DNA双链断裂检测——变压场凝胶电泳(GFGE)

DNA双链断裂与细胞死亡的关系更为密切。变压场凝胶电泳是采用将细胞包埋在低熔点琼脂糖凝胶中,通过蛋白酶、去污剂等渗入凝胶中融解细胞、去蛋白,纯化细胞DNA,再通过梯增电压进行琼脂糖凝胶电泳,结合DNA解旋荧光测定(FADU)法和检测DNA双链断裂。 1、主要试剂及配制方法: (1)蛋白酶K,SDS,低熔点琼脂糖。 (2)配制方法: 细胞缓冲液(A液)。0.25mol/L NaCl + 10mmol Na2HPO4 + 1mmol/L MgCl2,pH7.2. 细胞裂解液(B液)。9mol/L脲 + 10mmol/L NaOH + 2.5mmol/L环烷二胺四乙酸 + 0.1%SDS。 碱性变性液I(C液)。B液 + 0.2mol/NaOH,体积比为45:55. 碱性变性液I(D液)。B液 + 0.2mol/NaOH,体积比为40:60. 抗变性液(F液)。1ug/L溴化乙锭 + 13.3mmol/......阅读全文

德研究发现与DNA双链断裂修复相关基因

  德国研究人员在寻找参与修复脱氧核糖核酸(DNA)双链断裂的基因方面获得进展。研究小组在人类细胞中找到61个位点,并发现了此前未知的与DNA双链断裂修复有关的基因。该研究结果将显著加速DNA修复基因的继续搜寻,并带来新的医疗应用可能。相关研究成果发表在6月29日的《公共科学图书馆·生物学》杂志上。

DNA双链断裂检测——变压场凝胶电泳(GFGE)

DNA双链断裂与细胞死亡的关系更为密切。变压场凝胶电泳是采用将细胞包埋在低熔点琼脂糖凝胶中,通过蛋白酶、去污剂等渗入凝胶中融解细胞、去蛋白,纯化细胞DNA,再通过梯增电压进行琼脂糖凝胶电泳,结合DNA解旋荧光测定(FADU)法和检测DNA双链断裂。 1、主要试剂及配制方法: (1)蛋白酶K,

与DNA双链断裂修复相关新基因被发现

  德国研究人员在寻找参与修复脱氧核糖核酸(DNA)双链断裂的基因方面获得进展。研究小组在人类细胞中找到61个位点,并发现了此前未知的与DNA双链断裂修复有关的基因。该研究结果将显著加速DNA修复基因的继续搜寻,并带来新的医疗应用可能。相关研究成果发表在6月29日的《公共科学图书馆·生

DNA双链断裂是脑活动一部分

  长期以来,科学家认为一种特殊的DNA损伤——DNA双链断裂(DSB)对脑细胞特别有害,是老年病如老年痴呆背后的主要推手。据物理学家组织网3月24日报道,最近,美国加利福尼亚大学旧金山分校格拉斯通研究所科学家发现,DSB实际上是一种常规的、非伤害性脑活动过程的一部分。这一发现有助于理解老年痴呆症背

拟南芥叶绿体基因组DNA双链断裂修复的全新分子机制

  2021年6月16日,清华大学生命学院/清华-北大生命科学联合中心孙前文实验室在Nucleic Acids Research杂志在线发表题为“RNase H1C与单链DNA结合蛋白WHY1/3和重组酶RecA1在拟南芥叶绿体中协作完成DNA损伤修复 (RNaseH1C collaborates

利用BARBEKO高通量筛选,实现非依赖DNA双链断裂基因敲除

  基于CRISPR-Cas的功能性筛选技术为基因功能研究和药物靶点发现提供了有力手段。经典的CRISPR敲除筛选方法依赖于Cas9介导的双链DNA断裂。然而,DNA双链断裂的产生如果修复不及时会造成严重的细胞损伤。因此,Cas9靶向基因组多拷贝位点时极易引起细胞死亡,从而影响基因功能筛选的准确性。

Nature-|-破解领域难题:BRCA1如何被募到DNA双链断裂位点?

  同源末端重组 (HR) 和非同源末端重组 (NHEJ) 是细胞遭受DNA双链断裂 (DSBs) 之后进行损伤修复的两个重要武器,并分别由各自通路中的关键蛋白BRCA1 (HR) 和53BP1 (NHEJ) 所介导。它们的相同之处在于,BRCA1和53BP1都需要同时结合在H2AK15ub (由泛

DNA单链断裂检测技术:单细胞凝胶电泳(SCGE)检测原理..

DNA单链断裂检测技术:单细胞凝胶电泳(SCGE)检测原理和操作步放回玻片托盘中待琼脂糖凝固。 (3)裂解: 移开盖玻片,将载玻片缓慢浸入新配制的冰凉的细胞裂解液中,置于4℃冷藏至少1h。细胞可在裂解液中至少保存4周,但时间太长可能会引起缓冲液沉淀。 碱性细胞裂解液配制(每1000ml)

减数分裂时大约20%的断裂对应于紧密定位的双链断裂对

  减数分裂是一种特殊的细胞分裂过程,需要产生配子,即生物体的生殖细胞。在减数分裂过程中,父系和母系染色体复制、配对并交换部分DNA,这一过程称为减数分裂重组。为了调节这种遗传物质的交换,细胞将双链断裂(dsb)引入染色体DNA。来自维也纳大学和医学维也纳大学的Max Prutz实验室的染色体生物学

双脱氧法DNA测序实验

测序酶进行标记测序反应 α-标记核苷酸进行热循环测序反应             实验材料 DNA

双链DNA的结构特点

中文名称双链DNA英文名称double-stranded DNA;dsDNA定  义由两条DNA单链通过碱基互补作用而构成的DNA分子。应用学科遗传学(一级学科),分子遗传学(二级学科)

双链互补DNA的定义

中文名称双链互补DNA英文名称double-strand cDNA;dscDNA定  义以双链互补DNA为模板合成的双链DNA。应用学科生物化学与分子生物学(一级学科),核酸与基因(二级学科)

双脱氧法DNA测序实验

实验材料 DNA试剂、试剂盒 寡核苷酸引物测序酶终止混合液测序酶缓冲液焦磷酸酶混合液仪器、耗材 离心机离心管微量滴定板实验步骤 1.  对于每个单链模板:将下列试剂混合于0.5 ml 微量离心管中(1)0.5 pmol 单链DNA模板(2)0.5 pmol 引物(3)1 μl 10×测序酶缓冲液(4

双链DNA探针标记法

  分子生物研究中,最常用的探针即为双链DNA探针,它广泛应用于基因的鉴定、临床诊断等方面。  双链DNA探针的合成方法主要有下列两种:切口平移法和随机引物合成法。  1.切口平移法(nick translation) 当双链DNA分子的一条链上产生切口时,E.coli DNA聚合酶Ⅰ就可将核苷酸连

细胞化学词汇双链DNA

中文名称:双链DNA英文名称:double-stranded DNA;dsDNA定  义:由两条DNA单链通过碱基互补作用而构成的DNA分子。应用学科:遗传学(一级学科),分子遗传学(二级学科)

双链DNA的结构特点

中文名称双链DNA英文名称double-stranded DNA;dsDNA定  义由两条DNA单链通过碱基互补作用而构成的DNA分子。应用学科遗传学(一级学科),分子遗传学(二级学科)

质粒DNA的双酶切

实验概要掌握质粒DNA双酶切的原理和操作方法。实验原理分子生物学实验中,基因的重组与分离涉及到一系列的酶促反应。许多种酶在基因克隆实验中有着广泛的用途。限制性内切酶是一类能识别双链DNA分子特异性核酸序列的DNA水解酶。多种细菌能合成限制性核酸酶,这是它们保护自己,降解外来DNA分子的重要手段。每一

DNA双链末端的概念

中文名称平端英文名称blunt end定  义DNA双链末端平齐而无突出单链。应用学科遗传学(一级学科),分子遗传学(二级学科)

抗双链DNA抗体(aniDNA)的简介

  抗DNA抗体包括抗双链DNA抗体、抗单链DNA抗体和抗zDNA抗体。 检验中一般是指与双链DNA和单链DNA都反应的抗双链DNA抗体。 抗双链DNA抗体阳性是系统性红斑狼疮的标志,阳性率达90%以上,有较高的特异性,因而抗双链DNA抗体对系统性红斑狼疮的诊断和治疗监控极重要。抗双链DNA抗体在其

制备DNA测序模板实验——双脱氧测序的双链质粒DNA的碱变性

实验材料DNA试剂、试剂盒NaOHEDTA乙酸钠乙醇仪器、耗材离心管离心机摇床实验步骤1.  加入约0.5 pmol 重组质粒DNA于0.5 ml 微量离心管中,如果体积大于20 μl 应以乙醇沉淀,重溶于20 μl 水。2.  如果体积小于20 μl,用水补足20 μl。3.  加入2 μl 2

关于电离辐射引起的DNA损伤的介绍

  电离辐射损伤DNA有直接和间接的效应,直接效应是DNA直接吸收射线能量而遭损伤,间接效应是指DNA周围其他分子(主要是水分子)吸收射线能量产生具有很高反应活性的自由基进而损伤DNA。电离辐射可导致DNA分子的多种变化:  ①碱基变化 主要是由OH-自由基引起,包括DNA链上的碱基氧化修饰、过氧化

电离辐射引起的DNA损伤介绍

电离辐射损伤DNA有直接和间接的效应,直接效应是DNA直接吸收射线能量而遭损伤,间接效应是指DNA周围其他分子(主要是水分子)吸收射线能量产生具有很高反应活性的自由基进而损伤DNA。电离辐射可导致DNA分子的多种变化:①碱基变化 主要是由OH-自由基引起,包括DNA链上的碱基氧化修饰、过氧化物的形成

双链DNA探针切口平移法

当双链DNA分子的一条链上产生切口时,E.coli DNA聚合酶Ⅰ就可将核苷酸连接到切口的3'羟基末端。同时该酶具有从5'→3'的核酸外切酶活性,能从切口的5'端除去核苷酸。由于在切去核苷酸的同时又在切口的3'端补上核苷酸,从而使切口沿着DNA链移动,

细胞化学词汇双链互补DNA

中文名称:双链互补DNA英文名称:double-strand cDNA;dscDNA定  义:以双链互补DNA为模板合成的双链DNA。应用学科:生物化学与分子生物学(一级学科),核酸与基因(二级学科)

双链DNA探针切口平移法

   当双链DNA分子的一条链上产生切口时,E.coli DNA聚合酶Ⅰ就可将核苷酸连接到切口的3'羟基末端。同时该酶具有从5'→3'的核酸外切酶活性,能从切口的5'端除去核苷酸。由于在切去核苷酸的同时又在切口的3'端补上核苷酸,从而使切口沿着DNA链移动,用

双链DNA探针切口平移法

当双链DNA 分子的一条链上产生切口时,E.coli DNA 聚合酶Ⅰ就可将核苷酸连接到切口的3'羟基末端。同时该酶具有从5'→3'的核酸外切酶活性,能从切口的5'端除去核苷酸。由于在切去核苷酸的同时又在切口的3'端补上核苷酸,从而使切口沿着DNA

解旋酶打开DNA双链过程破解

  美国温安洛研究所近日发布公告称,该所科学家和洛克菲勒大学合作,成功破解CMG解旋酶参与真核生物内DNA(脱氧核糖核酸)复制的结构过程,并首次观察到其与DNA间的相互作用。这项发表在美国《国家科学院学报》上的最新研究,为生命繁殖之谜提供了全新注解。  温安洛研究所教授李慧琳(音译)从酵母生物体内提

细胞化学词汇DNA双链体

中文名称:DNA双链体英文名称:DNA duplex定  义:两条以3′,5′-磷酸二酯键相连而成的反向多核苷酸链通过沿着其轴向的互补碱基对的氢键交联在一起形成的双链DNA,通常形成双螺旋的结构。可以共价闭合成环状分子,形成超螺旋DNA。应用学科:生物化学与分子生物学(一级学科),核酸与基因(二级学

解旋酶打开DNA双链过程破解

  美国温安洛研究所近日发布公告称,该所科学家和洛克菲勒大学合作,成功破解CMG解旋酶参与真核生物内DNA(脱氧核糖核酸)复制的结构过程,并首次观察到其与DNA间的相互作用。这项发表在美国《国家科学院学报》上的最新研究,为生命繁殖之谜提供了全新注解。  温安洛研究所教授李慧琳(音译)从酵母生物体内提

双链DNA探针标记法介绍

分子生物研究中,最常用的探针即为双链DNA探针,它广泛应用于基因的鉴定、临床诊断等方面。双链DNA探针的合成方法主要有下列两种:切口平移法和随机引物合成法。1. 切口平移法(nick translation) 当双链DNA分子的一条链上产生切口时,E.coli DNA聚合酶Ⅰ就可将核苷酸连接到切口的