尽可能多乃至接近所有的蛋白质,这种观点从大规模、系统性的角度来看待蛋白质组学,也更符合蛋白质组学的本质。但是,由于蛋白质表达随空间和时间不断变化,要分析生物体内所有的蛋白质是一个难以实现的目标。另一

董孟秋·科学:蛋白质组学新技术

来自美国斯克利普斯研究所(Scripps Research Institute)Salk生物研究院,加州大学圣地亚哥分校的研究人员利用一种蛋白定量分析新方法对长寿命线虫进行了研究,发现了能延长和缩短寿命的蛋白。这对于进一步丰富蛋白定量研究方面来说意义重大。这一研究成果公布在《Science》杂志上。

实质等同性(蛋白质组学)实验

实验材料:ESI-MS                                                                  MALDI - MS  试剂、试剂盒:提取缓冲液仪器、耗材:SDS- 聚丙烯酰胺凝胶电泳        实验步骤:众所周知,在实验室内和实验室间难

蛋白质组学研究系列仪器及软件

人体内真正发挥作用的是蛋白质,蛋白质扮演着构筑生命大厦的“砖块”角色,随着破译生命密码的人类基因组计划进入尾声,一个以蛋白质和药物基因学为研究重点的后基因组时代已经拉开序幕,蛋白质将是今后的重点研究方向之一。然而,蛋白质的分离和鉴定非常费时,目前测定蛋白质的技术远远落后于破译基因组的工具,最好的实验

外泌体及其蛋白质组学研究

  外泌体是什么?  外泌体(Exosome),是一种能被大多数细胞分泌的微小膜泡,具有脂质双层膜结构,直径大约40-200 nm。外泌体存在于体液中,包括血液、唾液、尿液和母乳等,不同组织来源的外泌体在内容物组成和功能方面存在差异,这种差异受到细胞外基质和微环境的动态调控。越来越多的证据表明,宿主

蛋白质组学牛人Nature发表重要成果

  第一次结合两种新兴的大规模实验技术:多通道质谱分析法和具有高水平自然遗传多样性的小鼠种群,哈佛医学院(HMS)和Jackson实验室(JAX)的研究人员解决了生物学和医学中一个悬而未决的问题:遗传变异是如何影响蛋白质水平的?  蛋白质是构成所有细胞和生物结构与功能“零件表”的氨基酸链。因此,了解

蛋白质组学的标准化(下)

  蛋白质组学信息学研究组   蛋白质组学信息学研究组的任务是教育蛋白质组学研究实验室最大程度地应用和实践生物信息学方法,向精确和复杂的蛋白质组学数据分析方向发展。iPRG积极地支持和参与开发和提高新的算法、软件工具以及蛋白质组信息学战略,目标是向全体会员教育和介绍这些新技术。iPRG已经发起了两

蛋白质组学技术分析方法及概括

1 蛋白质组学概述“蛋白质组”一词的英文是Proteome,它是proteins 和genome 两个词的组合,意思是proteins expressed by a genome,即为基因组表达的蛋白质[1]。蛋白质组的概念是1994 年由Wilkins首先提出,并首次在1995 年7月的“Elec

蛋白质组学的标准化(上)

Tim Wehr   由于人类基因序列的建立已经接近完成,人们认识到生物科学届的下一项任务将是表征基因组的产物——其中绝大部分是蛋白质。作为正在兴起的研究领域,蛋白质组学将其研究目标定位于:鉴定和测量在一个细胞或组织中的所有蛋白质,这样做的预期是,将能发现那些能够成为疾病生物标志物(bioma